EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000017598 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pop4
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis POP4 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit (pop4)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9297 bases
Position: chrGL173499.1:69932-79228
Accession: NM_001017252
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000038197	UPF0086	PF01868.16	8.2e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000038197	-	1453	-	ENSXETP00000038197	219 (aa)	-	F6XZ98

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000017598	pop4	98	64.352	ENSG00000105171	POP4	100	80.208	Homo_sapiens
ENSXETG00000017598	pop4	95	59.809	ENSAMEG00000003172	-	94	60.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000017598	pop4	99	65.753	ENSAMEG00000018329	-	99	65.753	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000017598	pop4	96	58.019	ENSACIG00000008358	pop4	96	57.921	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000017598	pop4	90	59.701	ENSAOCG00000010116	pop4	98	58.209	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000017598	pop4	93	59.709	ENSAPEG00000002829	pop4	87	58.252	Amphiprion_percula
ENSXETG00000017598	pop4	96	58.411	ENSATEG00000013028	pop4	96	57.009	Anabas_testudineus
ENSXETG00000017598	pop4	92	72.772	ENSAPLG00000014051	POP4	98	72.772	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000017598	pop4	99	64.516	ENSANAG00000020295	POP4	99	65.438	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000017598	pop4	96	58.019	ENSACLG00000000526	pop4	96	58.019	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000017598	pop4	98	60.000	ENSAMXG00000002899	pop4	98	60.000	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000017598	pop4	98	66.667	ENSBTAG00000002223	POP4	98	68.056	Bos_taurus
ENSXETG00000017598	pop4	99	65.596	ENSCJAG00000046750	POP4	98	72.881	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000017598	pop4	83	70.879	ENSCAFG00000007630	POP4	100	70.879	Canis_familiaris
ENSXETG00000017598	pop4	98	67.442	ENSCHIG00000016743	POP4	98	67.442	Capra_hircus
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.278	ENSTSYG00000003488	POP4	98	65.278	Carlito_syrichta
ENSXETG00000017598	pop4	98	48.611	ENSCAPG00000011105	POP4	99	50.000	Cavia_aperea
ENSXETG00000017598	pop4	98	67.130	ENSCPOG00000002992	POP4	98	68.519	Cavia_porcellus
ENSXETG00000017598	pop4	99	57.604	ENSCCAG00000034244	-	99	57.604	Cebus_capucinus
ENSXETG00000017598	pop4	99	64.516	ENSCCAG00000020285	-	99	64.516	Cebus_capucinus
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.278	ENSCATG00000036022	POP4	100	81.250	Cercocebus_atys
ENSXETG00000017598	pop4	100	67.727	ENSCLAG00000013162	POP4	100	67.727	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.278	ENSCSAG00000004868	POP4	99	66.204	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000017598	pop4	98	48.148	ENSCHOG00000002071	POP4	99	48.148	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000017598	pop4	98	68.981	ENSCPBG00000016132	POP4	98	68.981	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000017598	pop4	88	31.472	ENSCING00000023871	-	98	31.156	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000017598	pop4	89	69.744	ENSCANG00000005924	POP4	97	70.769	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000017598	pop4	98	66.512	ENSCGRG00001017185	Pop4	98	66.512	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000017598	pop4	98	66.512	ENSCGRG00000008155	Pop4	98	66.512	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000017598	pop4	96	50.704	ENSCSEG00000002946	pop4	96	49.765	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000017598	pop4	98	43.119	ENSCVAG00000018602	POP4	94	42.661	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000017598	pop4	96	61.137	ENSDARG00000101472	pop4	96	61.137	Danio_rerio
ENSXETG00000017598	pop4	98	67.130	ENSDNOG00000047663	POP4	87	67.130	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000017598	pop4	78	61.988	ENSDORG00000008577	Pop4	99	61.988	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000017598	pop4	68	36.538	FBgn0035831	CG8038	71	36.301	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000017598	pop4	98	54.630	ENSETEG00000003607	POP4	99	54.630	Echinops_telfairi
