EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000006939 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ftsj3
Alias: -
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 3
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 166728 bases
Position: chrGL173525.1:103110-269837
Accession: XB-GENE-5797493
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000015145	FtsJ	PF01728.19	1.5e-56	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000015145	-	2486	-	ENSXETP00000015145	828 (aa)	-	F6WUN0

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000006939's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000006939's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.401	ENSG00000108592	FTSJ3	85	82.946	Homo_sapiens
ENSXETG00000006939	ftsj3	73	61.905	ENSAPOG00000005543	ftsj3	91	57.053	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	56.888	ENSAMEG00000003148	FTSJ3	97	58.901	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000006939	ftsj3	83	64.835	ENSACIG00000012880	ftsj3	89	64.835	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000006939	ftsj3	90	63.084	ENSAOCG00000023196	ftsj3	94	56.532	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000006939	ftsj3	90	61.682	ENSAPEG00000004250	ftsj3	95	56.413	Amphiprion_percula
ENSXETG00000006939	ftsj3	84	60.648	ENSATEG00000010069	ftsj3	97	55.025	Anabas_testudineus
ENSXETG00000006939	ftsj3	83	69.192	ENSAPLG00000010362	-	99	51.119	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000006939	ftsj3	55	53.249	ENSACAG00000017930	FTSJ3	99	53.956	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.485	ENSANAG00000033774	FTSJ3	97	58.629	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000006939	ftsj3	82	69.101	ENSACLG00000019137	ftsj3	94	69.101	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	56.346	ENSAMXG00000021571	ftsj3	92	57.346	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	59.255	ENSBTAG00000021060	FTSJ3	97	59.810	Bos_taurus
ENSXETG00000006939	ftsj3	74	43.779	WBGene00019168	H06I04.3	97	36.702	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.160	ENSCJAG00000019631	FTSJ3	97	58.057	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	57.533	ENSCAFG00000012770	FTSJ3	97	57.888	Canis_familiaris
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	57.109	ENSCAFG00020026630	FTSJ3	97	57.363	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000006939	ftsj3	88	70.098	ENSCHIG00000025676	FTSJ3	97	60.095	Capra_hircus
ENSXETG00000006939	ftsj3	98	56.634	ENSTSYG00000001393	FTSJ3	98	57.230	Carlito_syrichta
ENSXETG00000006939	ftsj3	72	60.059	ENSCAPG00000016654	FTSJ3	90	73.171	Cavia_aperea
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	61.567	ENSCPOG00000011384	FTSJ3	97	58.962	Cavia_porcellus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.536	ENSCCAG00000023533	-	97	58.726	Cebus_capucinus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.057	ENSCATG00000018510	FTSJ3	97	57.715	Cercocebus_atys
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.109	ENSCLAG00000003222	FTSJ3	97	59.011	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	56.940	ENSCSAG00000003921	FTSJ3	97	57.647	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000006939	ftsj3	89	73.184	ENSCPBG00000010032	FTSJ3	94	73.184	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000006939	ftsj3	57	55.518	ENSCING00000025069	-	95	39.110	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000006939	ftsj3	56	53.873	ENSCSAVG00000003607	-	95	37.740	Ciona_savignyi
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.641	ENSCANG00000042921	FTSJ3	97	58.580	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	59.639	ENSCGRG00001018068	FTSJ3	97	59.809	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	59.639	ENSCGRG00000010648	FTSJ3	97	59.809	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	54.620	ENSCSEG00000013468	ftsj3	93	55.792	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	56.786	ENSCVAG00000007484	ftsj3	95	57.794	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	56.138	ENSDARG00000104938	ftsj3	95	57.826	Danio_rerio
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	57.007	ENSDNOG00000002392	FTSJ3	97	58.600	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.575	ENSDORG00000004200	Ftsj3	97	59.572	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000006939	ftsj3	71	47.750	FBgn0030720	CG8939	96	37.602	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	57.143	ENSETEG00000019228	FTSJ3	97	59.237	Echinops_telfairi
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	47.229	ENSEBUG00000007828	ftsj3	94	47.653	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	58.740	ENSEASG00005013565	FTSJ3	92	71.351	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.675	ENSECAG00000011995	FTSJ3	99	57.143	Equus_caballus
