EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000006040 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: hras
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis Harvey rat sarcoma viral oncogene homolog (hras)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 26066 bases
Position: chrGL173034.1:392805-418870
Accession: NM_001017003
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000013308	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000013308	-	1743	-	ENSXETP00000013308	189 (aa)	XP_012816616	Q28EW2

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000006040's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000006040's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000006040	hras	94	34.973	ENSXETG00000013633	rab30	89	34.973
ENSXETG00000006040	hras	85	31.902	ENSXETG00000002305	rab5a	75	31.902
ENSXETG00000006040	hras	81	37.419	ENSXETG00000026943	rab35	76	37.419
ENSXETG00000006040	hras	86	48.780	ENSXETG00000007760	rap2b	90	48.780
ENSXETG00000006040	hras	88	34.911	ENSXETG00000020404	rab25	72	33.758
ENSXETG00000006040	hras	92	38.764	ENSXETG00000016920	rab33b	77	38.983
ENSXETG00000006040	hras	83	30.189	ENSXETG00000008055	rab3b	81	30.189
ENSXETG00000006040	hras	68	36.923	ENSXETG00000020729	rab13	94	34.211
ENSXETG00000006040	hras	85	35.185	ENSXETG00000017184	rab2b	69	34.667
ENSXETG00000006040	hras	95	30.769	ENSXETG00000002201	rab15	80	30.000
ENSXETG00000006040	hras	98	54.787	ENSXETG00000005505	MRAS	88	54.787
ENSXETG00000006040	hras	92	32.222	ENSXETG00000030983	RASL11A	73	32.222
ENSXETG00000006040	hras	84	34.356	ENSXETG00000018133	rab9b	76	32.895
ENSXETG00000006040	hras	83	32.278	ENSXETG00000030938	rab41	74	32.278
ENSXETG00000006040	hras	88	38.095	ENSXETG00000022517	rerg	84	38.095
ENSXETG00000006040	hras	87	33.133	ENSXETG00000004556	rab18	81	33.133
ENSXETG00000006040	hras	88	94.012	ENSXETG00000003398	kras	99	86.170
ENSXETG00000006040	hras	70	33.088	ENSXETG00000003868	nkiras1	86	31.200
ENSXETG00000006040	hras	84	36.250	ENSXETG00000025484	rab11b.1	67	35.333
ENSXETG00000006040	hras	83	32.278	ENSXETG00000023200	rab6a	83	32.278
ENSXETG00000006040	hras	98	86.022	ENSXETG00000021449	nras	97	86.022
ENSXETG00000006040	hras	85	35.802	ENSXETG00000021890	rab11b.2	68	34.667
ENSXETG00000006040	hras	86	36.970	ENSXETG00000014011	rab1a	94	35.233
ENSXETG00000006040	hras	92	31.148	ENSXETG00000018183	rab33a	85	31.148
ENSXETG00000006040	hras	88	95.210	ENSXETG00000014935	ralb	99	86.702
ENSXETG00000006040	hras	84	34.756	ENSXETG00000013345	rab9a	76	33.333
ENSXETG00000006040	hras	91	35.028	ENSXETG00000011370	rab35	87	35.028
ENSXETG00000006040	hras	86	38.554	ENSXETG00000032443	RAB39B	78	38.554
ENSXETG00000006040	hras	85	30.488	ENSXETG00000020622	rab39a	73	30.464
ENSXETG00000006040	hras	66	30.952	ENSXETG00000031363	-	58	32.231
ENSXETG00000006040	hras	85	37.654	ENSXETG00000006639	rab11a	69	36.667

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSG00000174775	HRAS	100	96.296	Homo_sapiens
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSAPOG00000023684	hrasb	100	95.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000006040	hras	100	94.180	ENSAMEG00000010515	HRAS	75	94.180	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSACIG00000000699	hrasb	100	95.767	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSAOCG00000011843	hrasb	100	95.767	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSAPEG00000009546	hrasb	100	95.767	Amphiprion_percula
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSATEG00000020001	hrasb	100	95.767	Anabas_testudineus
ENSXETG00000006040	hras	87	100.000	ENSAPLG00000012248	HRAS	100	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000006040	hras	100	97.354	ENSACAG00000014920	HRAS	100	97.354	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSANAG00000034201	HRAS	100	96.296	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSACLG00000001181	hrasb	100	95.238	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSAMXG00000033907	hrasb	100	95.238	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSAMXG00000035885	hrasa	100	96.296	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000006040	hras	100	93.122	ENSBTAG00000046644	HRAS	100	93.122	Bos_taurus
ENSXETG00000006040	hras	96	77.348	WBGene00002335	let-60	98	77.348	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSCJAG00000012199	HRAS	100	96.296	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000006040	hras	79	98.667	ENSCAFG00000031029	HRAS	60	98.667	Canis_familiaris
ENSXETG00000006040	hras	89	98.214	ENSCAFG00020007059	HRAS	89	98.675	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000006040	hras	100	93.651	ENSCHIG00000004808	HRAS	100	93.651	Capra_hircus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSTSYG00000003745	HRAS	100	96.296	Carlito_syrichta
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSCAPG00000000745	HRAS	100	95.767	Cavia_aperea
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSCPOG00000000101	HRAS	100	95.767	Cavia_porcellus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSCCAG00000031453	HRAS	100	96.296	Cebus_capucinus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSCATG00000031194	HRAS	100	96.296	Cercocebus_atys
