EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSXETG00000008061 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tut4
Alias: -
Full Name: terminal uridylyl transferase 4
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36939 bases
Position: chrGL172637.1:5537441-5574379
Accession: XB-GENE-1217309
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000017666	zf-CCHC	PF00098.23	8.1e-10	1	2
ENSXETP00000017666	zf-CCHC	PF00098.23	8.1e-10	2	2
ENSXETP00000017666	PAP_assoc	PF03828.19	7.7e-31	1	2
ENSXETP00000017666	PAP_assoc	PF03828.19	7.7e-31	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000017666	-	4493	-	ENSXETP00000017666	1367 (aa)	-	F6SNB9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000008061	tut4	67	68.129	ENSXETG00000017552	tut7	61	68.129

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000008061	tut4	98	61.171	ENSG00000134744	TUT4	99	64.244	Homo_sapiens
ENSXETG00000008061	tut4	98	61.239	ENSAMEG00000009340	TUT4	83	61.095	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000008061	tut4	70	61.471	ENSACIG00000018199	TUT4	99	60.735	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000008061	tut4	59	66.033	ENSACIG00000018887	-	84	50.000	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000008061	tut4	99	57.314	ENSAOCG00000007862	TUT4	87	57.274	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000008061	tut4	87	65.333	ENSAPEG00000019857	TUT4	90	55.978	Amphiprion_percula
ENSXETG00000008061	tut4	62	61.458	ENSATEG00000022516	-	92	55.193	Anabas_testudineus
ENSXETG00000008061	tut4	99	65.198	ENSATEG00000003823	TUT4	98	57.651	Anabas_testudineus
ENSXETG00000008061	tut4	98	65.824	ENSAPLG00000006345	TUT4	87	65.824	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000008061	tut4	99	64.941	ENSACAG00000008282	TUT4	89	65.010	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000008061	tut4	98	55.675	ENSANAG00000013486	TUT4	79	68.562	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000008061	tut4	99	57.880	ENSACLG00000023312	TUT4	91	58.321	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000008061	tut4	88	66.225	ENSAMXG00000007030	TUT4	89	58.794	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.879	ENSBTAG00000002721	TUT4	83	60.532	Bos_taurus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.673	ENSCJAG00000021588	TUT4	84	60.315	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000008061	tut4	98	61.143	ENSCAFG00000003734	TUT4	84	61.071	Canis_familiaris
ENSXETG00000008061	tut4	66	68.013	ENSCAFG00020010923	-	94	67.508	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000008061	tut4	100	59.944	ENSCHIG00000023944	TUT4	84	59.718	Capra_hircus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.967	ENSTSYG00000009885	TUT4	83	60.876	Carlito_syrichta
ENSXETG00000008061	tut4	97	53.091	ENSCAPG00000005680	TUT4	88	53.018	Cavia_aperea
ENSXETG00000008061	tut4	97	58.598	ENSCPOG00000005086	TUT4	86	59.321	Cavia_porcellus
ENSXETG00000008061	tut4	87	62.352	ENSCCAG00000036903	TUT4	78	68.562	Cebus_capucinus
ENSXETG00000008061	tut4	68	58.487	ENSCCAG00000025142	-	67	61.056	Cebus_capucinus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.158	ENSCATG00000024618	TUT4	84	59.942	Cercocebus_atys
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.958	ENSCLAG00000005255	TUT4	82	60.448	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.373	ENSCSAG00000001277	TUT4	83	60.879	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000008061	tut4	87	74.623	ENSCHOG00000010995	TUT4	78	74.747	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000008061	tut4	99	64.572	ENSCPBG00000014796	TUT4	88	64.799	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.272	ENSCANG00000036212	TUT4	79	68.562	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000008061	tut4	98	61.095	ENSCGRG00001020315	-	82	61.297	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000008061	tut4	98	61.095	ENSCGRG00000017571	Tut4	82	61.297	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000008061	tut4	70	61.696	ENSCSEG00000002476	TUT4	99	61.550	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000008061	tut4	88	63.024	ENSCVAG00000012659	TUT4	89	57.194	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000008061	tut4	70	60.209	ENSDARG00000101404	CABZ01065131.1	99	60.060	Danio_rerio
