EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000010932 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: skiv2l
Alias: -
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23612 bases
Position: chrGL173810.1:65173-88784
Accession: XB-GENE-486233
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000023885	rRNA_proc-arch	PF13234.6	4.2e-27	1	1
ENSXETP00000023885	DEAD	PF00270.29	1.4e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000023885	-	4056	XM_002942974	ENSXETP00000023885	1254 (aa)	XP_002943020	F7CKF2

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000010932's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000010932's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000010932	skiv2l	78	36.603	ENSXETG00000032798	MTREX	90	36.603

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.287	ENSG00000204351	SKIV2L	100	58.016	Homo_sapiens
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.828	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	58.749	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.637	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	58.446	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.600	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	57.920	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.615	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	58.615	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.537	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	58.537	Amphiprion_percula
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.903	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	58.842	Anabas_testudineus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	64.342	ENSACAG00000011746	SKIV2L	100	64.969	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.604	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	58.333	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.195	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	58.432	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000010932	skiv2l	98	58.147	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	58.090	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.366	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	58.095	Bos_taurus
ENSXETG00000010932	skiv2l	76	45.746	WBGene00008502	skih-2	78	45.946	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.777	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	58.506	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000010932	skiv2l	98	59.080	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	58.856	Canis_familiaris
ENSXETG00000010932	skiv2l	98	59.080	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	58.856	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.749	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	58.558	Capra_hircus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	57.983	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	58.082	Carlito_syrichta
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	59.395	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	59.395	Cavia_porcellus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.539	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	58.267	Cebus_capucinus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.366	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	58.413	Cercocebus_atys
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	59.239	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	58.983	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.307	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	58.036	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000010932	skiv2l	82	70.349	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	92	70.349	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000010932	skiv2l	93	50.595	ENSCING00000005576	-	99	50.549	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.413	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	58.459	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	59.350	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	59.080	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.720	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	58.866	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	59.617	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	59.617	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.347	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	58.347	Danio_rerio
ENSXETG00000010932	skiv2l	94	62.278	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	54.595	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000010932	skiv2l	95	43.596	FBgn0039117	tst	99	43.525	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000010932	skiv2l	68	63.636	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	63.636	Echinops_telfairi
ENSXETG00000010932	skiv2l	92	54.007	ENSEBUG00000013680	-	99	53.885	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000010932	skiv2l	92	60.000	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	60.000	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000010932	skiv2l	95	57.873	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	57.873	Equus_caballus
ENSXETG00000010932	skiv2l	52	74.308	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	74.308	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.991	ENSELUG00000000181	skiv2l	99	58.991	Esox_lucius
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.889	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	58.618	Felis_catus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	57.677	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	57.677	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	60.506	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.142	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.008	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	57.849	Gadus_morhua
ENSXETG00000010932	skiv2l	77	56.936	ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	57.026	Gallus_gallus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.987	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	58.987	Gambusia_affinis
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.689	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	58.333	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.604	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	58.333	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.353	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	58.591	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.730	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	58.618	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	57.302	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	57.188	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000010932	skiv2l	98	56.772	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	56.772	Hippocampus_comes
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.413	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	57.853	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.907	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	58.651	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000010932	skiv2l	59	57.186	ENSLACG00000002986	-	63	57.245	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.525	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	58.525	Loxodonta_africana
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.366	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	58.413	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.287	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	58.413	Macaca_mulatta
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.287	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	58.413	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.366	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	58.413	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.758	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	58.280	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.274	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	58.511	Maylandia_zebra
ENSXETG00000010932	skiv2l	70	48.454	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	98	48.454	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.446	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	58.366	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.049	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	57.857	Microcebus_murinus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	57.268	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	56.995	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.384	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	57.154	Mola_mola
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.824	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	59.062	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.510	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	57.303	Monopterus_albus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.571	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	58.459	Mus_caroli
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.492	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	58.459	Mus_musculus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.571	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	58.539	Mus_pahari
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.333	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	58.300	Mus_spretus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.697	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	58.763	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.604	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	58.413	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.200	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	57.120	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000010932	skiv2l	98	57.304	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	57.143	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000010932	skiv2l	78	59.292	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	59.292	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	57.957	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	58.016	Ochotona_princeps
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.525	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	58.459	Octodon_degus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.525	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	59.001	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.604	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	58.333	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.819	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	58.833	Oryzias_latipes
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.661	ENSORLG00020009462	skiv2l	97	62.564	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.564	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	58.564	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	59.494	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	59.731	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.558	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	58.525	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	55.280	ENSOARG00000002411	-	100	55.089	Ovis_aries
ENSXETG00000010932	skiv2l	98	57.853	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	57.769	Pan_paniscus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.875	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	58.684	Panthera_pardus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.399	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	58.208	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.604	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	58.333	Pan_troglodytes
ENSXETG00000010932	skiv2l	98	57.143	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	57.382	Papio_anubis
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.998	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	57.998	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.751	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	57.878	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.697	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	58.426	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	59.492	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	59.253	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.940	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	58.642	Poecilia_formosa
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.721	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	58.425	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.940	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	58.642	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.200	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	57.200	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.287	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	58.016	Pongo_abelii
ENSXETG00000010932	skiv2l	71	59.719	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	71	59.719	Procavia_capensis
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.777	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	58.506	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.525	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	58.347	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.361	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	63.292	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000010932	skiv2l	98	58.180	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	58.300	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.651	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	58.539	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000010932	skiv2l	98	57.051	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	57.245	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.366	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	58.413	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000010932	skiv2l	77	42.451	YLR398C	-	84	42.562	Saccharomyces_cerevisiae
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	59.015	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	58.744	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	59.141	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	58.267	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.517	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	58.392	Scleropages_formosus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.725	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	58.824	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.591	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	58.591	Seriola_dumerili
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	56.924	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	56.683	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	60.528	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	60.606	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000010932	skiv2l	94	57.728	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	57.895	Stegastes_partitus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.465	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	58.195	Sus_scrofa
ENSXETG00000010932	skiv2l	69	62.427	ENSTRUG00000000966	skiv2l	76	68.889	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	56.871	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	57.188	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000010932	skiv2l	94	60.292	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	60.292	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	54.869	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	54.754	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.954	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	58.763	Ursus_americanus
ENSXETG00000010932	skiv2l	92	60.588	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	60.381	Ursus_maritimus
ENSXETG00000010932	skiv2l	98	59.080	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	58.941	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	59.197	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	59.197	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.907	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	58.610	Xiphophorus_maculatus