EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000001638 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ehd1
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis EH domain containing 1 (ehd1)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24288 bases
Position: chrGL172932.1:1468223-1492510
Accession: NM_001006733
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000003457	MMR_HSR1	PF01926.23	5.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000003457	-	1698	-	ENSXETP00000003457	534 (aa)	-	Q6DIP4

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000001638's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000001638's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000001638	ehd1	99	73.872	ENSXETG00000002783	ehd2	99	73.872
ENSXETG00000001638	ehd1	66	33.333	ENSXETG00000017313	srl	80	33.333
ENSXETG00000001638	ehd1	99	86.278	ENSXETG00000022070	ehd3	99	86.278
ENSXETG00000001638	ehd1	99	77.444	ENSXETG00000015794	ehd4	99	77.444

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSG00000110047	EHD1	100	99.383	Homo_sapiens
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.538	ENSAPOG00000013440	ehd1a	98	86.538	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.199	ENSAMEG00000017785	EHD1	96	91.199	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.538	ENSACIG00000022182	ehd1a	98	86.538	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	ENSAOCG00000016322	ehd1a	98	86.346	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	ENSAPEG00000010363	ehd1a	98	86.346	Amphiprion_percula
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.731	ENSATEG00000013980	ehd1a	98	86.731	Anabas_testudineus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSANAG00000034810	EHD1	100	91.760	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	ENSACLG00000016016	ehd1a	98	86.346	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000001638	ehd1	100	82.210	ENSAMXG00000031892	-	100	82.210	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	85.206	ENSAMXG00000039344	ehd1a	99	85.206	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	92.135	ENSBTAG00000050712	EHD1	100	92.135	Bos_taurus
ENSXETG00000001638	ehd1	99	67.037	WBGene00004373	rme-1	97	67.037	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSCJAG00000002660	EHD1	100	91.760	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000001638	ehd1	79	91.038	ENSCAFG00000014128	EHD1	92	90.783	Canis_familiaris
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSCAFG00020014846	EHD1	100	91.573	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000001638	ehd1	100	92.135	ENSCHIG00000020707	-	100	92.135	Capra_hircus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSCPOG00000008157	EHD1	100	91.760	Cavia_porcellus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSCCAG00000004590	EHD1	100	91.760	Cebus_capucinus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.386	ENSCATG00000010658	EHD1	97	91.386	Cercocebus_atys
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSCLAG00000016412	EHD1	100	91.760	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSCSAG00000007397	EHD1	100	91.573	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000001638	ehd1	99	88.847	ENSCPBG00000023692	EHD1	98	88.847	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSCANG00000042123	EHD1	100	91.573	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.386	ENSCGRG00001019701	Ehd1	100	91.386	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000001638	ehd1	94	90.873	ENSCGRG00000000662	Ehd1	100	90.873	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000001638	ehd1	97	84.231	ENSCSEG00000006078	ehd1a	98	84.231	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.923	ENSCVAG00000012152	ehd1a	98	86.923	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000001638	ehd1	99	86.064	ENSDARG00000014793	ehd1b	99	86.064	Danio_rerio
ENSXETG00000001638	ehd1	99	85.150	ENSDARG00000098853	ehd1a	99	85.150	Danio_rerio
ENSXETG00000001638	ehd1	67	92.222	ENSDNOG00000017834	EHD1	96	92.222	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.386	ENSDORG00000030186	Ehd1	100	91.386	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000001638	ehd1	99	68.598	FBgn0016693	Past1	99	68.598	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000001638	ehd1	99	76.262	ENSEBUG00000009968	EHD1	99	76.262	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000001638	ehd1	57	81.699	ENSEBUG00000010829	EHD1	89	81.699	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSEASG00005018250	EHD1	100	91.760	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSECAG00000011638	EHD1	100	91.760	Equus_caballus
