EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000020199 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3054 bases
Position: chrKQ557205.1:15914820-15917873
Accession: ZDB-GENE-041007-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000027044	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	2.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000027377	-	1074	-	ENSXCOP00000027044	357 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	55.665	ENSG00000105849	TWISTNB	65	53.604	Homo_sapiens
ENSXCOG00000020199	twistnb	100	66.227	ENSAPOG00000011796	twistnb	94	67.778	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000020199	twistnb	99	59.401	ENSACIG00000020400	twistnb	95	61.408	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000020199	twistnb	95	63.889	ENSAOCG00000024200	twistnb	94	67.778	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000020199	twistnb	95	67.222	ENSAPEG00000016750	twistnb	94	68.889	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000020199	twistnb	68	76.210	ENSATEG00000017956	twistnb	94	64.306	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000020199	twistnb	57	52.217	ENSACAG00000011817	TWISTNB	95	52.217	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000020199	twistnb	61	53.333	ENSANAG00000026418	TWISTNB	66	53.333	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000020199	twistnb	98	59.249	ENSACLG00000022280	twistnb	62	71.654	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000020199	twistnb	63	59.292	ENSAMXG00000035868	twistnb	74	56.800	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	55.779	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	60	55.779	Bos_taurus
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	56.650	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	66	54.222	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	57.368	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	55	57.368	Canis_familiaris
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	57.368	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	52	57.368	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	56.316	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	57	56.021	Capra_hircus
ENSXCOG00000020199	twistnb	50	59.239	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	54	59.239	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000020199	twistnb	52	58.511	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	56	58.511	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	57.143	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	60	57.143	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	58.763	ENSCGRG00001000499	Twistnb	59	58.462	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000020199	twistnb	96	75.068	ENSCVAG00000014324	twistnb	97	74.114	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000020199	twistnb	56	62.857	ENSDARG00000024416	twistnb	60	58.723	Danio_rerio
ENSXCOG00000020199	twistnb	51	59.239	ENSDNOG00000006438	-	55	59.239	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	56.650	ENSDORG00000007795	Twistnb	63	56.650	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	56.373	ENSEASG00005021702	TWISTNB	62	54.545	Equus_asinus_asinus
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	57.732	ENSECAG00000014563	TWISTNB	62	54.545	Equus_caballus
ENSXCOG00000020199	twistnb	69	63.095	ENSELUG00000000098	TWISTNB	69	63.095	Esox_lucius
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	56.701	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	58	56.701	Felis_catus
ENSXCOG00000020199	twistnb	96	81.089	ENSFHEG00000013318	twistnb	97	81.948	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000020199	twistnb	96	88.385	ENSGAFG00000018309	twistnb	97	88.952	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000020199	twistnb	69	67.480	ENSGACG00000006425	twistnb	75	78.571	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	55.665	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	65	53.604	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000020199	twistnb	98	58.981	ENSHBUG00000020155	twistnb	88	61.732	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000020199	twistnb	52	58.511	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	56	58.511	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000020199	twistnb	70	69.291	ENSHCOG00000010590	twistnb	61	69.291	Hippocampus_comes
ENSXCOG00000020199	twistnb	57	62.562	ENSIPUG00000004117	twistnb	54	62.562	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	57.732	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	53	57.732	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000020199	twistnb	51	58.696	ENSJJAG00000015887	Twistnb	57	58.696	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000020199	twistnb	99	69.022	ENSKMAG00000001591	twistnb	96	70.787	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000020199	twistnb	80	69.072	ENSLBEG00000024225	twistnb	66	74.704	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000020199	twistnb	52	62.500	ENSLACG00000010508	TWISTNB	52	62.500	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000020199	twistnb	50	66.854	ENSLOCG00000011399	twistnb	61	60.697	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	56.158	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	61	56.158	Loxodonta_africana
