EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000017441 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: apobec4
Alias: -
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme%2C catalytic polypeptide-like 4 (putative)
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1157 bases
Position: chrGL172705.1:1649735-1650891
Accession: XB-GENE-6032664
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000037927	APOBEC_N	PF08210.11	4.3e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000037927	-	1122	-	ENSXETP00000037927	374 (aa)	-	F6ZR34

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000017441's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000017441's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000017441	apobec4	94	46.518	ENSG00000173627	APOBEC4	99	46.757	Homo_sapiens
ENSXETG00000017441	apobec4	94	45.879	ENSAMEG00000002503	APOBEC4	97	46.133	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000017441	apobec4	91	45.690	ENSACAG00000015192	APOBEC4	98	45.690	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000017441	apobec4	84	46.769	ENSBTAG00000047395	APOBEC4	99	44.624	Bos_taurus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	43.869	ENSCJAG00000040026	APOBEC4	99	43.883	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	45.330	ENSCAFG00000013349	APOBEC4	99	46.133	Canis_familiaris
ENSXETG00000017441	apobec4	94	45.330	ENSCAFG00020015526	APOBEC4	99	46.133	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000017441	apobec4	84	46.708	ENSCHIG00000011987	APOBEC4	96	44.444	Capra_hircus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	44.413	ENSCSAG00000000243	APOBEC4	100	44.687	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000017441	apobec4	96	45.405	ENSCHOG00000012387	APOBEC4	99	45.845	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000017441	apobec4	95	47.354	ENSCPBG00000015714	APOBEC4	97	47.354	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000017441	apobec4	84	46.082	ENSCGRG00001004553	Apobec4	90	46.082	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000017441	apobec4	93	45.682	ENSDNOG00000044664	APOBEC4	100	45.308	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	44.382	ENSDORG00000007335	Apobec4	99	44.382	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000017441	apobec4	94	47.632	ENSEASG00005006513	APOBEC4	99	47.554	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	47.075	ENSECAG00000019734	APOBEC4	99	47.011	Equus_caballus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	45.604	ENSFCAG00000010909	APOBEC4	100	46.113	Felis_catus
ENSXETG00000017441	apobec4	66	56.275	ENSFDAG00000018185	APOBEC4	78	56.275	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000017441	apobec4	86	44.720	ENSGALG00000053078	APOBEC4	94	44.720	Gallus_gallus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	46.995	ENSGGOG00000042217	APOBEC4	100	46.933	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000017441	apobec4	97	48.656	ENSLACG00000014504	APOBEC4	100	48.656	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000017441	apobec4	72	37.363	ENSLOCG00000010326	-	99	37.363	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	44.751	ENSMMUG00000031303	APOBEC4	100	44.744	Macaca_mulatta
ENSXETG00000017441	apobec4	85	45.171	ENSMGAG00000017190	APOBEC4	96	45.171	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000017441	apobec4	99	40.106	MGP_CAROLIEiJ_G0014701	Apobec4	99	40.106	Mus_caroli
ENSXETG00000017441	apobec4	99	39.788	ENSMUSG00000055547	Apobec4	99	39.788	Mus_musculus
ENSXETG00000017441	apobec4	97	39.189	MGP_PahariEiJ_G0027937	Apobec4	97	39.189	Mus_pahari
ENSXETG00000017441	apobec4	99	39.788	MGP_SPRETEiJ_G0015508	Apobec4	99	39.788	Mus_spretus
ENSXETG00000017441	apobec4	92	45.251	ENSMPUG00000011756	APOBEC4	98	46.594	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000017441	apobec4	91	46.023	ENSMLUG00000002458	APOBEC4	100	45.405	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	37.183	ENSNGAG00000017599	Apobec4	100	36.885	Nannospalax_galili
ENSXETG00000017441	apobec4	94	46.556	ENSNLEG00000035610	APOBEC4	100	46.505	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000017441	apobec4	84	47.531	ENSODEG00000009778	APOBEC4	92	47.531	Octodon_degus
ENSXETG00000017441	apobec4	96	48.229	ENSOANG00000001000	APOBEC4	99	48.229	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	44.772	ENSOGAG00000003118	APOBEC4	99	46.774	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000017441	apobec4	84	47.385	ENSOARG00000005287	APOBEC4	99	44.892	Ovis_aries
ENSXETG00000017441	apobec4	94	47.191	ENSPPAG00000038272	APOBEC4	99	47.411	Pan_paniscus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	45.055	ENSPPRG00000014706	APOBEC4	100	45.109	Panthera_pardus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	45.055	ENSPTIG00000005518	APOBEC4	100	45.109	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000017441	apobec4	94	46.961	ENSPTRG00000047181	APOBEC4	99	47.185	Pan_troglodytes
ENSXETG00000017441	apobec4	84	46.082	ENSPEMG00000019164	Apobec4	100	42.700	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000017441	apobec4	93	47.727	ENSPCIG00000003817	APOBEC4	99	47.027	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	45.961	ENSPPYG00000000424	APOBEC4	100	45.924	Pongo_abelii
ENSXETG00000017441	apobec4	93	36.188	ENSPCAG00000015174	APOBEC4	100	36.119	Procavia_capensis
ENSXETG00000017441	apobec4	94	47.253	ENSPVAG00000001100	APOBEC4	100	47.684	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000017441	apobec4	97	39.130	ENSRNOG00000028089	Apobec4	94	39.130	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000017441	apobec4	91	44.633	ENSSHAG00000013804	APOBEC4	100	43.548	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000017441	apobec4	97	48.248	ENSSPUG00000010884	APOBEC4	98	48.248	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000017441	apobec4	96	44.715	ENSSSCG00000015561	APOBEC4	100	45.109	Sus_scrofa
ENSXETG00000017441	apobec4	94	48.066	ENSTBEG00000006476	APOBEC4	100	47.967	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000017441	apobec4	94	45.278	ENSTTRG00000014784	APOBEC4	99	45.430	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000017441	apobec4	84	48.476	ENSUAMG00000005088	APOBEC4	99	46.400	Ursus_americanus
ENSXETG00000017441	apobec4	84	48.476	ENSUMAG00000016285	APOBEC4	99	46.400	Ursus_maritimus
ENSXETG00000017441	apobec4	94	45.055	ENSVVUG00000009054	APOBEC4	100	45.576	Vulpes_vulpes