EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000010094 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw1
Alias: -
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 68591 bases
Position: chrGL172807.1:682991-751581
Accession: XB-GENE-5955779
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000022246	Wyosine_form	PF08608.12	2.1e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000022246	-	3599	-	ENSXETP00000022246	732 (aa)	-	F6ZQB5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000010094	tyw1	99	61.872	ENSG00000277149	TYW1B	91	69.519	Homo_sapiens
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.501	ENSG00000198874	TYW1	99	69.837	Homo_sapiens
ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.923	ENSAPOG00000014391	tyw1	100	65.786	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	66.530	ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.757	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.232	ENSAOCG00000016792	tyw1	96	68.501	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.508	ENSAPEG00000015939	tyw1	99	70.105	Amphiprion_percula
ENSXETG00000010094	tyw1	89	68.950	ENSATEG00000006856	tyw1	90	68.037	Anabas_testudineus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.135	ENSANAG00000037051	-	99	69.189	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000010094	tyw1	100	68.027	ENSACLG00000018688	tyw1	97	67.663	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.714	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	69.986	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	71.680	ENSBTAG00000008446	TYW1	99	71.332	Bos_taurus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.701	ENSCJAG00000004295	-	99	68.750	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.792	ENSCAFG00000010867	-	99	69.878	Canis_familiaris
ENSXETG00000010094	tyw1	99	60.490	ENSCAFG00020005367	-	99	65.193	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000010094	tyw1	99	72.049	ENSCHIG00000019510	-	99	71.875	Capra_hircus
ENSXETG00000010094	tyw1	89	70.465	ENSTSYG00000008236	-	95	74.795	Carlito_syrichta
ENSXETG00000010094	tyw1	87	66.149	ENSCAPG00000013569	-	100	65.170	Cavia_aperea
ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.169	ENSCPOG00000011182	-	99	66.354	Cavia_porcellus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.190	ENSCCAG00000026643	-	99	69.158	Cebus_capucinus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.783	ENSCATG00000043677	-	99	69.429	Cercocebus_atys
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.649	ENSCLAG00000006321	-	99	67.333	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000010094	tyw1	92	72.761	ENSCSAG00000018274	-	99	72.110	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000010094	tyw1	67	88.034	ENSCHOG00000003801	-	75	88.034	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000010094	tyw1	99	76.934	ENSCPBG00000014896	-	96	79.705	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000010094	tyw1	80	60.914	ENSCING00000004125	-	97	61.083	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000010094	tyw1	89	54.896	ENSCSAVG00000005712	-	100	57.209	Ciona_savignyi
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.919	ENSCANG00000033209	-	99	69.565	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000010094	tyw1	70	79.859	ENSCGRG00001003679	Tyw1	86	80.046	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.571	ENSCSEG00000005810	tyw1	95	68.665	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000010094	tyw1	89	67.688	ENSCVAG00000001054	tyw1	92	67.275	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.697	ENSDARG00000062987	tyw1	96	70.233	Danio_rerio
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.963	ENSDNOG00000024165	-	99	70.572	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000010094	tyw1	87	64.632	ENSDORG00000014772	Tyw1	93	64.632	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000010094	tyw1	59	68.981	ENSEBUG00000004494	tyw1	91	68.981	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.476	ENSEASG00005008818	-	99	70.476	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	65.663	ENSECAG00000023164	-	52	84.483	Equus_caballus
ENSXETG00000010094	tyw1	61	82.828	ENSEEUG00000005950	-	55	82.828	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	67.170	ENSELUG00000008449	tyw1	98	65.455	Esox_lucius
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.973	ENSFCAG00000014262	-	99	69.755	Felis_catus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.631	ENSFALG00000013810	-	99	68.767	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000010094	tyw1	99	67.973	ENSFDAG00000013270	-	99	68.784	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000010094	tyw1	83	69.544	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	69.756	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000010094	tyw1	100	71.486	ENSGALG00000001110	-	99	71.120	Gallus_gallus
ENSXETG00000010094	tyw1	100	65.860	ENSGACG00000012692	tyw1	99	65.995	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	75.984	ENSGAGG00000022393	-	99	75.712	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000010094	tyw1	90	63.102	ENSGGOG00000001473	TYW1	99	62.293	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000010094	tyw1	100	67.755	ENSHBUG00000002640	tyw1	97	67.391	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000010094	tyw1	87	71.875	ENSHGLG00000012093	-	100	70.469	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.877	ENSHGLG00100011743	TYW1	99	68.421	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000010094	tyw1	98	61.997	ENSHCOG00000019949	tyw1	96	62.102	Hippocampus_comes
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.315	ENSIPUG00000016330	tyw1	97	70.259	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.163	ENSSTOG00000004067	-	91	67.486	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000010094	tyw1	98	69.252	ENSJJAG00000022959	Tyw1	99	68.529	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.050	ENSKMAG00000018599	tyw1	96	68.050	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.501	ENSLACG00000018917	tyw1	97	71.313	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.805	ENSLOCG00000004035	tyw1	96	70.245	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.783	ENSMFAG00000035457	-	99	69.158	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.783	ENSMMUG00000030374	-	99	69.158	Macaca_mulatta
