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Description

Ensembl ID: ENSXETG00000009184 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: aco1
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis aconitase 1 (aco1)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 32519 bases
Position: chrGL172798.1:2021598-2054116
Accession: NM_001142171
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000020189	Aconitase	PF00330.20	4.6e-181	1	1
ENSXETP00000020189	Aconitase_C	PF00694.19	3.2e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000020189	-	3480	-	ENSXETP00000020189	899 (aa)	-	F7CI44

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000009184	aco1	98	58.333	ENSXETG00000009774	ireb2	91	58.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.281	ENSG00000122729	ACO1	99	85.281	Homo_sapiens
ENSXETG00000009184	aco1	99	80.335	ENSAPOG00000008670	aco1	99	80.335	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.400	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	84.400	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000009184	aco1	99	81.166	ENSACIG00000014377	aco1	99	81.166	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000009184	aco1	99	80.670	ENSAOCG00000007699	aco1	99	80.670	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000009184	aco1	99	80.559	ENSAPEG00000014370	aco1	99	80.559	Amphiprion_percula
ENSXETG00000009184	aco1	99	81.166	ENSATEG00000000560	aco1	99	81.166	Anabas_testudineus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.063	ENSAPLG00000015490	ACO1	100	84.063	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000009184	aco1	95	84.094	ENSACAG00000001541	ACO1	99	84.094	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.820	ENSANAG00000003359	ACO1	99	83.820	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000009184	aco1	99	79.933	ENSACLG00000007755	aco1	99	79.933	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000009184	aco1	99	81.390	ENSAMXG00000002499	aco1	100	81.390	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.494	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	84.494	Bos_taurus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.719	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	84.719	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.744	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	83.744	Canis_familiaris
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.820	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	83.820	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.702	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	84.702	Capra_hircus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.753	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	84.753	Carlito_syrichta
ENSXETG00000009184	aco1	99	68.386	ENSCAPG00000007254	ACO1	99	68.274	Cavia_aperea
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.607	ENSCPOG00000003768	ACO1	99	84.607	Cavia_porcellus
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.933	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	83.933	Cebus_capucinus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.494	ENSCATG00000045333	ACO1	99	84.494	Cercocebus_atys
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.708	ENSCLAG00000002487	ACO1	99	83.708	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.211	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	84.211	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000009184	aco1	89	66.716	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	66.667	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.522	ENSCPBG00000008077	ACO1	100	85.522	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.494	ENSCANG00000014847	ACO1	99	84.494	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.056	ENSCGRG00001024337	Aco1	99	85.056	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.045	ENSCGRG00000004877	-	99	84.045	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000009184	aco1	99	78.403	ENSCSEG00000018262	aco1	99	78.403	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000009184	aco1	99	75.421	ENSCVAG00000020264	aco1	99	75.421	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000009184	aco1	99	82.175	ENSDARG00000026376	aco1	100	82.175	Danio_rerio
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.270	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	84.270	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.270	ENSDORG00000014246	Aco1	99	84.270	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000009184	aco1	85	61.565	ENSETEG00000012415	-	85	61.565	Echinops_telfairi
ENSXETG00000009184	aco1	99	56.540	ENSEBUG00000015441	aco1	97	56.540	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.056	ENSEASG00005004602	ACO1	99	85.056	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.961	ENSECAG00000014846	ACO1	99	84.944	Equus_caballus
ENSXETG00000009184	aco1	99	73.820	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	73.820	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000009184	aco1	99	79.933	ENSELUG00000016812	aco1	97	80.112	Esox_lucius
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.607	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	84.607	Felis_catus
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.838	ENSFALG00000001167	ACO1	100	83.838	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.831	ENSFDAG00000016058	ACO1	99	84.831	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000009184	aco1	99	80.247	ENSFHEG00000005619	aco1	99	80.247	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000009184	aco1	99	77.303	ENSGMOG00000005514	aco1	99	77.303	Gadus_morhua
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.951	ENSGALG00000002162	ACO1	100	83.951	Gallus_gallus
ENSXETG00000009184	aco1	99	80.000	ENSGACG00000001637	aco1	99	80.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.297	ENSGAGG00000023315	ACO1	100	85.297	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.056	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	85.056	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000009184	aco1	99	80.045	ENSHBUG00000008952	aco1	99	80.045	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.157	ENSHGLG00000018922	Aco1	99	84.157	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.157	ENSHGLG00100000149	Aco1	99	84.157	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000009184	aco1	99	77.278	ENSHCOG00000015881	aco1	99	77.278	Hippocampus_comes
ENSXETG00000009184	aco1	99	81.215	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	81.215	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.658	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	84.658	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.719	ENSJJAG00000013824	Aco1	99	84.719	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000009184	aco1	99	80.449	ENSKMAG00000015759	aco1	99	80.449	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000009184	aco1	99	75.982	ENSLBEG00000013866	aco1	99	75.982	Labrus_bergylta
