EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000015900 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: cnot1
Alias: -
Full Name: CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 87609 bases
Position: chrGL172642.1:3770032-3857640
Accession: XB-GENE-1032888
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000034707	Not1	PF04054.15	6.9e-153	1	1
ENSXETP00000034721	Not1	PF04054.15	7e-153	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000034707	-	7437	-	ENSXETP00000034707	2367 (aa)	-	F6TND7
ENSXETT00000034721	-	7500	-	ENSXETP00000034721	2388 (aa)	-	F6TMQ7

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.282	ENSG00000125107	CNOT1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSXETG00000015900	cnot1	97	89.216	ENSAPOG00000005042	cnot1	100	89.216	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.282	ENSAMEG00000017298	CNOT1	100	90.492	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000015900	cnot1	90	84.211	ENSACIG00000016003	cnot1	100	84.490	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	84.213	ENSAPEG00000022342	cnot1	100	85.103	Amphiprion_percula
ENSXETG00000015900	cnot1	97	89.356	ENSATEG00000012892	cnot1	100	89.356	Anabas_testudineus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.690	ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	90.067	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000015900	cnot1	91	87.974	ENSACAG00000001602	CNOT1	98	87.835	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000015900	cnot1	100	87.051	ENSANAG00000038198	CNOT1	100	87.260	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000015900	cnot1	100	83.550	ENSACLG00000014234	cnot1	100	89.356	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000015900	cnot1	100	85.654	ENSAMXG00000013170	cnot1	100	86.081	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000015900	cnot1	95	99.394	ENSBTAG00000020782	CNOT1	100	99.394	Bos_taurus
ENSXETG00000015900	cnot1	82	39.791	WBGene00002845	let-711	92	54.430	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.966	ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	90.176	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.862	ENSCAFG00000008426	CNOT1	100	90.071	Canis_familiaris
ENSXETG00000015900	cnot1	95	95.775	ENSCAFG00020010156	CNOT1	100	95.775	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.176	ENSCHIG00000010452	CNOT1	100	90.386	Capra_hircus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.092	ENSTSYG00000006888	CNOT1	100	90.302	Carlito_syrichta
ENSXETG00000015900	cnot1	100	86.272	ENSCPOG00000013026	CNOT1	100	85.978	Cavia_porcellus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.547	ENSCCAG00000026333	CNOT1	100	89.757	Cebus_capucinus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.008	ENSCATG00000032625	CNOT1	100	90.218	Cercocebus_atys
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.134	ENSCLAG00000006289	CNOT1	100	90.344	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.008	ENSCSAG00000004731	CNOT1	100	90.218	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000015900	cnot1	75	98.587	ENSCHOG00000009712	CNOT1	78	98.587	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000015900	cnot1	93	99.596	ENSCPBG00000026222	CNOT1	98	99.596	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000015900	cnot1	100	57.143	ENSCING00000009149	-	100	56.918	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000015900	cnot1	89	59.691	ENSCSAVG00000002414	-	94	78.808	Ciona_savignyi
ENSXETG00000015900	cnot1	100	88.130	ENSCANG00000040534	CNOT1	100	88.213	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.798	ENSCGRG00001016365	Cnot1	100	90.008	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.798	ENSCGRG00000001714	Cnot1	100	90.008	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000015900	cnot1	100	80.730	ENSCVAG00000018930	cnot1	100	80.688	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	85.241	ENSDARG00000004174	cnot1	100	84.828	Danio_rerio
ENSXETG00000015900	cnot1	100	87.789	ENSDNOG00000013250	CNOT1	100	87.998	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000015900	cnot1	94	50.216	FBgn0085436	Not1	99	46.996	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000015900	cnot1	84	88.271	ENSETEG00000012806	CNOT1	84	88.271	Echinops_telfairi
ENSXETG00000015900	cnot1	79	76.471	ENSEBUG00000011534	cnot1	93	76.471	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000015900	cnot1	95	99.394	ENSEASG00005005819	CNOT1	100	99.394	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.092	ENSECAG00000009889	CNOT1	100	90.302	Equus_caballus
ENSXETG00000015900	cnot1	89	88.489	ENSEEUG00000006015	CNOT1	90	88.802	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	84.431	ENSELUG00000014085	cnot1	100	84.533	Esox_lucius
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.749	ENSFCAG00000025155	CNOT1	100	89.958	Felis_catus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.966	ENSFALG00000007285	CNOT1	100	90.176	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.092	ENSFDAG00000013399	CNOT1	100	90.302	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000015900	cnot1	100	84.499	ENSFHEG00000020574	cnot1	100	84.541	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000015900	cnot1	90	83.626	ENSGMOG00000012864	cnot1	100	83.402	Gadus_morhua
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.882	ENSGALG00000002301	CNOT1	100	90.092	Gallus_gallus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	83.795	ENSGAFG00000015005	cnot1	100	83.795	Gambusia_affinis
