EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSXETG00000003394 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
eftud2
Alias
-
Full Name
Xenopus tropicalis elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 (eftud2)%2C mRNA.
Gene Type
protein_coding
Species
Xenopus_tropicalis
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
20045 bases
Position
chrGL172791.1:1368364-1388408
Accession
NM_001030366
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSXETP00000007369GTP_EFTUPF00009.278.6e-4511
ENSXETP00000007369GTP_EFTU_D2PF03144.251.1e-1211
ENSXETP00000007369EFG_IVPF03764.185.8e-2411
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSXETT00000007369-3180-ENSXETP00000007369938 (aa)-F6WDR1
Gene Model
Click here to download ENSXETG00000003394's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000003394's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSXETG00000003394eftud29038.144ENSXETG00000006391eef2.19938.144
ENSXETG00000003394eftud29038.673ENSXETG00000021508eef2.29938.673
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSG00000108883EFTUD210098.507Homo_sapiens
ENSXETG00000003394eftud29893.471ENSAPOG00000002433eftud29692.834Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSAMEG00000018390EFTUD29794.776Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000003394eftud29889.880ENSACIG00000009096eftud29689.412Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000003394eftud29187.882ENSAOCG00000023385eftud210087.882Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000003394eftud29893.580ENSAPEG00000003321eftud29692.941Amphiprion_percula
ENSXETG00000003394eftud29893.580ENSATEG00000000457eftud29692.834Anabas_testudineus
ENSXETG00000003394eftud29892.182ENSAPLG00000011036EFTUD29791.277Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000003394eftud29896.179ENSACAG00000007637EFTUD29795.096Anolis_carolinensis
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSANAG00000025320EFTUD29794.883Aotus_nancymaae
ENSXETG00000003394eftud29893.580ENSACLG00000001296eftud29692.834Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000003394eftud29893.464ENSAMXG00000000568eftud29692.234Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSBTAG00000013526EFTUD29695.192Bos_taurus
ENSXETG00000003394eftud29970.183WBGene00001166eftu-29570.183Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSCJAG00000012349EFTUD29794.883Callithrix_jacchus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSCAFG00000014065EFTUD29794.776Canis_familiaris
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSCAFG00020009633EFTUD29794.776Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSCHIG00000011603EFTUD29695.192Capra_hircus
ENSXETG00000003394eftud29895.756ENSTSYG00000013172EFTUD29794.670Carlito_syrichta
ENSXETG00000003394eftud29895.756ENSCAPG00000014639EFTUD29794.456Cavia_aperea
ENSXETG00000003394eftud29895.756ENSCPOG00000010566EFTUD29794.456Cavia_porcellus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSCCAG00000035302EFTUD29794.883Cebus_capucinus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSCATG00000035809EFTUD29794.883Cercocebus_atys
ENSXETG00000003394eftud29895.543ENSCLAG00000014733EFTUD29694.872Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSCSAG00000003614EFTUD29794.883Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000003394eftud29582.883ENSCHOG00000010031EFTUD210082.301Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000003394eftud29896.083ENSCPBG00000008904EFTUD29794.989Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000003394eftud29878.959ENSCING00000009372-9777.849Ciona_intestinalis
ENSXETG00000003394eftud29879.565ENSCSAVG00000004985-9979.009Ciona_savignyi
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSCANG00000026557EFTUD29794.883Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSCGRG00001009904Eftud29794.456Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSCGRG00000003825Eftud29794.456Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000003394eftud29893.036ENSCSEG00000016775eftud29692.193Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000003394eftud29893.145ENSCVAG00000012537eftud29692.193Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000003394eftud29892.702ENSDARG00000012261eftud29691.880Danio_rerio
ENSXETG00000003394eftud29895.647ENSDNOG00000008033EFTUD29794.670Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000003394eftud29895.974ENSDORG00000011566Eftud29794.670Dipodomys_ordii
ENSXETG00000003394eftud29976.231FBgn0039566CG48499676.231Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000003394eftud29098.370ENSETEG00000005678EFTUD28898.370Echinops_telfairi
