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Description

Ensembl ID: ENSXETG00000004510 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: gzf1
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis GDNF inducible zinc finger protein 1 (gzf1)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8586 bases
Position: chrGL172884.1:231887-240472
Accession: NM_001045636
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000009796	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-33	1	6
ENSXETP00000009796	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-33	2	6
ENSXETP00000009796	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-33	3	6
ENSXETP00000009796	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-33	4	6
ENSXETP00000009796	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-33	5	6
ENSXETP00000009796	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-33	6	6
ENSXETP00000009796	zf-met	PF12874.7	1.6e-14	1	2
ENSXETP00000009796	zf-met	PF12874.7	1.6e-14	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000009796	-	2206	XM_012963100	ENSXETP00000009796	697 (aa)	XP_012818554	B7ZUK9

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000004510	gzf1	53	40.702	ENSXETG00000006575	znf420	87	41.115
ENSXETG00000004510	gzf1	73	35.374	ENSXETG00000022419	hic2	66	35.374
ENSXETG00000004510	gzf1	50	40.260	ENSXETG00000016091	e4f1	63	30.409
ENSXETG00000004510	gzf1	57	33.333	ENSXETG00000004190	patz1	86	34.524
ENSXETG00000004510	gzf1	82	32.479	ENSXETG00000032207	ZNF131	67	32.479
ENSXETG00000004510	gzf1	62	42.211	ENSXETG00000033508	-	96	42.211
ENSXETG00000004510	gzf1	51	44.118	ENSXETG00000008801	znf628	96	43.429
ENSXETG00000004510	gzf1	60	45.570	ENSXETG00000021294	zbtb24	60	46.479
ENSXETG00000004510	gzf1	84	34.158	ENSXETG00000006162	zbtb47	91	34.158
ENSXETG00000004510	gzf1	85	42.466	ENSXETG00000021754	zbtb34	90	42.466
ENSXETG00000004510	gzf1	51	40.351	ENSXETG00000002339	znf423	80	40.351
ENSXETG00000004510	gzf1	84	41.912	ENSXETG00000002279	zbtb14	92	41.912
ENSXETG00000004510	gzf1	62	36.364	ENSXETG00000033139	ZBTB16	60	36.078
ENSXETG00000004510	gzf1	52	33.929	ENSXETG00000001980	znf408	75	36.667
ENSXETG00000004510	gzf1	50	43.796	ENSXETG00000026673	-	97	43.796
ENSXETG00000004510	gzf1	84	43.529	ENSXETG00000020530	zbtb6	97	43.529
ENSXETG00000004510	gzf1	82	33.793	ENSXETG00000009952	zbtb41	77	34.906

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.916	ENSG00000125812	GZF1	100	68.750	Homo_sapiens
ENSXETG00000004510	gzf1	86	46.990	ENSAPOG00000012930	GZF1	96	46.656	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	56.685	ENSAMEG00000009853	GZF1	98	56.727	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000004510	gzf1	87	45.498	ENSACIG00000004753	-	74	45.656	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000004510	gzf1	84	45.691	ENSAOCG00000024275	GZF1	96	47.199	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000004510	gzf1	97	41.621	ENSAPEG00000017195	GZF1	51	53.153	Amphiprion_percula
ENSXETG00000004510	gzf1	100	36.538	ENSATEG00000018374	GZF1	88	77.049	Anabas_testudineus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.865	ENSANAG00000028240	GZF1	98	59.065	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000004510	gzf1	96	42.479	ENSACLG00000025866	GZF1	77	42.618	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000004510	gzf1	85	46.365	ENSAMXG00000017178	GZF1	81	46.365	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000004510	gzf1	100	58.856	ENSCJAG00000000733	GZF1	100	59.053	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000004510	gzf1	100	59.805	ENSCAFG00000005142	GZF1	100	59.807	Canis_familiaris
ENSXETG00000004510	gzf1	55	64.706	ENSCAFG00020027463	-	100	64.706	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000004510	gzf1	98	59.971	ENSTSYG00000028054	GZF1	97	59.857	Carlito_syrichta
ENSXETG00000004510	gzf1	99	55.758	ENSCAPG00000002173	GZF1	98	56.356	Cavia_aperea
ENSXETG00000004510	gzf1	99	55.758	ENSCPOG00000010790	GZF1	98	56.356	Cavia_porcellus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	60.113	ENSCCAG00000035601	GZF1	98	60.113	Cebus_capucinus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.914	ENSCATG00000039279	GZF1	98	58.774	Cercocebus_atys
