EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000008007 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: apobec2
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis apolipoprotein B mRNA editing enzyme%2C catalytic polypeptide-like 2 (apobec2)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13839 bases
Position: chrGL173148.1:732980-746818
Accession: NM_001006721
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000017542	APOBEC_N	PF08210.11	2.4e-47	1	1
ENSXETP00000017542	APOBEC_C	PF05240.14	2.4e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000017542	-	2507	-	ENSXETP00000017542	234 (aa)	-	Q6DIS6

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000008007's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000008007's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSG00000124701	APOBEC2	93	53.425	Homo_sapiens
ENSXETG00000008007	apobec2	89	49.763	ENSAPOG00000019390	apobec2b	72	49.763	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000008007	apobec2	79	51.053	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	71	51.053	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000008007	apobec2	100	46.610	ENSACIG00000002472	APOBEC2	92	46.610	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000008007	apobec2	82	46.392	ENSACIG00000016370	apobec2a	70	46.392	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000008007	apobec2	93	47.748	ENSAOCG00000003291	apobec2a	85	47.748	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000008007	apobec2	89	50.237	ENSAOCG00000023355	apobec2b	72	50.237	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000008007	apobec2	89	49.763	ENSAPEG00000004591	apobec2b	72	49.763	Amphiprion_percula
ENSXETG00000008007	apobec2	89	48.815	ENSAPEG00000003630	apobec2a	80	48.815	Amphiprion_percula
ENSXETG00000008007	apobec2	84	49.246	ENSATEG00000023043	APOBEC2	68	49.246	Anabas_testudineus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	47.236	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	46.277	Anabas_testudineus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	56.061	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	97	52.609	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000008007	apobec2	98	46.983	ENSACAG00000016506	APOBEC2	94	54.011	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSANAG00000026993	APOBEC2	100	50.000	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000008007	apobec2	84	52.261	ENSACLG00000007634	APOBEC2	68	52.261	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000008007	apobec2	79	44.385	ENSACLG00000026736	-	96	44.385	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000008007	apobec2	92	49.115	ENSAMXG00000015966	apobec2b	75	49.115	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000008007	apobec2	88	45.540	ENSAMXG00000042992	apobec2a	91	42.915	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	72	50.420	Bos_taurus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	100	50.420	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	51.142	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	100	48.319	Canis_familiaris
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.055	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	100	49.160	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	100	50.840	Capra_hircus
ENSXETG00000008007	apobec2	100	50.000	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	100	50.000	Carlito_syrichta
ENSXETG00000008007	apobec2	100	50.628	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	100	50.209	Cavia_aperea
ENSXETG00000008007	apobec2	100	50.628	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	100	50.209	Cavia_porcellus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	100	50.000	Cebus_capucinus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSCATG00000010691	APOBEC2	100	50.840	Cercocebus_atys
ENSXETG00000008007	apobec2	100	50.209	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	100	49.791	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	100	50.420	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000008007	apobec2	79	53.158	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	99	53.158	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000008007	apobec2	97	51.965	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	99	52.609	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSCANG00000035072	APOBEC2	100	50.420	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSCGRG00001014983	Apobec2	93	52.968	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSCGRG00000007835	Apobec2	93	52.968	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000008007	apobec2	89	47.867	ENSCSEG00000020201	apobec2a	78	47.867	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000008007	apobec2	84	49.246	ENSCSEG00000000690	-	76	47.489	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000008007	apobec2	84	51.256	ENSCVAG00000012342	apobec2b	69	51.256	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	49.107	ENSDARG00000113992	apobec2b	77	49.107	Danio_rerio
ENSXETG00000008007	apobec2	86	49.010	ENSDARG00000018881	apobec2a	84	45.378	Danio_rerio
ENSXETG00000008007	apobec2	86	37.441	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	93	37.333	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000008007	apobec2	100	48.750	ENSDORG00000006447	Apobec2	100	48.750	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000008007	apobec2	92	50.679	ENSETEG00000000624	APOBEC2	100	48.133	Echinops_telfairi
ENSXETG00000008007	apobec2	82	51.795	ENSEASG00005002937	APOBEC2	100	51.795	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000008007	apobec2	100	50.840	ENSECAG00000006576	APOBEC2	100	50.840	Equus_caballus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	100	50.420	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	49.495	ENSELUG00000003736	apobec2a	71	48.387	Esox_lucius
ENSXETG00000008007	apobec2	92	50.685	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	93	50.685	Felis_catus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	49.246	ENSFALG00000003910	APOBEC2	99	46.522	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000008007	apobec2	90	53.846	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	95	53.333	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000008007	apobec2	89	49.289	ENSFHEG00000005492	apobec2b	83	49.289	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	50.251	ENSGMOG00000006819	apobec2b	76	50.251	Gadus_morhua
