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Description

Ensembl ID: ENSXETG00000018368 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: -
Full Name: pelota homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7867 bases
Position: chrGL173464.1:279134-287000
Accession: XB-GENE-5901550
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000057423	eRF1_2	PF03464.15	1.5e-30	1	1
ENSXETP00000039788	eRF1_2	PF03464.15	3.3e-30	1	1
ENSXETP00000060355	eRF1_2	PF03464.15	5.3e-29	1	1
ENSXETP00000039788	eRF1_3	PF03465.15	6.1e-26	1	1
ENSXETP00000060355	eRF1_3	PF03465.15	7.5e-26	1	1
ENSXETP00000057423	eRF1_1	PF03463.15	7e-24	1	1
ENSXETP00000039788	eRF1_1	PF03463.15	1.2e-23	1	1
ENSXETP00000060355	eRF1_1	PF03463.15	1.3e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000039788	-	966	-	ENSXETP00000039788	321 (aa)	-	F6V5Y3
ENSXETT00000057423	-	666	-	ENSXETP00000057423	221 (aa)	-	F6SIV7
ENSXETT00000060232	-	975	-	ENSXETP00000060355	324 (aa)	-	F6W5J5

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.755	ENSG00000152684	PELO	81	81.613	Homo_sapiens
ENSXETG00000018368	pelo	100	76.994	ENSAPOG00000023072	pelo	81	78.387	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000018368	pelo	83	77.717	ENSAPOG00000023700	-	67	77.717	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000018368	pelo	83	77.717	ENSAPOG00000000616	pelo	67	77.717	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSAMEG00000007734	PELO	81	80.968	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000018368	pelo	97	72.258	ENSACIG00000014386	pelo	79	74.909	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000018368	pelo	100	77.301	ENSAOCG00000023717	pelo	81	78.710	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000018368	pelo	100	77.301	ENSAPEG00000011235	pelo	81	78.710	Amphiprion_percula
ENSXETG00000018368	pelo	100	76.380	ENSATEG00000019550	pelo	81	78.065	Anabas_testudineus
ENSXETG00000018368	pelo	93	71.523	ENSAPLG00000013265	PELO	96	73.077	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000018368	pelo	98	80.831	ENSACAG00000004352	PELO	81	80.968	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000018368	pelo	100	80.061	ENSANAG00000014096	PELO	81	81.935	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000018368	pelo	100	76.074	ENSACLG00000010305	pelo	81	77.419	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000018368	pelo	97	78.710	ENSAMXG00000020299	pelo	80	78.710	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSBTAG00000003268	PELO	80	80.968	Bos_taurus
ENSXETG00000018368	pelo	98	57.595	WBGene00011280	pelo-1	81	58.252	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.755	ENSCJAG00000035190	PELO	81	81.613	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSCAFG00020023234	PELO	81	81.290	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000018368	pelo	100	78.834	ENSCHIG00000016410	PELO	80	80.645	Capra_hircus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSTSYG00000005203	PELO	81	80.968	Carlito_syrichta
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.755	ENSCPOG00000027406	PELO	81	81.613	Cavia_porcellus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.755	ENSCCAG00000035600	PELO	81	81.613	Cebus_capucinus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSCATG00000011829	PELO	81	81.290	Cercocebus_atys
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSCLAG00000005043	PELO	81	81.290	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSCSAG00000016692	PELO	81	81.290	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000018368	pelo	100	78.528	ENSCHOG00000000523	PELO	81	80.323	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000018368	pelo	98	81.150	ENSCPBG00000007544	PELO	81	81.290	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000018368	pelo	97	66.129	ENSCING00000001979	-	80	66.775	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000018368	pelo	99	66.458	ENSCSAVG00000006158	-	80	67.320	Ciona_savignyi
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSCANG00000023382	PELO	81	81.290	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000018368	pelo	97	81.290	ENSCGRG00001024665	Pelo	80	81.290	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000018368	pelo	97	81.935	ENSCGRG00000004570	Pelo	81	81.935	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000018368	pelo	100	75.153	ENSCSEG00000008807	pelo	81	76.774	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000018368	pelo	100	75.153	ENSCVAG00000016082	pelo	81	76.774	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000018368	pelo	100	78.221	ENSDARG00000055477	pelo	81	80.000	Danio_rerio
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSDNOG00000036721	PELO	80	81.290	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSDORG00000016689	Pelo	81	81.290	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000018368	pelo	96	66.124	FBgn0011207	pelo	78	65.806	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000018368	pelo	68	81.356	ENSEBUG00000004955	pelo	76	81.356	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSEASG00005013348	PELO	81	80.968	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000018368	pelo	100	77.914	ENSELUG00000023229	pelo	81	79.677	Esox_lucius
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSFCAG00000032341	PELO	81	80.968	Felis_catus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSFALG00000004559	PELO	81	81.290	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000018368	pelo	94	80.676	ENSFDAG00000002076	PELO	69	80.090	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000018368	pelo	100	74.847	ENSFHEG00000009769	pelo	84	76.452	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000018368	pelo	98	76.677	ENSGMOG00000005849	pelo	80	77.023	Gadus_morhua
ENSXETG00000018368	pelo	99	76.025	ENSGAFG00000019350	pelo	81	76.452	Gambusia_affinis
