EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000015708 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nrde2
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing (nrde2)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29303 bases
Position: chrGL172685.1:2268802-2298104
Accession: NM_001079399
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000059066	NRDE-2	PF08424.10	2e-103	1	1
ENSXETP00000034250	NRDE-2	PF08424.10	4.7e-103	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000060731	-	3498	-	ENSXETP00000059066	1125 (aa)	-	F6T5F2
ENSXETT00000034250	-	3525	-	ENSXETP00000034250	1134 (aa)	-	F6Z2N8

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000015708's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000015708's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.421	ENSG00000119720	NRDE2	99	65.196	Homo_sapiens
ENSXETG00000015708	nrde2	91	46.035	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	43.662	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.654	ENSAMEG00000001807	NRDE2	99	53.833	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000015708	nrde2	92	46.332	ENSACIG00000014783	nrde2	96	47.404	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000015708	nrde2	91	46.386	ENSAOCG00000015576	nrde2	98	43.963	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000015708	nrde2	91	46.550	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	43.933	Amphiprion_percula
ENSXETG00000015708	nrde2	100	43.590	ENSATEG00000010247	nrde2	99	42.988	Anabas_testudineus
ENSXETG00000015708	nrde2	90	60.172	ENSAPLG00000015870	NRDE2	98	56.916	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000015708	nrde2	99	51.161	ENSACAG00000014571	NRDE2	99	51.247	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.830	ENSANAG00000025313	NRDE2	99	52.263	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000015708	nrde2	100	43.225	ENSACLG00000025154	nrde2	92	44.656	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000015708	nrde2	83	64.103	ENSAMXG00000034642	nrde2	91	42.970	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.249	ENSBTAG00000005427	NRDE2	99	54.120	Bos_taurus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.149	ENSCJAG00000017711	NRDE2	99	54.128	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.845	ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	52.207	Canis_familiaris
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.010	ENSCAFG00020016346	NRDE2	99	54.056	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.541	ENSCHIG00000005876	NRDE2	99	53.144	Capra_hircus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.339	ENSTSYG00000000161	NRDE2	99	52.997	Carlito_syrichta
ENSXETG00000015708	nrde2	91	57.681	ENSCAPG00000012039	NRDE2	96	55.806	Cavia_aperea
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.733	ENSCPOG00000002428	NRDE2	99	54.335	Cavia_porcellus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.985	ENSCCAG00000024917	NRDE2	99	53.892	Cebus_capucinus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.608	ENSCLAG00000015185	NRDE2	99	54.327	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.202	ENSCSAG00000011451	NRDE2	99	54.335	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000015708	nrde2	74	55.620	ENSCHOG00000006165	NRDE2	74	55.702	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000015708	nrde2	99	56.058	ENSCPBG00000008537	NRDE2	97	57.314	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.596	ENSCANG00000029067	NRDE2	99	54.217	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.916	ENSCGRG00001015658	Nrde2	99	53.242	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.179	ENSCGRG00000005062	Nrde2	99	53.516	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000015708	nrde2	90	45.005	ENSCSEG00000000089	nrde2	96	45.967	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000015708	nrde2	100	44.649	ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.351	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000015708	nrde2	100	46.729	ENSDARG00000074726	nrde2	92	49.250	Danio_rerio
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.452	ENSDNOG00000024057	NRDE2	99	54.163	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000015708	nrde2	81	57.725	ENSDORG00000003197	Nrde2	99	57.573	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000015708	nrde2	62	61.111	ENSETEG00000000198	NRDE2	70	52.555	Echinops_telfairi
ENSXETG00000015708	nrde2	89	40.660	ENSEBUG00000014552	nrde2	90	39.469	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.499	ENSEASG00005020675	NRDE2	99	54.413	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.530	ENSECAG00000003862	NRDE2	99	54.499	Equus_caballus
ENSXETG00000015708	nrde2	67	71.429	ENSEEUG00000004026	-	68	69.919	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000015708	nrde2	92	48.219	ENSELUG00000005973	nrde2	93	47.641	Esox_lucius