ENSXCOG00000020199	twistnb	98	59.249	ENSMZEG00005007561	twistnb	62	71.654	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000020199	twistnb	68	49.606	ENSMICG00000036489	TWISTNB	65	53.881	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000020199	twistnb	70	65.909	ENSMMOG00000020085	twistnb	92	57.660	Mola_mola
ENSXCOG00000020199	twistnb	95	56.787	ENSMALG00000016407	twistnb	94	56.787	Monopterus_albus
ENSXCOG00000020199	twistnb	51	59.043	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	64	55.140	Mus_caroli
ENSXCOG00000020199	twistnb	78	43.493	ENSMUSG00000020561	Twistnb	91	43.234	Mus_musculus
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	56.650	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	62	56.650	Mus_pahari
ENSXCOG00000020199	twistnb	51	58.511	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	57	58.511	Mus_spretus
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	57.732	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	60	54.378	Mustela_putorius_furo
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	58.081	ENSNGAG00000022455	Twistnb	96	58.333	Nannospalax_galili
ENSXCOG00000020199	twistnb	69	72.619	ENSNBRG00000008652	twistnb	94	61.433	Neolamprologus_brichardi
ENSXCOG00000020199	twistnb	50	59.016	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	59	56.436	Nomascus_leucogenys
ENSXCOG00000020199	twistnb	54	57.436	ENSODEG00000007222	TWISTNB	70	51.695	Octodon_degus
ENSXCOG00000020199	twistnb	96	60.870	ENSORLG00000004005	twistnb	86	61.957	Oryzias_latipes
ENSXCOG00000020199	twistnb	96	57.568	ENSORLG00020002579	twistnb	93	62.570	Oryzias_latipes_hni
ENSXCOG00000020199	twistnb	94	59.280	ENSORLG00015013403	twistnb	83	63.408	Oryzias_latipes_hsok
ENSXCOG00000020199	twistnb	50	58.696	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	61	55.024	Otolemur_garnettii
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	56.316	ENSOARG00000009803	TWISTNB	56	56.316	Ovis_aries
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	55.665	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	65	53.604	Pan_paniscus
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	56.701	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	59	56.701	Panthera_pardus
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	55.665	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	65	53.604	Pan_troglodytes
ENSXCOG00000020199	twistnb	54	57.513	ENSPANG00000015736	TWISTNB	57	57.513	Papio_anubis
ENSXCOG00000020199	twistnb	69	57.255	ENSPKIG00000025635	twistnb	69	55.118	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXCOG00000020199	twistnb	95	61.345	ENSPMGG00000019023	twistnb	59	75.893	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXCOG00000020199	twistnb	81	41.806	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	54	56.667	Phascolarctos_cinereus
ENSXCOG00000020199	twistnb	56	54.369	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	65	52.444	Pongo_abelii
ENSXCOG00000020199	twistnb	50	58.919	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	65	53.636	Propithecus_coquereli
ENSXCOG00000020199	twistnb	50	59.890	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	53	59.890	Pteropus_vampyrus
ENSXCOG00000020199	twistnb	98	59.249	ENSPNYG00000002674	twistnb	66	71.654	Pundamilia_nyererei
ENSXCOG00000020199	twistnb	55	58.209	ENSPNAG00000011956	twistnb	52	60.638	Pygocentrus_nattereri
ENSXCOG00000020199	twistnb	51	60.106	ENSRNOG00000010750	Twistnb	73	54.237	Rattus_norvegicus
ENSXCOG00000020199	twistnb	50	64.407	ENSSFOG00015012788	twistnb	56	64.407	Scleropages_formosus
ENSXCOG00000020199	twistnb	100	62.534	ENSSMAG00000012792	twistnb	94	66.572	Scophthalmus_maximus
ENSXCOG00000020199	twistnb	95	66.111	ENSSDUG00000007038	twistnb	94	66.667	Seriola_dumerili
ENSXCOG00000020199	twistnb	95	68.571	ENSSPAG00000005871	twistnb	94	68.571	Stegastes_partitus
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	56.701	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	70	50.424	Sus_scrofa
ENSXCOG00000020199	twistnb	90	56.587	ENSTNIG00000017778	twistnb	60	76.382	Tetraodon_nigroviridis
ENSXCOG00000020199	twistnb	58	53.917	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	64	53.917	Tupaia_belangeri
ENSXCOG00000020199	twistnb	50	58.696	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	58	56.853	Ursus_americanus
ENSXCOG00000020199	twistnb	50	58.152	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	58	56.345	Ursus_maritimus
ENSXCOG00000020199	twistnb	53	57.895	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	56	57.895	Vulpes_vulpes