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.375	ENSDNOG00000013920	TUT4	82	60.519	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000008061	tut4	98	61.123	ENSDORG00000027891	Tut4	82	61.168	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000008061	tut4	73	89.744	ENSETEG00000016298	TUT4	63	89.744	Echinops_telfairi
ENSXETG00000008061	tut4	78	47.930	ENSEBUG00000009834	TUT4	88	48.325	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.604	ENSECAG00000021261	TUT4	82	60.373	Equus_caballus
ENSXETG00000008061	tut4	98	56.044	ENSEEUG00000003834	TUT4	78	56.752	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000008061	tut4	98	56.766	ENSELUG00000024167	TUT4	88	57.285	Esox_lucius
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.589	ENSFCAG00000003246	TUT4	84	60.562	Felis_catus
ENSXETG00000008061	tut4	99	66.127	ENSFALG00000005607	TUT4	87	66.127	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.057	ENSFDAG00000016676	TUT4	82	59.871	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000008061	tut4	69	61.991	ENSFHEG00000002296	-	99	61.388	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000008061	tut4	87	63.342	ENSGMOG00000001281	TUT4	98	58.321	Gadus_morhua
ENSXETG00000008061	tut4	97	65.303	ENSGALG00000010629	TUT4	88	65.328	Gallus_gallus
ENSXETG00000008061	tut4	70	63.314	ENSGAFG00000011427	-	100	62.389	Gambusia_affinis
ENSXETG00000008061	tut4	87	62.419	ENSGACG00000005282	-	98	56.998	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000008061	tut4	97	61.024	ENSGAGG00000020531	TUT4	86	60.300	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000008061	tut4	64	60.787	ENSHBUG00000008564	-	99	61.164	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.173	ENSHGLG00000000804	TUT4	82	60.057	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.173	ENSHGLG00100002051	TUT4	82	60.057	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000008061	tut4	70	55.954	ENSHCOG00000009746	-	98	59.009	Hippocampus_comes
ENSXETG00000008061	tut4	89	63.248	ENSIPUG00000002638	zcchc11	88	56.780	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.823	ENSSTOG00000015611	TUT4	82	60.704	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000008061	tut4	70	61.994	ENSKMAG00000017970	TUT4	99	60.983	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000008061	tut4	88	64.758	ENSLBEG00000006518	TUT4	89	57.567	Labrus_bergylta
ENSXETG00000008061	tut4	99	60.455	ENSLACG00000010748	TUT4	84	61.432	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000008061	tut4	92	66.623	ENSLOCG00000006248	TUT4	89	66.102	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000008061	tut4	98	61.295	ENSLAFG00000003763	TUT4	83	61.367	Loxodonta_africana
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.373	ENSMFAG00000011842	TUT4	84	60.879	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000008061	tut4	96	59.781	ENSMMUG00000017023	TUT4	79	68.227	Macaca_mulatta
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.157	ENSMNEG00000009839	TUT4	87	60.660	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.229	ENSMLEG00000036158	TUT4	84	59.871	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000008061	tut4	90	63.450	ENSMAMG00000014890	TUT4	89	57.992	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000008061	tut4	99	57.809	ENSMZEG00005017227	TUT4	88	58.321	Maylandia_zebra
ENSXETG00000008061	tut4	94	66.393	ENSMGAG00000011185	TUT4	99	66.592	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000008061	tut4	73	56.194	ENSMAUG00000010283	Tut4	77	56.194	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000008061	tut4	98	58.568	ENSMICG00000015853	TUT4	83	58.568	Microcebus_murinus
ENSXETG00000008061	tut4	73	55.683	ENSMOCG00000012851	Tut4	77	55.683	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000008061	tut4	62	63.889	ENSMMOG00000017546	-	93	46.003	Mola_mola
ENSXETG00000008061	tut4	64	60.153	ENSMMOG00000016870	-	99	61.103	Mola_mola
ENSXETG00000008061	tut4	98	64.424	ENSMODG00000000618	TUT4	86	65.086	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000008061	tut4	70	59.621	ENSMALG00000014488	-	100	59.216	Monopterus_albus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.188	MGP_CAROLIEiJ_G0026268	Tut4	82	60.405	Mus_caroli
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.188	ENSMUSG00000034610	Tut4	82	60.405	Mus_musculus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.889	MGP_PahariEiJ_G0028601	Tut4	82	61.107	Mus_pahari
