EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSXETG00000010326 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo6
Alias: -
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24243 bases
Position: chrGL172663.1:1319941-1344183
Accession: XB-GENE-493618
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000052835	Xpo1	PF08389.12	1.1e-24	1	1
ENSXETP00000052835	IBN_N	PF03810.19	4.4e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000052835	-	3378	-	ENSXETP00000052835	1125 (aa)	-	F6T9E8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.800	ENSG00000169180	XPO6	100	90.476	Homo_sapiens
ENSXETG00000010326	xpo6	99	72.333	ENSAPOG00000012873	xpo6	99	72.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.533	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	80.533	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000010326	xpo6	99	72.985	ENSACIG00000008055	xpo6	99	72.985	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000010326	xpo6	100	74.025	ENSAOCG00000001326	xpo6	99	74.025	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000010326	xpo6	100	74.025	ENSAPEG00000016304	xpo6	99	74.025	Amphiprion_percula
ENSXETG00000010326	xpo6	99	73.582	ENSATEG00000002273	xpo6	99	73.582	Anabas_testudineus
ENSXETG00000010326	xpo6	100	81.972	ENSAPLG00000007480	XPO6	100	81.972	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000010326	xpo6	99	70.599	ENSACAG00000016883	XPO6	99	70.599	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.711	ENSANAG00000031761	XPO6	99	80.711	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000010326	xpo6	99	73.019	ENSACLG00000007048	xpo6	99	73.019	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000010326	xpo6	99	70.830	ENSAMXG00000032539	xpo6	99	70.830	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.267	ENSBTAG00000010309	XPO6	99	80.267	Bos_taurus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.800	ENSCJAG00000006014	XPO6	99	80.800	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.622	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	80.622	Canis_familiaris
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.622	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	80.608	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.356	ENSCHIG00000022341	XPO6	99	80.356	Capra_hircus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	77.184	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	77.184	Carlito_syrichta
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.800	ENSCPOG00000012824	XPO6	99	80.800	Cavia_porcellus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.711	ENSCCAG00000036360	XPO6	99	80.711	Cebus_capucinus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.978	ENSCATG00000034030	XPO6	99	80.978	Cercocebus_atys
ENSXETG00000010326	xpo6	100	80.817	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	80.889	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000010326	xpo6	91	79.688	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	79.688	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000010326	xpo6	89	80.781	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	80.781	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000010326	xpo6	99	46.201	ENSCING00000006884	-	99	46.201	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000010326	xpo6	100	44.828	ENSCSAVG00000000850	-	100	44.828	Ciona_savignyi
ENSXETG00000010326	xpo6	99	81.067	ENSCANG00000041578	XPO6	99	81.067	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.622	ENSCGRG00001013173	Xpo6	99	80.622	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000010326	xpo6	99	72.558	ENSCSEG00000013622	xpo6	99	72.558	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000010326	xpo6	99	72.915	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	72.915	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000010326	xpo6	97	69.362	ENSDARG00000041217	xpo6	99	69.362	Danio_rerio
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.622	ENSDNOG00000012449	XPO6	99	80.622	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.267	ENSDORG00000000919	Xpo6	99	80.267	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000010326	xpo6	82	79.151	ENSETEG00000018768	XPO6	85	79.151	Echinops_telfairi
ENSXETG00000010326	xpo6	99	60.142	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	60.142	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.533	ENSEASG00005017296	XPO6	99	80.603	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.444	ENSECAG00000008601	XPO6	99	80.444	Equus_caballus
ENSXETG00000010326	xpo6	97	74.267	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	74.267	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	75.512	ENSELUG00000009159	xpo6	99	75.512	Esox_lucius
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.533	ENSFCAG00000010309	XPO6	99	80.533	Felis_catus
ENSXETG00000010326	xpo6	100	80.823	ENSFALG00000004441	XPO6	98	81.217	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.533	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	80.533	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000010326	xpo6	100	72.389	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	72.389	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	81.956	ENSGALG00000035360	XPO6	99	81.956	Gallus_gallus
ENSXETG00000010326	xpo6	100	71.706	ENSGAFG00000004044	xpo6	99	71.565	Gambusia_affinis
ENSXETG00000010326	xpo6	95	81.631	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	81.631	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.800	ENSGGOG00000005609	XPO6	99	80.800	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.962	ENSHBUG00000019504	xpo6	99	71.875	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.622	ENSHGLG00000009679	-	99	80.622	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000010326	xpo6	93	66.667	ENSHGLG00000003865	-	99	66.667	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.622	ENSHGLG00100003673	-	99	80.622	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000010326	xpo6	93	68.878	ENSHGLG00100001081	-	99	68.878	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.341	ENSHCOG00000004987	xpo6	99	71.429	Hippocampus_comes
ENSXETG00000010326	xpo6	99	70.053	ENSIPUG00000006516	xpo6	99	70.053	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.533	ENSSTOG00000012161	XPO6	99	80.533	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	79.911	ENSJJAG00000019392	Xpo6	99	79.911	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	72.776	ENSKMAG00000010403	xpo6	99	72.776	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	73.339	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	73.339	Labrus_bergylta
