EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000002224 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo1
Alias: -
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 34838 bases
Position: chrGL173131.1:514476-549313
Accession: XB-GENE-993240
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000004732	CRM1_C	PF08767.11	2.1e-135	1	1
ENSXETP00000004732	Xpo1	PF08389.12	8.9e-37	1	1
ENSXETP00000004732	IBN_N	PF03810.19	2.3e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000004732	-	3347	-	ENSXETP00000004732	1071 (aa)	-	F7EP94

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.892	ENSAPOG00000004984	-	100	95.892	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000002224	xpo1	88	89.894	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	89.894	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.948	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	97.948	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000002224	xpo1	88	92.234	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.234	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000002224	xpo1	88	96.170	ENSACIG00000010818	-	100	96.170	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.985	ENSAOCG00000010121	-	100	95.985	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.503	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.503	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.985	ENSAPEG00000007038	-	100	95.985	Amphiprion_percula
ENSXETG00000002224	xpo1	91	91.967	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	91.967	Amphiprion_percula
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.317	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.317	Anabas_testudineus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.985	ENSATEG00000008816	-	100	95.985	Anabas_testudineus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.133	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	98.133	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.946	ENSACAG00000002501	XPO1	100	97.946	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSANAG00000020802	XPO1	100	97.106	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000002224	xpo1	88	92.447	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.447	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.892	ENSACLG00000015192	-	100	95.892	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.078	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.078	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000002224	xpo1	88	93.220	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.220	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	98.039	Bos_taurus
ENSXETG00000002224	xpo1	99	51.201	WBGene00002078	xpo-1	99	51.721	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	97.106	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	98.039	Canis_familiaris
ENSXETG00000002224	xpo1	93	97.791	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	97.791	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	98.039	Capra_hircus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	98.039	Carlito_syrichta
ENSXETG00000002224	xpo1	53	93.262	ENSCAPG00000006454	-	100	93.262	Cavia_aperea
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.545	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	96.545	Cavia_porcellus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	78.571	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	78.757	Cebus_capucinus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.345	ENSCATG00000032674	XPO1	100	96.809	Cercocebus_atys
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.759	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	97.759	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	97.106	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000002224	xpo1	83	98.703	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.703	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.226	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	98.226	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000002224	xpo1	100	80.633	ENSCING00000024562	-	100	80.633	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000002224	xpo1	99	79.645	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.645	Ciona_savignyi
ENSXETG00000002224	xpo1	100	92.904	ENSCANG00000028883	XPO1	100	96.809	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.825	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	96.825	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.825	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	96.825	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000002224	xpo1	87	95.284	ENSCSEG00000001693	XPO1	99	95.284	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000002224	xpo1	100	90.476	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	90.476	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.518	ENSCVAG00000016788	-	100	95.518	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.359	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.359	Danio_rerio
ENSXETG00000002224	xpo1	100	92.624	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	94.737	Danio_rerio
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.133	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	98.133	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000002224	xpo1	92	95.297	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.297	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000002224	xpo1	99	70.318	FBgn0020497	emb	99	70.318	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000002224	xpo1	94	97.048	ENSETEG00000018045	XPO1	94	97.048	Echinops_telfairi
ENSXETG00000002224	xpo1	90	78.942	ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSEASG00005007223	XPO1	100	98.039	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSECAG00000024920	XPO1	100	98.039	Equus_caballus
ENSXETG00000002224	xpo1	92	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000002224	xpo1	88	94.681	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	94.681	Esox_lucius
ENSXETG00000002224	xpo1	87	92.941	ENSELUG00000014306	-	99	92.842	Esox_lucius