ENSXETG00000015708	nrde2	100	54.213	ENSFCAG00000011312	NRDE2	99	54.506	Felis_catus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	55.537	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	55.017	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.045	ENSFDAG00000021350	NRDE2	99	54.163	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000015708	nrde2	100	44.871	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	44.677	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000015708	nrde2	65	51.674	ENSGMOG00000015815	nrde2	89	51.674	Gadus_morhua
ENSXETG00000015708	nrde2	99	55.149	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	55.107	Gallus_gallus
ENSXETG00000015708	nrde2	92	46.002	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	47.788	Gambusia_affinis
ENSXETG00000015708	nrde2	100	43.059	ENSGACG00000012619	nrde2	99	42.523	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000015708	nrde2	88	61.652	ENSGAGG00000003252	NRDE2	99	57.057	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.826	ENSGGOG00000008835	NRDE2	99	54.131	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000015708	nrde2	100	43.126	ENSHBUG00000016736	nrde2	92	44.565	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.264	ENSHGLG00000006731	NRDE2	99	54.608	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000015708	nrde2	91	57.427	ENSHGLG00100017736	NRDE2	95	55.938	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000015708	nrde2	92	41.575	ENSHCOG00000009559	nrde2	99	40.781	Hippocampus_comes
ENSXETG00000015708	nrde2	92	46.358	ENSIPUG00000016129	nrde2	92	45.782	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000015708	nrde2	88	57.666	ENSSTOG00000001678	NRDE2	99	53.265	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.156	ENSJJAG00000000907	Nrde2	99	54.327	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000015708	nrde2	91	45.929	ENSKMAG00000008647	nrde2	99	44.380	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000015708	nrde2	89	47.505	ENSLBEG00000021428	nrde2	97	46.339	Labrus_bergylta
ENSXETG00000015708	nrde2	72	57.419	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	57.265	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000015708	nrde2	90	55.436	ENSLOCG00000009037	nrde2	92	53.679	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000015708	nrde2	94	56.004	ENSLAFG00000004966	NRDE2	96	55.718	Loxodonta_africana
ENSXETG00000015708	nrde2	80	58.333	ENSMMUG00000010442	NRDE2	99	64.706	Macaca_mulatta
ENSXETG00000015708	nrde2	90	45.338	ENSMAMG00000013452	nrde2	92	45.045	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000015708	nrde2	100	43.142	ENSMZEG00005008319	nrde2	92	44.565	Maylandia_zebra
ENSXETG00000015708	nrde2	86	58.510	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	58.232	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.093	ENSMAUG00000018578	Nrde2	99	53.047	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.944	ENSMICG00000016741	NRDE2	99	55.021	Microcebus_murinus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	50.471	ENSMOCG00000014472	Nrde2	99	50.556	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000015708	nrde2	72	46.776	ENSMMOG00000004703	nrde2	91	46.776	Mola_mola
ENSXETG00000015708	nrde2	94	52.692	ENSMODG00000002711	NRDE2	100	52.692	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000015708	nrde2	89	47.162	ENSMALG00000021869	nrde2	95	45.599	Monopterus_albus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.446	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	52.956	Mus_caroli
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.510	ENSMUSG00000021179	Nrde2	99	53.590	Mus_musculus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.835	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	53.385	Mus_pahari
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.122	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	97	69.945	Mus_spretus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	51.858	ENSMPUG00000008135	NRDE2	99	51.941	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.721	ENSMLUG00000007484	NRDE2	99	53.886	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.098	ENSNGAG00000002993	Nrde2	99	53.482	Nannospalax_galili
ENSXETG00000015708	nrde2	89	46.279	ENSNBRG00000010184	nrde2	96	47.894	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.426	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	53.492	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000015708	nrde2	73	58.468	ENSMEUG00000011097	NRDE2	73	58.468	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000015708	nrde2	62	73.469	ENSOPRG00000001375	-	60	73.000	Ochotona_princeps
ENSXETG00000015708	nrde2	91	56.927	ENSODEG00000012422	NRDE2	91	57.430	Octodon_degus
