EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000017592 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: celf4
Alias: zgc:92761
Full Name: CUGBP%2C Elav-like family member 4
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 81171 bases
Position: chrKQ557213.1:5948452-6029622
Accession: ZDB-GENE-040718-300
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000023551	RRM_1	PF00076.22	1.2e-39	1	2
ENSXCOP00000023551	RRM_1	PF00076.22	1.2e-39	2	2
ENSXCOP00000023553	RRM_1	PF00076.22	3.4e-37	1	2
ENSXCOP00000023553	RRM_1	PF00076.22	3.4e-37	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000023832	-	1260	-	ENSXCOP00000023551	419 (aa)	-	-
ENSXCOT00000023834	-	1290	-	ENSXCOP00000023553	429 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXCOG00000017592	celf4	97	65.566	ENSXCOG00000019737	celf3a	98	66.504
ENSXCOG00000017592	celf4	97	63.033	ENSXCOG00000019503	celf3b	88	64.339
ENSXCOG00000017592	celf4	97	37.500	ENSXCOG00000014236	elavl1a	76	45.679
ENSXCOG00000017592	celf4	53	34.737	ENSXCOG00000008068	-	65	37.500
ENSXCOG00000017592	celf4	92	37.037	ENSXCOG00000002464	ELAVL2	82	41.975
ENSXCOG00000017592	celf4	100	53.881	ENSXCOG00000009514	-	87	56.522
ENSXCOG00000017592	celf4	92	40.389	ENSXCOG00000011871	-	94	39.443
ENSXCOG00000017592	celf4	84	76.404	ENSXCOG00000008353	si:dkey-205h23.2	99	76.966

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000017592	celf4	97	75.229	ENSG00000101489	CELF4	100	94.030	Homo_sapiens
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.911	ENSAPOG00000002964	celf4	90	85.649	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000017592	celf4	83	73.879	ENSAMEG00000017059	CELF4	88	78.151	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000017592	celf4	97	79.524	ENSACIG00000018097	celf4	88	81.658	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000017592	celf4	60	65.637	ENSAOCG00000019919	-	76	65.637	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.911	ENSAOCG00000020590	celf4	90	85.649	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000017592	celf4	97	77.830	ENSAPEG00000002940	celf4	99	78.723	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000017592	celf4	97	77.830	ENSATEG00000023731	celf4	88	80.846	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000017592	celf4	81	70.025	ENSAPLG00000007830	-	100	70.025	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000017592	celf4	53	79.832	ENSACAG00000012428	CELF4	92	79.741	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.973	ENSANAG00000029499	CELF4	89	77.644	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000017592	celf4	97	90.094	ENSACLG00000011828	celf4	90	92.786	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000017592	celf4	97	77.273	ENSAMXG00000007935	celf4	92	82.916	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	75.878	ENSBTAG00000004940	CELF4	89	79.557	Bos_taurus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.913	ENSCJAG00000021135	CELF4	89	77.590	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	75.878	ENSCHIG00000007169	CELF4	89	79.557	Capra_hircus
ENSXCOG00000017592	celf4	95	69.789	ENSTSYG00000000816	CELF4	93	71.429	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000017592	celf4	86	82.474	ENSCPOG00000035956	CELF4	81	82.474	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.973	ENSCCAG00000028373	CELF4	89	77.644	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.913	ENSCATG00000045293	CELF4	89	77.590	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.275	ENSCLAG00000008344	CELF4	89	82.609	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000017592	celf4	81	83.708	ENSCSAG00000017933	CELF4	100	84.831	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000017592	celf4	81	78.652	ENSCPBG00000005237	CELF4	93	79.272	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.973	ENSCANG00000036735	CELF4	89	77.644	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000017592	celf4	86	74.603	ENSCGRG00001018085	Celf4	89	75.132	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.260	ENSCSEG00000007074	celf4	90	85.649	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000017592	celf4	97	79.433	ENSCVAG00000017617	celf4	88	81.592	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	79.783	ENSDARG00000070045	celf4	100	81.281	Danio_rerio
ENSXCOG00000017592	celf4	84	81.793	ENSDNOG00000032492	CELF4	99	82.065	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.275	ENSDORG00000007169	Celf4	89	82.609	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000017592	celf4	72	93.750	ENSETEG00000007432	-	51	93.750	Echinops_telfairi
ENSXCOG00000017592	celf4	97	75.701	ENSEASG00005016534	CELF4	89	79.803	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.913	ENSECAG00000008810	CELF4	89	77.590	Equus_caballus
ENSXCOG00000017592	celf4	70	66.460	ENSEEUG00000003763	CELF4	72	68.634	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	75.878	ENSFCAG00000045234	CELF4	89	79.557	Felis_catus
ENSXCOG00000017592	celf4	81	83.989	ENSFALG00000009188	CELF4	98	85.112	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000017592	celf4	85	82.723	ENSFDAG00000010287	CELF4	80	82.723	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000017592	celf4	81	71.788	ENSFHEG00000003431	celf4	84	76.123	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000017592	celf4	81	74.680	ENSGMOG00000008703	celf4	74	73.913	Gadus_morhua
ENSXCOG00000017592	celf4	66	92.683	ENSGMOG00000011747	-	72	92.683	Gadus_morhua