ENSXETG00000017598	pop4	91	44.860	ENSEBUG00000010447	pop4	83	43.458	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000017598	pop4	98	41.204	ENSEBUG00000008575	pop4	98	41.204	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000017598	pop4	98	38.428	ENSEBUG00000004305	pop4	98	37.118	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000017598	pop4	98	76.923	ENSECAG00000020206	POP4	80	76.923	Equus_caballus
ENSXETG00000017598	pop4	89	51.282	ENSEEUG00000013109	POP4	98	51.282	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000017598	pop4	96	59.716	ENSELUG00000019812	pop4	96	59.716	Esox_lucius
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.741	ENSFCAG00000001619	POP4	98	65.741	Felis_catus
ENSXETG00000017598	pop4	99	67.431	ENSFALG00000000206	POP4	97	67.431	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000017598	pop4	98	68.519	ENSFDAG00000017859	POP4	98	68.519	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000017598	pop4	98	51.376	ENSFHEG00000012745	pop4	96	50.698	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000017598	pop4	86	59.067	ENSGMOG00000000335	pop4	96	59.067	Gadus_morhua
ENSXETG00000017598	pop4	98	66.667	ENSGALG00000041972	POP4	91	68.519	Gallus_gallus
ENSXETG00000017598	pop4	78	49.425	ENSGAFG00000003571	pop4	96	49.425	Gambusia_affinis
ENSXETG00000017598	pop4	96	57.009	ENSGACG00000014510	pop4	96	62.500	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000017598	pop4	98	69.444	ENSGAGG00000024544	POP4	78	69.444	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000017598	pop4	100	64.545	ENSGGOG00000038346	POP4	100	65.455	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000017598	pop4	96	58.019	ENSHBUG00000021821	pop4	96	58.019	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000017598	pop4	100	67.727	ENSHGLG00000015798	POP4	100	67.727	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000017598	pop4	98	68.056	ENSHGLG00100009737	POP4	98	68.056	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000017598	pop4	96	57.674	ENSHCOG00000020937	pop4	96	57.209	Hippocampus_comes
ENSXETG00000017598	pop4	98	58.333	ENSIPUG00000013652	pop4	98	58.333	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000017598	pop4	98	67.130	ENSSTOG00000011016	POP4	98	67.130	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000017598	pop4	99	67.580	ENSJJAG00000013376	Pop4	98	68.056	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000017598	pop4	98	55.963	ENSKMAG00000012250	pop4	98	55.505	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000017598	pop4	98	53.211	ENSLBEG00000018846	-	98	52.752	Labrus_bergylta
ENSXETG00000017598	pop4	98	53.211	ENSLBEG00000014139	pop4	98	52.752	Labrus_bergylta
ENSXETG00000017598	pop4	99	63.303	ENSLACG00000008581	POP4	98	64.679	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000017598	pop4	99	66.359	ENSLOCG00000005597	pop4	99	66.359	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000017598	pop4	98	64.352	ENSLAFG00000000084	POP4	98	65.741	Loxodonta_africana
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.278	ENSMFAG00000029606	POP4	98	66.204	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000017598	pop4	98	64.977	ENSMMUG00000017424	POP4	98	64.977	Macaca_mulatta
ENSXETG00000017598	pop4	98	64.977	ENSMNEG00000031374	POP4	98	64.977	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000017598	pop4	98	66.204	ENSMLEG00000043454	POP4	98	66.204	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000017598	pop4	96	58.411	ENSMAMG00000011716	pop4	96	57.009	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000017598	pop4	96	58.019	ENSMZEG00005002360	pop4	96	58.019	Maylandia_zebra
ENSXETG00000017598	pop4	98	66.667	ENSMGAG00000005337	POP4	96	68.519	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.741	ENSMAUG00000020110	Pop4	98	65.741	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000017598	pop4	100	63.636	ENSMICG00000035730	POP4	99	63.182	Microcebus_murinus
ENSXETG00000017598	pop4	97	57.547	ENSMMOG00000015321	pop4	98	56.744	Mola_mola
