EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000003419 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP 38kDa subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 23027 bases
Position: chrGL172740.1:1866122-1889148
Accession: XB-GENE-943258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000007410	RNase_P_pop3	PF08228.11	1.1e-05	1	1
ENSXETP00000007410	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	7.9e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000007410	-	1054	XM_002934588	ENSXETP00000007410	280 (aa)	XP_002934634	F6SHW8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.043	ENSG00000152464	RPP38	95	53.704	Homo_sapiens
ENSXETG00000003419	rpp38	89	38.550	ENSAPOG00000001240	rpp38	89	38.550	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.727	ENSAMEG00000018832	RPP38	92	48.120	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000003419	rpp38	89	40.856	ENSACIG00000011592	rpp38	90	39.689	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000003419	rpp38	89	36.397	ENSAOCG00000017293	rpp38	89	36.397	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000003419	rpp38	89	40.945	ENSAPEG00000002315	rpp38	88	40.945	Amphiprion_percula
ENSXETG00000003419	rpp38	92	43.333	ENSATEG00000000731	rpp38	90	43.295	Anabas_testudineus
ENSXETG00000003419	rpp38	93	47.348	ENSAPLG00000002054	RPP38	92	47.744	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000003419	rpp38	89	40.316	ENSACLG00000016962	rpp38	89	40.316	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000003419	rpp38	89	40.711	ENSACLG00000016958	rpp38	89	40.711	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000003419	rpp38	91	41.406	ENSAMXG00000025023	rpp38	90	41.699	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.561	ENSBTAG00000007702	RPP38	92	47.955	Bos_taurus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	50.182	ENSCAFG00000024373	RPP38	92	50.752	Canis_familiaris
ENSXETG00000003419	rpp38	97	50.182	ENSCAFG00020008008	RPP38	92	50.752	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.921	ENSCHIG00000012484	RPP38	92	48.327	Capra_hircus
ENSXETG00000003419	rpp38	99	48.421	ENSCPOG00000003981	RPP38	95	48.188	Cavia_porcellus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	49.110	ENSCLAG00000010194	RPP38	92	48.529	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000003419	rpp38	92	46.125	ENSCSAG00000019055	RPP38	92	46.909	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	49.653	ENSCHOG00000004335	RPP38	92	51.111	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000003419	rpp38	97	46.043	ENSCGRG00001001395	Rpp38	92	47.212	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000003419	rpp38	97	46.043	ENSCGRG00000017441	Rpp38	92	47.212	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000003419	rpp38	91	42.529	ENSCSEG00000001721	rpp38	91	42.529	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000003419	rpp38	95	37.589	ENSCVAG00000001676	rpp38	95	38.652	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000003419	rpp38	95	42.857	ENSDARG00000040350	rpp38	93	42.222	Danio_rerio
ENSXETG00000003419	rpp38	97	50.000	ENSDNOG00000040314	RPP38	92	49.446	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	49.640	ENSDORG00000009783	Rpp38	92	49.442	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000003419	rpp38	97	49.821	ENSETEG00000002839	RPP38	92	49.630	Echinops_telfairi
ENSXETG00000003419	rpp38	97	44.523	ENSEASG00005019783	RPP38	91	45.185	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	46.763	ENSEEUG00000014677	RPP38	92	46.097	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000003419	rpp38	92	37.770	ENSELUG00000010160	rpp38	93	37.770	Esox_lucius
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.387	ENSFCAG00000022449	RPP38	92	48.519	Felis_catus
ENSXETG00000003419	rpp38	93	47.368	ENSFALG00000014804	RPP38	90	47.761	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.399	ENSFDAG00000018669	RPP38	92	47.794	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000003419	rpp38	95	39.024	ENSFHEG00000013741	rpp38	95	41.135	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000003419	rpp38	93	48.120	ENSGALG00000008794	RPP38	88	48.120	Gallus_gallus
ENSXETG00000003419	rpp38	55	45.455	ENSGACG00000009258	rpp38	90	45.455	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000003419	rpp38	89	39.921	ENSHBUG00000010937	rpp38	89	39.921	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000003419	rpp38	97	47.653	ENSHGLG00000012144	RPP38	92	47.015	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000003419	rpp38	90	42.688	ENSIPUG00000022879	rpp38	90	43.629	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	46.953	ENSSTOG00000025699	RPP38	90	46.296	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.921	ENSJJAG00000007523	Rpp38	92	48.327	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000003419	rpp38	91	39.615	ENSKMAG00000003986	rpp38	91	39.850	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000003419	rpp38	94	43.173	ENSLBEG00000006853	rpp38	92	42.586	Labrus_bergylta
ENSXETG00000003419	rpp38	95	44.561	ENSLACG00000006502	RPP38	94	44.561	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000003419	rpp38	96	47.273	ENSLOCG00000018347	rpp38	91	47.940	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000003419	rpp38	99	48.582	ENSLAFG00000000509	RPP38	94	47.985	Loxodonta_africana
ENSXETG00000003419	rpp38	92	45.149	ENSMMUG00000007679	RPP38	92	45.956	Macaca_mulatta
ENSXETG00000003419	rpp38	92	43.130	ENSMAMG00000012774	rpp38	89	42.802	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000003419	rpp38	89	40.711	ENSMZEG00005003200	rpp38	89	40.711	Maylandia_zebra
ENSXETG00000003419	rpp38	89	40.711	ENSMZEG00005003189	rpp38	89	40.711	Maylandia_zebra
