EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSXETG00000010729 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
rps3
Alias
-
Full Name
Xenopus tropicalis ribosomal protein S3 (rps3)%2C mRNA.
Gene Type
protein_coding
Species
Xenopus_tropicalis
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
8580 bases
Position
chrGL172913.1:1309751-1318330
Accession
NM_203788
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSXETP00000023473KH_2PF07650.172.2e-1111
ENSXETP00000023473Ribosomal_S3_CPF00189.207.5e-2111
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSXETT00000023473-850-ENSXETP00000023473247 (aa)-F6UKB7
Gene Model
Click here to download ENSXETG00000010729's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000010729's network
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSG00000149273RPS3100100.000Homo_sapiens
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSAMEG00000017051RPS39897.166Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000010729rps39871.605ENSAMEG00000007309-9373.593Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000010729rps310095.984ENSACIG00000023535rps310095.984Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSAOCG00000013654rps310095.582Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSAPEG00000022808rps310095.582Amphiprion_percula
ENSXETG00000010729rps310094.779ENSATEG00000003502rps39498.268Anabas_testudineus
ENSXETG00000010729rps310076.000ENSAPLG00000014513-9576.068Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSACAG00000002169-10097.166Anolis_carolinensis
ENSXETG00000010729rps310082.186ENSANAG00000023438-8592.638Aotus_nancymaae
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSANAG00000027669-10096.970Aotus_nancymaae
ENSXETG00000010729rps39570.940ENSANAG00000022561-9383.721Aotus_nancymaae
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSACLG00000013763rps38895.582Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSAMXG00000013642rps310095.582Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSBTAG00000005620RPS310096.761Bos_taurus
ENSXETG00000010729rps39675.210WBGene00004472rps-39276.754Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000010729rps310096.356ENSCJAG00000015424RPS310096.970Callithrix_jacchus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSCAFG00000005402RPS310097.166Canis_familiaris
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSCAFG00020002102-10097.166Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSCHIG00000012342-10096.761Capra_hircus
ENSXETG00000010729rps38663.208ENSCHIG00000015952-8763.208Capra_hircus
ENSXETG00000010729rps310090.283ENSTSYG00000034881-9694.776Carlito_syrichta
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSTSYG00000008664-10096.970Carlito_syrichta
ENSXETG00000010729rps39697.046ENSCAPG00000016681-9797.046Cavia_aperea
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSCPOG00000004665-10097.166Cavia_porcellus
ENSXETG00000010729rps310085.081ENSCCAG00000021048-9093.103Cebus_capucinus
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSCCAG00000022155RPS310096.970Cebus_capucinus
ENSXETG00000010729rps310078.947ENSCATG00000037875-9188.235Cercocebus_atys
ENSXETG00000010729rps39186.726ENSCATG00000043998-10085.106Cercocebus_atys
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSCATG00000035348-10096.970Cercocebus_atys
ENSXETG00000010729rps36894.444ENSCATG00000011713-9294.444Cercocebus_atys
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSCLAG00000013819-10097.166Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSCSAG00000003937-10096.761Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000010729rps39480.087ENSCHOG00000005328-9580.087Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000010729rps37996.907ENSCPBG00000027671-8896.907Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000010729rps39486.580ENSCING00000005003-8786.580Ciona_intestinalis
ENSXETG00000010729rps39486.147ENSCSAVG00000003490-8986.147Ciona_savignyi
ENSXETG00000010729rps310086.235ENSCANG00000041522-8787.845Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSCANG00000036026RPS310096.970Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSCGRG00001013667Rps39599.448Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000010729rps39973.770ENSCGRG00001003744-9273.684Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000010729rps39973.770ENSCGRG00000004849-9273.684Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000010729rps310091.903ENSCGRG00000019934-9593.074Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000010729rps39678.481ENSCGRG00000000152-9481.416Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000010729rps39993.902ENSCGRG00000004739-9498.246Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSCSEG00000014436rps310095.181Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSCVAG00000009247rps310095.181Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSDARG00000103007rps310095.181Danio_rerio
