EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSXETG00000009664 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago4
Alias: -
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24428 bases
Position: chrGL173047.1:1008830-1033257
Accession: XB-GENE-1006882
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000021272	PAZ	PF02170.22	1e-19	1	1
ENSXETP00000021272	Piwi	PF02171.17	7.5e-104	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000021272	-	2535	-	ENSXETP00000021272	844 (aa)	-	F7ALP3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000009664	ago4	99	66.667	ENSXETG00000023755	ago2	98	66.590
ENSXETG00000009664	ago4	99	71.363	ENSXETG00000004364	ago1	98	71.363
ENSXETG00000009664	ago4	99	70.930	ENSXETG00000027042	ago3	99	70.930

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSG00000134698	AGO4	100	85.615	Homo_sapiens
ENSXETG00000009664	ago4	96	82.045	ENSAPOG00000023867	ago4	99	82.045	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.066	ENSAMEG00000000573	AGO4	99	86.066	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000009664	ago4	92	84.005	ENSACIG00000014548	ago4	100	84.005	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000009664	ago4	92	81.194	ENSAPEG00000022426	ago4	100	81.194	Amphiprion_percula
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSATEG00000006717	ago4	100	82.178	Anabas_testudineus
ENSXETG00000009664	ago4	98	86.423	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	86.423	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000009664	ago4	99	85.246	ENSACAG00000017275	AGO4	99	85.246	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.499	ENSANAG00000031428	AGO4	100	85.499	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.554	ENSACLG00000005181	ago4	100	82.554	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.782	ENSAMXG00000010318	ago4	100	83.753	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000009664	ago4	99	85.012	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	85.012	Bos_taurus
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	85.615	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000009664	ago4	92	85.390	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	85.390	Canis_familiaris
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.499	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	85.499	Capra_hircus
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.183	ENSTSYG00000014007	AGO4	99	86.183	Carlito_syrichta
ENSXETG00000009664	ago4	99	82.915	ENSCAPG00000009369	AGO4	99	82.915	Cavia_aperea
ENSXETG00000009664	ago4	99	84.168	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	84.168	Cavia_porcellus
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	85.615	Cebus_capucinus
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSCATG00000043421	AGO4	95	93.989	Cercocebus_atys
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.183	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	86.183	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	85.615	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000009664	ago4	77	98.820	ENSCHOG00000006867	AGO4	76	98.820	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.300	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	86.300	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.066	ENSCANG00000016914	AGO4	99	86.066	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.267	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	85.267	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000009664	ago4	99	85.714	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	85.714	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000009664	ago4	92	78.141	ENSCSEG00000010696	ago4	100	78.141	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000009664	ago4	100	84.473	ENSDARG00000100854	ago4	100	84.473	Danio_rerio
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.731	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	85.731	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.731	ENSDORG00000008933	Ago4	100	85.731	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000009664	ago4	61	98.030	ENSETEG00000018390	AGO4	83	98.030	Echinops_telfairi
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSEASG00005012079	AGO4	100	85.615	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSECAG00000024686	AGO4	100	85.615	Equus_caballus
ENSXETG00000009664	ago4	67	98.601	ENSEEUG00000000745	AGO4	66	98.601	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000009664	ago4	99	82.910	ENSELUG00000023873	ago4	99	82.893	Esox_lucius
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	85.615	Felis_catus
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.183	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	86.183	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000009664	ago4	97	75.837	ENSFHEG00000019658	ago4	100	75.837	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000009664	ago4	98	84.806	ENSGMOG00000009544	ago4	99	84.284	Gadus_morhua
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.847	ENSGALG00000039713	AGO4	100	85.847	Gallus_gallus
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.554	ENSGAFG00000017239	ago4	100	82.554	Gambusia_affinis
ENSXETG00000009664	ago4	99	84.455	ENSGACG00000002683	ago4	100	84.455	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000009664	ago4	92	85.642	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	85.642	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000009664	ago4	99	82.844	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	82.844	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000009664	ago4	93	92.077	ENSHBUG00000001525	ago4	100	82.554	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.731	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	85.731	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.235	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	86.235	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.554	ENSHCOG00000003725	ago4	100	82.554	Hippocampus_comes
ENSXETG00000009664	ago4	98	83.082	ENSIPUG00000015600	ago4	100	82.554	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.030	ENSSTOG00000004725	AGO4	99	86.030	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSKMAG00000018602	ago4	100	82.668	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.220	ENSLBEG00000010670	ago4	100	82.220	Labrus_bergylta
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.383	ENSLACG00000016888	AGO4	100	85.383	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.877	ENSLOCG00000000584	ago4	100	82.877	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000009664	ago4	93	85.019	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	85.019	Loxodonta_africana
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	85.615	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000009664	ago4	99	85.965	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	98.413	Macaca_mulatta
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	98.413	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.066	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	86.066	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.554	ENSMAMG00000003874	ago4	100	82.554	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.554	ENSMZEG00005026346	ago4	100	82.554	Maylandia_zebra