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSCLAG00000002823	HRAS	100	95.767	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSCSAG00000011033	HRAS	100	96.296	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000006040	hras	100	97.354	ENSCPBG00000013941	-	100	97.354	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSCANG00000017827	HRAS	100	96.296	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSCGRG00001018735	Hras	100	96.296	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSCGRG00000010918	Hras	100	96.296	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSCSEG00000007927	hrasb	100	95.767	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSCVAG00000008670	hrasb	100	95.238	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSDARG00000005651	hrasb	100	98.611	Danio_rerio
ENSXETG00000006040	hras	99	81.383	ENSDARG00000013161	zgc:55558	89	89.820	Danio_rerio
ENSXETG00000006040	hras	100	94.709	ENSDARG00000098497	hrasa	100	94.709	Danio_rerio
ENSXETG00000006040	hras	99	93.617	ENSDNOG00000015293	HRAS	99	93.617	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSDORG00000028079	Hras	100	96.296	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000006040	hras	93	80.663	FBgn0003205	Ras85D	96	80.663	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSETEG00000019899	HRAS	100	95.767	Echinops_telfairi
ENSXETG00000006040	hras	100	89.947	ENSEBUG00000004670	hrasb	100	89.947	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000006040	hras	100	94.180	ENSECAG00000008473	HRAS	100	94.180	Equus_caballus
ENSXETG00000006040	hras	79	97.333	ENSEEUG00000014548	HRAS	87	97.333	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSELUG00000004712	HRAS	100	95.767	Esox_lucius
ENSXETG00000006040	hras	100	94.180	ENSFCAG00000002990	HRAS	100	94.180	Felis_catus
ENSXETG00000006040	hras	100	98.413	ENSFALG00000012145	HRAS	100	98.413	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSFDAG00000006760	HRAS	100	96.296	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSFHEG00000010055	hrasb	100	95.238	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000006040	hras	94	97.740	ENSGMOG00000010196	hrasb	95	97.740	Gadus_morhua
ENSXETG00000006040	hras	100	97.884	ENSGALG00000029260	H-RAS	100	97.884	Gallus_gallus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSGAFG00000021814	hrasb	100	95.767	Gambusia_affinis
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSGACG00000011340	hrasb	100	95.767	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000006040	hras	100	97.354	ENSGAGG00000019886	-	100	97.354	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSGGOG00000015438	HRAS	100	95.767	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSHBUG00000011998	hrasb	100	95.238	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSHGLG00000004508	HRAS	100	95.767	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSHGLG00100012888	HRAS	100	95.767	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSIPUG00000006053	hras	100	95.238	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSIPUG00000022502	hrasb	100	95.238	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSSTOG00000021206	HRAS	100	96.296	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000006040	hras	100	86.772	ENSJJAG00000011743	-	100	86.772	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSJJAG00000022529	-	100	95.767	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSKMAG00000001922	Ha-ras	100	95.767	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSLBEG00000001905	hrasb	100	95.767	Labrus_bergylta
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSLACG00000018427	HRAS	100	96.296	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000006040	hras	100	96.825	ENSLOCG00000000684	hrasb	100	96.825	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSMFAG00000039003	HRAS	100	96.296	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSMMUG00000021659	HRAS	100	96.296	Macaca_mulatta
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSMNEG00000039358	HRAS	100	96.296	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSMLEG00000042070	HRAS	100	96.296	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSMAMG00000004359	hrasb	100	95.767	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSMZEG00005017583	hrasb	100	95.238	Maylandia_zebra
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSMAUG00000020006	Hras	100	96.296	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSMICG00000006472	HRAS	100	95.767	Microcebus_murinus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSMOCG00000000744	Hras	100	96.296	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000006040	hras	79	99.333	ENSMODG00000016580	HRAS	71	99.333	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSMALG00000011273	hrasb	100	95.767	Monopterus_albus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	MGP_CAROLIEiJ_G0030681	Hras	100	95.767	Mus_caroli
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSMUSG00000025499	Hras	100	96.296	Mus_musculus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	MGP_PahariEiJ_G0013880	Hras	100	95.767	Mus_pahari
ENSXETG00000006040	hras	100	85.714	MGP_SPRETEiJ_G0031792	-	100	85.714	Mus_spretus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSNGAG00000022044	Hras	100	96.296	Nannospalax_galili
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSNLEG00000008300	HRAS	100	96.296	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSODEG00000015703	HRAS	100	95.767	Octodon_degus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSONIG00000014560	hrasb	100	95.767	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSORLG00000018912	hrasb	100	95.238	Oryzias_latipes