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSDNOG00000037189-9495.385Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000010729rps310080.972ENSDNOG00000032230-9382.251Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000010729rps39776.250ENSDNOG00000014888-9377.586Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000010729rps37276.536ENSDORG00000025518-9884.483Dipodomys_ordii
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSDORG00000002974Rps310097.166Dipodomys_ordii
ENSXETG00000010729rps39483.983FBgn0002622RpS39185.714Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000010729rps310080.567ENSETEG00000015500-9580.952Echinops_telfairi
ENSXETG00000010729rps35790.196ENSEBUG00000003683rps37890.196Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSEASG00005014248-8697.166Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSECAG00000013915-8697.166Equus_caballus
ENSXETG00000010729rps310095.142ENSEEUG00000014531-10095.142Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000010729rps39496.137ENSELUG00000017575-9496.537Esox_lucius
ENSXETG00000010729rps310094.758ENSELUG00000024369-9396.970Esox_lucius
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSFCAG00000011942-10097.166Felis_catus
ENSXETG00000010729rps36868.862ENSFCAG00000033114-9468.862Felis_catus
ENSXETG00000010729rps310097.571ENSFALG00000007956-7697.571Ficedula_albicollis
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSFDAG00000016319-10097.166Fukomys_damarensis
ENSXETG00000010729rps36575.000ENSFDAG00000012411-9374.699Fukomys_damarensis
ENSXETG00000010729rps310094.779ENSFHEG00000022153rps39497.403Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000010729rps310094.332ENSGMOG00000000838rps39397.403Gadus_morhua
ENSXETG00000010729rps310097.571ENSGALG00000017330-10097.571Gallus_gallus
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSGAFG00000015709rps39498.701Gambusia_affinis
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSGACG00000013384rps310095.181Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000010729rps310097.571ENSGAGG00000012704-10097.571Gopherus_agassizii
ENSXETG00000010729rps36173.333ENSGAGG00000022297-7574.627Gopherus_agassizii
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSGGOG00000006519RPS310096.970Gorilla_gorilla
ENSXETG00000010729rps39880.083ENSGGOG00000022405-8194.118Gorilla_gorilla
ENSXETG00000010729rps310090.283ENSGGOG00000026674-9291.775Gorilla_gorilla
ENSXETG00000010729rps310083.401ENSGGOG00000038504-8192.308Gorilla_gorilla
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSHBUG00000002368rps310095.181Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSHGLG00000019339RPS310096.761Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSHGLG00100012857RPS310096.761Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000010729rps39694.958ENSHCOG00000005060rps38997.748Hippocampus_comes
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSIPUG00000005685rps310095.582Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSSTOG00000028813-10097.166Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000010729rps37198.295ENSJJAG00000017023-9698.295Jaculus_jaculus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSJJAG00000018981Rps310097.166Jaculus_jaculus
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSKMAG00000009747rps310095.582Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSLBEG00000021017rps310095.582Labrus_bergylta
ENSXETG00000010729rps310096.356ENSLACG00000006132-10096.356Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000010729rps310093.927ENSLOCG00000006405rps39497.403Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSLAFG00000004297-10097.166Loxodonta_africana
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSMFAG00000000525RPS310096.970Macaca_fascicularis
ENSXETG00000010729rps310076.113ENSMMUG00000045640-9485.577Macaca_mulatta
ENSXETG00000010729rps38572.857ENSMMUG00000037851-7781.548Macaca_mulatta
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSMMUG00000009019RPS310096.970Macaca_mulatta
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSMNEG00000032069-10096.970Macaca_nemestrina
ENSXETG00000010729rps310076.113ENSMNEG00000030799-9379.808Macaca_nemestrina
ENSXETG00000010729rps310078.138ENSMLEG00000032606-9382.759Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000010729rps310084.615ENSMLEG00000044314-9485.714Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000010729rps310079.352ENSMLEG00000017301-9483.654Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSMLEG00000027047RPS310096.970Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSMAMG00000020146rps310095.582Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSMZEG00005024678rps38895.582Maylandia_zebra