ENSXETG00000009184	aco1	75	70.631	ENSLACG00000000936	ACO1	99	70.458	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.015	ENSLOCG00000011082	aco1	99	83.015	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.034	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	83.034	Loxodonta_africana
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.719	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	84.719	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.831	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	84.831	Macaca_mulatta
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.607	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	84.607	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.607	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	84.607	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000009184	aco1	99	81.390	ENSMAMG00000002915	aco1	99	81.390	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000009184	aco1	99	76.648	ENSMZEG00005012733	aco1	99	76.313	Maylandia_zebra
ENSXETG00000009184	aco1	99	69.599	ENSMGAG00000008851	ACO1	100	69.599	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.169	ENSMAUG00000021408	Aco1	99	85.169	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.297	ENSMICG00000006540	ACO1	99	85.281	Microcebus_murinus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.831	ENSMOCG00000015393	Aco1	99	84.831	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000009184	aco1	99	78.924	ENSMMOG00000020282	aco1	99	78.924	Mola_mola
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.494	ENSMODG00000004463	ACO1	99	84.494	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000009184	aco1	99	80.045	ENSMALG00000019764	aco1	99	80.045	Monopterus_albus
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.506	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	99	85.506	Mus_caroli
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.169	ENSMUSG00000028405	Aco1	99	85.169	Mus_musculus
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.169	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	99	85.169	Mus_pahari
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.393	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	99	85.393	Mus_spretus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.831	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	84.831	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.146	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	83.146	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.607	ENSNGAG00000005703	Aco1	99	84.607	Nannospalax_galili
ENSXETG00000009184	aco1	99	62.876	ENSNBRG00000008973	aco1	99	62.653	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.056	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	85.056	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000009184	aco1	89	76.538	ENSMEUG00000014756	ACO1	89	76.538	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000009184	aco1	99	81.573	ENSOPRG00000016791	ACO1	99	81.573	Ochotona_princeps
ENSXETG00000009184	aco1	99	79.101	ENSODEG00000015432	-	99	78.652	Octodon_degus
ENSXETG00000009184	aco1	99	82.022	ENSODEG00000001240	-	99	82.022	Octodon_degus
ENSXETG00000009184	aco1	99	80.045	ENSONIG00000019869	aco1	99	80.045	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000009184	aco1	81	86.188	ENSOANG00000012132	ACO1	99	86.188	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000009184	aco1	99	83.333	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	83.111	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000009184	aco1	99	79.438	ENSORLG00000020656	aco1	99	79.438	Oryzias_latipes
ENSXETG00000009184	aco1	99	79.101	ENSORLG00020010991	aco1	99	79.101	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000009184	aco1	99	79.213	ENSORLG00015011785	aco1	99	79.213	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000009184	aco1	99	78.579	ENSOMEG00000000660	aco1	99	78.579	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.270	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	84.270	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.719	ENSOARG00000014707	ACO1	98	84.719	Ovis_aries
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.169	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	85.169	Pan_paniscus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.270	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	84.270	Panthera_pardus
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.175	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	84.175	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.169	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	85.169	Pan_troglodytes
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.607	ENSPANG00000025270	ACO1	99	84.607	Papio_anubis
ENSXETG00000009184	aco1	99	79.551	ENSPKIG00000023168	aco1	99	79.551	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000009184	aco1	99	86.308	ENSPSIG00000008030	ACO1	100	86.308	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000009184	aco1	99	81.257	ENSPMGG00000020708	aco1	99	81.257	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.169	ENSPEMG00000018464	Aco1	99	85.169	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.139	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	84.512	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000009184	aco1	99	79.842	ENSPFOG00000013405	aco1	98	80.708	Poecilia_formosa
ENSXETG00000009184	aco1	89	80.500	ENSPLAG00000023422	aco1	97	80.500	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000009184	aco1	89	80.424	ENSPMEG00000011800	aco1	98	80.424	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000009184	aco1	99	79.461	ENSPREG00000021791	aco1	99	79.461	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000009184	aco1	99	85.185	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	85.185	Pongo_abelii
ENSXETG00000009184	aco1	77	82.021	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	82.021	Procavia_capensis
ENSXETG00000009184	aco1	88	84.829	ENSPCOG00000021198	ACO1	99	84.829	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000009184	aco1	96	79.045	ENSPVAG00000002372	ACO1	99	79.045	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000009184	aco1	99	80.045	ENSPNYG00000009425	aco1	99	80.045	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000009184	aco1	99	82.677	ENSPNAG00000017918	aco1	99	82.677	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000009184	aco1	99	84.719	ENSRNOG00000005849	Aco1	99	84.719	Rattus_norvegicus
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ENSXETG00000009184	aco1	99	84.045	ENSSHAG00000008924	ACO1	99	84.045	Sarcophilus_harrisii
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ENSXETG00000009184	aco1	99	79.888	ENSXMAG00000023603	aco1	99	79.978	Xiphophorus_maculatus