EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000002208 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis poly(A) polymerase gamma (papolg)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18599 bases
Position: chrGL173131.1:202499-221097
Accession: NM_001005684
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000004695	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.1e-27	1	2
ENSXETP00000004695	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.1e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000004695	-	2626	-	ENSXETP00000004695	753 (aa)	-	F6PZK2

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000002208's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000002208's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000002208	papolg	98	58.681	ENSXETG00000013949	papola	99	58.177

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000002208	papolg	100	75.066	ENSG00000115421	PAPOLG	100	87.179	Homo_sapiens
ENSXETG00000002208	papolg	100	68.470	ENSAPOG00000004798	papolg	99	66.446	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000002208	papolg	98	76.152	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	98	76.152	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.313	ENSACIG00000010546	papolg	99	66.446	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000002208	papolg	100	68.470	ENSAOCG00000010254	papolg	89	68.470	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000002208	papolg	100	68.470	ENSAPEG00000006944	papolg	89	68.470	Amphiprion_percula
ENSXETG00000002208	papolg	100	69.029	ENSATEG00000009007	papolg	78	83.976	Anabas_testudineus
ENSXETG00000002208	papolg	99	70.306	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	70.306	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000002208	papolg	81	60.650	ENSACAG00000015048	-	100	60.650	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.536	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	74.536	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.839	ENSACLG00000015592	papolg	89	67.097	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000002208	papolg	100	69.935	ENSAMXG00000004611	papolg	100	69.935	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	74.403	Bos_taurus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.934	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	74.934	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.668	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	74.668	Canis_familiaris
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.177	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	74.177	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	74.403	Capra_hircus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	74.403	Carlito_syrichta
ENSXETG00000002208	papolg	51	80.315	ENSCAPG00000014901	-	100	80.315	Cavia_aperea
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.005	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	74.005	Cavia_porcellus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.801	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	74.801	Cebus_capucinus
ENSXETG00000002208	papolg	91	80.519	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	80.519	Cercocebus_atys
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	74.403	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.934	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	74.934	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000002208	papolg	89	74.107	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	74.107	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000002208	papolg	64	64.523	ENSCING00000024664	-	90	64.523	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000002208	papolg	64	64.959	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.959	Ciona_savignyi
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.934	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	74.934	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000002208	papolg	98	74.661	ENSCGRG00001014951	Papolg	99	74.661	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000002208	papolg	98	74.661	ENSCGRG00000005552	-	99	74.661	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000002208	papolg	73	80.292	ENSCSEG00000000771	papolg	99	67.857	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000002208	papolg	100	64.545	ENSCVAG00000016602	papolg	88	83.198	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000002208	papolg	100	70.196	ENSDARG00000012141	papolg	100	70.196	Danio_rerio
ENSXETG00000002208	papolg	100	72.414	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	72.414	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000002208	papolg	57	85.082	ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.082	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000002208	papolg	99	61.208	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	61.477	Echinops_telfairi
ENSXETG00000002208	papolg	64	56.405	ENSEBUG00000005042	-	82	56.405	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000002208	papolg	58	70.390	ENSEBUG00000004020	papolg	92	68.238	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	74.403	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	ENSECAG00000009859	PAPOLG	97	75.474	Equus_caballus
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.313	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	66.313	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000002208	papolg	99	70.014	ENSELUG00000014497	papolg	96	70.183	Esox_lucius
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.934	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	74.934	Felis_catus
ENSXETG00000002208	papolg	98	63.503	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	63.503	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	74.403	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000002208	papolg	67	60.784	ENSFHEG00000019080	papolg	90	60.784	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000002208	papolg	87	78.058	ENSGMOG00000018772	papolg	94	78.058	Gadus_morhua
ENSXETG00000002208	papolg	100	68.435	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	68.435	Gallus_gallus
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.273	ENSGAFG00000003263	papolg	89	67.104	Gambusia_affinis
ENSXETG00000002208	papolg	100	68.302	ENSGACG00000002718	papolg	100	68.302	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000002208	papolg	100	75.066	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	75.066	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.839	ENSHBUG00000004882	papolg	89	67.010	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000002208	papolg	98	75.339	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	98	75.339	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.271	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	74.271	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000002208	papolg	100	67.593	ENSHCOG00000006782	papolg	89	67.593	Hippocampus_comes
ENSXETG00000002208	papolg	100	70.976	ENSIPUG00000021642	papolg	100	70.993	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.271	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	74.271	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000002208	papolg	57	84.382	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	84.382	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000002208	papolg	100	67.448	ENSKMAG00000016439	papolg	97	65.274	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000002208	papolg	99	66.115	ENSLBEG00000023218	papolg	89	66.879	Labrus_bergylta
ENSXETG00000002208	papolg	98	68.464	ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	68.464	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000002208	papolg	100	70.404	ENSLOCG00000016130	papolg	100	70.404	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000002208	papolg	100	73.942	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.082	Loxodonta_africana
ENSXETG00000002208	papolg	100	75.066	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	75.066	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000002208	papolg	100	75.066	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	75.066	Macaca_mulatta
ENSXETG00000002208	papolg	100	68.116	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	68.116	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000002208	papolg	100	75.066	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	75.066	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000002208	papolg	100	68.734	ENSMAMG00000010667	papolg	99	66.313	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.839	ENSMZEG00005018140	papolg	99	67.925	Maylandia_zebra