ENSXETG00000006939	ftsj3	66	60.650	ENSFCAG00000013983	FTSJ3	97	58.164	Felis_catus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.126	ENSFALG00000013635	FTSJ3	97	58.148	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.696	ENSFDAG00000010274	FTSJ3	97	59.091	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.280	ENSFHEG00000007639	ftsj3	95	57.623	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000006939	ftsj3	91	61.207	ENSGALG00000032993	FTSJ3	97	57.633	Gallus_gallus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	59.401	ENSGAGG00000006236	FTSJ3	96	60.024	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.297	ENSGGOG00000006794	FTSJ3	97	58.107	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	62.018	ENSHBUG00000022331	ftsj3	94	58.711	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.454	ENSHGLG00000012282	FTSJ3	97	59.476	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.454	ENSHGLG00100003578	FTSJ3	97	59.476	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	59.817	ENSHCOG00000018770	ftsj3	94	55.844	Hippocampus_comes
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	55.648	ENSIPUG00000024942	ftsj3	92	56.686	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	56.147	ENSSTOG00000021265	FTSJ3	97	58.608	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.605	ENSJJAG00000012822	Ftsj3	97	59.431	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.246	ENSKMAG00000021997	ftsj3	94	57.126	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	56.423	ENSLBEG00000027142	ftsj3	94	57.160	Labrus_bergylta
ENSXETG00000006939	ftsj3	78	43.982	ENSLACG00000005523	FTSJ3	91	45.185	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	59.779	ENSLOCG00000008979	ftsj3	96	55.294	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	58.817	ENSLAFG00000003252	FTSJ3	97	59.290	Loxodonta_africana
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.332	ENSMFAG00000003764	FTSJ3	97	57.969	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000006939	ftsj3	82	71.795	ENSMMUG00000016768	FTSJ3	97	56.028	Macaca_mulatta
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.263	ENSMNEG00000029254	FTSJ3	97	57.901	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.314	ENSMLEG00000029091	FTSJ3	97	57.870	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000006939	ftsj3	86	59.728	ENSMAMG00000006408	ftsj3	91	60.465	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000006939	ftsj3	90	64.186	ENSMZEG00005001992	ftsj3	94	57.895	Maylandia_zebra
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	54.704	ENSMGAG00000000953	FTSJ3	97	55.128	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	59.008	ENSMAUG00000015688	Ftsj3	97	59.379	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.401	ENSMICG00000045996	FTSJ3	97	58.768	Microcebus_murinus
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	58.534	ENSMOCG00000017809	Ftsj3	97	59.140	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000006939	ftsj3	90	62.100	ENSMMOG00000019522	ftsj3	87	57.432	Mola_mola
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.493	ENSMODG00000009901	FTSJ3	96	58.993	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.363	MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	97	59.386	Mus_caroli
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.513	ENSMUSG00000020706	Ftsj3	97	58.706	Mus_musculus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.983	MGP_PahariEiJ_G0018445	Ftsj3	97	58.754	Mus_pahari
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	59.184	MGP_SPRETEiJ_G0018159	Ftsj3	97	58.768	Mus_spretus
ENSXETG00000006939	ftsj3	89	66.986	ENSMPUG00000014911	FTSJ3	97	58.195	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	61.049	ENSMLUG00000011667	FTSJ3	97	58.760	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.965	ENSNGAG00000005899	Ftsj3	97	58.670	Nannospalax_galili
ENSXETG00000006939	ftsj3	83	68.306	ENSNBRG00000017453	ftsj3	95	68.306	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.914	ENSNLEG00000004188	FTSJ3	97	58.244	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	53.486	ENSMEUG00000013252	FTSJ3	97	54.447	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.053	ENSOPRG00000014985	FTSJ3	97	59.189	Ochotona_princeps
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	58.383	ENSODEG00000008167	FTSJ3	97	59.620	Octodon_degus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.228	ENSONIG00000001654	ftsj3	94	58.065	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	59.042	ENSOCUG00000004319	FTSJ3	97	59.330	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	55.689	ENSORLG00000005910	ftsj3	94	56.527	Oryzias_latipes
