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Description

Ensembl ID: ENSXETG00000016812 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 39153 bases
Position: chrGL172749.1:781165-820317
Accession: XB-GENE-493792
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000036652	IBN_N	PF03810.19	7.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000036652	-	2661	-	ENSXETP00000036652	886 (aa)	-	F6ZF74

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	85.421	ENSXETG00000004771	tnpo2	99	85.421

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSG00000083312	TNPO1	100	96.891	Homo_sapiens
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.360	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	92.360	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	93.430	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	93.541	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000016812	tnpo1	86	91.085	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	91.602	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.360	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	92.360	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.360	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	92.360	Amphiprion_percula
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.360	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	92.360	Anabas_testudineus
ENSXETG00000016812	tnpo1	98	91.094	ENSAPLG00000009619	-	96	93.039	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	95.281	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	95.281	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	86.560	ENSANAG00000025351	-	99	86.560	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	93.933	ENSANAG00000022453	-	99	93.933	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	61.024	ENSANAG00000027118	-	99	61.581	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	90.000	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	90.449	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.480	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	91.480	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	94.382	Bos_taurus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.045	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	94.045	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000016812	tnpo1	95	94.399	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	94.399	Canis_familiaris
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.573	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.573	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	94.382	Capra_hircus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	90.734	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	93.099	Carlito_syrichta
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	93.933	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.933	Cebus_capucinus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	94.382	Cercocebus_atys
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	93.933	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.933	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	94.382	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000016812	tnpo1	93	81.764	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	82.360	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	95.169	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	95.169	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	74.578	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.141	Ciona_savignyi
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	94.382	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	94.270	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000016812	tnpo1	95	94.503	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	94.503	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.798	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	91.798	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.910	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	91.910	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.246	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	91.246	Danio_rerio
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	88.130	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	88.690	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000016812	tnpo1	92	94.578	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	94.572	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	58.182	FBgn0035693	CG8219	99	58.182	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000016812	tnpo1	85	95.880	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.880	Echinops_telfairi
ENSXETG00000016812	tnpo1	93	84.964	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.084	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	94.382	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	94.270	Equus_caballus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	85.294	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.141	Esox_lucius
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	94.382	Felis_catus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.831	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	94.831	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.045	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	94.045	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.919	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	91.919	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	89.274	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.274	Gadus_morhua
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.494	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	94.719	Gallus_gallus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.928	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	91.928	Gambusia_affinis
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.685	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	91.685	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	95.169	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	95.169	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	78.812	ENSGGOG00000022535	-	98	78.812	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	94.382	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.135	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	92.135	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	93.933	ENSHGLG00000000970	-	99	93.933	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000016812	tnpo1	95	94.042	ENSHGLG00100017090	-	99	94.042	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000016812	tnpo1	96	75.590	ENSHGLG00100000963	-	99	75.590	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	93.868	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.868	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.910	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	91.910	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000016812	tnpo1	90	88.533	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	88.533	Labrus_bergylta
ENSXETG00000016812	tnpo1	95	87.442	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	93.820	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	93.820	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000016812	tnpo1	95	95.740	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	95.740	Loxodonta_africana
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	94.382	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	94.270	Macaca_mulatta
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	94.382	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	94.382	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.584	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	92.584	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.348	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	91.798	Maylandia_zebra
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	90.562	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.562	Microcebus_murinus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.855	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000016812	tnpo1	86	91.237	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	91.237	Mola_mola
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	95.957	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	95.957	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.011	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.011	Monopterus_albus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	94.270	Mus_caroli
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	94.270	Mus_musculus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	94.176	Mus_pahari
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.045	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.928	Mus_spretus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	94.382	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000016812	tnpo1	95	94.179	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	94.179	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	94.382	Nannospalax_galili
ENSXETG00000016812	tnpo1	86	90.956	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	91.473	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	94.382	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000016812	tnpo1	91	89.162	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	89.162	Ochotona_princeps
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.045	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	94.045	Octodon_degus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.406	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	91.406	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000016812	tnpo1	91	95.000	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	95.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000016812	tnpo1	95	90.521	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	90.521	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000016812	tnpo1	86	90.532	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	91.180	Oryzias_latipes
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.094	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	91.657	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.883	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	91.883	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.883	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	91.883	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	94.382	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	94.382	Ovis_aries
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	94.382	Pan_paniscus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	94.382	Panthera_pardus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	94.382	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000016812	tnpo1	93	81.906	ENSPTRG00000047731	-	100	81.906	Pan_troglodytes
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	94.382	Pan_troglodytes
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	94.382	Papio_anubis
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	88.764	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	88.764	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.831	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	94.831	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	89.764	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	89.876	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000016812	tnpo1	95	94.503	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	94.503	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	95.169	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	95.169	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.161	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	92.161	Poecilia_formosa
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.161	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	92.161	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.360	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	92.360	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.489	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	92.489	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.270	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	94.270	Pongo_abelii
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ENSXETG00000016812	tnpo1	99	94.382	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	94.382	Pteropus_vampyrus
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ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.144	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.144	Xiphophorus_maculatus