ENSXETG00000015708	nrde2	100	45.347	ENSONIG00000019512	nrde2	99	45.150	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.124	ENSOCUG00000010083	NRDE2	99	53.959	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000015708	nrde2	89	46.467	ENSORLG00000017730	nrde2	98	43.453	Oryzias_latipes
ENSXETG00000015708	nrde2	100	42.518	ENSORLG00020015965	nrde2	92	43.677	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000015708	nrde2	100	42.787	ENSORLG00015012437	nrde2	97	43.528	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000015708	nrde2	91	46.935	ENSOMEG00000010890	nrde2	92	45.987	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000015708	nrde2	99	55.403	ENSOGAG00000006624	NRDE2	99	55.232	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000015708	nrde2	91	54.135	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	51.630	Ovis_aries
ENSXETG00000015708	nrde2	92	57.009	ENSPPAG00000034133	NRDE2	99	58.019	Pan_paniscus
ENSXETG00000015708	nrde2	100	54.383	ENSPPRG00000006422	NRDE2	99	54.506	Panthera_pardus
ENSXETG00000015708	nrde2	100	54.383	ENSPTIG00000009989	NRDE2	99	54.506	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.912	ENSPTRG00000023399	NRDE2	99	54.217	Pan_troglodytes
ENSXETG00000015708	nrde2	100	46.626	ENSPKIG00000009331	nrde2	99	45.958	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000015708	nrde2	99	57.326	ENSPSIG00000005588	NRDE2	99	57.376	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000015708	nrde2	93	44.995	ENSPMGG00000024089	nrde2	95	44.793	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.825	ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	53.077	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000015708	nrde2	99	55.613	ENSPCIG00000018567	NRDE2	99	54.772	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000015708	nrde2	91	45.158	ENSPFOG00000013217	nrde2	91	44.455	Poecilia_formosa
ENSXETG00000015708	nrde2	91	45.363	ENSPLAG00000022350	nrde2	91	44.665	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000015708	nrde2	91	45.363	ENSPMEG00000000778	nrde2	91	44.665	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000015708	nrde2	90	45.680	ENSPREG00000009066	nrde2	99	43.012	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000015708	nrde2	85	57.867	ENSPPYG00000006245	NRDE2	99	57.645	Pongo_abelii
ENSXETG00000015708	nrde2	73	81.538	ENSPCAG00000016399	NRDE2	70	80.000	Procavia_capensis
ENSXETG00000015708	nrde2	94	52.925	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	52.925	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000015708	nrde2	96	51.678	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	51.730	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000015708	nrde2	92	43.855	ENSPNYG00000022833	nrde2	93	47.614	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000015708	nrde2	92	47.474	ENSPNAG00000015807	nrde2	99	46.863	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000015708	nrde2	90	51.507	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	52.260	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.530	ENSSBOG00000024346	NRDE2	99	54.335	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000015708	nrde2	99	54.863	ENSSHAG00000016736	NRDE2	96	54.149	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000015708	nrde2	92	50.993	ENSSFOG00015011794	nrde2	99	48.999	Scleropages_formosus
ENSXETG00000015708	nrde2	89	45.046	ENSSMAG00000011671	nrde2	98	42.399	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000015708	nrde2	90	45.678	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	43.636	Seriola_dumerili
ENSXETG00000015708	nrde2	90	47.070	ENSSLDG00000023798	nrde2	98	47.409	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000015708	nrde2	91	60.095	ENSSPUG00000006348	NRDE2	99	60.153	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000015708	nrde2	89	47.030	ENSSPAG00000000539	nrde2	98	46.659	Stegastes_partitus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.391	ENSSSCG00000002434	NRDE2	99	53.853	Sus_scrofa
ENSXETG00000015708	nrde2	90	59.192	ENSTGUG00000012462	-	97	56.346	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000015708	nrde2	78	46.637	ENSTRUG00000002798	nrde2	95	46.488	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000015708	nrde2	86	59.688	ENSTBEG00000011834	NRDE2	86	58.672	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.740	ENSTTRG00000013583	NRDE2	99	52.916	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000015708	nrde2	90	57.212	ENSUAMG00000004159	NRDE2	97	55.576	Ursus_americanus
ENSXETG00000015708	nrde2	91	56.142	ENSUMAG00000006393	NRDE2	96	54.646	Ursus_maritimus
ENSXETG00000015708	nrde2	99	53.599	ENSVVUG00000018202	NRDE2	99	53.814	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000015708	nrde2	92	45.207	ENSXCOG00000013298	nrde2	98	44.879	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000015708	nrde2	100	44.023	ENSXMAG00000009320	nrde2	99	43.641	Xiphophorus_maculatus