ENSXETG00000001638	ehd1	98	84.895	ENSELUG00000007973	-	98	84.895	Esox_lucius
ENSXETG00000001638	ehd1	99	86.364	ENSELUG00000016093	ehd1b	99	86.364	Esox_lucius
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.948	ENSFCAG00000027734	EHD1	97	91.948	Felis_catus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSFDAG00000007697	EHD1	100	91.760	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.731	ENSFHEG00000002690	ehd1a	98	86.731	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	ENSGMOG00000012192	ehd1a	99	86.346	Gadus_morhua
ENSXETG00000001638	ehd1	98	87.356	ENSGAFG00000000730	ehd1a	98	87.356	Gambusia_affinis
ENSXETG00000001638	ehd1	97	85.769	ENSGACG00000017605	ehd1a	98	85.769	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	89.139	ENSGAGG00000001677	-	92	89.139	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	ENSHBUG00000012087	ehd1a	98	86.346	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSHGLG00000010254	EHD1	100	91.573	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSHGLG00100014206	EHD1	100	91.573	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.538	ENSHCOG00000006825	ehd1a	98	86.538	Hippocampus_comes
ENSXETG00000001638	ehd1	100	85.581	ENSIPUG00000002819	ehd1a	99	85.581	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000001638	ehd1	99	83.051	ENSIPUG00000017390	EHD1	99	83.051	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.386	ENSSTOG00000009829	EHD1	100	91.386	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSJJAG00000022299	Ehd1	100	91.760	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000001638	ehd1	97	85.962	ENSKMAG00000004764	ehd1a	98	85.962	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	ENSLBEG00000004390	ehd1a	98	86.346	Labrus_bergylta
ENSXETG00000001638	ehd1	100	88.993	ENSLACG00000018148	EHD1	100	88.993	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000001638	ehd1	99	80.038	ENSLOCG00000000924	ehd1b	96	80.038	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	89.139	ENSLAFG00000011643	EHD1	100	89.139	Loxodonta_africana
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSMFAG00000032608	EHD1	100	91.573	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSMMUG00000003972	EHD1	97	91.573	Macaca_mulatta
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSMNEG00000031673	EHD1	100	91.573	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSMLEG00000031992	EHD1	100	91.573	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.923	ENSMAMG00000021737	ehd1a	98	86.923	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	ENSMZEG00005004305	ehd1a	98	86.346	Maylandia_zebra
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.386	ENSMAUG00000013823	Ehd1	100	91.386	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSMICG00000001239	EHD1	99	90.971	Microcebus_murinus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSMOCG00000015517	Ehd1	100	91.573	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000001638	ehd1	98	86.372	ENSMMOG00000003005	ehd1a	98	86.372	Mola_mola
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.731	ENSMALG00000012679	ehd1a	98	86.731	Monopterus_albus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.386	MGP_CAROLIEiJ_G0022603	Ehd1	100	91.386	Mus_caroli
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.386	ENSMUSG00000024772	Ehd1	100	91.386	Mus_musculus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.199	MGP_PahariEiJ_G0014097	Ehd1	100	91.199	Mus_pahari
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.386	MGP_SPRETEiJ_G0023514	Ehd1	100	91.386	Mus_spretus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.386	ENSMPUG00000012497	EHD1	100	91.386	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSNGAG00000020358	Ehd1	100	91.573	Nannospalax_galili
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.154	ENSNBRG00000002933	ehd1a	98	86.154	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSNLEG00000005375	EHD1	100	91.573	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000001638	ehd1	100	90.637	ENSOPRG00000011350	EHD1	100	90.637	Ochotona_princeps
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSODEG00000014527	EHD1	100	91.760	Octodon_degus
ENSXETG00000001638	ehd1	61	94.136	ENSOCUG00000029532	EHD1	96	94.136	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.538	ENSORLG00000022561	ehd1a	98	86.538	Oryzias_latipes
