EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000018340 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo4
Alias: fc26b07|wu:fc26b07|wu:fi43b10|zgc:55678
Full Name: exportin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 65476 bases
Position: chrKQ557222.1:4933396-4998871
Accession: ZDB-GENE-030131-3062
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000024553	CRM1_C	PF08767.11	0.00011	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000024849	-	3324	-	ENSXCOP00000024553	1107 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.410	ENSG00000132953	XPO4	92	89.610	Homo_sapiens
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.410	ENSAMEG00000014679	XPO4	92	89.610	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000018340	xpo4	98	87.260	ENSACIG00000006476	xpo4	100	87.260	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000018340	xpo4	98	86.143	ENSATEG00000001554	xpo4	92	96.930	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	74.870	ENSAPLG00000003203	XPO4	92	85.517	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	75.847	ENSACAG00000002526	XPO4	92	89.172	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	87.489	ENSACLG00000017587	xpo4	100	87.489	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000018340	xpo4	95	92.393	ENSAMXG00000005543	xpo4	91	92.393	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.043	ENSBTAG00000003710	XPO4	92	91.250	Bos_taurus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.324	ENSCJAG00000004899	XPO4	92	89.610	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000018340	xpo4	93	90.196	ENSCAFG00000007222	XPO4	100	90.196	Canis_familiaris
ENSXCOG00000018340	xpo4	51	83.393	ENSTSYG00000000346	XPO4	99	83.393	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.237	ENSCCAG00000020123	XPO4	92	89.610	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	89.610	ENSCATG00000036978	XPO4	92	89.610	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000018340	xpo4	82	83.721	ENSCSAG00000018125	XPO4	100	83.721	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000018340	xpo4	50	85.584	ENSCPBG00000020754	-	99	85.584	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000018340	xpo4	74	34.926	ENSCING00000002840	-	90	38.583	Ciona_intestinalis
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	40.845	ENSCSAVG00000008902	-	92	40.845	Ciona_savignyi
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.151	ENSCANG00000031628	XPO4	92	89.610	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	77.580	ENSCGRG00001004627	Xpo4	92	89.610	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	74.679	ENSCGRG00000015666	Xpo4	92	89.610	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000018340	xpo4	95	94.771	ENSCSEG00000009017	xpo4	92	94.771	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	82.582	ENSDARG00000010281	xpo4	92	93.464	Danio_rerio
ENSXCOG00000018340	xpo4	98	74.671	ENSDNOG00000008001	XPO4	92	90.977	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	83.550	ENSELUG00000006395	xpo4	92	90.789	Esox_lucius
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.324	ENSFCAG00000000855	XPO4	92	89.610	Felis_catus
ENSXCOG00000018340	xpo4	98	75.462	ENSFALG00000008733	XPO4	90	91.603	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.410	ENSFDAG00000017460	XPO4	92	88.961	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000018340	xpo4	98	86.328	ENSFHEG00000015300	xpo4	99	86.328	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	75.673	ENSGALG00000017132	XPO4	92	91.391	Gallus_gallus
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	91.469	ENSGAFG00000003860	xpo4	99	91.469	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	74.374	ENSGAGG00000025383	XPO4	90	84.234	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.410	ENSGGOG00000000890	XPO4	92	89.610	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	86.724	ENSHBUG00000003863	xpo4	92	96.374	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.496	ENSHGLG00000018113	XPO4	92	88.961	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.496	ENSHGLG00100011413	XPO4	92	88.961	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	81.959	ENSIPUG00000003777	xpo4	91	93.464	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.065	ENSSTOG00000010695	XPO4	92	89.610	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	86.168	ENSKMAG00000013983	xpo4	100	86.168	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000018340	xpo4	95	96.732	ENSLBEG00000014303	xpo4	91	96.732	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000018340	xpo4	93	88.229	ENSLOCG00000010910	xpo4	91	87.773	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.237	ENSLAFG00000003781	XPO4	92	89.610	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	89.610	ENSMFAG00000030414	XPO4	92	89.610	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.194	ENSMNEG00000043776	XPO4	92	89.610	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	86.454	ENSMAMG00000020520	xpo4	92	96.930	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	87.489	ENSMZEG00005019337	xpo4	100	87.489	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	74.613	ENSMICG00000004636	XPO4	97	85.348	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	74.807	ENSMOCG00000006678	Xpo4	92	87.662	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000018340	xpo4	97	96.510	ENSMMOG00000019453	xpo4	91	96.510	Mola_mola