ENSXCOG00000017592	celf4	97	83.261	ENSGAFG00000021515	celf4	93	86.270	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000017592	celf4	97	78.139	ENSGACG00000008752	celf4	87	77.922	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000017592	celf4	92	68.112	ENSGAGG00000017672	-	93	67.866	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000017592	celf4	71	76.115	ENSGAGG00000023014	-	98	77.316	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.973	ENSGGOG00000013920	CELF4	89	77.644	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000017592	celf4	97	90.307	ENSHBUG00000021618	celf4	90	93.017	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000017592	celf4	97	75.688	ENSHGLG00000003130	CELF4	89	77.778	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000017592	celf4	97	79.587	ENSHGLG00100006394	CELF4	89	81.884	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000017592	celf4	97	76.995	ENSHCOG00000012195	celf4	89	79.703	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000017592	celf4	97	76.019	ENSIPUG00000010810	celf4	89	78.974	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	79.358	ENSJJAG00000016892	Celf4	89	81.643	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.694	ENSKMAG00000019602	celf4	90	85.194	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	77.358	ENSLBEG00000000940	celf4	87	80.348	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000017592	celf4	81	69.630	ENSLOCG00000004792	celf4	98	69.877	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.275	ENSLAFG00000021352	CELF4	100	87.209	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.973	ENSMFAG00000042983	CELF4	89	77.644	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.684	ENSMMUG00000006866	CELF4	89	76.386	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000017592	celf4	97	75.878	ENSMNEG00000033449	CELF4	89	79.557	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000017592	celf4	75	84.290	ENSMLEG00000028543	CELF4	77	84.290	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	77.830	ENSMAMG00000018573	celf4	87	80.846	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	74.528	ENSMZEG00005026879	celf4	88	77.114	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000017592	celf4	71	66.667	ENSMGAG00000017029	CELF4	100	66.981	Meleagris_gallopavo
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.913	ENSMICG00000006984	CELF4	89	77.590	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.046	ENSMOCG00000011985	Celf4	89	82.367	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000017592	celf4	97	77.358	ENSMMOG00000012281	celf4	88	80.348	Mola_mola
ENSXCOG00000017592	celf4	70	72.622	ENSMODG00000000306	CELF4	93	71.469	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000017592	celf4	97	89.858	ENSMALG00000001696	celf4	90	92.537	Monopterus_albus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.046	MGP_CAROLIEiJ_G0022058	Celf4	95	77.404	Mus_caroli
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.328	ENSMUSG00000024268	Celf4	89	84.236	Mus_musculus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.046	MGP_PahariEiJ_G0018792	Celf4	95	77.404	Mus_pahari
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.046	MGP_SPRETEiJ_G0022969	Celf4	100	77.285	Mus_spretus
ENSXCOG00000017592	celf4	85	82.527	ENSMLUG00000001755	CELF4	100	82.527	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.275	ENSNGAG00000000761	Celf4	89	82.609	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000017592	celf4	97	74.528	ENSNBRG00000018194	celf4	88	77.114	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000017592	celf4	77	73.429	ENSMEUG00000007202	-	100	73.639	Notamacropus_eugenii
ENSXCOG00000017592	celf4	81	79.508	ENSOPRG00000014415	CELF4	75	83.111	Ochotona_princeps
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.275	ENSODEG00000018464	CELF4	89	82.609	Octodon_degus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	83.043	ENSONIG00000019463	celf4	90	85.845	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000017592	celf4	83	78.142	ENSOCUG00000024790	CELF4	71	82.609	Oryctolagus_cuniculus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	83.043	ENSORLG00000008913	celf4	90	85.845	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000017592	celf4	97	83.043	ENSORLG00020008454	celf4	90	85.845	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000017592	celf4	97	87.105	ENSORLG00015004115	celf4	89	89.460	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.911	ENSOMEG00000002391	celf4	90	85.649	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000017592	celf4	85	94.545	ENSOGAG00000010018	CELF4	100	73.412	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000017592	celf4	71	81.210	ENSOARG00000005276	CELF4	100	81.210	Ovis_aries
ENSXCOG00000017592	celf4	88	78.701	ENSPPAG00000020644	CELF4	88	81.044	Pan_paniscus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.973	ENSPPRG00000007683	CELF4	89	77.644	Panthera_pardus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.973	ENSPTRG00000009982	CELF4	89	77.644	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.973	ENSPANG00000006365	CELF4	89	77.644	Papio_anubis
ENSXCOG00000017592	celf4	97	74.588	ENSPKIG00000017421	celf4	90	76.256	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000017592	celf4	81	83.989	ENSPSIG00000015538	CELF4	98	85.112	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000017592	celf4	97	80.046	ENSPEMG00000019299	Celf4	89	82.367	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000017592	celf4	68	91.065	ENSPLAG00000012151	celf4	76	95.539	Poecilia_latipinna
ENSXCOG00000017592	celf4	78	100.000	ENSPMEG00000015313	celf4	85	100.000	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000017592	celf4	97	90.094	ENSPREG00000021231	celf4	90	92.786	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000017592	celf4	68	80.198	ENSPCAG00000000126	CELF4	69	80.198	Procavia_capensis
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.973	ENSPVAG00000009204	CELF4	89	77.644	Pteropus_vampyrus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	74.528	ENSPNYG00000004131	celf4	88	77.114	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000017592	celf4	97	86.588	ENSPNAG00000006426	celf4	92	90.796	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000017592	celf4	79	74.571	ENSRNOG00000014503	Celf4	100	76.571	Rattus_norvegicus
ENSXCOG00000017592	celf4	97	75.878	ENSRBIG00000035924	CELF4	89	79.557	Rhinopithecus_bieti
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.973	ENSRROG00000014839	CELF4	89	77.644	Rhinopithecus_roxellana
ENSXCOG00000017592	celf4	97	73.059	ENSSBOG00000030001	CELF4	89	76.683	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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