ENSXETG00000010326	xpo6	99	78.292	ENSLACG00000017930	XPO6	99	78.292	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000010326	xpo6	94	77.985	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	77.985	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.178	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	80.178	Loxodonta_africana
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.978	ENSMFAG00000045067	XPO6	99	80.978	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.978	ENSMMUG00000018623	XPO6	99	80.978	Macaca_mulatta
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.978	ENSMNEG00000028587	XPO6	99	80.978	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.978	ENSMLEG00000029685	XPO6	99	80.978	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	72.444	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	72.444	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	73.108	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	73.108	Maylandia_zebra
ENSXETG00000010326	xpo6	97	81.148	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	81.148	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.950	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	71.518	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.889	ENSMICG00000001923	XPO6	99	80.889	Microcebus_murinus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.444	ENSMOCG00000008015	Xpo6	99	80.444	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000010326	xpo6	99	73.623	ENSMMOG00000011992	xpo6	99	73.623	Mola_mola
ENSXETG00000010326	xpo6	99	81.350	ENSMODG00000015516	XPO6	99	81.350	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000010326	xpo6	99	66.903	ENSMALG00000020612	xpo6	99	67.080	Monopterus_albus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.622	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	80.622	Mus_caroli
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.533	ENSMUSG00000000131	Xpo6	99	80.533	Mus_musculus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.444	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	99	80.444	Mus_pahari
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.622	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	99	80.622	Mus_spretus
ENSXETG00000010326	xpo6	100	80.373	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	80.373	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.178	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	80.178	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.800	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	80.800	Nannospalax_galili
ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.962	ENSNBRG00000007275	xpo6	99	71.875	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.800	ENSNLEG00000011518	XPO6	99	80.800	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000010326	xpo6	87	79.070	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	79.070	Ochotona_princeps
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.622	ENSODEG00000012917	XPO6	99	80.622	Octodon_degus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.615	ENSONIG00000019366	xpo6	99	71.528	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.622	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	80.622	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.217	ENSORLG00000011231	xpo6	100	70.536	Oryzias_latipes
ENSXETG00000010326	xpo6	99	72.573	ENSORLG00020000386	xpo6	99	72.573	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.130	ENSORLG00015003636	xpo6	99	71.130	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.565	ENSOMEG00000016505	xpo6	99	71.826	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.889	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	80.889	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.267	ENSOARG00000000960	XPO6	100	80.267	Ovis_aries
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.800	ENSPPAG00000033668	XPO6	99	80.800	Pan_paniscus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.216	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	80.216	Panthera_pardus
ENSXETG00000010326	xpo6	97	79.209	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	79.209	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.800	ENSPTRG00000007919	XPO6	99	80.800	Pan_troglodytes
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.978	ENSPANG00000017103	XPO6	99	80.978	Papio_anubis
ENSXETG00000010326	xpo6	99	77.176	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	77.176	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000010326	xpo6	99	79.605	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	79.605	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000010326	xpo6	99	72.980	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	72.980	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.267	ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	80.267	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000010326	xpo6	100	68.569	ENSPMAG00000003127	xpo6	100	68.569	Petromyzon_marinus
ENSXETG00000010326	xpo6	97	80.970	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	81.350	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.503	ENSPFOG00000008763	xpo6	99	71.503	Poecilia_formosa
ENSXETG00000010326	xpo6	100	71.745	ENSPLAG00000014054	xpo6	99	71.745	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000010326	xpo6	100	71.922	ENSPMEG00000018994	xpo6	99	71.922	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000010326	xpo6	97	71.339	ENSPREG00000016421	xpo6	96	71.339	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.711	ENSPPYG00000007218	XPO6	99	80.711	Pongo_abelii
ENSXETG00000010326	xpo6	90	82.849	ENSPCAG00000008918	XPO6	90	82.849	Procavia_capensis
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.889	ENSPCOG00000017886	XPO6	99	80.889	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000010326	xpo6	80	82.353	ENSPVAG00000012234	XPO6	80	82.353	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000010326	xpo6	99	73.179	ENSPNYG00000008375	xpo6	99	73.244	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000010326	xpo6	99	70.419	ENSPNAG00000008284	xpo6	99	70.419	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.178	ENSRNOG00000016722	Xpo6	99	80.178	Rattus_norvegicus
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ENSXETG00000010326	xpo6	99	81.067	ENSRROG00000044864	XPO6	99	81.067	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000010326	xpo6	99	80.711	ENSSBOG00000027650	XPO6	99	80.711	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000010326	xpo6	99	81.172	ENSSHAG00000013864	XPO6	99	81.172	Sarcophilus_harrisii
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ENSXETG00000010326	xpo6	99	71.739	ENSXMAG00000011630	xpo6	99	71.739	Xiphophorus_maculatus