ENSXETG00000008007	apobec2	79	45.989	ENSGMOG00000007028	apobec2a	99	45.989	Gadus_morhua
ENSXETG00000008007	apobec2	84	55.779	ENSGALG00000003226	APOBEC2	100	51.477	Gallus_gallus
ENSXETG00000008007	apobec2	99	47.009	ENSGAFG00000007634	apobec2b	70	47.009	Gambusia_affinis
ENSXETG00000008007	apobec2	85	46.535	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	46.535	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000008007	apobec2	89	51.659	ENSGACG00000009663	apobec2b	98	48.511	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000008007	apobec2	100	51.681	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	100	52.521	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	90	53.425	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000008007	apobec2	84	48.485	ENSHBUG00000015890	apobec2a	74	48.485	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000008007	apobec2	97	47.414	ENSHBUG00000005993	apobec2b	81	47.414	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000008007	apobec2	97	50.649	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	100	49.372	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000008007	apobec2	97	50.649	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	100	49.372	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000008007	apobec2	91	50.463	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	76	50.463	Hippocampus_comes
ENSXETG00000008007	apobec2	89	45.972	ENSHCOG00000020319	apobec2a	80	45.972	Hippocampus_comes
ENSXETG00000008007	apobec2	92	49.115	ENSIPUG00000013784	Apobec2	85	46.311	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	49.774	ENSIPUG00000017355	apobec2a	59	49.774	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.055	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	93	52.055	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSJJAG00000009733	Apobec2	100	50.420	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000008007	apobec2	91	48.661	ENSKMAG00000020631	apobec2b	79	48.661	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	52.261	ENSLBEG00000009422	-	65	52.261	Labrus_bergylta
ENSXETG00000008007	apobec2	99	44.206	ENSLBEG00000025214	apobec2a	90	44.206	Labrus_bergylta
ENSXETG00000008007	apobec2	99	51.695	ENSLACG00000015985	APOBEC2	95	51.695	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000008007	apobec2	92	54.378	ENSLOCG00000012415	apobec2b	78	51.724	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	93	52.968	Loxodonta_africana
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	100	50.420	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	100	50.420	Macaca_mulatta
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	100	50.420	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	100	50.420	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	49.749	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	67	49.749	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000008007	apobec2	91	49.091	ENSMAMG00000023685	apobec2a	81	49.091	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000008007	apobec2	85	47.761	ENSMZEG00005005240	-	83	52.273	Maylandia_zebra
ENSXETG00000008007	apobec2	84	51.759	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	68	51.759	Maylandia_zebra
ENSXETG00000008007	apobec2	84	55.779	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	97	51.477	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000008007	apobec2	100	50.420	ENSMAUG00000011016	Apobec2	100	50.420	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.511	ENSMICG00000043339	APOBEC2	93	52.511	Microcebus_murinus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSMOCG00000001904	Apobec2	100	50.000	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000008007	apobec2	55	34.375	ENSMMOG00000009531	-	67	34.375	Mola_mola
ENSXETG00000008007	apobec2	98	45.763	ENSMMOG00000008681	apobec2b	84	45.763	Mola_mola
ENSXETG00000008007	apobec2	91	53.571	ENSMODG00000013090	APOBEC2	97	53.333	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000008007	apobec2	91	47.664	ENSMALG00000013779	APOBEC2	90	44.490	Monopterus_albus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	47.739	ENSMALG00000020523	apobec2a	87	43.913	Monopterus_albus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.055	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	100	49.160	Mus_caroli
ENSXETG00000008007	apobec2	92	51.598	ENSMUSG00000040694	Apobec2	100	48.739	Mus_musculus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	51.598	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	100	48.739	Mus_pahari
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.055	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	89	52.055	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.055	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	90	52.055	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.511	ENSNGAG00000013717	Apobec2	100	49.580	Nannospalax_galili
ENSXETG00000008007	apobec2	84	50.754	ENSNBRG00000018806	apobec2b	61	50.754	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000008007	apobec2	85	48.756	ENSNBRG00000021776	apobec2a	74	48.990	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	100	50.420	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000008007	apobec2	91	53.778	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	97	53.778	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000008007	apobec2	100	50.628	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	100	50.209	Ochotona_princeps
ENSXETG00000008007	apobec2	97	51.515	ENSODEG00000016183	APOBEC2	92	51.515	Octodon_degus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	49.495	ENSONIG00000004644	-	74	49.495	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	51.759	ENSONIG00000012289	apobec2b	87	46.185	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000008007	apobec2	75	56.180	ENSOANG00000000824	APOBEC2	97	54.787	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000008007	apobec2	100	49.580	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	100	50.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	47.297	ENSORLG00000022372	APOBEC2	77	47.297	Oryzias_latipes