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	98.039	Felis_catus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.852	ENSFALG00000010989	XPO1	100	97.852	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.172	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	96.172	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000002224	xpo1	100	90.756	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	90.756	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	90.663	ENSGMOG00000019063	-	100	90.663	Gadus_morhua
ENSXETG00000002224	xpo1	100	92.250	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.250	Gadus_morhua
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.133	ENSGALG00000029476	XPO1	100	98.133	Gallus_gallus
ENSXETG00000002224	xpo1	88	92.234	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.234	Gambusia_affinis
ENSXETG00000002224	xpo1	91	95.675	ENSGAFG00000003355	-	98	95.675	Gambusia_affinis
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.130	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.130	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.705	ENSGACG00000002743	-	100	95.705	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.319	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	98.319	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	97.106	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.892	ENSHBUG00000020037	-	100	95.892	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.597	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	91.597	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.666	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	97.666	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.666	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	97.666	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000002224	xpo1	88	95.213	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.213	Hippocampus_comes
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.359	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	96.359	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	93.371	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.371	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.852	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	97.852	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.759	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	97.759	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	90.756	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	90.756	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.238	ENSKMAG00000016218	-	100	95.238	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000002224	xpo1	88	89.407	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	89.407	Labrus_bergylta
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.985	ENSLBEG00000005740	-	100	95.985	Labrus_bergylta
ENSXETG00000002224	xpo1	100	76.547	ENSLACG00000018213	XPO1	100	76.547	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.452	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.452	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	98.039	Loxodonta_africana
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	97.106	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	97.106	Macaca_mulatta
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	97.106	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.349	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	95.349	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.892	ENSMAMG00000010568	-	100	95.892	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.597	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.597	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.597	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	91.597	Maylandia_zebra
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.892	ENSMZEG00005018158	-	98	96.087	Maylandia_zebra
ENSXETG00000002224	xpo1	68	98.209	ENSMGAG00000001496	-	100	98.209	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.825	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	96.825	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSMICG00000027770	XPO1	100	98.039	Microcebus_murinus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	97.106	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000002224	xpo1	87	95.838	ENSMMOG00000008001	-	99	95.838	Mola_mola
ENSXETG00000002224	xpo1	88	92.021	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.021	Mola_mola
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.919	ENSMODG00000002831	XPO1	100	96.919	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.518	ENSMALG00000007085	-	100	95.518	Monopterus_albus
ENSXETG00000002224	xpo1	88	91.286	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	91.286	Monopterus_albus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.199	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	97.199	Mus_caroli
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.199	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	97.199	Mus_musculus
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ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.199	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	97.199	Mus_spretus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	98.039	Mustela_putorius_furo
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ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.946	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	97.946	Nannospalax_galili
ENSXETG00000002224	xpo1	96	95.257	ENSNBRG00000012229	-	100	96.277	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.597	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	91.597	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000002224	xpo1	100	93.267	ENSNLEG00000009680	XPO1	100	93.267	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000002224	xpo1	63	100.000	ENSMEUG00000013277	-	63	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000002224	xpo1	100	92.344	ENSOPRG00000012615	XPO1	100	92.344	Ochotona_princeps
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.639	ENSODEG00000012632	XPO1	100	96.639	Octodon_degus
ENSXETG00000002224	xpo1	93	95.984	ENSONIG00000002969	-	99	95.984	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	88.060	ENSONIG00000000019	xpo1a	100	88.060	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000002224	xpo1	96	97.965	ENSOANG00000012417	XPO1	100	97.965	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.946	ENSOCUG00000004986	XPO1	100	97.946	Oryctolagus_cuniculus