ENSXETG00000017598	pop4	98	66.667	ENSMODG00000029406	POP4	94	68.056	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000017598	pop4	96	58.019	ENSMALG00000012571	pop4	96	59.906	Monopterus_albus
ENSXETG00000017598	pop4	98	67.742	MGP_CAROLIEiJ_G0029600	Pop4	98	67.742	Mus_caroli
ENSXETG00000017598	pop4	98	67.281	ENSMUSG00000030423	Pop4	98	67.281	Mus_musculus
ENSXETG00000017598	pop4	98	67.442	MGP_SPRETEiJ_G0030699	Pop4	98	67.442	Mus_spretus
ENSXETG00000017598	pop4	98	64.815	ENSMPUG00000008041	-	98	64.815	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000017598	pop4	98	56.481	ENSMPUG00000008063	-	98	56.481	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000017598	pop4	99	52.273	ENSMLUG00000010774	POP4	99	52.273	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000017598	pop4	57	76.800	ENSMEUG00000003636	-	100	76.800	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000017598	pop4	89	71.795	ENSOPRG00000004736	POP4	98	72.308	Ochotona_princeps
ENSXETG00000017598	pop4	98	67.593	ENSODEG00000013025	POP4	96	69.712	Octodon_degus
ENSXETG00000017598	pop4	98	56.481	ENSONIG00000003458	pop4	96	56.481	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000017598	pop4	98	66.204	ENSOCUG00000015974	POP4	98	66.667	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000017598	pop4	99	52.941	ENSORLG00000020317	pop4	95	52.489	Oryzias_latipes
ENSXETG00000017598	pop4	96	56.075	ENSORLG00015011624	pop4	96	55.607	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000017598	pop4	93	59.223	ENSOMEG00000002538	pop4	92	59.223	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000017598	pop4	100	65.000	ENSOGAG00000011168	POP4	100	65.000	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000017598	pop4	98	67.742	ENSOARG00000004041	POP4	98	67.742	Ovis_aries
ENSXETG00000017598	pop4	98	64.815	ENSPPAG00000040372	POP4	98	65.741	Pan_paniscus
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.741	ENSPPRG00000010502	POP4	98	65.741	Panthera_pardus
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.741	ENSPTIG00000016598	POP4	98	65.741	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000017598	pop4	98	64.815	ENSPTRG00000010779	POP4	98	65.741	Pan_troglodytes
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.278	ENSPANG00000008546	POP4	98	66.204	Papio_anubis
ENSXETG00000017598	pop4	90	61.692	ENSPKIG00000004468	pop4	88	60.697	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000017598	pop4	98	71.759	ENSPSIG00000015690	POP4	100	73.762	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000017598	pop4	90	51.961	ENSPMGG00000008608	pop4	98	52.451	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.278	ENSPEMG00000014034	-	93	70.443	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000017598	pop4	98	53.704	ENSPEMG00000019982	-	99	54.630	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000017598	pop4	66	64.138	ENSPMAG00000006265	pop4	73	64.138	Petromyzon_marinus
ENSXETG00000017598	pop4	98	68.519	ENSPCIG00000024738	POP4	94	68.519	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000017598	pop4	98	54.378	ENSPFOG00000000925	pop4	98	53.917	Poecilia_formosa
ENSXETG00000017598	pop4	98	54.839	ENSPLAG00000003161	pop4	98	54.378	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000017598	pop4	98	54.378	ENSPMEG00000002475	pop4	98	53.917	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000017598	pop4	98	53.456	ENSPREG00000022403	pop4	92	52.995	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.278	ENSPPYG00000009805	POP4	98	66.204	Pongo_abelii
ENSXETG00000017598	pop4	98	64.352	ENSPCAG00000007737	POP4	98	64.815	Procavia_capensis
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.741	ENSPCOG00000018055	POP4	98	65.741	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000017598	pop4	98	65.278	ENSPVAG00000006069	POP4	98	64.815	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000017598	pop4	96	58.491	ENSPNYG00000020038	pop4	96	58.491	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000017598	pop4	98	56.944	ENSPNAG00000005591	pop4	98	56.944	Pygocentrus_nattereri
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