ENSXETG00000008007	apobec2	93	46.119	ENSORLG00000010752	apobec2a	86	46.119	Oryzias_latipes
ENSXETG00000008007	apobec2	92	47.297	ENSORLG00020006164	APOBEC2	77	47.297	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000008007	apobec2	93	46.119	ENSORLG00020004153	apobec2a	86	46.119	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000008007	apobec2	93	46.119	ENSORLG00015021781	apobec2a	86	46.119	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000008007	apobec2	92	47.297	ENSORLG00015022089	-	77	47.297	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000008007	apobec2	92	47.297	ENSOMEG00000015449	APOBEC2	88	46.288	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000008007	apobec2	94	44.344	ENSOMEG00000001311	apobec2a	87	44.344	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSOGAG00000002632	APOBEC2	93	52.968	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSOARG00000000820	APOBEC2	100	50.840	Ovis_aries
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSPPAG00000035598	APOBEC2	90	53.425	Pan_paniscus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	50.685	ENSPPRG00000008530	APOBEC2	93	50.685	Panthera_pardus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	51.142	ENSPTIG00000011084	APOBEC2	93	51.142	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSPTRG00000029679	APOBEC2	90	53.425	Pan_troglodytes
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSPANG00000007121	APOBEC2	100	50.420	Papio_anubis
ENSXETG00000008007	apobec2	94	49.327	ENSPKIG00000005395	apobec2a	85	49.327	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000008007	apobec2	89	49.289	ENSPKIG00000004741	apobec2b	71	49.289	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000008007	apobec2	83	56.345	ENSPSIG00000013480	APOBEC2	97	53.017	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000008007	apobec2	92	50.000	ENSPMGG00000004044	apobec2a	96	45.600	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000008007	apobec2	97	46.957	ENSPMGG00000002686	APOBEC2	64	46.957	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.511	ENSPEMG00000005724	Apobec2	100	49.580	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000008007	apobec2	99	47.009	ENSPFOG00000001216	apobec2b	81	47.009	Poecilia_formosa
ENSXETG00000008007	apobec2	99	47.009	ENSPLAG00000002074	apobec2b	88	45.532	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000008007	apobec2	99	47.009	ENSPMEG00000017537	apobec2b	81	47.009	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000008007	apobec2	99	47.009	ENSPREG00000020060	apobec2b	70	47.009	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSPPYG00000016586	APOBEC2	100	50.000	Pongo_abelii
ENSXETG00000008007	apobec2	84	55.224	ENSPCAG00000011433	APOBEC2	99	55.224	Procavia_capensis
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSPCOG00000026935	APOBEC2	93	53.425	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.511	ENSPVAG00000008316	APOBEC2	100	49.580	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	51.759	ENSPNYG00000016747	apobec2b	68	51.759	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000008007	apobec2	92	49.115	ENSPNAG00000013666	apobec2b	76	49.115	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000008007	apobec2	92	48.402	ENSPNAG00000010382	apobec2a	78	48.402	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.511	ENSRNOG00000012303	Apobec2	100	49.580	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	54.338	ENSRBIG00000044756	APOBEC2	100	51.261	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSRROG00000030082	APOBEC2	100	50.420	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSSBOG00000028496	APOBEC2	100	50.420	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000008007	apobec2	90	54.751	ENSSHAG00000017771	APOBEC2	96	54.222	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000008007	apobec2	77	41.848	ENSSFOG00015005437	-	71	41.848	Scleropages_formosus
ENSXETG00000008007	apobec2	93	49.554	ENSSFOG00015022920	apobec2	76	49.554	Scleropages_formosus
ENSXETG00000008007	apobec2	89	49.763	ENSSMAG00000005110	APOBEC2	67	50.754	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000008007	apobec2	89	46.919	ENSSMAG00000001011	apobec2a	59	46.919	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000008007	apobec2	94	48.869	ENSSDUG00000014543	apobec2b	74	48.869	Seriola_dumerili
ENSXETG00000008007	apobec2	89	47.393	ENSSDUG00000007013	apobec2a	78	47.393	Seriola_dumerili
ENSXETG00000008007	apobec2	89	47.393	ENSSLDG00000020199	apobec2a	78	47.393	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000008007	apobec2	94	48.869	ENSSLDG00000003321	apobec2b	74	48.869	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000008007	apobec2	83	55.612	ENSSPUG00000010839	APOBEC2	89	56.122	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000008007	apobec2	100	45.868	ENSSPAG00000005253	apobec2b	84	45.868	Stegastes_partitus
ENSXETG00000008007	apobec2	97	45.175	ENSSPAG00000016299	-	86	45.175	Stegastes_partitus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.968	ENSSSCG00000036018	APOBEC2	100	50.000	Sus_scrofa
ENSXETG00000008007	apobec2	84	56.061	ENSTGUG00000018533	APOBEC2	99	52.402	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000008007	apobec2	84	47.236	ENSTRUG00000012839	apobec2b	70	47.236	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000008007	apobec2	94	45.249	ENSTRUG00000009123	apobec2a	82	45.249	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000008007	apobec2	98	43.534	ENSTNIG00000015038	apobec2b	82	43.534	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000008007	apobec2	92	53.425	ENSTBEG00000003553	APOBEC2	100	50.840	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000008007	apobec2	100	50.840	ENSTTRG00000013392	APOBEC2	100	50.840	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.055	ENSUAMG00000027667	APOBEC2	100	49.167	Ursus_americanus
ENSXETG00000008007	apobec2	92	52.055	ENSVVUG00000026617	APOBEC2	100	49.160	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000008007	apobec2	89	49.289	ENSXCOG00000007398	apobec2b	85	45.690	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000008007	apobec2	84	50.251	ENSXMAG00000008134	apobec2b	81	46.186	Xiphophorus_maculatus