EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000003291 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polr2e
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide E%2C 25kDa (polr2e)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7109 bases
Position: chrGL172925.1:619501-626609
Accession: NM_001016473
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000007134	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	9.1e-35	1	1
ENSXETP00000007134	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	2.1e-34	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000007134	-	1115	-	ENSXETP00000007134	210 (aa)	-	Q28HF5

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000003291's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000003291's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSG00000099817	POLR2E	100	97.143	Homo_sapiens
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSAPOG00000002935	polr2eb	100	97.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSAMEG00000003159	POLR2E	100	97.619	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000003291	polr2e	100	83.810	ENSACIG00000024371	polr2eb	100	83.810	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSAOCG00000018166	polr2eb	100	97.143	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSAPEG00000009000	polr2eb	100	97.143	Amphiprion_percula
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSATEG00000023760	polr2eb	100	97.143	Anabas_testudineus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSANAG00000038488	POLR2E	100	97.619	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSACLG00000005254	polr2eb	100	96.667	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSAMXG00000018915	POLR2E	100	96.667	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSBTAG00000020776	POLR2E	100	97.619	Bos_taurus
ENSXETG00000003291	polr2e	99	77.885	WBGene00019246	rpb-5	99	77.885	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000003291	polr2e	67	92.857	ENSCJAG00000007666	-	77	92.857	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	94.762	ENSCAFG00000019546	POLR2E	100	94.762	Canis_familiaris
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSCAFG00020017111	POLR2E	100	97.619	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSCHIG00000014151	POLR2E	100	97.619	Capra_hircus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	80.465	ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	80.465	Carlito_syrichta
ENSXETG00000003291	polr2e	91	97.396	ENSCAPG00000010843	POLR2E	93	97.396	Cavia_aperea
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSCPOG00000001542	POLR2E	100	97.619	Cavia_porcellus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSCCAG00000025658	POLR2E	100	97.619	Cebus_capucinus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSCATG00000008926	POLR2E	100	97.619	Cercocebus_atys
ENSXETG00000003291	polr2e	98	74.634	ENSCLAG00000009238	-	100	74.634	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSCLAG00000014874	-	100	97.143	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSCSAG00000012336	POLR2E	100	97.619	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	98.095	ENSCPBG00000009702	POLR2E	100	98.095	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000003291	polr2e	100	85.714	ENSCING00000024933	-	99	85.714	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSCANG00000025560	POLR2E	100	97.619	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSCGRG00001022927	Polr2e	100	97.619	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000003291	polr2e	100	91.163	ENSCGRG00000016441	Polr2e	100	91.163	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000003291	polr2e	100	95.238	ENSCSEG00000007107	polr2eb	92	95.238	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSCVAG00000019940	polr2eb	100	97.143	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.190	ENSDARG00000026183	polr2eb	100	96.190	Danio_rerio
ENSXETG00000003291	polr2e	90	97.368	ENSDNOG00000044994	POLR2E	84	97.368	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSDORG00000001154	Polr2e	100	97.619	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000003291	polr2e	99	84.689	FBgn0033571	Rpb5	99	84.689	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000003291	polr2e	75	91.083	ENSEBUG00000010159	-	76	91.083	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000003291	polr2e	69	91.034	ENSEASG00005021615	POLR2E	67	85.185	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000003291	polr2e	91	96.335	ENSECAG00000011124	POLR2E	100	84.762	Equus_caballus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	95.714	ENSELUG00000005815	POLR2E	100	95.714	Esox_lucius
ENSXETG00000003291	polr2e	100	94.762	ENSELUG00000020646	polr2e	100	94.762	Esox_lucius
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSFCAG00000007318	POLR2E	100	97.143	Felis_catus
ENSXETG00000003291	polr2e	91	97.917	ENSFALG00000013986	POLR2E	99	97.917	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSFDAG00000014539	POLR2E	100	97.619	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSFHEG00000022398	polr2eb	100	97.143	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	95.714	ENSGMOG00000007615	polr2eb	100	95.714	Gadus_morhua