ENSXETG00000003394eftud27793.035ENSEBUG00000004047-9687.483Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSEASG00005010321EFTUD29794.776Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000003394eftud29895.756ENSECAG00000019363EFTUD29094.670Equus_caballus
ENSXETG00000003394eftud28699.153ENSEEUG00000011128EFTUD29299.153Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000003394eftud29892.165ENSELUG00000017169eftud29691.230Esox_lucius
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSFCAG00000005466EFTUD29794.883Felis_catus
ENSXETG00000003394eftud29896.083ENSFALG00000007551EFTUD29794.989Ficedula_albicollis
ENSXETG00000003394eftud29895.974ENSFDAG00000013143EFTUD29695.085Fukomys_damarensis
ENSXETG00000003394eftud29892.927ENSFHEG00000013479eftud29691.979Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000003394eftud29893.145ENSGMOG00000014277eftud29692.308Gadus_morhua
ENSXETG00000003394eftud29995.685ENSGALG00000000988EFTUD29995.685Gallus_gallus
ENSXETG00000003394eftud29893.254ENSGAFG00000002263eftud29692.086Gambusia_affinis
ENSXETG00000003394eftud29892.818ENSGACG00000009163eftud29691.791Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSGGOG00000012999EFTUD29794.883Gorilla_gorilla
ENSXETG00000003394eftud29893.580ENSHBUG00000023546eftud29692.834Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSHGLG00000014497EFTUD29694.872Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSHGLG00100013432EFTUD29694.872Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000003394eftud29892.601ENSHCOG00000017689eftud29691.765Hippocampus_comes
ENSXETG00000003394eftud29893.043ENSIPUG00000023182Eftud29791.898Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000003394eftud29595.383ENSSTOG00000012188EFTUD29993.115Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSJJAG00000018268Eftud210094.872Jaculus_jaculus
ENSXETG00000003394eftud29892.601ENSKMAG00000021027eftud29691.872Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000003394eftud29392.792ENSLBEG00000005875eftud210092.353Labrus_bergylta
ENSXETG00000003394eftud29894.124ENSLACG00000012918EFTUD29693.376Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000003394eftud29893.362ENSLOCG00000011460eftud29692.727Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSLAFG00000015344EFTUD29694.563Loxodonta_africana
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSMFAG00000042655EFTUD29794.883Macaca_fascicularis
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSMMUG00000013118EFTUD210098.507Macaca_mulatta
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSMNEG00000037895EFTUD29794.883Macaca_nemestrina
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSMLEG00000032960EFTUD29794.883Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000003394eftud29893.362ENSMAMG00000022190eftud29692.727Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000003394eftud29893.580ENSMZEG00005022885eftud29692.834Maylandia_zebra
ENSXETG00000003394eftud29895.983ENSMGAG00000010083EFTUD29695.000Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000003394eftud29895.756ENSMAUG00000021178Eftud29794.456Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSMICG00000016592EFTUD29794.883Microcebus_murinus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSMOCG00000009039-9794.563Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000003394eftud28978.017ENSMOCG00000017653-8676.986Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000003394eftud29193.647ENSMMOG00000020811eftud210093.647Mola_mola
ENSXETG00000003394eftud29896.083ENSMODG00000011347EFTUD29795.096Monodelphis_domestica
ENSXETG00000003394eftud29192.118ENSMALG00000014501eftud210092.118Monopterus_albus
ENSXETG00000003394eftud29895.756MGP_CAROLIEiJ_G0017263Eftud29694.872Mus_caroli
ENSXETG00000003394eftud29895.756ENSMUSG00000020929Eftud29694.877Mus_musculus
ENSXETG00000003394eftud29895.756MGP_PahariEiJ_G0018393Eftud29694.872Mus_pahari
ENSXETG00000003394eftud29895.756MGP_SPRETEiJ_G0018106Eftud29694.872Mus_spretus
ENSXETG00000003394eftud29595.623ENSMPUG00000009136EFTUD28794.396Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSMLUG00000012164EFTUD29694.776Myotis_lucifugus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSNGAG00000017834Eftud29794.456Nannospalax_galili
ENSXETG00000003394eftud29893.471ENSNBRG00000020081eftud29692.727Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000003394eftud29593.919ENSNLEG00000005210EFTUD29391.951Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000003394eftud29892.274ENSMEUG00000015620EFTUD29791.365Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000003394eftud29887.160ENSOPRG00000016323EFTUD29786.141Ochotona_princeps
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSODEG00000018041-9694.765Octodon_degus
ENSXETG00000003394eftud29176.868ENSODEG00000003385-9676.868Octodon_degus