ENSXETG00000010729rps310070.850ENSMAUG00000015088-9471.429Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSMAUG00000012031-10097.166Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000010729rps310090.283ENSMAUG00000006329-9491.342Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000010729rps310081.452ENSMICG00000033427-9478.879Microcebus_murinus
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSMICG00000030910-10097.727Microcebus_murinus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSMOCG00000007699Rps310097.166Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000010729rps310093.976ENSMMOG00000005152rps39497.403Mola_mola
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSMODG00000006945-10097.166Monodelphis_domestica
ENSXETG00000010729rps310095.161ENSMALG00000021156rps39498.268Monopterus_albus
ENSXETG00000010729rps310097.166MGP_CAROLIEiJ_G0030029Rps310097.166Mus_caroli
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSMUSG00000030744Rps310097.166Mus_musculus
ENSXETG00000010729rps310097.166MGP_PahariEiJ_G0013250Rps39999.448Mus_pahari
ENSXETG00000010729rps310097.166MGP_SPRETEiJ_G0031139Rps310097.166Mus_spretus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSMPUG00000009197-10097.166Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000010729rps39971.020ENSMLUG00000025123-9571.179Myotis_lucifugus
ENSXETG00000010729rps39674.370ENSMLUG00000026956-9274.775Myotis_lucifugus
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSMLUG00000004079-10096.761Myotis_lucifugus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSNGAG00000015514Rps310097.166Nannospalax_galili
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSNBRG00000006241rps310095.582Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000010729rps35785.714ENSNLEG00000029322-9885.714Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000010729rps310085.020ENSNLEG00000027260-9086.667Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000010729rps37795.812ENSNLEG00000036221-10094.167Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000010729rps310096.356ENSMEUG00000011581-9598.268Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000010729rps373100.000ENSOPRG00000009496-73100.000Ochotona_princeps
ENSXETG00000010729rps310085.425ENSODEG00000000640-9486.580Octodon_degus
ENSXETG00000010729rps310086.235ENSODEG00000002537-9487.879Octodon_degus
ENSXETG00000010729rps36795.960ENSODEG00000006804-9295.960Octodon_degus
ENSXETG00000010729rps36284.314ENSODEG00000001789-9784.314Octodon_degus
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSODEG00000004564-10096.761Octodon_degus
ENSXETG00000010729rps310095.984ENSONIG00000001263rps38895.984Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000010729rps38672.642ENSOANG00000009953-10072.642Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSOCUG00000022412-8697.166Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000010729rps39892.149ENSOCUG00000024686-9393.805Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSORLG00000000607rps310095.181Oryzias_latipes
ENSXETG00000010729rps39995.161ENSORLG00020021035rps39995.161Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSORLG00015010080rps310095.181Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000010729rps36891.124ENSOMEG00000020705rps38395.364Oryzias_melastigma
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSOGAG00000005318RPS310096.761Otolemur_garnettii
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSOARG00000011523RPS38696.761Ovis_aries
ENSXETG00000010729rps39885.477ENSPPAG00000039573-8686.580Pan_paniscus
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSPPAG00000029211RPS310096.970Pan_paniscus
ENSXETG00000010729rps39191.150ENSPPAG00000033710-9091.150Pan_paniscus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSPPRG00000021200-10097.166Panthera_pardus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSPTIG00000012777-10097.166Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000010729rps39885.477ENSPTRG00000047374-8683.117Pan_troglodytes
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSPTRG00000048574RPS310096.970Pan_troglodytes
ENSXETG00000010729rps310089.474ENSPTRG00000015680-8991.351Pan_troglodytes
ENSXETG00000010729rps36891.667ENSPANG00000032441-9291.667Papio_anubis
ENSXETG00000010729rps39382.096ENSPANG00000033652-9088.406Papio_anubis
ENSXETG00000010729rps310090.875ENSPANG00000016549-10096.970Papio_anubis
ENSXETG00000010729rps310094.378ENSPKIG00000024046rps39497.403Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000010729rps310097.571ENSPSIG00000008818-10097.571Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000010729rps310095.565ENSPMGG00000012744rps310095.565Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000010729rps310069.636ENSPEMG00000022426-9470.996Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSPEMG00000021741-10097.166Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000010729rps310081.452ENSPEMG00000020704-9481.897Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000010729rps37892.746ENSPMAG00000007775-9692.746Petromyzon_marinus
