EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000017748 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10305 bases
Position: chrKQ557213.1:8040638-8050942
Accession: ZDB-GENE-101110-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000023760	PseudoU_synth_1	PF01416.20	2.8e-30	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000024044	-	834	-	ENSXCOP00000023760	277 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.821	ENSG00000169972	PUSL1	97	53.659	Homo_sapiens
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	70.463	ENSAPOG00000016290	pusl1	94	70.463	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	48.746	ENSAMEG00000013752	PUSL1	92	48.746	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000017748	pusl1	100	71.480	ENSACIG00000015240	pusl1	100	70.696	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000017748	pusl1	100	68.953	ENSAOCG00000019419	pusl1	85	68.310	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	69.203	ENSAPEG00000005452	pusl1	94	68.929	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	71.174	ENSATEG00000024154	pusl1	94	71.174	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	50.181	ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	50.181	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000017748	pusl1	88	56.557	ENSACAG00000014111	PUSL1	92	56.557	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	50.909	ENSANAG00000037456	PUSL1	90	50.909	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	74.733	ENSACLG00000008675	pusl1	96	75.984	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	56.631	ENSAMXG00000044007	pusl1	95	56.631	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	50.000	ENSBTAG00000007619	PUSL1	96	50.000	Bos_taurus
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	50.545	ENSCJAG00000010972	PUSL1	90	50.545	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	48.387	ENSCAFG00000019291	PUSL1	91	48.387	Canis_familiaris
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSCAFG00020011568	PUSL1	90	49.462	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.286	ENSCHIG00000012615	PUSL1	97	49.286	Capra_hircus
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	48.201	ENSCPOG00000005149	PUSL1	90	48.201	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	50.545	ENSCCAG00000027475	PUSL1	90	50.545	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.821	ENSCATG00000018260	PUSL1	91	49.821	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	49.110	ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	49.110	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSCSAG00000000680	PUSL1	91	49.462	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	52.899	ENSCPBG00000022621	PUSL1	95	52.899	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSCANG00000034373	PUSL1	91	49.462	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSCGRG00001012429	Pusl1	95	49.462	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSCGRG00000006466	Pusl1	95	49.462	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000017748	pusl1	100	70.714	ENSCSEG00000005159	pusl1	93	70.714	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000017748	pusl1	86	69.583	ENSCVAG00000012923	pusl1	92	69.583	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	61.871	ENSDARG00000074565	pusl1	95	65.517	Danio_rerio
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	31.023	FBgn0083976	CG34140	99	31.023	Drosophila_melanogaster
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.821	ENSECAG00000006248	PUSL1	91	49.821	Equus_caballus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	47.518	ENSEEUG00000000837	PUSL1	94	47.518	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	60.440	ENSELUG00000015945	pusl1	93	60.440	Esox_lucius
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	50.545	ENSFCAG00000007617	PUSL1	91	50.545	Felis_catus
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	83.630	ENSFHEG00000006370	pusl1	94	83.630	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	67.021	ENSGMOG00000019388	pusl1	100	67.021	Gadus_morhua
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	51.625	ENSGALG00000001714	PUSL1	95	51.625	Gallus_gallus
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	87.719	ENSGAFG00000007546	pusl1	96	87.719	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	63.830	ENSGACG00000007848	pusl1	93	63.830	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	52.899	ENSGAGG00000004730	PUSL1	95	52.899	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000017748	pusl1	87	52.893	ENSGGOG00000005364	PUSL1	93	52.893	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	75.445	ENSHBUG00000001264	pusl1	94	75.445	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	47.687	ENSHGLG00000017570	PUSL1	91	47.687	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000017748	pusl1	90	49.402	ENSHGLG00100007641	PUSL1	82	49.402	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000017748	pusl1	100	63.509	ENSHCOG00000010077	pusl1	100	64.727	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	61.455	ENSIPUG00000023921	pusl1	95	61.455	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	49.455	ENSSTOG00000001783	PUSL1	85	49.455	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	50.903	ENSJJAG00000020471	Pusl1	93	50.903	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000017748	pusl1	88	68.852	ENSKMAG00000005154	pusl1	83	68.852	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	69.643	ENSLBEG00000013469	pusl1	96	69.643	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000017748	pusl1	69	55.959	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	55.959	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	50.534	ENSLOCG00000002210	pusl1	95	50.534	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000017748	pusl1	90	51.600	ENSLAFG00000013685	PUSL1	93	51.600	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSMFAG00000046288	PUSL1	91	49.462	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	44.086	ENSMMUG00000016279	PUSL1	91	44.086	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSMNEG00000037989	PUSL1	92	49.462	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	68.327	ENSMAMG00000016538	pusl1	93	68.327	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000017748	pusl1	100	74.368	ENSMZEG00005026990	pusl1	98	74.368	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	51.079	ENSMGAG00000003037	PUSL1	94	51.079	Meleagris_gallopavo