ENSXETG00000006040	hras	88	90.419	ENSORLG00000024443	zgc:55558	90	90.419	Oryzias_latipes
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSORLG00020008129	hras	100	95.238	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000006040	hras	88	90.419	ENSORLG00020013690	zgc:55558	90	90.419	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000006040	hras	88	90.419	ENSORLG00015003353	zgc:55558	90	90.419	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000006040	hras	100	94.180	ENSOMEG00000018719	hrasb	100	94.180	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000006040	hras	88	91.018	ENSOMEG00000016685	zgc:55558	90	91.018	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000006040	hras	100	94.709	ENSOGAG00000024846	HRAS	100	94.709	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000006040	hras	79	98.000	ENSOARG00000007365	HRAS	99	98.000	Ovis_aries
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSPPAG00000028620	HRAS	100	96.296	Pan_paniscus
ENSXETG00000006040	hras	79	98.667	ENSPPRG00000008185	HRAS	88	98.667	Panthera_pardus
ENSXETG00000006040	hras	70	98.496	ENSPTIG00000006043	HRAS	100	98.496	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSPTRG00000034469	HRAS	100	96.296	Pan_troglodytes
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSPANG00000008022	-	100	96.296	Papio_anubis
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSPANG00000016633	-	100	95.767	Papio_anubis
ENSXETG00000006040	hras	100	96.825	ENSPKIG00000000303	HRAS	100	96.825	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000006040	hras	99	95.213	ENSPKIG00000013507	hrasb	100	94.709	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000006040	hras	100	96.825	ENSPSIG00000014690	HRAS	99	96.825	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000006040	hras	96	97.790	ENSPMGG00000005812	HRAS	88	97.790	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000006040	hras	70	93.233	ENSPMGG00000014517	zgc:55558	94	93.233	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSPEMG00000013973	-	100	96.296	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000006040	hras	100	89.947	ENSPMAG00000004548	hrasb	98	89.947	Petromyzon_marinus
ENSXETG00000006040	hras	100	97.884	ENSPCIG00000008359	HRAS	100	97.884	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSPFOG00000002595	hrasb	100	95.767	Poecilia_formosa
ENSXETG00000006040	hras	100	94.709	ENSPLAG00000003379	hrasb	100	94.709	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSPMEG00000020891	hrasb	100	95.767	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSPREG00000019341	hrasb	100	95.767	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSPPYG00000002868	HRAS	100	96.296	Pongo_abelii
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSPCOG00000021838	HRAS	100	95.767	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSPNYG00000015124	hrasb	100	95.238	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSPNAG00000000584	hrasb	100	95.238	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSPNAG00000014085	hrasa	100	95.767	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSRNOG00000016611	Hras	100	96.296	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSRBIG00000034835	HRAS	100	96.296	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSRROG00000041325	HRAS	100	96.296	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSSBOG00000023272	HRAS	100	96.296	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000006040	hras	96	55.135	ENSSHAG00000004318	-	92	55.135	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSSFOG00015011157	-	100	96.296	Scleropages_formosus
ENSXETG00000006040	hras	100	96.296	ENSSFOG00015003051	hrasb	100	96.296	Scleropages_formosus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSSMAG00000008745	hrasb	100	95.767	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSSDUG00000019086	hrasb	100	95.767	Seriola_dumerili
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSSLDG00000012627	hrasb	100	95.767	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000006040	hras	100	97.354	ENSSPUG00000005243	HRAS	100	97.354	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.238	ENSSPAG00000007357	hrasb	100	95.238	Stegastes_partitus
ENSXETG00000006040	hras	100	94.709	ENSSSCG00000031513	HRAS	100	94.709	Sus_scrofa
ENSXETG00000006040	hras	100	98.413	ENSTGUG00000009877	HRAS	100	98.413	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000006040	hras	100	94.709	ENSTRUG00000024825	hrasb	100	94.709	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000006040	hras	100	94.709	ENSTNIG00000011385	hrasb	100	94.709	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000006040	hras	100	93.651	ENSTTRG00000011120	HRAS	100	93.651	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000006040	hras	100	94.180	ENSUAMG00000027527	-	100	94.180	Ursus_americanus
ENSXETG00000006040	hras	100	94.180	ENSUMAG00000005506	-	100	94.180	Ursus_maritimus
ENSXETG00000006040	hras	100	94.180	ENSVVUG00000017151	HRAS	100	94.180	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000006040	hras	98	94.681	ENSXCOG00000020608	hrasb	94	95.420	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000006040	hras	100	95.767	ENSXMAG00000015132	hrasb	100	95.767	Xiphophorus_maculatus