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Description

Ensembl ID: ENSXETG00000015299 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: smarca2
Alias: -
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 97193 bases
Position: chrGL173332.1:370624-467816
Accession: XB-GENE-1013843
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000033490	ResIII	PF04851.15	5.1e-09	1	1
ENSXETP00000033490	BRK	PF07533.16	1.6e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000033490	-	5137	-	ENSXETP00000033490	1605 (aa)	-	F6SIJ0
ENSXETT00000033473	-	2059	-	ENSXETP00000033473	580 (aa)	-	F6SIZ3
ENSXETT00000062370	-	1912	-	ENSXETP00000060838	531 (aa)	-	F6SWR4

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000015299	smarca2	96	70.368	ENSXETG00000009355	smarca4	98	70.754

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000015299	smarca2	82	87.557	ENSG00000080503	SMARCA2	100	92.617	Homo_sapiens
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.015	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	76.695	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000015299	smarca2	91	78.378	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	87.956	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000015299	smarca2	100	74.924	ENSACIG00000015607	SMARCA2	98	76.238	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	74.666	ENSAOCG00000009647	-	100	76.728	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000015299	smarca2	100	74.818	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	100	76.852	Amphiprion_percula
ENSXETG00000015299	smarca2	99	77.193	ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	77.502	Anabas_testudineus
ENSXETG00000015299	smarca2	89	81.730	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	82.076	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000015299	smarca2	100	83.779	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	83.468	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000015299	smarca2	100	82.174	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	83.168	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000015299	smarca2	100	74.725	ENSACLG00000004248	SMARCA2	98	76.226	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000015299	smarca2	100	77.819	ENSAMXG00000012404	smarca2	100	78.248	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	82.857	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	83.354	Bos_taurus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	82.550	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	82.673	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	83.106	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	83.261	Canis_familiaris
ENSXETG00000015299	smarca2	73	88.491	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	88.321	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000015299	smarca2	100	82.919	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	83.416	Capra_hircus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	79.752	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	83.126	Carlito_syrichta
ENSXETG00000015299	smarca2	80	86.311	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	100	80.462	Cavia_aperea
ENSXETG00000015299	smarca2	81	88.420	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	82.898	Cavia_porcellus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	82.178	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	83.013	Cebus_capucinus
ENSXETG00000015299	smarca2	92	84.351	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	83.189	Cercocebus_atys
ENSXETG00000015299	smarca2	81	88.574	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	82	88.804	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000015299	smarca2	75	88.734	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	84.151	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000015299	smarca2	67	84.472	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	83.739	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000015299	smarca2	100	84.777	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	84.777	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000015299	smarca2	82	87.633	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	83.354	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000015299	smarca2	81	78.879	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	97	72.756	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000015299	smarca2	85	73.608	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	74.130	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	78.044	ENSDARG00000008904	smarca2	98	78.482	Danio_rerio
ENSXETG00000015299	smarca2	100	83.116	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	83.571	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000015299	smarca2	82	87.245	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	83.002	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000015299	smarca2	76	60.870	FBgn0000212	brm	92	52.769	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000015299	smarca2	77	64.432	ENSEBUG00000002449	-	99	60.546	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000015299	smarca2	74	75.667	ENSEBUG00000011442	-	80	73.867	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000015299	smarca2	66	90.278	ENSEEUG00000015540	-	70	90.278	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000015299	smarca2	92	77.467	ENSELUG00000010318	smarca2	92	82.697	Esox_lucius
ENSXETG00000015299	smarca2	100	82.981	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	83.602	Felis_catus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	84.525	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	85.504	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000015299	smarca2	81	88.059	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	81.796	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000015299	smarca2	100	76.587	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	76.786	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000015299	smarca2	98	75.079	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	98	75.237	Gadus_morhua
ENSXETG00000015299	smarca2	100	84.897	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	84.783	Gallus_gallus
ENSXETG00000015299	smarca2	77	76.917	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	71.855	Gambusia_affinis
ENSXETG00000015299	smarca2	99	74.200	ENSGACG00000014488	SMARCA2	100	74.707	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	84.777	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	84.777	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000015299	smarca2	90	88.889	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	80.556	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.549	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	98	76.836	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000015299	smarca2	100	81.954	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	82.400	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000015299	smarca2	89	68.145	ENSHCOG00000015348	-	98	77.748	Hippocampus_comes
ENSXETG00000015299	smarca2	100	76.890	ENSIPUG00000011060	smarca2	99	78.080	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000015299	smarca2	81	88.249	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	83.478	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000015299	smarca2	82	87.226	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	83.127	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.877	ENSKMAG00000015844	-	100	76.275	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000015299	smarca2	50	68.834	ENSLACG00000000270	SMARCA2	99	70.492	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000015299	smarca2	98	79.649	ENSLOCG00000011499	smarca2	100	79.707	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	82.043	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	82.838	Loxodonta_africana
ENSXETG00000015299	smarca2	92	85.188	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	82.214	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000015299	smarca2	82	87.709	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	83.478	Macaca_mulatta