ENSXETG00000018368	pelo	100	75.767	ENSGACG00000007245	pelo	81	77.419	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000018368	pelo	98	81.150	ENSGAGG00000004018	PELO	81	81.290	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSGGOG00000012635	PELO	81	81.290	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000018368	pelo	100	76.074	ENSHBUG00000005866	pelo	81	77.419	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.755	ENSHGLG00000005932	PELO	81	81.613	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000018368	pelo	100	78.834	ENSHGLG00100017627	PELO	80	80.645	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000018368	pelo	100	74.540	ENSHCOG00000016782	pelo	81	76.129	Hippocampus_comes
ENSXETG00000018368	pelo	99	77.259	ENSIPUG00000020627	pelo	80	77.670	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSSTOG00000027378	PELO	81	81.290	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSJJAG00000015032	Pelo	81	80.968	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000018368	pelo	99	77.640	ENSKMAG00000021305	pelo	81	79.032	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000018368	pelo	100	76.308	ENSLBEG00000022399	pelo	81	77.742	Labrus_bergylta
ENSXETG00000018368	pelo	100	78.528	ENSLAFG00000020551	PELO	81	80.323	Loxodonta_africana
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSMFAG00000000651	PELO	81	81.290	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSMMUG00000039101	PELO	81	81.290	Macaca_mulatta
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSMNEG00000035538	PELO	81	81.290	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSMLEG00000039113	PELO	81	81.290	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000018368	pelo	97	79.032	ENSMAMG00000013260	pelo	81	79.032	Mastacembelus_armatus
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ENSXETG00000018368	pelo	100	78.834	ENSMICG00000044040	PELO	81	80.645	Microcebus_murinus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.755	ENSMOCG00000017554	Pelo	81	81.613	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000018368	pelo	100	75.153	ENSMMOG00000001324	pelo	81	76.774	Mola_mola
ENSXETG00000018368	pelo	100	76.074	ENSMALG00000008194	pelo	81	78.065	Monopterus_albus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	81	81.290	Mus_caroli
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSMUSG00000042275	Pelo	81	80.968	Mus_musculus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	81	80.968	Mus_pahari
ENSXETG00000018368	pelo	100	78.834	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	81	80.645	Mus_spretus
ENSXETG00000018368	pelo	100	77.778	ENSMLUG00000024132	PELO	81	79.677	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.755	ENSNGAG00000019331	Pelo	81	81.613	Nannospalax_galili
ENSXETG00000018368	pelo	100	75.767	ENSNBRG00000011799	pelo	81	77.097	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSNLEG00000035970	PELO	81	81.290	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.630	ENSMEUG00000005468	PELO	81	81.613	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000018368	pelo	98	80.573	ENSOPRG00000018793	PELO	81	80.844	Ochotona_princeps
ENSXETG00000018368	pelo	100	80.061	ENSODEG00000017579	PELO	81	81.935	Octodon_degus
ENSXETG00000018368	pelo	96	76.948	ENSONIG00000011511	pelo	81	77.097	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSOCUG00000023902	PELO	81	80.968	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000018368	pelo	100	75.153	ENSORLG00000005827	pelo	81	76.774	Oryzias_latipes
ENSXETG00000018368	pelo	100	75.460	ENSORLG00020016456	pelo	81	77.097	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000018368	pelo	100	76.074	ENSORLG00015014447	pelo	86	77.742	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000018368	pelo	100	76.994	ENSOMEG00000021567	pelo	88	78.710	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSOGAG00000027940	PELO	81	81.290	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSOARG00000008324	PELO	80	80.968	Ovis_aries
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSPPAG00000038951	PELO	81	81.290	Pan_paniscus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSPPRG00000018800	PELO	81	80.968	Panthera_pardus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSPTIG00000019988	PELO	81	80.968	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSPTRG00000034409	PELO	81	81.290	Pan_troglodytes
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSPANG00000010902	PELO	81	81.290	Papio_anubis
ENSXETG00000018368	pelo	100	77.160	ENSPKIG00000015190	pelo	81	79.355	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000018368	pelo	98	81.789	ENSPSIG00000004971	PELO	81	81.935	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000018368	pelo	88	73.846	ENSPMGG00000014561	pelo	72	73.846	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSPEMG00000015584	Pelo	81	81.290	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.012	ENSPCIG00000004880	PELO	81	80.968	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000018368	pelo	100	75.153	ENSPFOG00000007277	pelo	81	76.774	Poecilia_formosa
ENSXETG00000018368	pelo	100	75.460	ENSPLAG00000020787	pelo	81	77.097	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000018368	pelo	100	75.153	ENSPMEG00000016964	pelo	81	76.774	Poecilia_mexicana
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ENSXETG00000018368	pelo	100	78.834	ENSPCOG00000021178	PELO	81	80.645	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000018368	pelo	100	76.074	ENSPNYG00000017325	pelo	81	77.419	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000018368	pelo	97	79.032	ENSPNAG00000012458	pelo	80	79.032	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.141	ENSRNOG00000061128	Pelo	81	80.968	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSRBIG00000007299	PELO	81	81.290	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000018368	pelo	100	79.448	ENSRROG00000035507	PELO	81	81.290	Rhinopithecus_roxellana
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