ENSXETG00000003291	polr2e	100	98.095	ENSGALG00000002591	POLR2E	100	98.095	Gallus_gallus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSGAFG00000005087	polr2eb	100	96.667	Gambusia_affinis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	95.714	ENSGACG00000013247	polr2eb	100	95.714	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	98.095	ENSGAGG00000008356	POLR2E	100	98.095	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSGGOG00000011267	POLR2E	100	97.619	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000003291	polr2e	68	91.549	ENSHBUG00000011099	polr2eb	100	91.549	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSHGLG00000013330	POLR2E	100	96.667	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSHGLG00100011014	POLR2E	100	96.667	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000003291	polr2e	53	93.750	ENSHCOG00000012099	-	88	93.750	Hippocampus_comes
ENSXETG00000003291	polr2e	100	95.714	ENSHCOG00000000906	polr2eb	100	95.714	Hippocampus_comes
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSIPUG00000019801	polr2e	100	97.143	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSSTOG00000002853	POLR2E	100	97.619	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000003291	polr2e	77	80.124	ENSJJAG00000015812	-	100	80.124	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSJJAG00000016595	-	100	97.619	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	78.571	ENSJJAG00000003145	-	100	78.571	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSKMAG00000005954	polr2eb	100	97.143	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSLBEG00000024802	polr2eb	100	97.143	Labrus_bergylta
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000003291	polr2e	77	96.296	ENSLOCG00000004599	POLR2E	100	96.296	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	77.830	ENSLAFG00000025587	POLR2E	100	77.830	Loxodonta_africana
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSMFAG00000002884	POLR2E	100	97.619	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSMMUG00000013927	POLR2E	100	97.619	Macaca_mulatta
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSMNEG00000034046	-	100	97.619	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000003291	polr2e	100	65.403	ENSMNEG00000033452	-	100	65.403	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000003291	polr2e	92	79.275	ENSMLEG00000012405	POLR2E	94	79.275	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSMAMG00000018703	polr2eb	100	97.143	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000003291	polr2e	90	96.316	ENSMZEG00005010796	polr2eb	96	96.316	Maylandia_zebra
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.682	ENSMGAG00000003769	POLR2E	100	96.682	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000003291	polr2e	100	66.667	ENSMAUG00000011003	-	100	66.667	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000003291	polr2e	92	96.891	ENSMAUG00000010125	-	100	97.382	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSMICG00000013063	POLR2E	100	97.619	Microcebus_murinus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSMOCG00000013414	Polr2e	100	97.619	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000003291	polr2e	100	82.381	ENSMMOG00000001161	polr2eb	100	82.381	Mola_mola
ENSXETG00000003291	polr2e	91	87.435	ENSMMOG00000001167	polr2eb	88	87.435	Mola_mola
ENSXETG00000003291	polr2e	100	98.095	ENSMODG00000005494	POLR2E	100	98.095	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSMALG00000021888	polr2eb	100	96.667	Monopterus_albus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	MGP_CAROLIEiJ_G0015561	Polr2e	100	97.619	Mus_caroli
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSMUSG00000004667	Polr2e	100	97.619	Mus_musculus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	MGP_PahariEiJ_G0030974	Polr2e	100	97.619	Mus_pahari
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	MGP_SPRETEiJ_G0016379	Polr2e	100	97.619	Mus_spretus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSMPUG00000008953	POLR2E	100	96.667	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000003291	polr2e	66	92.754	ENSMLUG00000006376	-	100	81.481	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSMLUG00000013193	POLR2E	100	97.619	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSNGAG00000001147	Polr2e	100	97.619	Nannospalax_galili
ENSXETG00000003291	polr2e	85	73.184	ENSNGAG00000017344	-	96	73.184	Nannospalax_galili
ENSXETG00000003291	polr2e	100	83.810	ENSNBRG00000022772	polr2eb	100	83.810	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000003291	polr2e	100	75.238	ENSNLEG00000031364	-	100	75.238	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000003291	polr2e	100	93.839	ENSNLEG00000001207	-	100	93.839	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000003291	polr2e	100	85.238	ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	85.238	Ochotona_princeps
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSODEG00000013230	-	100	97.619	Octodon_degus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	70.476	ENSODEG00000011490	-	100	70.476	Octodon_degus