ENSXETG00000015299	smarca2	82	86.943	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	83.065	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000015299	smarca2	92	89.108	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	96	89.266	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	77.298	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	77.572	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.748	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	98	76.918	Maylandia_zebra
ENSXETG00000015299	smarca2	77	69.029	ENSMGAG00000005160	-	99	64.590	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000015299	smarca2	100	82.671	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	83.168	Microcebus_murinus
ENSXETG00000015299	smarca2	82	87.302	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	82.930	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000015299	smarca2	99	74.175	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	74.042	Mola_mola
ENSXETG00000015299	smarca2	100	85.012	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	85.075	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000015299	smarca2	99	75.157	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	75.405	Monopterus_albus
ENSXETG00000015299	smarca2	82	87.377	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	83.168	Mus_caroli
ENSXETG00000015299	smarca2	82	87.453	ENSMUSG00000024921	Smarca2	93	98.000	Mus_musculus
ENSXETG00000015299	smarca2	82	87.226	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	83.106	Mus_pahari
ENSXETG00000015299	smarca2	79	90.593	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	99	90.593	Mus_spretus
ENSXETG00000015299	smarca2	79	87.597	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	87.752	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000015299	smarca2	99	79.012	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	79.110	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000015299	smarca2	99	80.689	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	81.561	Nannospalax_galili
ENSXETG00000015299	smarca2	95	66.737	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	90.506	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000015299	smarca2	93	88.208	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	97	88.601	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.015	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	74.985	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000015299	smarca2	79	83.777	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	79.193	Ochotona_princeps
ENSXETG00000015299	smarca2	81	87.062	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	82.886	Octodon_degus
ENSXETG00000015299	smarca2	99	76.698	ENSONIG00000014163	SMARCA2	98	77.218	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000015299	smarca2	79	88.950	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	83.665	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.337	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	76.667	Oryzias_latipes
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.337	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	76.420	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000015299	smarca2	99	76.614	ENSOMEG00000009736	-	100	76.576	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000015299	smarca2	79	88.670	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	81.246	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000015299	smarca2	79	88.489	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	82.433	Ovis_aries
ENSXETG00000015299	smarca2	92	89.092	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	97	85.768	Pan_paniscus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	83.043	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	83.665	Panthera_pardus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	83.116	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	83.168	Pan_troglodytes
ENSXETG00000015299	smarca2	81	83.639	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	78.098	Papio_anubis
ENSXETG00000015299	smarca2	100	79.117	ENSPKIG00000018469	-	99	84.404	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000015299	smarca2	100	84.396	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	84.520	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000015299	smarca2	94	75.881	ENSPMGG00000013696	-	97	70.860	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000015299	smarca2	82	86.546	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	81.858	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000015299	smarca2	94	69.672	ENSPMAG00000005337	-	95	69.845	Petromyzon_marinus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	84.950	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	84.449	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.230	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	75.980	Poecilia_formosa
ENSXETG00000015299	smarca2	99	75.622	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	99	75.123	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000015299	smarca2	99	75.671	ENSPMEG00000001815	-	99	75.919	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.400	ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	76.030	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000015299	smarca2	81	87.481	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	82.795	Pongo_abelii
ENSXETG00000015299	smarca2	79	74.386	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	74.386	Procavia_capensis
ENSXETG00000015299	smarca2	100	80.757	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	80.870	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000015299	smarca2	91	82.467	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	94	82.777	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	73.755	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	98	74.264	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000015299	smarca2	99	78.323	ENSPNAG00000014635	smarca2	99	78.876	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000015299	smarca2	82	86.055	ENSRNOG00000011931	Smarca2	100	82.187	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	77.660	ENSRBIG00000038618	SMARCA2	95	88.949	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000015299	smarca2	100	81.083	ENSRROG00000019271	SMARCA2	100	82.447	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000015299	smarca2	93	89.028	ENSSBOG00000034827	SMARCA2	96	88.589	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000015299	smarca2	100	84.577	ENSSHAG00000007884	SMARCA2	100	84.201	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000015299	smarca2	89	79.086	ENSSFOG00015014870	SMARCA2	97	79.349	Scleropages_formosus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	76.027	ENSSMAG00000013707	SMARCA2	100	76.716	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.136	ENSSDUG00000008852	-	100	76.214	Seriola_dumerili
ENSXETG00000015299	smarca2	80	82.780	ENSSLDG00000025449	SMARCA2	99	75.866	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000015299	smarca2	85	84.219	ENSSARG00000007888	SMARCA2	88	84.219	Sorex_araneus
ENSXETG00000015299	smarca2	95	81.883	ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	81.883	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.562	ENSSPAG00000020091	-	100	77.122	Stegastes_partitus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	82.919	ENSSSCG00000005232	SMARCA2	100	83.416	Sus_scrofa
ENSXETG00000015299	smarca2	98	84.395	ENSTGUG00000005460	SMARCA2	100	83.903	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000015299	smarca2	99	75.883	ENSTRUG00000015619	SMARCA2	100	76.601	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000015299	smarca2	63	100.000	ENSTBEG00000008767	SMARCA2	69	100.000	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000015299	smarca2	95	82.654	ENSTTRG00000002033	SMARCA2	95	82.977	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000015299	smarca2	89	82.300	ENSUAMG00000024701	SMARCA2	99	82.287	Ursus_americanus
ENSXETG00000015299	smarca2	80	89.326	ENSVPAG00000001204	SMARCA2	90	89.326	Vicugna_pacos
ENSXETG00000015299	smarca2	73	87.734	ENSVVUG00000004598	SMARCA2	96	87.564	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000015299	smarca2	71	80.139	ENSXCOG00000011073	SMARCA2	99	74.451	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000015299	smarca2	100	75.414	ENSXMAG00000015611	SMARCA2	100	76.059	Xiphophorus_maculatus