EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXCOG00000020608 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: hrasb
Alias: hrasl|zgc:110734
Full Name: -Ha-ras Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog b
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_couchianus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9232 bases
Position: chrKQ557212.1:16011048-16020279
Accession: ZDB-GENE-050522-466
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXCOP00000027628	MMR_HSR1	PF01926.23	1.2e-05	1	1
ENSXCOP00000027629	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-05	1	1
ENSXCOP00000027630	MMR_HSR1	PF01926.23	2.6e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXCOT00000027964	-	570	-	ENSXCOP00000027629	189 (aa)	-	-
ENSXCOT00000027965	-	606	-	ENSXCOP00000027630	201 (aa)	-	-
ENSXCOT00000027963	-	423	-	ENSXCOP00000027628	140 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	32.571	ENSXCOG00000008410	si:dkey-34d22.5	73	33.333
ENSXCOG00000020608	hrasb	91	30.534	ENSXCOG00000019054	rab9a	66	32.192
ENSXCOG00000020608	hrasb	88	36.686	ENSXCOG00000010770	-	67	36.686
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	31.579	ENSXCOG00000012032	-	80	31.285
ENSXCOG00000020608	hrasb	91	32.061	ENSXCOG00000020575	RAB9A	70	33.987
ENSXCOG00000020608	hrasb	99	32.624	ENSXCOG00000002232	rab6bb	75	31.646
ENSXCOG00000020608	hrasb	84	34.746	ENSXCOG00000013226	rasd4	50	33.333
ENSXCOG00000020608	hrasb	93	32.576	ENSXCOG00000016788	rab5c	78	31.953
ENSXCOG00000020608	hrasb	91	34.010	ENSXCOG00000000469	rab33ba	82	33.503
ENSXCOG00000020608	hrasb	91	35.632	ENSXCOG00000008042	-	77	33.929
ENSXCOG00000020608	hrasb	86	38.182	ENSXCOG00000013842	rab1ab	81	38.182
ENSXCOG00000020608	hrasb	92	36.090	ENSXCOG00000020125	rab25a	90	37.500
ENSXCOG00000020608	hrasb	93	31.061	ENSXCOG00000020121	rab5aa	79	31.579
ENSXCOG00000020608	hrasb	81	32.174	ENSXCOG00000011864	rab23	60	30.769
ENSXCOG00000020608	hrasb	99	31.429	ENSXCOG00000015802	RAB41	73	32.692
ENSXCOG00000020608	hrasb	93	31.818	ENSXCOG00000006300	-	74	30.909
ENSXCOG00000020608	hrasb	86	39.157	ENSXCOG00000006807	rab39bb	78	39.157
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	64.286	ENSXCOG00000007650	rras	96	55.789
ENSXCOG00000020608	hrasb	86	30.168	ENSXCOG00000017353	rasl10a	59	31.933
ENSXCOG00000020608	hrasb	85	37.654	ENSXCOG00000001357	rab11a	57	36.667
ENSXCOG00000020608	hrasb	83	41.379	ENSXCOG00000019281	rheb	75	38.971
ENSXCOG00000020608	hrasb	85	36.420	ENSXCOG00000004226	rab11al	69	35.333
ENSXCOG00000020608	hrasb	98	31.655	ENSXCOG00000004227	rab25b	78	30.723
ENSXCOG00000020608	hrasb	92	36.316	ENSXCOG00000018683	zgc:101559	81	36.316
ENSXCOG00000020608	hrasb	86	36.585	ENSXCOG00000010695	zgc:171927	89	35.519
ENSXCOG00000020608	hrasb	86	32.231	ENSXCOG00000006259	rab6a	75	31.646
ENSXCOG00000020608	hrasb	69	65.625	ENSXCOG00000011229	rras2	90	53.988
ENSXCOG00000020608	hrasb	83	34.568	ENSXCOG00000019921	rab7a	73	33.775
ENSXCOG00000020608	hrasb	91	30.899	ENSXCOG00000003137	nkiras1	56	31.481
ENSXCOG00000020608	hrasb	86	31.200	ENSXCOG00000009094	rab9b	76	31.373
ENSXCOG00000020608	hrasb	87	33.529	ENSXCOG00000013344	rab33a	60	33.529
ENSXCOG00000020608	hrasb	85	33.537	ENSXCOG00000003428	rab42a	69	34.437
ENSXCOG00000020608	hrasb	93	36.158	ENSXCOG00000019533	rab13	94	36.158
ENSXCOG00000020608	hrasb	84	35.593	ENSXCOG00000009194	-	77	33.962
ENSXCOG00000020608	hrasb	91	35.632	ENSXCOG00000009190	-	74	34.568
ENSXCOG00000020608	hrasb	100	90.714	ENSXCOG00000020508	kras	100	90.714

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSG00000174775	HRAS	94	97.740	Homo_sapiens
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSAPOG00000023684	hrasb	94	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSAMEG00000010515	HRAS	70	96.045	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSACIG00000000699	hrasb	94	100.000	Amphilophus_citrinellus
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSAOCG00000011843	hrasb	94	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSAPEG00000009546	hrasb	94	100.000	Amphiprion_percula
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSATEG00000020001	hrasb	94	100.000	Anabas_testudineus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	ENSAPLG00000012248	HRAS	100	98.780	Anas_platyrhynchos
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	ENSACAG00000014920	HRAS	94	99.435	Anolis_carolinensis
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSANAG00000034201	HRAS	94	97.740	Aotus_nancymaae
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	99.412	ENSACLG00000001181	hrasb	94	99.435	Astatotilapia_calliptera
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSAMXG00000033907	hrasb	94	98.870	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSAMXG00000035885	hrasa	94	100.000	Astyanax_mexicanus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	93.130	ENSBTAG00000046644	HRAS	94	94.915	Bos_taurus
ENSXCOG00000020608	hrasb	89	88.000	WBGene00002335	let-60	98	79.444	Caenorhabditis_elegans
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSCJAG00000012199	HRAS	94	97.740	Callithrix_jacchus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSCAFG00000031029	HRAS	60	97.333	Canis_familiaris
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSCAFG00020007059	HRAS	89	97.351	Canis_lupus_dingo
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	93.893	ENSCHIG00000004808	HRAS	94	95.480	Capra_hircus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSTSYG00000003745	HRAS	94	97.740	Carlito_syrichta
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	93.893	ENSCAPG00000000745	HRAS	94	97.175	Cavia_aperea
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	93.893	ENSCPOG00000000101	HRAS	94	97.175	Cavia_porcellus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSCCAG00000031453	HRAS	94	97.740	Cebus_capucinus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSCATG00000031194	HRAS	94	97.740	Cercocebus_atys