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.346	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	ENSORLG00015017672	ehd1a	98	86.346	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.154	ENSOMEG00000019329	ehd1a	98	86.154	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSOGAG00000009351	EHD1	100	91.573	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000001638	ehd1	91	92.623	ENSOARG00000010447	EHD1	99	92.623	Ovis_aries
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSPPAG00000037178	EHD1	100	91.573	Pan_paniscus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	89.700	ENSPPRG00000006031	EHD1	97	89.700	Panthera_pardus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSPTRG00000003851	EHD1	97	91.573	Pan_troglodytes
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSPANG00000023358	EHD1	97	91.573	Papio_anubis
ENSXETG00000001638	ehd1	98	86.641	ENSPKIG00000023165	-	99	86.641	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000001638	ehd1	67	89.444	ENSPKIG00000020297	-	88	89.444	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000001638	ehd1	100	89.888	ENSPSIG00000005727	EHD1	100	89.888	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000001638	ehd1	99	85.633	ENSPMGG00000017810	ehd1a	98	85.797	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSPEMG00000010917	Ehd1	100	91.573	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.199	ENSPCIG00000014850	EHD1	100	91.199	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000001638	ehd1	73	70.513	ENSPCIG00000017053	-	96	70.513	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000001638	ehd1	98	86.782	ENSPFOG00000010613	ehd1a	97	86.782	Poecilia_formosa
ENSXETG00000001638	ehd1	98	86.782	ENSPLAG00000023296	ehd1a	98	86.782	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000001638	ehd1	98	86.973	ENSPMEG00000003397	ehd1a	98	86.973	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000001638	ehd1	98	86.782	ENSPREG00000015893	ehd1a	98	86.782	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSPPYG00000003093	EHD1	100	91.573	Pongo_abelii
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSPCOG00000010309	EHD1	99	91.573	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.011	ENSPVAG00000007890	EHD1	100	91.011	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.346	ENSPNYG00000015448	ehd1a	98	86.346	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000001638	ehd1	99	85.311	ENSPNAG00000007408	EHD1	99	85.311	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000001638	ehd1	100	85.768	ENSPNAG00000023091	ehd1a	99	85.768	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.386	ENSRNOG00000043503	Ehd1	100	91.386	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSRBIG00000039111	EHD1	100	91.573	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSRROG00000026366	EHD1	100	91.573	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.760	ENSSBOG00000023399	EHD1	100	91.760	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000001638	ehd1	75	69.077	ENSSHAG00000007430	-	96	66.667	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000001638	ehd1	99	86.629	ENSSFOG00015006481	-	99	86.629	Scleropages_formosus
ENSXETG00000001638	ehd1	92	86.708	ENSSFOG00015019587	EHD1	100	86.708	Scleropages_formosus
ENSXETG00000001638	ehd1	97	85.962	ENSSMAG00000018210	ehd1a	98	85.962	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.923	ENSSDUG00000016436	ehd1a	98	86.923	Seriola_dumerili
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.923	ENSSLDG00000015328	ehd1a	98	86.923	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.731	ENSSPAG00000008682	ehd1a	98	86.731	Stegastes_partitus
ENSXETG00000001638	ehd1	99	92.105	ENSSSCG00000013017	EHD1	99	92.105	Sus_scrofa
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.731	ENSTRUG00000025890	ehd1a	98	86.731	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000001638	ehd1	97	86.154	ENSTNIG00000016792	ehd1a	97	86.154	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000001638	ehd1	78	82.734	ENSTBEG00000007057	EHD1	100	82.734	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSTTRG00000008887	EHD1	100	91.573	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSUAMG00000012071	EHD1	100	91.573	Ursus_americanus
ENSXETG00000001638	ehd1	98	90.476	ENSUMAG00000007890	EHD1	99	90.476	Ursus_maritimus
ENSXETG00000001638	ehd1	100	91.573	ENSVVUG00000027552	EHD1	84	91.573	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000001638	ehd1	99	85.902	ENSXCOG00000001781	ehd1a	99	85.902	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000001638	ehd1	98	86.973	ENSXMAG00000005301	ehd1a	98	86.973	Xiphophorus_maculatus