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ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.518	ENSORLG00020020577	-	99	95.518	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000002224	xpo1	91	95.778	ENSORLG00015008640	-	98	95.778	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000002224	xpo1	100	90.476	ENSORLG00015015414	xpo1a	100	90.476	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000002224	xpo1	88	91.383	ENSOMEG00000007343	xpo1a	100	91.383	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.612	ENSOMEG00000001384	-	100	95.851	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000002224	xpo1	100	94.320	ENSOGAG00000000143	XPO1	100	94.320	Otolemur_garnettii
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ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSPTIG00000012259	XPO1	100	98.039	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSPTRG00000011962	XPO1	100	97.106	Pan_troglodytes
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.106	ENSPANG00000006892	XPO1	100	97.106	Papio_anubis
ENSXETG00000002224	xpo1	100	93.931	ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.639	ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.592	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.677	ENSPSIG00000014457	XPO1	100	98.783	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000002224	xpo1	100	93.937	ENSPMGG00000010632	XPO1	100	93.937	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000002224	xpo1	86	91.323	ENSPMGG00000019000	XPO1	100	91.323	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.292	ENSPEMG00000010103	Xpo1	100	97.292	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000002224	xpo1	100	87.127	ENSPMAG00000001270	-	100	87.127	Petromyzon_marinus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.572	ENSPCIG00000027737	XPO1	100	97.572	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.130	ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.130	Poecilia_formosa
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.612	ENSPFOG00000013233	-	100	95.612	Poecilia_formosa
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.130	ENSPLAG00000000356	xpo1a	100	91.130	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.612	ENSPLAG00000018279	-	100	95.612	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.130	ENSPMEG00000003659	xpo1a	100	91.130	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.433	ENSPMEG00000003904	-	100	95.433	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.612	ENSPREG00000010135	-	100	95.612	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.223	ENSPREG00000020796	xpo1a	100	91.223	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000002224	xpo1	100	93.838	ENSPPYG00000012383	XPO1	100	93.838	Pongo_abelii
ENSXETG00000002224	xpo1	96	94.947	ENSPCAG00000006798	XPO1	100	94.947	Procavia_capensis
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.039	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000002224	xpo1	100	87.395	ENSPVAG00000002535	XPO1	100	87.395	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000002224	xpo1	53	88.652	ENSPNYG00000006874	-	100	88.652	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.597	ENSPNYG00000023463	xpo1a	100	91.597	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.265	ENSPNAG00000008916	xpo1b	100	96.265	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000002224	xpo1	100	93.371	ENSPNAG00000014209	xpo1a	100	93.371	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.386	ENSRNOG00000009935	Xpo1	100	97.386	Rattus_norvegicus
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ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.892	ENSSFOG00015001881	XPO1	100	95.892	Scleropages_formosus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.705	ENSSMAG00000015718	-	100	95.705	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.036	ENSSMAG00000021007	xpo1a	100	91.036	Scophthalmus_maximus
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ENSXETG00000002224	xpo1	86	92.391	ENSSDUG00000000812	xpo1a	99	92.391	Seriola_dumerili
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.892	ENSSLDG00000019530	-	100	95.892	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000002224	xpo1	51	92.000	ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	92.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000002224	xpo1	91	97.677	ENSSARG00000014000	-	91	97.677	Sorex_araneus
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ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.503	ENSSPAG00000010307	xpo1a	100	91.503	Stegastes_partitus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.133	ENSSSCG00000028228	XPO1	100	98.133	Sus_scrofa
ENSXETG00000002224	xpo1	100	96.849	ENSTGUG00000006512	XPO1	100	96.849	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.518	ENSTRUG00000005571	-	99	96.522	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000002224	xpo1	99	91.471	ENSTRUG00000001415	xpo1a	100	91.471	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000002224	xpo1	100	90.103	ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	90.103	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000002224	xpo1	64	99.363	ENSTBEG00000014485	-	70	99.363	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000002224	xpo1	96	87.488	ENSTTRG00000013369	XPO1	100	87.488	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSUAMG00000026512	XPO1	100	98.039	Ursus_americanus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	97.946	ENSUMAG00000019859	XPO1	100	97.946	Ursus_maritimus
ENSXETG00000002224	xpo1	96	94.526	ENSVPAG00000011446	XPO1	100	94.526	Vicugna_pacos
ENSXETG00000002224	xpo1	100	98.039	ENSVVUG00000012009	XPO1	100	98.039	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000002224	xpo1	78	95.652	ENSXCOG00000006625	-	97	95.652	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000002224	xpo1	88	92.128	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	92.128	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	95.518	ENSXMAG00000007353	-	100	95.518	Xiphophorus_maculatus
ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.223	ENSXMAG00000005790	xpo1a	100	91.223	Xiphophorus_maculatus