ENSXETG00000003394eftud29893.580ENSONIG00000000912eftud29692.834Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSOCUG00000006879EFTUD29794.776Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000003394eftud29892.927ENSORLG00000003109eftud29691.979Oryzias_latipes
ENSXETG00000003394eftud29892.927ENSORLG00020009865eftud29692.086Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000003394eftud29892.927ENSORLG00015002611eftud210092.919Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000003394eftud29893.798ENSOGAG00000012918EFTUD29692.857Otolemur_garnettii
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSOARG00000009078EFTUD29495.192Ovis_aries
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSPPAG00000029450EFTUD29794.883Pan_paniscus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSPPRG00000010981EFTUD29794.776Panthera_pardus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSPTIG00000007703EFTUD29794.776Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSPTRG00000009287EFTUD29794.883Pan_troglodytes
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSPANG00000021284EFTUD29794.883Papio_anubis
ENSXETG00000003394eftud29194.731ENSPSIG00000004505EFTUD29693.585Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000003394eftud29885.201ENSPMGG00000007281eftud29684.402Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSPEMG00000005129Eftud29695.085Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000003394eftud29896.083ENSPCIG00000015027EFTUD29795.096Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000003394eftud29893.254ENSPFOG00000008515eftud29692.086Poecilia_formosa
ENSXETG00000003394eftud29893.254ENSPLAG00000010393eftud29692.086Poecilia_latipinna
ENSXETG00000003394eftud29893.254ENSPMEG00000005087eftud29692.086Poecilia_mexicana
ENSXETG00000003394eftud29894.450ENSPPYG00000008320EFTUD29793.497Pongo_abelii
ENSXETG00000003394eftud29891.839ENSPCAG00000000812EFTUD29790.938Procavia_capensis
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSPCOG00000020029EFTUD29794.883Propithecus_coquereli
ENSXETG00000003394eftud29891.295ENSPVAG00000016155EFTUD29690.192Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000003394eftud29893.471ENSPNYG00000012448eftud29692.727Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000003394eftud29893.478ENSPNAG00000012490eftud29792.537Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000003394eftud29895.756ENSRNOG00000002818Eftud29694.984Rattus_norvegicus
ENSXETG00000003394eftud29895.756ENSRBIG00000043255EFTUD29794.776Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000003394eftud29895.756ENSRROG00000042925EFTUD29794.776Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000003394eftud29633.848YKL173WSNU1149334.089Saccharomyces_cerevisiae
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSSBOG00000021892EFTUD29794.883Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000003394eftud29896.083ENSSHAG00000008134EFTUD210095.203Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000003394eftud29892.927ENSSFOG00015023272eftud29692.193Scleropages_formosus
ENSXETG00000003394eftud29892.601ENSSMAG00000010174eftud210090.000Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000003394eftud29893.471ENSSDUG00000022675eftud29692.834Seriola_dumerili
ENSXETG00000003394eftud29893.580ENSSLDG00000001595eftud29692.941Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000003394eftud29887.486ENSSARG00000008664EFTUD29686.567Sorex_araneus
ENSXETG00000003394eftud29895.974ENSSPUG00000010249EFTUD29794.989Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000003394eftud29893.471ENSSPAG00000016235eftud29592.834Stegastes_partitus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSSSCG00000017346EFTUD29794.776Sus_scrofa
ENSXETG00000003394eftud28595.268ENSTGUG00000002065EFTUD210094.039Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000003394eftud29891.948ENSTRUG00000016422eftud29691.230Takifugu_rubripes
ENSXETG00000003394eftud29887.324ENSTNIG00000005346eftud29686.688Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000003394eftud29889.989ENSTBEG00000011337EFTUD29789.126Tupaia_belangeri
ENSXETG00000003394eftud29492.168ENSTTRG00000006230EFTUD29192.168Tursiops_truncatus
ENSXETG00000003394eftud29894.886ENSUAMG00000000399EFTUD29793.817Ursus_americanus
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSUMAG00000014323EFTUD29794.776Ursus_maritimus
ENSXETG00000003394eftud28698.507ENSVPAG00000002748EFTUD28598.507Vicugna_pacos
ENSXETG00000003394eftud29895.865ENSVVUG00000018113EFTUD29794.776Vulpes_vulpes
ENSXETG00000003394eftud28492.985ENSXCOG00000017309eftud29692.985Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000003394eftud29893.254ENSXMAG00000008494eftud29692.086Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us