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	89.610	ENSMODG00000008262	XPO4	92	89.610	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	91.557	ENSMALG00000018033	xpo4	91	91.557	Monopterus_albus
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	88.961	MGP_CAROLIEiJ_G0019352	Xpo4	92	88.961	Mus_caroli
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	88.961	ENSMUSG00000021952	Xpo4	92	88.961	Mus_musculus
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	88.961	MGP_PahariEiJ_G0030370	Xpo4	92	88.961	Mus_pahari
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	88.961	MGP_SPRETEiJ_G0020246	Xpo4	92	88.961	Mus_spretus
ENSXCOG00000018340	xpo4	97	82.911	ENSMPUG00000000600	XPO4	100	89.103	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000018340	xpo4	98	74.956	ENSMLUG00000012089	-	92	91.603	Myotis_lucifugus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	74.892	ENSNGAG00000014823	Xpo4	92	88.961	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000018340	xpo4	81	79.868	ENSNBRG00000011410	xpo4	84	96.078	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.324	ENSNLEG00000001816	XPO4	92	89.610	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000018340	xpo4	86	83.773	ENSOPRG00000010581	XPO4	83	83.773	Ochotona_princeps
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	86.897	ENSONIG00000015714	xpo4	99	86.897	Oreochromis_niloticus
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	84.615	ENSOANG00000009030	-	92	84.615	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	74.848	ENSOCUG00000008490	XPO4	91	87.324	Oryctolagus_cuniculus
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	89.783	ENSORLG00000013136	xpo4	100	89.964	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	89.873	ENSORLG00020009218	xpo4	100	90.054	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	89.873	ENSORLG00015012168	xpo4	100	90.054	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000018340	xpo4	94	96.850	ENSOMEG00000009492	xpo4	92	96.850	Oryzias_melastigma
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	77.450	ENSOGAG00000000048	XPO4	93	83.152	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000018340	xpo4	98	74.628	ENSOARG00000013784	XPO4	92	90.977	Ovis_aries
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.410	ENSPPAG00000031464	XPO4	92	89.610	Pan_paniscus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.237	ENSPPRG00000017050	XPO4	92	89.610	Panthera_pardus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.237	ENSPANG00000001765	XPO4	92	89.610	Papio_anubis
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	93.464	ENSPKIG00000001940	xpo4	92	93.464	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000018340	xpo4	92	91.034	ENSPSIG00000006908	XPO4	100	89.103	Pelodiscus_sinensis
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	88.961	ENSPEMG00000017255	Xpo4	92	88.961	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	88.961	ENSPCIG00000000193	XPO4	92	88.961	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	87.532	ENSPFOG00000005062	xpo4	100	87.532	Poecilia_formosa
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	89.358	ENSPLAG00000001184	xpo4	100	89.358	Poecilia_latipinna
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	89.358	ENSPMEG00000016525	xpo4	100	89.358	Poecilia_mexicana
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	98.791	ENSPREG00000000899	xpo4	92	98.791	Poecilia_reticulata
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.324	ENSPPYG00000005196	XPO4	92	89.610	Pongo_abelii
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	67.472	ENSPCAG00000004580	XPO4	92	88.312	Procavia_capensis
ENSXCOG00000018340	xpo4	91	80.439	ENSPCOG00000013299	-	97	80.439	Propithecus_coquereli
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	87.489	ENSPNYG00000006605	xpo4	100	87.489	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000018340	xpo4	98	92.393	ENSPNAG00000005781	xpo4	92	92.810	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000018340	xpo4	96	88.961	ENSRNOG00000010137	Xpo4	92	88.961	Rattus_norvegicus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.324	ENSRROG00000034581	XPO4	92	89.610	Rhinopithecus_roxellana
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.324	ENSSBOG00000020841	XPO4	92	89.610	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXCOG00000018340	xpo4	87	89.796	ENSSHAG00000006069	XPO4	92	89.796	Sarcophilus_harrisii
ENSXCOG00000018340	xpo4	94	92.913	ENSSFOG00015001025	xpo4	92	92.913	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	85.591	ENSSMAG00000007828	xpo4	93	96.711	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000018340	xpo4	86	93.878	ENSSDUG00000013955	xpo4	85	93.878	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	88.435	ENSSLDG00000013233	xpo4	99	88.435	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXCOG00000018340	xpo4	98	79.659	ENSSPUG00000014529	XPO4	92	91.603	Sphenodon_punctatus
ENSXCOG00000018340	xpo4	93	91.503	ENSSSCG00000009276	XPO4	100	92.405	Sus_scrofa
ENSXCOG00000018340	xpo4	98	75.198	ENSTGUG00000011343	XPO4	92	91.603	Taeniopygia_guttata
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	87.544	ENSTRUG00000015851	xpo4	100	87.622	Takifugu_rubripes
ENSXCOG00000018340	xpo4	99	84.867	ENSTNIG00000015669	xpo4	93	92.810	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	75.086	ENSTTRG00000015597	XPO4	92	88.961	Tursiops_truncatus
ENSXCOG00000018340	xpo4	100	92.413	ENSXMAG00000014884	xpo4	100	92.413	Xiphophorus_maculatus