ENSXETG00000002208	papolg	99	67.867	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	99	67.867	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000002208	papolg	98	75.068	ENSMAUG00000009088	Papolg	98	75.068	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.934	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	74.934	Microcebus_murinus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.138	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	74.138	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000002208	papolg	100	68.553	ENSMMOG00000008020	papolg	99	68.553	Mola_mola
ENSXETG00000002208	papolg	99	75.834	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	75.834	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000002208	papolg	100	68.602	ENSMALG00000007012	papolg	89	68.602	Monopterus_albus
ENSXETG00000002208	papolg	100	73.475	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	85.047	Mus_caroli
ENSXETG00000002208	papolg	100	73.342	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.047	Mus_musculus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.138	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	99	75.203	Mus_pahari
ENSXETG00000002208	papolg	100	73.342	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.047	Mus_spretus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.668	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	74.668	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000002208	papolg	98	75.203	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	98	75.203	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.138	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	74.138	Nannospalax_galili
ENSXETG00000002208	papolg	99	61.854	ENSNBRG00000011943	papolg	99	62.169	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000002208	papolg	57	84.848	ENSNLEG00000009507	-	100	84.848	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000002208	papolg	81	66.207	ENSMEUG00000013605	-	87	66.207	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.005	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	74.005	Ochotona_princeps
ENSXETG00000002208	papolg	55	83.654	ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	83.654	Octodon_degus
ENSXETG00000002208	papolg	100	62.286	ENSONIG00000002985	papolg	100	62.418	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000002208	papolg	99	76.133	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	76.133	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	74.403	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000002208	papolg	100	67.016	ENSORLG00000001577	papolg	89	67.277	Oryzias_latipes
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.754	ENSORLG00020002482	papolg	89	67.277	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.754	ENSORLG00015008836	papolg	89	67.016	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000002208	papolg	100	67.890	ENSOMEG00000001406	papolg	89	67.890	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000002208	papolg	59	66.817	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	66.817	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.403	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	74.403	Ovis_aries
ENSXETG00000002208	papolg	100	75.066	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	75.066	Pan_paniscus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.934	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	74.934	Panthera_pardus
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.801	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	74.801	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000002208	papolg	100	75.066	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	75.066	Pan_troglodytes
ENSXETG00000002208	papolg	100	71.429	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	71.429	Papio_anubis
ENSXETG00000002208	papolg	93	68.458	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	68.458	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000002208	papolg	99	69.241	ENSPKIG00000003313	papolg	99	69.241	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000002208	papolg	99	72.727	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	72.727	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000002208	papolg	98	75.068	ENSPEMG00000008960	-	99	75.068	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000002208	papolg	99	51.828	ENSPMAG00000002961	papolg	99	51.828	Petromyzon_marinus
ENSXETG00000002208	papolg	65	63.580	ENSPMAG00000004864	-	96	63.580	Petromyzon_marinus
ENSXETG00000002208	papolg	100	75.926	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	75.926	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.667	ENSPFOG00000012909	papolg	99	66.798	Poecilia_formosa
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.798	ENSPLAG00000018445	papolg	89	67.235	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.317	ENSPMEG00000003961	papolg	89	66.885	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000002208	papolg	100	65.882	ENSPREG00000010358	papolg	89	66.449	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.801	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	74.801	Pongo_abelii
ENSXETG00000002208	papolg	98	66.981	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	66.981	Procavia_capensis
ENSXETG00000002208	papolg	100	67.109	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	67.639	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000002208	papolg	86	81.967	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.967	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000002208	papolg	100	67.109	ENSPNYG00000006729	papolg	99	67.109	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000002208	papolg	100	69.622	ENSPNAG00000015521	papolg	100	69.622	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.005	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	74.005	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000002208	papolg	100	70.690	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	70.690	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000002208	papolg	100	75.066	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	75.066	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.801	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	74.801	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000002208	papolg	94	75.843	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	75.843	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000002208	papolg	100	60.265	ENSSFOG00015011874	papolg	100	60.265	Scleropages_formosus
ENSXETG00000002208	papolg	100	66.535	ENSSFOG00015002383	papolg	100	66.535	Scleropages_formosus
ENSXETG00000002208	papolg	72	81.181	ENSSMAG00000015598	papolg	93	66.879	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000002208	papolg	100	67.942	ENSSDUG00000000912	papolg	99	66.180	Seriola_dumerili
ENSXETG00000002208	papolg	100	67.942	ENSSLDG00000001217	papolg	99	63.311	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000002208	papolg	100	72.185	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	72.185	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000002208	papolg	100	67.704	ENSSPAG00000009004	papolg	99	65.918	Stegastes_partitus
ENSXETG00000002208	papolg	100	75.332	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	75.332	Sus_scrofa
ENSXETG00000002208	papolg	72	74.444	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	74.444	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000002208	papolg	100	67.593	ENSTRUG00000006410	papolg	99	67.593	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000002208	papolg	100	62.958	ENSTNIG00000017106	papolg	100	62.958	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000002208	papolg	98	69.377	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	99	69.377	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000002208	papolg	100	70.557	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	70.557	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000002208	papolg	98	76.152	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	99	76.152	Ursus_americanus
ENSXETG00000002208	papolg	98	76.152	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	89	76.152	Ursus_maritimus
ENSXETG00000002208	papolg	98	72.222	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	72.222	Vicugna_pacos
ENSXETG00000002208	papolg	100	74.668	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	74.668	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000002208	papolg	65	82.996	ENSXCOG00000006611	papolg	73	82.996	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000002208	papolg	70	80.606	ENSXMAG00000007383	papolg	88	80.606	Xiphophorus_maculatus