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSCLAG00000002823	HRAS	94	97.175	Chinchilla_lanigera
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSCSAG00000011033	HRAS	94	97.740	Chlorocebus_sabaeus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	ENSCPBG00000013941	-	94	98.305	Chrysemys_picta_bellii
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSCANG00000017827	HRAS	94	97.740	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSCGRG00001018735	Hras	94	97.740	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSCGRG00000010918	Hras	94	97.740	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSCSEG00000007927	hrasb	94	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	ENSCVAG00000008670	hrasb	94	99.435	Cyprinodon_variegatus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	89.313	ENSDARG00000013161	zgc:55558	100	83.770	Danio_rerio
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSDARG00000005651	hrasb	100	100.000	Danio_rerio
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	ENSDARG00000098497	hrasa	94	98.870	Danio_rerio
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	ENSDNOG00000015293	HRAS	94	97.740	Dasypus_novemcinctus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSDORG00000028079	Hras	94	97.740	Dipodomys_ordii
ENSXCOG00000020608	hrasb	89	88.800	FBgn0003205	Ras85D	96	81.215	Drosophila_melanogaster
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSETEG00000019899	HRAS	94	96.610	Echinops_telfairi
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSEBUG00000004670	hrasb	91	95.349	Eptatretus_burgeri
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSECAG00000008473	HRAS	94	96.045	Equus_caballus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	93.130	ENSEEUG00000014548	HRAS	87	96.000	Erinaceus_europaeus
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSELUG00000004712	HRAS	94	100.000	Esox_lucius
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSFCAG00000002990	HRAS	94	96.045	Felis_catus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	ENSFALG00000012145	HRAS	94	98.870	Ficedula_albicollis
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSFDAG00000006760	HRAS	94	97.740	Fukomys_damarensis
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSFHEG00000010055	hrasb	94	99.435	Fundulus_heteroclitus
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	98.824	ENSGMOG00000010196	hrasb	95	98.870	Gadus_morhua
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	ENSGALG00000029260	H-RAS	94	98.870	Gallus_gallus
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSGAFG00000021814	hrasb	94	100.000	Gambusia_affinis
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSGACG00000011340	hrasb	94	100.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	ENSGAGG00000019886	-	94	98.305	Gopherus_agassizii
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	93.893	ENSGGOG00000015438	HRAS	94	97.175	Gorilla_gorilla
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	99.412	ENSHBUG00000011998	hrasb	94	99.435	Haplochromis_burtoni
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSHGLG00000004508	HRAS	94	97.175	Heterocephalus_glaber_female
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSHGLG00100012888	HRAS	94	97.175	Heterocephalus_glaber_male
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSIPUG00000022502	hrasb	94	98.870	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	99.412	ENSIPUG00000006053	hras	94	99.435	Ictalurus_punctatus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSSTOG00000021206	HRAS	94	97.740	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSJJAG00000022529	-	94	97.175	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSJJAG00000011743	-	93	87.571	Jaculus_jaculus
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSKMAG00000001922	Ha-ras	94	100.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSLBEG00000001905	hrasb	94	100.000	Labrus_bergylta
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSLACG00000018427	HRAS	94	97.740	Latimeria_chalumnae
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSLOCG00000000684	hrasb	94	100.000	Lepisosteus_oculatus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSMFAG00000039003	HRAS	94	97.740	Macaca_fascicularis
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSMMUG00000021659	HRAS	94	97.740	Macaca_mulatta
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSMNEG00000039358	HRAS	94	97.740	Macaca_nemestrina
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSMLEG00000042070	HRAS	94	97.740	Mandrillus_leucophaeus
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSMAMG00000004359	hrasb	94	100.000	Mastacembelus_armatus
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	99.412	ENSMZEG00005017583	hrasb	94	99.435	Maylandia_zebra
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSMAUG00000020006	Hras	94	97.740	Mesocricetus_auratus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSMICG00000006472	HRAS	94	97.175	Microcebus_murinus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSMOCG00000000744	Hras	94	97.740	Microtus_ochrogaster
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	ENSMODG00000016580	HRAS	71	99.333	Monodelphis_domestica
ENSXCOG00000020608	hrasb	90	100.000	ENSMALG00000011273	hrasb	94	100.000	Monopterus_albus
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	MGP_CAROLIEiJ_G0030681	Hras	94	97.175	Mus_caroli
ENSXCOG00000020608	hrasb	94	94.656	ENSMUSG00000025499	Hras	94	97.740	Mus_musculus
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ENSXCOG00000020608	hrasb	89	98.400	MGP_SPRETEiJ_G0031792	-	94	87.006	Mus_spretus
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