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.783	ENSMNEG00000041992	-	99	72.477	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.919	ENSMLEG00000039741	-	99	69.293	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000010094	tyw1	98	69.295	ENSMAMG00000016089	tyw1	94	67.911	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000010094	tyw1	90	72.466	ENSMZEG00005024386	tyw1	97	72.356	Maylandia_zebra
ENSXETG00000010094	tyw1	99	72.222	ENSMGAG00000002176	-	99	71.313	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.158	ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	69.919	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.476	ENSMICG00000014374	-	94	74.859	Microcebus_murinus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.486	ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	69.755	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000010094	tyw1	100	63.946	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	63.179	Mola_mola
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.553	ENSMODG00000025697	-	99	69.595	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.819	ENSMALG00000010238	tyw1	96	68.182	Monopterus_albus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.622	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	99	67.919	Mus_caroli
ENSXETG00000010094	tyw1	99	67.989	ENSMUSG00000056310	Tyw1	99	67.989	Mus_musculus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	67.764	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	68.033	Mus_pahari
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.126	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	68.126	Mus_spretus
ENSXETG00000010094	tyw1	94	69.767	ENSMPUG00000016191	-	99	69.578	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000010094	tyw1	99	67.297	ENSMLUG00000013582	-	99	67.297	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000010094	tyw1	100	69.577	ENSNGAG00000002742	Tyw1	100	69.565	Nannospalax_galili
ENSXETG00000010094	tyw1	90	70.865	ENSNBRG00000016996	tyw1	94	70.365	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.241	ENSNLEG00000013210	-	96	72.299	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000010094	tyw1	92	57.270	ENSOPRG00000008734	-	89	55.687	Ochotona_princeps
ENSXETG00000010094	tyw1	99	61.853	ENSODEG00000014729	-	99	61.126	Octodon_degus
ENSXETG00000010094	tyw1	100	68.435	ENSONIG00000005872	tyw1	97	68.207	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000010094	tyw1	98	69.986	ENSOCUG00000003173	-	99	69.210	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.033	ENSORLG00000001393	tyw1	99	66.164	Oryzias_latipes
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.120	ENSORLG00020019361	tyw1	99	65.342	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.320	ENSORLG00015008095	tyw1	95	68.493	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.377	ENSOGAG00000016555	-	99	67.935	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000010094	tyw1	99	72.043	ENSOARG00000010673	-	99	70.485	Ovis_aries
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.809	ENSPPRG00000004945	-	99	69.482	Panthera_pardus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.986	ENSPTIG00000019545	-	99	69.767	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000010094	tyw1	99	65.317	ENSPTRG00000023076	TYW1B	98	64.238	Pan_troglodytes
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.648	ENSPANG00000019053	-	99	69.293	Papio_anubis
ENSXETG00000010094	tyw1	100	67.940	ENSPKIG00000006545	tyw1	97	67.711	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000010094	tyw1	96	67.651	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	67.183	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.852	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	68.213	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.724	ENSPFOG00000015855	tyw1	98	68.544	Poecilia_formosa
ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.138	ENSPLAG00000000838	tyw1	97	69.185	Poecilia_latipinna
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ENSXETG00000010094	tyw1	98	66.620	ENSPREG00000018773	tyw1	97	66.345	Poecilia_reticulata
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ENSXETG00000010094	tyw1	99	53.639	ENSPCOG00000015294	-	99	52.432	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000010094	tyw1	100	68.027	ENSPNYG00000022381	tyw1	97	67.663	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.822	ENSPNAG00000009001	tyw1	99	70.822	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.577	ENSRNOG00000024352	Tyw1	99	69.577	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.054	ENSRBIG00000039619	-	99	69.701	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000010094	tyw1	100	69.959	ENSRROG00000039780	-	99	69.607	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000010094	tyw1	90	40.889	YPL207W	-	74	40.889	Saccharomyces_cerevisiae
ENSXETG00000010094	tyw1	99	69.429	ENSSBOG00000025873	-	99	68.071	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000010094	tyw1	99	67.531	ENSSHAG00000010346	-	100	67.872	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000010094	tyw1	98	70.360	ENSSFOG00015001054	tyw1	97	71.795	Scleropages_formosus
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ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.919	ENSSPUG00000002715	-	99	70.919	Sphenodon_punctatus
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ENSXETG00000010094	tyw1	98	67.720	ENSTRUG00000016107	tyw1	93	67.125	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000010094	tyw1	89	71.664	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	70.571	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.652	ENSUMAG00000015343	-	99	70.436	Ursus_maritimus
ENSXETG00000010094	tyw1	99	68.521	ENSVVUG00000016457	-	99	69.607	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000010094	tyw1	98	67.541	ENSXMAG00000013125	tyw1	99	70.890	Xiphophorus_maculatus