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.276	MGP_SPRETEiJ_G0027237	Tut4	82	60.494	Mus_spretus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.290	ENSMPUG00000006880	TUT4	82	60.145	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.304	ENSMLUG00000001067	TUT4	82	60.260	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000008061	tut4	73	56.443	ENSNGAG00000011508	Tut4	77	56.443	Nannospalax_galili
ENSXETG00000008061	tut4	70	62.080	ENSNBRG00000005683	-	99	62.443	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.578	ENSNLEG00000017998	TUT4	84	60.857	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000008061	tut4	92	61.426	ENSMEUG00000003865	TUT4	78	62.048	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000008061	tut4	98	51.474	ENSOPRG00000016362	TUT4	83	51.439	Ochotona_princeps
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.637	ENSODEG00000007328	TUT4	82	60.492	Octodon_degus
ENSXETG00000008061	tut4	99	57.824	ENSONIG00000019455	TUT4	98	59.440	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000008061	tut4	95	61.000	ENSOANG00000012864	TUT4	86	61.258	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.722	ENSOCUG00000002390	TUT4	83	60.650	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000008061	tut4	70	61.621	ENSORLG00000013135	-	99	60.550	Oryzias_latipes
ENSXETG00000008061	tut4	70	61.468	ENSORLG00020002631	-	99	60.245	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000008061	tut4	70	61.963	ENSORLG00015001219	-	99	61.196	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000008061	tut4	69	58.270	ENSOMEG00000015574	-	99	58.877	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.143	ENSOGAG00000005425	TUT4	83	60.215	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.702	ENSOARG00000005494	TUT4	82	60.630	Ovis_aries
ENSXETG00000008061	tut4	98	59.471	ENSPPAG00000037653	TUT4	84	61.382	Pan_paniscus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.645	ENSPPRG00000020521	TUT4	83	60.904	Panthera_pardus
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.645	ENSPTIG00000010511	TUT4	83	60.904	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000008061	tut4	98	60.838	ENSPTRG00000000740	TUT4	84	60.259	Pan_troglodytes
ENSXETG00000008061	tut4	98	59.655	ENSPANG00000005042	TUT4	84	59.584	Papio_anubis
ENSXETG00000008061	tut4	70	61.877	ENSPKIG00000004670	TUT4	94	61.584	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000008061	tut4	97	64.224	ENSPSIG00000016704	TUT4	87	64.224	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000008061	tut4	73	55.654	ENSPEMG00000023722	Tut4	77	55.654	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000008061	tut4	99	62.569	ENSPCIG00000022380	TUT4	86	63.781	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000008061	tut4	98	57.328	ENSPFOG00000002439	TUT4	97	57.224	Poecilia_formosa
ENSXETG00000008061	tut4	65	62.722	ENSPLAG00000008701	-	100	61.652	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000008061	tut4	64	62.722	ENSPMEG00000006996	-	100	61.652	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000008061	tut4	98	61.449	ENSPPYG00000001347	TUT4	83	60.632	Pongo_abelii
ENSXETG00000008061	tut4	80	87.179	ENSPCAG00000013380	TUT4	75	87.179	Procavia_capensis
ENSXETG00000008061	tut4	98	56.969	ENSPCOG00000007824	TUT4	83	57.513	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000008061	tut4	95	72.093	ENSPVAG00000009804	TUT4	79	72.093	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000008061	tut4	99	57.809	ENSPNYG00000023175	TUT4	88	58.250	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000008061	tut4	87	64.745	ENSPNAG00000022786	TUT4	89	57.756	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000008061	tut4	98	57.962	ENSRNOG00000052062	Tut4	80	58.185	Rattus_norvegicus
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ENSXETG00000008061	tut4	98	60.876	ENSRROG00000034868	TUT4	98	60.876	Rhinopithecus_roxellana
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ENSXETG00000008061	tut4	98	60.604	ENSSBOG00000013661	TUT4	84	60.532	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000008061	tut4	89	70.161	ENSSHAG00000006231	TUT4	78	70.430	Sarcophilus_harrisii
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