ENSXETG00000009664	ago4	99	85.948	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	85.948	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000009664	ago4	81	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	91	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000009664	ago4	99	85.965	ENSMICG00000033507	AGO4	100	85.965	Microcebus_murinus
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.267	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	85.267	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000009664	ago4	92	83.123	ENSMMOG00000013473	ago4	100	83.123	Mola_mola
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.731	ENSMODG00000017888	AGO4	100	85.731	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000009664	ago4	99	82.964	ENSMALG00000011797	ago4	99	82.964	Monopterus_albus
ENSXETG00000009664	ago4	100	84.919	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	84.919	Mus_caroli
ENSXETG00000009664	ago4	100	84.803	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	84.803	Mus_musculus
ENSXETG00000009664	ago4	100	84.339	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	84.339	Mus_pahari
ENSXETG00000009664	ago4	100	84.687	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	84.687	Mus_spretus
ENSXETG00000009664	ago4	92	85.390	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	85.390	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000009664	ago4	99	84.866	ENSMLUG00000017102	AGO4	99	84.866	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.183	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	86.183	Nannospalax_galili
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.554	ENSNBRG00000013492	ago4	100	82.554	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.066	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	86.066	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000009664	ago4	82	89.846	ENSMEUG00000001023	AGO4	81	89.846	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000009664	ago4	99	81.499	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	81.499	Ochotona_princeps
ENSXETG00000009664	ago4	92	85.589	ENSODEG00000006355	AGO4	97	85.589	Octodon_degus
ENSXETG00000009664	ago4	99	84.211	ENSONIG00000013603	ago4	100	82.554	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000009664	ago4	92	85.516	ENSOANG00000002082	AGO4	100	85.516	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.847	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	85.847	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSORLG00000009865	ago4	92	82.668	Oryzias_latipes
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSORLG00020016978	ago4	92	82.668	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSORLG00015008800	ago4	92	82.668	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSOMEG00000006399	ago4	100	82.668	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000009664	ago4	99	78.770	ENSOGAG00000027107	-	99	78.770	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000009664	ago4	93	84.481	ENSOGAG00000004233	-	100	84.481	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000009664	ago4	99	85.414	ENSOARG00000019568	AGO4	98	85.414	Ovis_aries
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.066	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	86.066	Pan_paniscus
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	85.615	Panthera_pardus
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.066	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	86.066	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.615	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	85.615	Pan_troglodytes
ENSXETG00000009664	ago4	92	85.390	ENSPANG00000007232	AGO4	100	85.390	Papio_anubis
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSPKIG00000022598	ago4	100	82.668	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.300	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	86.300	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000009664	ago4	92	83.879	ENSPMGG00000023325	ago4	100	83.879	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000009664	ago4	87	100.000	ENSPEMG00000022651	-	96	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000009664	ago4	100	85.731	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	85.731	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSPFOG00000001935	ago4	100	82.668	Poecilia_formosa
ENSXETG00000009664	ago4	100	84.357	ENSPLAG00000011534	ago4	100	84.357	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSPMEG00000005049	ago4	100	82.668	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSPREG00000010315	ago4	100	82.668	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.066	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	86.066	Pongo_abelii
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.082	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	86.082	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000009664	ago4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.554	ENSPNYG00000002089	ago4	100	82.554	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000009664	ago4	100	83.893	ENSPNAG00000005191	ago4	100	83.893	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000009664	ago4	68	81.681	ENSRNOG00000025596	Ago4	99	81.681	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000009664	ago4	99	85.076	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	98.413	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000009664	ago4	92	85.390	ENSRROG00000035783	AGO4	100	85.390	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000009664	ago4	99	82.168	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	84.676	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000009664	ago4	99	85.981	ENSSHAG00000017320	AGO4	99	85.981	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.782	ENSSFOG00015022028	ago4	100	82.782	Scleropages_formosus
ENSXETG00000009664	ago4	99	82.644	ENSSMAG00000000808	ago4	93	81.324	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000009664	ago4	100	81.828	ENSSDUG00000020781	ago4	100	83.375	Seriola_dumerili
ENSXETG00000009664	ago4	92	84.005	ENSSLDG00000021841	ago4	100	84.005	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000009664	ago4	76	93.443	ENSSARG00000011504	AGO4	75	93.443	Sorex_araneus
ENSXETG00000009664	ago4	100	86.079	ENSSPUG00000000889	AGO4	100	86.079	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000009664	ago4	99	80.824	ENSTGUG00000001631	AGO4	99	80.513	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.326	ENSTRUG00000008052	ago4	100	82.326	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000009664	ago4	99	84.400	ENSTNIG00000006331	ago4	99	84.400	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000009664	ago4	76	100.000	ENSTBEG00000016478	AGO4	77	100.000	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000009664	ago4	99	84.660	ENSTTRG00000015086	AGO4	100	84.660	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000009664	ago4	92	85.390	ENSUAMG00000027156	-	100	85.390	Ursus_americanus
ENSXETG00000009664	ago4	99	86.761	ENSUMAG00000006297	AGO4	99	85.142	Ursus_maritimus
ENSXETG00000009664	ago4	88	84.190	ENSVPAG00000006662	AGO4	100	84.190	Vicugna_pacos
ENSXETG00000009664	ago4	92	85.390	ENSVVUG00000000465	-	100	85.390	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000009664	ago4	100	82.668	ENSXMAG00000016657	ago4	100	82.668	Xiphophorus_maculatus