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	55.569	ENSORLG00020021255	ftsj3	88	64.516	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	55.755	ENSORLG00015018416	ftsj3	94	56.475	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000006939	ftsj3	89	65.657	ENSOMEG00000014432	ftsj3	88	64.059	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	58.273	ENSOGAG00000032479	FTSJ3	97	58.907	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.313	ENSOARG00000013637	FTSJ3	97	59.595	Ovis_aries
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.349	ENSPPAG00000027297	FTSJ3	97	58.531	Pan_paniscus
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	57.807	ENSPPRG00000003042	FTSJ3	97	58.164	Panthera_pardus
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	57.227	ENSPTIG00000012576	FTSJ3	97	57.583	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.297	ENSPTRG00000009524	FTSJ3	97	58.580	Pan_troglodytes
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.194	ENSPANG00000020978	FTSJ3	97	57.851	Papio_anubis
ENSXETG00000006939	ftsj3	87	67.539	ENSPKIG00000012838	ftsj3	96	56.730	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000006939	ftsj3	82	60.748	ENSPMGG00000012959	ftsj3	91	60.352	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	59.058	ENSPEMG00000000248	Ftsj3	97	59.427	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	61.698	ENSPCIG00000009088	FTSJ3	97	58.243	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	54.911	ENSPFOG00000023101	ftsj3	95	56.635	Poecilia_formosa
ENSXETG00000006939	ftsj3	90	61.215	ENSPLAG00000003846	ftsj3	95	56.517	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	56.353	ENSPREG00000014874	ftsj3	95	56.471	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.762	ENSPPYG00000008532	FTSJ3	97	58.234	Pongo_abelii
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	57.770	ENSPCAG00000002560	FTSJ3	97	57.801	Procavia_capensis
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	61.194	ENSPCOG00000023921	FTSJ3	97	58.901	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	60.448	ENSPVAG00000000162	FTSJ3	97	57.988	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000006939	ftsj3	83	68.306	ENSPNYG00000005108	ftsj3	94	68.306	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	60.256	ENSPNAG00000022474	ftsj3	95	55.201	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.604	ENSRNOG00000009857	Ftsj3	96	59.498	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.762	ENSRBIG00000039259	FTSJ3	97	58.274	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.882	ENSRROG00000045002	FTSJ3	97	58.392	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000006939	ftsj3	72	40.690	YCL054W	-	96	34.023	Saccharomyces_cerevisiae
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	57.074	ENSSBOG00000031794	FTSJ3	90	58.719	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	62.264	ENSSHAG00000013062	FTSJ3	97	58.314	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	55.263	ENSSFOG00015018053	ftsj3	94	56.243	Scleropages_formosus
ENSXETG00000006939	ftsj3	63	73.941	ENSSMAG00000002863	ftsj3	94	57.262	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	55.872	ENSSDUG00000003385	ftsj3	93	56.738	Seriola_dumerili
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	56.734	ENSSLDG00000017970	ftsj3	93	57.651	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000006939	ftsj3	93	57.070	ENSSPUG00000012959	FTSJ3	97	57.746	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000006939	ftsj3	90	63.084	ENSSPAG00000002390	ftsj3	94	57.177	Stegastes_partitus
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.824	ENSSSCG00000017288	FTSJ3	97	59.431	Sus_scrofa
ENSXETG00000006939	ftsj3	83	62.903	ENSTRUG00000017550	ftsj3	94	57.399	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	55.437	ENSTNIG00000015549	ftsj3	96	55.910	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	54.132	ENSTBEG00000010295	FTSJ3	97	54.923	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000006939	ftsj3	99	58.612	ENSTTRG00000006973	FTSJ3	97	59.215	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000006939	ftsj3	82	84.685	ENSUAMG00000007332	FTSJ3	92	84.685	Ursus_americanus
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	61.682	ENSUMAG00000017450	FTSJ3	97	58.732	Ursus_maritimus
ENSXETG00000006939	ftsj3	100	57.683	ENSVVUG00000006106	FTSJ3	97	58.343	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000006939	ftsj3	83	65.385	ENSXCOG00000002999	ftsj3	86	65.385	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000006939	ftsj3	64	59.712	ENSXMAG00000018139	ftsj3	94	56.398	Xiphophorus_maculatus