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	48.387	ENSMAUG00000019924	Pusl1	95	48.387	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	51.429	ENSMICG00000014171	PUSL1	95	51.429	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	50.538	ENSMOCG00000005602	Pusl1	95	50.538	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000017748	pusl1	100	70.397	ENSMMOG00000003269	pusl1	97	70.397	Mola_mola
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	68.440	ENSMALG00000021686	pusl1	93	68.440	Monopterus_albus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	50.896	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	95	50.896	Mus_caroli
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	50.538	ENSMUSG00000051557	Pusl1	95	50.538	Mus_musculus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	51.254	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	95	51.254	Mus_pahari
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	51.254	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	95	51.254	Mus_spretus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.643	ENSMPUG00000014313	PUSL1	91	49.643	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.822	ENSNGAG00000004647	Pusl1	84	49.822	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000017748	pusl1	94	73.664	ENSNBRG00000014762	pusl1	95	73.664	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000017748	pusl1	89	52.227	ENSNLEG00000000051	PUSL1	89	52.227	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	51.273	ENSMEUG00000011649	-	96	51.273	Notamacropus_eugenii
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	43.985	ENSMEUG00000005176	-	98	43.985	Notamacropus_eugenii
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	50.538	ENSODEG00000008247	PUSL1	89	50.538	Octodon_degus
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	74.377	ENSONIG00000019361	pusl1	96	71.429	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	66.904	ENSORLG00000016228	pusl1	95	66.904	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	66.904	ENSORLG00020013710	pusl1	95	66.904	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	66.431	ENSORLG00015008715	pusl1	99	66.431	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	66.548	ENSOMEG00000018897	pusl1	97	66.548	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	50.545	ENSOGAG00000031692	PUSL1	95	50.545	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000017748	pusl1	89	52.209	ENSOARG00000004905	PUSL1	93	52.209	Ovis_aries
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	50.179	ENSPPAG00000029283	PUSL1	91	50.179	Pan_paniscus
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	50.909	ENSPPRG00000023329	PUSL1	91	50.909	Panthera_pardus
ENSXCOG00000017748	pusl1	90	52.400	ENSPTIG00000018532	PUSL1	92	52.400	Panthera_tigris_altaica
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.821	ENSPTRG00000000021	PUSL1	91	49.821	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSPANG00000000591	PUSL1	91	49.462	Papio_anubis
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	57.801	ENSPKIG00000002447	pusl1	97	57.801	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000017748	pusl1	88	56.735	ENSPSIG00000002781	PUSL1	91	56.735	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	67.509	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	66.052	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	50.179	ENSPEMG00000013541	Pusl1	95	50.179	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	48.913	ENSPCIG00000007816	-	63	48.913	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	84.859	ENSPFOG00000015448	pusl1	93	84.859	Poecilia_formosa
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	84.859	ENSPLAG00000004348	pusl1	95	84.859	Poecilia_latipinna
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	84.859	ENSPMEG00000000931	pusl1	100	83.453	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	83.099	ENSPREG00000002324	pusl1	95	83.099	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000017748	pusl1	89	51.406	ENSPPYG00000002014	PUSL1	89	51.406	Pongo_abelii
ENSXCOG00000017748	pusl1	87	44.033	ENSPCAG00000002272	PUSL1	98	44.033	Procavia_capensis
ENSXCOG00000017748	pusl1	69	51.163	ENSPVAG00000001016	PUSL1	65	51.163	Pteropus_vampyrus
ENSXCOG00000017748	pusl1	84	75.833	ENSPNYG00000006588	pusl1	100	75.833	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	60.072	ENSPNAG00000024441	pusl1	96	60.072	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	51.613	ENSRNOG00000022354	Pusl1	98	53.175	Rattus_norvegicus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSRBIG00000036842	PUSL1	91	49.462	Rhinopithecus_bieti
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSRROG00000030704	PUSL1	91	49.462	Rhinopithecus_roxellana
ENSXCOG00000017748	pusl1	87	52.049	ENSSBOG00000032249	PUSL1	87	52.049	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXCOG00000017748	pusl1	97	60.432	ENSSFOG00015008281	pusl1	92	60.432	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	66.192	ENSSMAG00000007187	pusl1	93	66.192	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000017748	pusl1	100	72.563	ENSSDUG00000000287	pusl1	96	72.563	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	69.504	ENSSLDG00000009605	pusl1	90	69.504	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXCOG00000017748	pusl1	60	49.091	ENSSARG00000005323	-	87	49.091	Sorex_araneus
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	64.483	ENSSPAG00000002528	pusl1	100	64.469	Stegastes_partitus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.104	ENSSSCG00000003338	PUSL1	91	49.104	Sus_scrofa
ENSXCOG00000017748	pusl1	96	47.985	ENSTGUG00000003214	PUSL1	96	48.175	Taeniopygia_guttata
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	63.345	ENSTRUG00000010102	pusl1	95	63.345	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000017748	pusl1	65	66.667	ENSTNIG00000005789	pusl1	81	66.667	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000017748	pusl1	64	48.889	ENSTBEG00000005001	PUSL1	74	48.889	Tupaia_belangeri
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	43.214	ENSTTRG00000017030	PUSL1	92	43.214	Tursiops_truncatus
ENSXCOG00000017748	pusl1	88	51.220	ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	51.220	Ursus_americanus
ENSXCOG00000017748	pusl1	88	51.220	ENSUMAG00000002084	PUSL1	81	51.220	Ursus_maritimus
ENSXCOG00000017748	pusl1	98	49.462	ENSVVUG00000004320	PUSL1	92	44.025	Vulpes_vulpes
ENSXCOG00000017748	pusl1	80	50.435	ENSXETG00000011145	pusl1	100	50.435	Xenopus_tropicalis
ENSXCOG00000017748	pusl1	99	91.197	ENSXMAG00000018846	pusl1	95	91.197	Xiphophorus_maculatus