EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000017864 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp30
Alias: fk66h08|rpp1|wu:fk66h08|zgc:110189
Full Name: ribonuclease P/MRP 30 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5310 bases
Position: chrKQ557202.1:1432617-1437926
Accession: ZDB-GENE-050320-45
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000023928	RNase_P_p30	PF01876.16	7.3e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000024212	-	786	-	ENSXCOP00000023928	261 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	54.264	ENSG00000148688	RPP30	95	57.143	Homo_sapiens
ENSXCOG00000017864	rpp30	86	75.966	ENSAPOG00000023156	rpp30	97	68.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	57.959	ENSAMEG00000016776	RPP30	91	57.959	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000017864	rpp30	85	74.783	ENSACIG00000022810	rpp30	94	67.416	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	77.381	ENSAOCG00000016438	rpp30	85	77.381	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	76.984	ENSAPEG00000008697	rpp30	87	76.984	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000017864	rpp30	92	74.510	ENSATEG00000015263	rpp30	93	74.510	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000017864	rpp30	85	50.840	ENSAPLG00000009959	RPP30	99	50.840	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	51.765	ENSACAG00000007996	RPP30	95	51.765	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	49.200	ENSANAG00000009439	RPP30	80	49.200	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	76.494	ENSACLG00000015389	-	94	76.494	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000017864	rpp30	92	62.348	ENSAMXG00000040653	rpp30	91	62.348	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	58.025	ENSBTAG00000002973	RPP30	91	58.025	Bos_taurus
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	56.000	ENSCJAG00000011045	RPP30	96	56.000	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	57.143	ENSCAFG00000031801	RPP30	91	57.143	Canis_familiaris
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	57.143	ENSCAFG00020000258	RPP30	91	57.143	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	58.650	ENSCHIG00000012901	RPP30	91	58.650	Capra_hircus
ENSXCOG00000017864	rpp30	98	52.206	ENSTSYG00000013903	RPP30	91	55.918	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000017864	rpp30	79	39.070	ENSCAPG00000001326	RPP30	87	42.105	Cavia_aperea
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	54.286	ENSCPOG00000033174	RPP30	91	54.286	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000017864	rpp30	99	52.688	ENSCCAG00000029514	RPP30	96	54.651	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	54.651	ENSCATG00000042072	RPP30	96	54.651	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	54.286	ENSCLAG00000008595	RPP30	91	54.286	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	54.651	ENSCSAG00000006694	RPP30	96	54.651	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000017864	rpp30	54	36.905	ENSCHOG00000007023	-	65	36.905	Choloepus_hoffmanni
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	55.512	ENSCPBG00000026518	RPP30	94	55.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000017864	rpp30	53	49.315	ENSCING00000019714	-	93	38.000	Ciona_intestinalis
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	39.921	ENSCSAVG00000011282	-	84	39.921	Ciona_savignyi
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	54.651	ENSCANG00000041084	RPP30	96	54.651	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	46.124	ENSCGRG00001000834	-	96	46.124	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000017864	rpp30	85	53.648	ENSCGRG00001017068	-	97	53.648	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	46.512	ENSCGRG00000006196	-	96	46.512	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	53.101	ENSCGRG00000002508	-	96	53.101	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	67.769	ENSCSEG00000001779	rpp30	83	67.769	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	81.818	ENSCVAG00000003139	rpp30	96	79.767	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000017864	rpp30	92	64.777	ENSDARG00000027428	rpp30	92	64.777	Danio_rerio
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	55.510	ENSDNOG00000010186	RPP30	84	55.510	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	55.918	ENSDORG00000015333	Rpp30	91	55.918	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000017864	rpp30	95	54.511	ENSETEG00000018823	RPP30	99	54.511	Echinops_telfairi
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	56.327	ENSEASG00005011050	RPP30	91	56.327	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	58.403	ENSECAG00000021917	RPP30	91	58.403	Equus_caballus
ENSXCOG00000017864	rpp30	87	40.167	ENSEEUG00000009986	-	91	40.167	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000017864	rpp30	92	63.563	ENSELUG00000003731	rpp30	88	63.563	Esox_lucius
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	54.902	ENSFCAG00000029073	RPP30	88	54.902	Felis_catus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	55.918	ENSFALG00000007711	RPP30	91	55.918	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	55.510	ENSFDAG00000019241	RPP30	91	55.510	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000017864	rpp30	96	79.457	ENSFHEG00000014739	rpp30	94	79.310	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	65.833	ENSGMOG00000005379	rpp30	99	65.833	Gadus_morhua
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	55.102	ENSGALG00000006486	RPP30	81	61.000	Gallus_gallus