ENSXETG00000010729rps36194.048ENSPCIG00000022539-8994.048Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000010729rps37385.083ENSPCIG00000030274-8885.083Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000010729rps310096.356ENSPCIG00000024144-9598.268Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSPFOG00000013835rps39498.701Poecilia_formosa
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSPLAG00000005854rps39498.701Poecilia_latipinna
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSPMEG00000020999rps39498.701Poecilia_mexicana
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSPREG00000017536rps39498.701Poecilia_reticulata
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSPPYG00000003688RPS310096.761Pongo_abelii
ENSXETG00000010729rps310078.947ENSPCAG00000003033-10078.947Procavia_capensis
ENSXETG00000010729rps39973.061ENSPCOG00000024652-9469.869Propithecus_coquereli
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSPCOG00000028750RPS310096.970Propithecus_coquereli
ENSXETG00000010729rps39485.714ENSPCOG00000026192-9288.889Propithecus_coquereli
ENSXETG00000010729rps310091.498ENSPVAG00000011271-10091.498Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSPNYG00000007419rps310095.582Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSPNAG00000018641rps310095.582Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSRNOG00000017418Rps310097.166Rattus_norvegicus
ENSXETG00000010729rps310093.522ENSRNOG00000007605AABR07052430.19595.238Rattus_norvegicus
ENSXETG00000010729rps36085.507ENSRNOG00000056660AABR07025928.19285.507Rattus_norvegicus
ENSXETG00000010729rps310077.328ENSRBIG00000033623-9188.235Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSRBIG00000044916RPS310096.970Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000010729rps37374.033ENSRBIG00000012001-9574.033Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000010729rps310084.274ENSRBIG00000040846-9584.971Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000010729rps35497.761ENSRBIG00000042266-92100.000Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000010729rps310076.113ENSRROG00000039887-9368.831Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000010729rps35588.406ENSRROG00000037141-9088.406Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000010729rps35497.015ENSRROG00000039976-9397.015Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000010729rps39697.458ENSRROG00000032977-9599.451Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSRROG00000009870RPS310096.970Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000010729rps38871.101YNL178WRPS38971.101Saccharomyces_cerevisiae
ENSXETG00000010729rps39389.956ENSSBOG00000021803-8492.019Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSSBOG00000021847-10096.970Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000010729rps39872.727ENSSBOG00000024651-8273.043Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000010729rps39895.062ENSSHAG00000011198-9496.916Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000010729rps310094.378ENSSFOG00015002290rps39497.403Scleropages_formosus
ENSXETG00000010729rps310095.547ENSSMAG00000004341rps39398.268Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSSDUG00000004327rps310095.181Seriola_dumerili
ENSXETG00000010729rps35485.075ENSSLDG00000007403-9985.075Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSSLDG00000018053rps310095.181Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000010729rps39795.436ENSSARG00000006979-9598.268Sorex_araneus
ENSXETG00000010729rps39696.624ENSSPUG00000017181-10096.624Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000010729rps310095.984ENSSPAG00000022245rps310095.984Stegastes_partitus
ENSXETG00000010729rps39362.009ENSSSCG00000036413-9862.009Sus_scrofa
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSSSCG00000014855RPS310096.761Sus_scrofa
ENSXETG00000010729rps36395.513ENSTGUG00000013480-9995.513Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000010729rps310095.582ENSTRUG00000023549rps310095.582Takifugu_rubripes
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSTBEG00000007053-10097.166Tupaia_belangeri
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSTTRG00000005858RPS310096.761Tursiops_truncatus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSUAMG00000021546-10097.166Ursus_americanus
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSUMAG00000010808-10097.166Ursus_maritimus
ENSXETG00000010729rps310096.761ENSVPAG00000011615RPS310096.761Vicugna_pacos
ENSXETG00000010729rps310097.166ENSVVUG00000024353-10097.166Vulpes_vulpes
ENSXETG00000010729rps36376.768ENSVVUG00000018431-9576.768Vulpes_vulpes
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSXCOG00000012468rps39498.701Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000010729rps310095.181ENSXMAG00000004703rps39498.701Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us