ENSXETG00000004510	gzf1	99	54.883	ENSCLAG00000014714	GZF1	98	54.883	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.496	ENSCSAG00000011054	GZF1	98	59.775	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000004510	gzf1	87	50.779	ENSCPBG00000023418	-	83	48.817	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000004510	gzf1	100	64.034	ENSCPBG00000023415	GZF1	100	64.034	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.916	ENSCANG00000041260	GZF1	98	59.916	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000004510	gzf1	98	57.925	ENSCGRG00001003944	Gzf1	98	57.736	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000004510	gzf1	98	57.925	ENSCGRG00000012721	Gzf1	98	57.736	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000004510	gzf1	69	62.851	ENSDNOG00000014290	GZF1	100	57.290	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.831	ENSDORG00000011855	Gzf1	98	59.831	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000004510	gzf1	60	72.285	ENSEBUG00000004858	GZF1	56	72.285	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000004510	gzf1	55	65.611	ENSECAG00000040045	-	100	65.611	Equus_caballus
ENSXETG00000004510	gzf1	83	46.154	ENSELUG00000013581	GZF1	86	46.717	Esox_lucius
ENSXETG00000004510	gzf1	100	58.897	ENSFCAG00000006484	GZF1	100	59.172	Felis_catus
ENSXETG00000004510	gzf1	94	55.844	ENSFDAG00000019468	GZF1	97	55.844	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000004510	gzf1	63	64.062	ENSFHEG00000020498	GZF1	84	41.071	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000004510	gzf1	86	44.019	ENSGMOG00000011017	GZF1	99	44.715	Gadus_morhua
ENSXETG00000004510	gzf1	100	63.394	ENSGALG00000053640	GZF1	100	63.394	Gallus_gallus
ENSXETG00000004510	gzf1	88	45.104	ENSGAFG00000008725	GZF1	74	45.208	Gambusia_affinis
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.181	ENSGGOG00000023248	GZF1	98	59.775	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000004510	gzf1	99	41.245	ENSHBUG00000016502	-	85	41.375	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000004510	gzf1	99	55.110	ENSHGLG00000008891	GZF1	98	55.387	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000004510	gzf1	99	55.110	ENSHGLG00100015117	GZF1	98	55.387	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000004510	gzf1	87	44.426	ENSHCOG00000004326	GZF1	88	38.689	Hippocampus_comes
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.021	ENSSTOG00000009820	GZF1	98	59.830	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	60.576	ENSJJAG00000008172	Gzf1	98	61.119	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000004510	gzf1	51	71.134	ENSKMAG00000001453	-	98	71.134	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	60.709	ENSLAFG00000002458	GZF1	98	60.809	Loxodonta_africana
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.914	ENSMFAG00000042408	GZF1	98	58.774	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.914	ENSMMUG00000022387	GZF1	98	58.774	Macaca_mulatta
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.496	ENSMNEG00000033117	GZF1	98	59.775	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.496	ENSMLEG00000036831	GZF1	98	59.775	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000004510	gzf1	70	56.771	ENSMAMG00000011931	-	65	56.771	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000004510	gzf1	96	42.618	ENSMZEG00005010711	-	78	42.758	Maylandia_zebra
ENSXETG00000004510	gzf1	86	61.008	ENSMAUG00000019656	Gzf1	100	60.935	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000004510	gzf1	100	58.197	ENSMICG00000046070	GZF1	100	58.864	Microcebus_murinus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	57.850	ENSMOCG00000017816	Gzf1	99	57.746	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000004510	gzf1	88	45.907	ENSMMOG00000004395	-	76	45.981	Mola_mola
ENSXETG00000004510	gzf1	100	62.113	ENSMODG00000006238	GZF1	99	77.043	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.557	MGP_CAROLIEiJ_G0024409	Gzf1	99	58.956	Mus_caroli
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.007	ENSMUSG00000027439	Gzf1	99	59.007	Mus_musculus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.782	MGP_PahariEiJ_G0025852	Gzf1	99	58.782	Mus_pahari
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.007	MGP_SPRETEiJ_G0025327	Gzf1	99	59.007	Mus_spretus
ENSXETG00000004510	gzf1	100	59.198	ENSMPUG00000001160	GZF1	89	58.630	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000004510	gzf1	98	56.389	ENSMLUG00000002194	GZF1	100	55.769	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	60.563	ENSNGAG00000024012	Gzf1	99	60.563	Nannospalax_galili
ENSXETG00000004510	gzf1	86	39.130	ENSNBRG00000019987	GZF1	98	41.491	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.437	ENSNLEG00000011565	GZF1	98	59.437	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.543	ENSOPRG00000004697	GZF1	99	58.824	Ochotona_princeps
ENSXETG00000004510	gzf1	99	53.945	ENSODEG00000013020	GZF1	98	54.494	Octodon_degus