ENSXCOG00000017864	rpp30	100	89.219	ENSGAFG00000001445	rpp30	100	89.219	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000017864	rpp30	92	70.196	ENSGACG00000010285	rpp30	91	70.196	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	54.724	ENSGAGG00000000980	RPP30	66	54.724	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	54.651	ENSGGOG00000026917	RPP30	96	54.651	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000017864	rpp30	96	74.806	ENSHBUG00000019332	rpp30	94	76.096	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	55.918	ENSHGLG00000013072	RPP30	91	55.918	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	55.918	ENSHGLG00100017798	RPP30	91	55.918	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000017864	rpp30	92	63.137	ENSHCOG00000004763	-	90	63.137	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000017864	rpp30	89	61.826	ENSIPUG00000003863	rpp30	89	61.826	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	55.510	ENSSTOG00000027002	RPP30	91	55.510	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000017864	rpp30	92	55.294	ENSJJAG00000020041	Rpp30	95	55.294	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000017864	rpp30	95	80.859	ENSKMAG00000015355	rpp30	96	80.859	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000017864	rpp30	92	65.882	ENSLBEG00000019989	rpp30	93	65.882	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000017864	rpp30	69	44.550	ENSLACG00000002534	RPP30	92	44.550	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	60.714	ENSLOCG00000000031	rpp30	94	60.714	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	56.735	ENSLAFG00000015931	RPP30	91	56.735	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	54.651	ENSMFAG00000031109	RPP30	96	54.651	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	56.400	ENSMMUG00000006628	RPP30	96	54.651	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	54.264	ENSMNEG00000033838	RPP30	96	54.264	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	54.651	ENSMLEG00000037578	RPP30	96	54.651	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000017864	rpp30	92	72.984	ENSMAMG00000010934	rpp30	92	72.984	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	76.494	ENSMZEG00005018508	-	94	76.494	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000017864	rpp30	95	47.547	ENSMGAG00000008452	RPP30	99	47.925	Meleagris_gallopavo
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	53.488	ENSMAUG00000008797	Rpp30	96	53.488	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	57.143	ENSMICG00000012019	RPP30	91	57.143	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	53.878	ENSMOCG00000016872	Rpp30	91	53.878	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000017864	rpp30	96	73.047	ENSMMOG00000009266	rpp30	98	73.047	Mola_mola
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	55.686	ENSMODG00000006863	-	95	55.686	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	46.275	ENSMODG00000009342	-	95	46.275	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000017864	rpp30	92	72.289	ENSMALG00000011718	rpp30	92	72.289	Monopterus_albus
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	52.157	MGP_CAROLIEiJ_G0022902	Rpp30	95	52.157	Mus_caroli
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	51.765	ENSMUSG00000024800	Rpp30	95	51.765	Mus_musculus
ENSXCOG00000017864	rpp30	95	51.128	MGP_PahariEiJ_G0014397	Rpp30	99	51.128	Mus_pahari
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	51.765	MGP_SPRETEiJ_G0023821	Rpp30	95	51.765	Mus_spretus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	57.959	ENSMPUG00000017258	RPP30	85	57.959	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	57.143	ENSMLUG00000017169	RPP30	91	57.143	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	55.102	ENSNGAG00000012018	-	91	55.102	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000017864	rpp30	75	48.598	ENSNGAG00000014392	-	91	48.598	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000017864	rpp30	96	69.721	ENSNBRG00000024170	-	97	69.721	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	56.400	ENSNLEG00000012383	RPP30	96	56.400	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	49.425	ENSMEUG00000015587	-	96	49.425	Notamacropus_eugenii
ENSXCOG00000017864	rpp30	51	59.155	ENSOPRG00000007367	-	100	59.155	Ochotona_princeps
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	39.592	ENSODEG00000004560	-	89	39.592	Octodon_degus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	55.102	ENSODEG00000004530	-	93	55.102	Octodon_degus
ENSXCOG00000017864	rpp30	75	75.490	ENSONIG00000019140	rpp30	100	73.430	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000017864	rpp30	95	55.039	ENSOANG00000003415	RPP30	96	55.039	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	53.061	ENSOCUG00000006896	RPP30	84	53.061	Oryctolagus_cuniculus
ENSXCOG00000017864	rpp30	99	73.063	ENSORLG00000020420	rpp30	93	73.063	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	76.984	ENSORLG00020009037	-	94	76.984	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000017864	rpp30	93	76.984	ENSORLG00015008300	rpp30	88	76.984	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000017864	rpp30	70	80.328	ENSOMEG00000012640	-	99	80.328	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	57.143	ENSOGAG00000013963	RPP30	91	57.143	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000017864	rpp30	89	53.498	ENSOARG00000015789	RPP30	90	53.498	Ovis_aries
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	54.264	ENSPPAG00000043779	RPP30	96	54.264	Pan_paniscus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	56.735	ENSPPRG00000000115	RPP30	91	56.735	Panthera_pardus
ENSXCOG00000017864	rpp30	90	56.735	ENSPTIG00000014949	RPP30	91	56.735	Panthera_tigris_altaica
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	56.000	ENSPTRG00000002742	RPP30	96	56.000	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000017864	rpp30	94	54.651	ENSPANG00000021710	RPP30	96	54.651	Papio_anubis
ENSXCOG00000017864	rpp30	54	47.887	ENSPKIG00000024858	rpp30	78	47.887	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000017864	rpp30	83	53.247	ENSPSIG00000013213	RPP30	95	53.247	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000017864	rpp30	85	54.054	ENSPMGG00000014872	rpp30	93	54.054	Periophthalmus_magnuspinnatus
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