EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000004364 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago1
Alias: -
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23268 bases
Position: chrGL172830.1:26675-49942
Accession: XB-GENE-5933499
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000009509	PAZ	PF02170.22	2.7e-26	1	1
ENSXETP00000009509	Piwi	PF02171.17	3.2e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000009509	-	3058	-	ENSXETP00000009509	859 (aa)	-	F6PSN5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000004364	ago1	98	81.967	ENSXETG00000023755	ago2	99	80.892
ENSXETG00000004364	ago1	98	71.363	ENSXETG00000009664	ago4	99	71.363
ENSXETG00000004364	ago1	98	84.742	ENSXETG00000027042	ago3	99	84.742

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSG00000092847	AGO1	100	98.469	Homo_sapiens
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSAPOG00000024299	ago1	100	95.698	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	98.021	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000004364	ago1	82	91.619	ENSACIG00000005298	ago1	98	91.619	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSAOCG00000017727	ago1	100	95.698	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSAPEG00000004458	ago1	100	95.698	Amphiprion_percula
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSATEG00000008523	ago1	100	95.698	Anabas_testudineus
ENSXETG00000004364	ago1	99	91.949	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	91.949	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000004364	ago1	91	98.469	ENSACAG00000029174	AGO1	100	98.469	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSANAG00000037711	AGO1	100	98.021	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.465	ENSACLG00000000890	ago1	100	95.465	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000004364	ago1	80	98.110	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.110	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.905	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	97.905	Bos_taurus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	98.021	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	98.021	Canis_familiaris
ENSXETG00000004364	ago1	99	97.421	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.048	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.103	ENSCHIG00000011848	-	100	97.103	Capra_hircus
ENSXETG00000004364	ago1	100	77.416	ENSTSYG00000032426	-	99	78.917	Carlito_syrichta
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSTSYG00000009767	-	100	98.021	Carlito_syrichta
ENSXETG00000004364	ago1	89	93.568	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	92.693	Cavia_aperea
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	98.021	Cavia_porcellus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	98.021	Cebus_capucinus
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.558	ENSCATG00000031521	AGO1	100	98.469	Cercocebus_atys
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	98.021	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	98.021	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000004364	ago1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	98.021	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSCANG00000039798	AGO1	100	98.021	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	98.021	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000004364	ago1	99	98.233	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	98.233	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000004364	ago1	99	94.432	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.432	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.465	ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.465	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000004364	ago1	100	96.047	ENSDARG00000092644	ago1	100	96.047	Danio_rerio
ENSXETG00000004364	ago1	91	98.469	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	98.469	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000004364	ago1	91	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000004364	ago1	84	90.871	ENSETEG00000007626	AGO1	100	90.871	Echinops_telfairi
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSEASG00005012086	AGO1	100	98.021	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSECAG00000024353	AGO1	100	98.021	Equus_caballus
ENSXETG00000004364	ago1	92	90.114	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	90.114	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000004364	ago1	91	96.556	ENSELUG00000016803	ago1	100	96.556	Esox_lucius
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	98.021	Felis_catus
ENSXETG00000004364	ago1	91	91.985	ENSFALG00000000790	AGO1	100	91.985	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	98.021	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000004364	ago1	99	92.326	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.326	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000004364	ago1	87	84.154	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.154	Gadus_morhua
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSGALG00000002249	AGO1	100	98.021	Gallus_gallus
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSGAFG00000009775	ago1	100	95.698	Gambusia_affinis
ENSXETG00000004364	ago1	87	96.680	ENSGACG00000012443	ago1	100	96.680	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000004364	ago1	91	98.469	ENSGAGG00000012893	-	100	98.469	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	98.021	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.465	ENSHBUG00000010459	ago1	100	95.465	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	98.021	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	98.021	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000004364	ago1	99	96.222	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.222	Hippocampus_comes
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSIPUG00000023216	ago1	100	95.698	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	98.021	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	98.021	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSKMAG00000019464	ago1	100	95.698	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSLBEG00000007694	ago1	100	95.698	Labrus_bergylta
ENSXETG00000004364	ago1	99	93.051	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.051	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000004364	ago1	100	93.256	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.256	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000004364	ago1	99	98.120	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	98.120	Loxodonta_africana
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	98.021	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000004364	ago1	99	92.999	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	93.846	Macaca_mulatta
ENSXETG00000004364	ago1	100	94.179	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	98.469	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	98.021	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSMAMG00000008381	ago1	100	95.698	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.465	ENSMZEG00005007996	ago1	100	95.465	Maylandia_zebra
ENSXETG00000004364	ago1	99	92.567	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	92.567	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	98.021	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSMICG00000016147	AGO1	100	98.021	Microcebus_murinus
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.905	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	97.905	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000004364	ago1	78	98.214	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.214	Mola_mola
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.905	ENSMODG00000023335	AGO1	100	97.905	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000004364	ago1	99	96.104	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.104	Monopterus_albus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.096	Mus_caroli
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.096	Mus_musculus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.096	Mus_pahari
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.096	Mus_spretus
ENSXETG00000004364	ago1	84	98.750	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	98.750	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000004364	ago1	61	96.947	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	96.947	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.905	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	97.905	Nannospalax_galili
ENSXETG00000004364	ago1	91	96.556	ENSNBRG00000010867	ago1	100	96.556	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.905	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	97.905	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000004364	ago1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000004364	ago1	93	99.392	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	99.392	Ochotona_princeps
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSODEG00000005321	AGO1	100	98.021	Octodon_degus
ENSXETG00000004364	ago1	99	95.986	ENSONIG00000016345	ago1	99	95.986	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000004364	ago1	100	89.504	ENSOANG00000002080	AGO1	100	90.069	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.905	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	97.905	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSORLG00000014965	ago1	100	95.698	Oryzias_latipes
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSORLG00020018253	ago1	100	95.698	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSORLG00015003287	ago1	100	95.698	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSOMEG00000020528	ago1	100	95.698	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000004364	ago1	99	98.120	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	98.120	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.905	ENSOARG00000019591	AGO1	100	97.905	Ovis_aries
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	98.021	Pan_paniscus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	98.021	Panthera_pardus
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.788	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	97.788	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	98.021	Pan_troglodytes
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSPANG00000009060	AGO1	100	98.021	Papio_anubis
ENSXETG00000004364	ago1	98	97.749	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	97.749	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000004364	ago1	80	96.812	ENSPMGG00000024099	ago1	98	96.812	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	98.021	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000004364	ago1	100	97.905	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	97.905	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSPFOG00000005867	ago1	100	95.698	Poecilia_formosa
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSPLAG00000002824	ago1	99	97.691	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.691	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	ENSPREG00000006534	ago1	100	95.698	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	98.021	Pongo_abelii
ENSXETG00000004364	ago1	58	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	Procavia_capensis
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