ENSXETG00000015900	cnot1	91	84.427	ENSGACG00000002606	cnot1	100	89.346	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.013	ENSGAGG00000022646	CNOT1	100	90.097	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.092	ENSGGOG00000009547	CNOT1	100	90.302	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000015900	cnot1	97	89.356	ENSHBUG00000001729	cnot1	100	89.356	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.050	ENSHGLG00000014322	CNOT1	100	90.260	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000015900	cnot1	100	84.239	ENSHCOG00000006501	cnot1	100	84.217	Hippocampus_comes
ENSXETG00000015900	cnot1	100	84.277	ENSIPUG00000011915	cnot1	100	84.228	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.344	ENSSTOG00000005490	CNOT1	100	90.344	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.421	ENSJJAG00000000633	Cnot1	100	89.631	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	84.734	ENSKMAG00000006149	cnot1	100	85.182	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000015900	cnot1	95	97.778	ENSLBEG00000004740	cnot1	100	97.778	Labrus_bergylta
ENSXETG00000015900	cnot1	100	88.707	ENSLACG00000010869	CNOT1	100	88.959	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000015900	cnot1	100	87.301	ENSLOCG00000006324	cnot1	100	87.374	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.849	ENSLAFG00000000098	CNOT1	100	90.059	Loxodonta_africana
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.240	ENSMFAG00000035888	CNOT1	100	90.450	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.966	ENSMMUG00000014625	CNOT1	94	99.273	Macaca_mulatta
ENSXETG00000015900	cnot1	100	87.411	ENSMNEG00000031820	CNOT1	100	89.660	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000015900	cnot1	100	88.707	ENSMLEG00000040933	CNOT1	100	88.791	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	83.263	ENSMAMG00000016524	cnot1	100	83.683	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	74.676	ENSMZEG00005016210	cnot1	100	89.356	Maylandia_zebra
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.114	ENSMGAG00000001908	CNOT1	100	90.324	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.631	ENSMICG00000007071	CNOT1	100	89.924	Microcebus_murinus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.757	ENSMOCG00000017969	Cnot1	100	89.966	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000015900	cnot1	97	85.994	ENSMMOG00000019134	cnot1	100	85.994	Mola_mola
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.348	ENSMODG00000014199	CNOT1	100	90.558	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000015900	cnot1	100	84.341	ENSMALG00000008645	cnot1	100	84.725	Monopterus_albus
ENSXETG00000015900	cnot1	95	98.095	MGP_CAROLIEiJ_G0031430	Cnot1	92	98.095	Mus_caroli
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.987	ENSMUSG00000036550	Cnot1	100	90.198	Mus_musculus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.882	MGP_PahariEiJ_G0023028	Cnot1	100	90.092	Mus_pahari
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.840	MGP_SPRETEiJ_G0032549	Cnot1	100	90.050	Mus_spretus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.092	ENSMPUG00000004830	CNOT1	100	90.302	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.798	ENSMLUG00000003728	CNOT1	100	89.882	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.966	ENSNGAG00000018628	Cnot1	100	90.176	Nannospalax_galili
ENSXETG00000015900	cnot1	92	89.356	ENSNBRG00000019358	cnot1	99	89.356	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.008	ENSNLEG00000003566	CNOT1	100	90.260	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000015900	cnot1	87	94.444	ENSMEUG00000006145	CNOT1	87	94.444	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000015900	cnot1	83	99.111	ENSOPRG00000005604	CNOT1	83	99.111	Ochotona_princeps
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.176	ENSODEG00000016337	CNOT1	100	90.386	Octodon_degus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	85.182	ENSONIG00000007358	cnot1	100	85.117	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000015900	cnot1	90	89.586	ENSOANG00000012109	CNOT1	100	89.775	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.008	ENSOCUG00000006911	CNOT1	100	90.218	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	85.487	ENSORLG00000013734	cnot1	100	85.558	Oryzias_latipes
ENSXETG00000015900	cnot1	100	83.711	ENSORLG00020017012	cnot1	100	83.641	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000015900	cnot1	100	83.627	ENSORLG00015007091	cnot1	100	83.208	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000015900	cnot1	100	83.019	ENSOMEG00000015124	cnot1	100	83.711	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.050	ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	90.260	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.176	ENSOARG00000001567	CNOT1	100	90.386	Ovis_aries
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.050	ENSPPAG00000022013	CNOT1	100	90.260	Pan_paniscus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.092	ENSPPRG00000004867	CNOT1	100	90.302	Panthera_pardus
ENSXETG00000015900	cnot1	100	90.092	ENSPTIG00000012589	CNOT1	100	90.302	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.707	ENSPTRG00000008183	CNOT1	100	89.916	Pan_troglodytes
ENSXETG00000015900	cnot1	100	87.139	ENSPANG00000020901	CNOT1	100	87.222	Papio_anubis
ENSXETG00000015900	cnot1	100	86.404	ENSPKIG00000023538	CNOT1	100	85.900	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000015900	cnot1	100	81.367	ENSPKIG00000002914	CNOT1	100	80.731	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000015900	cnot1	100	89.757	ENSPSIG00000005499	CNOT1	100	89.966	Pelodiscus_sinensis
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ENSXETG00000015900	cnot1	99	84.349	ENSPFOG00000003497	cnot1	100	84.391	Poecilia_formosa
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