ENSXETG00000003419	rpp38	93	47.368	ENSMGAG00000008217	RPP38	88	47.368	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000003419	rpp38	97	45.683	ENSMAUG00000003644	Rpp38	92	46.840	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	46.429	ENSMOCG00000007020	Rpp38	92	45.756	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000003419	rpp38	97	38.768	ENSMMOG00000003446	rpp38	95	38.745	Mola_mola
ENSXETG00000003419	rpp38	96	49.281	ENSMODG00000024091	RPP38	95	50.000	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000003419	rpp38	99	38.488	ENSMALG00000002356	rpp38	96	38.652	Monopterus_albus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	47.670	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	92	46.691	Mus_caroli
ENSXETG00000003419	rpp38	97	46.619	ENSMUSG00000049950	Rpp38	92	45.956	Mus_musculus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	45.296	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	92	45.324	Mus_pahari
ENSXETG00000003419	rpp38	97	47.331	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	92	46.691	Mus_spretus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	49.462	ENSMPUG00000018523	RPP38	93	49.259	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000003419	rpp38	93	47.744	ENSMLUG00000002153	RPP38	92	48.889	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.582	ENSNGAG00000011066	Rpp38	92	47.985	Nannospalax_galili
ENSXETG00000003419	rpp38	95	39.560	ENSNBRG00000006994	rpp38	96	39.560	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000003419	rpp38	89	39.526	ENSONIG00000020467	rpp38	88	39.526	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000003419	rpp38	93	49.430	ENSOCUG00000022768	-	92	49.813	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000003419	rpp38	93	49.248	ENSOCUG00000024367	-	92	49.630	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000003419	rpp38	96	40.925	ENSORLG00000009219	rpp38	95	41.304	Oryzias_latipes
ENSXETG00000003419	rpp38	96	41.091	ENSORLG00020011503	rpp38	92	41.219	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000003419	rpp38	96	40.364	ENSORLG00015017702	rpp38	92	40.860	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000003419	rpp38	90	40.613	ENSOMEG00000005414	rpp38	90	41.509	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000003419	rpp38	97	47.670	ENSOGAG00000008059	RPP38	92	47.037	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000003419	rpp38	97	49.640	ENSOARG00000004534	RPP38	92	49.071	Ovis_aries
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.582	ENSPPAG00000041577	RPP38	84	48.162	Pan_paniscus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	50.000	ENSPPRG00000015329	RPP38	92	49.451	Panthera_pardus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.387	ENSPTIG00000007188	RPP38	92	48.519	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.582	ENSPTRG00000002318	RPP38	84	48.162	Pan_troglodytes
ENSXETG00000003419	rpp38	94	45.865	ENSPKIG00000025652	rpp38	89	45.385	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000003419	rpp38	96	50.903	ENSPSIG00000001527	RPP38	92	50.373	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.201	ENSPEMG00000008375	Rpp38	92	47.584	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000003419	rpp38	99	50.523	ENSPCIG00000009096	RPP38	90	50.000	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000003419	rpp38	67	44.503	ENSPFOG00000016823	rpp38	84	44.134	Poecilia_formosa
ENSXETG00000003419	rpp38	95	38.929	ENSPLAG00000007626	rpp38	91	39.623	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000003419	rpp38	91	34.701	ENSPMEG00000020392	rpp38	90	36.226	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000003419	rpp38	99	38.776	ENSPREG00000017744	rpp38	96	38.652	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.043	ENSPPYG00000002113	RPP38	92	47.601	Pongo_abelii
ENSXETG00000003419	rpp38	92	46.743	ENSPVAG00000007155	RPP38	92	47.547	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000003419	rpp38	89	40.711	ENSPNYG00000004293	rpp38	89	40.711	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000003419	rpp38	90	38.735	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	39.850	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000003419	rpp38	97	50.360	ENSRNOG00000038025	Rpp38	92	49.814	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000003419	rpp38	99	49.648	ENSSHAG00000015529	RPP38	95	49.818	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000003419	rpp38	97	41.304	ENSSMAG00000018276	rpp38	93	41.199	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000003419	rpp38	90	43.462	ENSSDUG00000001651	rpp38	91	43.462	Seriola_dumerili
ENSXETG00000003419	rpp38	90	42.748	ENSSLDG00000014355	rpp38	91	42.748	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000003419	rpp38	97	39.858	ENSSARG00000012099	RPP38	91	38.971	Sorex_araneus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	50.719	ENSSPUG00000018363	-	92	50.186	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	51.439	ENSSPUG00000005237	-	92	50.929	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	45.965	ENSSPUG00000008560	-	93	45.290	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000003419	rpp38	95	38.290	ENSSPAG00000020387	rpp38	93	38.290	Stegastes_partitus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.043	ENSSSCG00000027110	RPP38	92	47.426	Sus_scrofa
ENSXETG00000003419	rpp38	93	45.353	ENSTGUG00000001366	RPP38	93	45.756	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000003419	rpp38	98	39.068	ENSTNIG00000001334	rpp38	95	39.405	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000003419	rpp38	97	49.281	ENSTTRG00000004420	RPP38	92	48.699	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000003419	rpp38	98	48.227	ENSUAMG00000002618	RPP38	92	47.970	Ursus_americanus
ENSXETG00000003419	rpp38	95	49.630	ENSUMAG00000012382	RPP38	92	49.248	Ursus_maritimus
ENSXETG00000003419	rpp38	97	50.000	ENSVVUG00000005272	RPP38	92	50.554	Vulpes_vulpes