ENSXETG00000003291	polr2e	89	86.022	ENSODEG00000007985	-	100	86.022	Octodon_degus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.190	ENSONIG00000002519	polr2eb	100	96.190	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSORLG00000015346	polr2eb	100	96.667	Oryzias_latipes
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSORLG00020020700	polr2e	100	96.667	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSORLG00015016842	polr2e	100	96.667	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSOMEG00000002709	polr2eb	100	97.143	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSOGAG00000012311	POLR2E	100	97.619	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSOARG00000010994	POLR2E	100	97.619	Ovis_aries
ENSXETG00000003291	polr2e	91	97.382	ENSPPAG00000003145	POLR2E	100	97.382	Pan_paniscus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSPPRG00000000777	POLR2E	100	97.143	Panthera_pardus
ENSXETG00000003291	polr2e	91	75.521	ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	92.105	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSPTRG00000010183	POLR2E	100	97.619	Pan_troglodytes
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSPANG00000018011	POLR2E	100	97.619	Papio_anubis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.190	ENSPKIG00000009607	POLR2E	100	96.190	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.190	ENSPKIG00000024123	POLR2E	100	96.190	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000003291	polr2e	98	94.146	ENSPSIG00000002870	POLR2E	99	94.146	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	84.286	ENSPMGG00000014354	polr2eb	100	84.286	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSPEMG00000023261	Polr2e	100	97.619	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000003291	polr2e	90	97.884	ENSPCIG00000007312	POLR2E	75	97.884	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSPFOG00000005734	polr2eb	100	96.667	Poecilia_formosa
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSPLAG00000014496	polr2eb	100	96.667	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSPMEG00000008053	polr2eb	100	96.667	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSPREG00000006489	polr2eb	100	96.667	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000003291	polr2e	100	90.521	ENSPPYG00000009305	POLR2E	100	90.521	Pongo_abelii
ENSXETG00000003291	polr2e	53	96.396	ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	96.396	Procavia_capensis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSPCOG00000014491	POLR2E	100	97.619	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000003291	polr2e	65	100.000	ENSPVAG00000007718	-	65	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000003291	polr2e	90	96.316	ENSPNYG00000019797	polr2eb	96	96.316	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.190	ENSPNAG00000026263	POLR2E	100	96.190	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSRNOG00000013545	Polr2e	100	97.619	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSRBIG00000028726	-	100	97.619	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000003291	polr2e	100	72.038	ENSRBIG00000027259	-	100	72.038	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSRROG00000043763	POLR2E	100	97.619	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000003291	polr2e	99	44.495	YBR154C	RPB5	98	44.495	Saccharomyces_cerevisiae
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSSBOG00000027241	POLR2E	100	97.619	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	98.095	ENSSHAG00000010690	POLR2E	100	98.095	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSSFOG00015006073	polr2e	100	97.143	Scleropages_formosus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSSMAG00000012782	polr2eb	100	97.143	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSSDUG00000003352	polr2eb	100	97.143	Seriola_dumerili
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSSLDG00000004965	polr2eb	100	97.143	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.619	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSSPAG00000017556	polr2eb	100	97.143	Stegastes_partitus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSSSCG00000021472	POLR2E	100	97.619	Sus_scrofa
ENSXETG00000003291	polr2e	66	90.000	ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	90.000	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000003291	polr2e	96	92.537	ENSTRUG00000018238	polr2eb	100	84.286	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSTNIG00000013187	polr2eb	100	97.143	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	97.143	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000003291	polr2e	92	94.330	ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	84.286	Ursus_americanus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	ENSVVUG00000022818	POLR2E	54	97.619	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000003291	polr2e	100	83.810	ENSXCOG00000009197	polr2eb	100	83.810	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000003291	polr2e	100	96.667	ENSXMAG00000026495	polr2eb	100	96.667	Xiphophorus_maculatus