ENSXETG00000004510	gzf1	87	44.806	ENSONIG00000000989	GZF1	99	44.961	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	60.684	ENSOCUG00000025214	GZF1	99	60.684	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000004510	gzf1	69	63.750	ENSORLG00000010006	-	80	42.442	Oryzias_latipes
ENSXETG00000004510	gzf1	67	65.359	ENSORLG00020001395	-	72	44.498	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000004510	gzf1	67	65.359	ENSORLG00015015364	GZF1	72	44.497	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.831	ENSOGAG00000028389	GZF1	98	60.028	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.574	ENSPPAG00000028487	GZF1	98	59.775	Pan_paniscus
ENSXETG00000004510	gzf1	100	58.759	ENSPPRG00000010040	GZF1	100	59.366	Panthera_pardus
ENSXETG00000004510	gzf1	100	58.759	ENSPTIG00000019328	GZF1	100	59.366	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.490	ENSPTRG00000013320	GZF1	98	59.775	Pan_troglodytes
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.496	ENSPANG00000017419	GZF1	98	59.775	Papio_anubis
ENSXETG00000004510	gzf1	86	48.885	ENSPKIG00000003781	GZF1	77	48.885	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000004510	gzf1	87	51.402	ENSPSIG00000014208	-	86	48.991	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000004510	gzf1	100	63.418	ENSPSIG00000014455	GZF1	100	63.752	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000004510	gzf1	62	59.624	ENSPMGG00000003778	-	80	38.330	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000004510	gzf1	98	59.007	ENSPEMG00000011285	Gzf1	98	59.371	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000004510	gzf1	100	62.429	ENSPCIG00000013803	GZF1	100	62.429	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000004510	gzf1	61	65.552	ENSPFOG00000002393	GZF1	99	45.024	Poecilia_formosa
ENSXETG00000004510	gzf1	61	65.552	ENSPLAG00000005232	GZF1	93	44.968	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000004510	gzf1	61	52.874	ENSPMEG00000020017	-	69	43.407	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000004510	gzf1	58	57.785	ENSPREG00000016398	GZF1	72	39.394	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000004510	gzf1	75	71.802	ENSPPYG00000010766	GZF1	93	67.347	Pongo_abelii
ENSXETG00000004510	gzf1	82	61.433	ENSPCAG00000007544	GZF1	99	60.922	Procavia_capensis
ENSXETG00000004510	gzf1	100	58.921	ENSPCOG00000024180	GZF1	100	59.270	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000004510	gzf1	99	60.169	ENSPVAG00000014056	GZF1	98	60.423	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000004510	gzf1	55	51.440	ENSPNYG00000000788	-	54	51.440	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.317	ENSRNOG00000004735	Gzf1	99	59.317	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.914	ENSRBIG00000028715	GZF1	98	59.775	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.053	ENSRROG00000030533	GZF1	98	58.914	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.123	ENSSBOG00000018893	GZF1	98	59.322	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000004510	gzf1	100	61.528	ENSSHAG00000009367	GZF1	100	61.723	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000004510	gzf1	88	46.841	ENSSFOG00015008631	gzf1	74	47.840	Scleropages_formosus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	41.473	ENSSDUG00000008186	GZF1	83	41.826	Seriola_dumerili
ENSXETG00000004510	gzf1	99	41.644	ENSSLDG00000002382	GZF1	83	41.781	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000004510	gzf1	75	73.458	ENSSARG00000010285	GZF1	74	73.458	Sorex_araneus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	56.463	ENSSPUG00000004147	GZF1	100	59.085	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000004510	gzf1	59	50.973	ENSSPAG00000011759	GZF1	75	43.889	Stegastes_partitus
ENSXETG00000004510	gzf1	85	57.143	ENSSSCG00000007117	GZF1	100	57.143	Sus_scrofa
ENSXETG00000004510	gzf1	94	41.972	ENSTRUG00000006128	-	84	42.837	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000004510	gzf1	87	45.752	ENSTNIG00000010722	GZF1	99	45.752	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000004510	gzf1	99	58.520	ENSTTRG00000011345	GZF1	98	58.906	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000004510	gzf1	54	68.095	ENSUAMG00000021858	-	95	68.095	Ursus_americanus
ENSXETG00000004510	gzf1	99	59.358	ENSUMAG00000004065	GZF1	98	59.034	Ursus_maritimus
ENSXETG00000004510	gzf1	100	59.610	ENSVVUG00000012086	GZF1	100	59.945	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000004510	gzf1	62	64.401	ENSXMAG00000023249	GZF1	75	45.000	Xiphophorus_maculatus