EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000018904 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: mtrf1
Alias: -
Full Name: mitochondrial translational release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8149 bases
Position: chrGL172972.1:458652-466800
Accession: XB-GENE-991014
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000041017	RF-1	PF00472.20	8.3e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000041017	-	1161	-	ENSXETP00000041017	387 (aa)	-	F6TU89

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000018904	mtrf1	67	58.687	ENSXETG00000018541	mtrf1l	95	58.687

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.277	ENSG00000120662	MTRF1	86	67.277	Homo_sapiens
ENSXETG00000018904	mtrf1	86	57.864	ENSAPOG00000010181	mtrf1	83	57.864	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.282	ENSAMEG00000008696	MTRF1	85	67.282	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000018904	mtrf1	59	70.870	ENSACIG00000001495	mtrf1	93	70.870	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	57.219	ENSAOCG00000002832	mtrf1	84	57.219	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	56.684	ENSAPEG00000014844	mtrf1	84	56.684	Amphiprion_percula
ENSXETG00000018904	mtrf1	88	58.892	ENSATEG00000017403	mtrf1	82	58.892	Anabas_testudineus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	64.096	ENSAPLG00000009317	MTRF1	87	64.096	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	62.105	ENSACAG00000000897	MTRF1	86	62.105	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	59.843	ENSANAG00000023063	-	84	59.843	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000018904	mtrf1	87	67.463	ENSANAG00000025310	-	92	67.463	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	57.143	ENSACLG00000023945	mtrf1	86	57.143	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000018904	mtrf1	62	68.619	ENSAMXG00000031859	mtrf1	99	68.619	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	68.684	ENSBTAG00000012260	MTRF1	85	68.684	Bos_taurus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	66.316	ENSCJAG00000017739	MTRF1	96	74.251	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	67.200	ENSCAFG00000004795	MTRF1	84	67.200	Canis_familiaris
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	67.200	ENSCAFG00020018178	MTRF1	84	67.200	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	68.684	ENSCHIG00000011810	MTRF1	85	68.684	Capra_hircus
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.102	ENSTSYG00000006976	MTRF1	86	67.102	Carlito_syrichta
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.895	ENSCAPG00000013163	MTRF1	88	67.895	Cavia_aperea
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.895	ENSCPOG00000005264	MTRF1	85	67.895	Cavia_porcellus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	66.316	ENSCCAG00000035116	MTRF1	85	66.316	Cebus_capucinus
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.277	ENSCATG00000009909	MTRF1	86	67.277	Cercocebus_atys
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.632	ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	67.632	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.016	ENSCSAG00000017835	MTRF1	86	67.016	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000018904	mtrf1	90	63.714	ENSCHOG00000011915	-	86	63.714	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	63.990	ENSCPBG00000007969	MTRF1	86	63.990	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	66.754	ENSCANG00000040353	MTRF1	86	66.754	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	65.000	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	86	65.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	65.000	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	86	65.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	55.496	ENSCSEG00000005667	mtrf1	84	55.496	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000018904	mtrf1	94	57.418	ENSCVAG00000021729	mtrf1	84	57.418	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000018904	mtrf1	61	60.000	ENSDARG00000033579	mtrf1	100	60.000	Danio_rerio
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	66.492	ENSDNOG00000034196	MTRF1	98	74.257	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	66.579	ENSDORG00000016429	Mtrf1	85	66.579	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	65.789	ENSETEG00000014811	MTRF1	85	65.789	Echinops_telfairi
ENSXETG00000018904	mtrf1	59	59.389	ENSEBUG00000000778	mtrf1	94	59.389	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.368	ENSEASG00005015715	MTRF1	85	67.368	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	68.158	ENSECAG00000014389	MTRF1	83	68.158	Equus_caballus
ENSXETG00000018904	mtrf1	94	52.732	ENSEEUG00000004450	-	82	53.552	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	54.933	ENSELUG00000006544	mtrf1	87	54.933	Esox_lucius
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.632	ENSFCAG00000031635	MTRF1	85	67.632	Felis_catus
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	63.089	ENSFALG00000008036	MTRF1	95	63.089	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.895	ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	67.895	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000018904	mtrf1	94	55.249	ENSFHEG00000019043	mtrf1	83	55.249	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	51.862	ENSGMOG00000008608	mtrf1	98	51.862	Gadus_morhua
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	64.136	ENSGALG00000016951	MTRF1	84	64.136	Gallus_gallus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	56.499	ENSGAFG00000007093	mtrf1	85	56.499	Gambusia_affinis
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	54.617	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	54.617	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000018904	mtrf1	80	70.227	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	69.775	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.016	ENSGGOG00000002529	MTRF1	86	67.016	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.105	ENSHGLG00000003210	MTRF1	85	67.105	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.105	ENSHGLG00100011843	MTRF1	85	67.105	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	55.381	ENSHCOG00000009449	mtrf1	86	55.381	Hippocampus_comes
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	66.316	ENSSTOG00000021682	MTRF1	86	66.316	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	66.133	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	84	66.133	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	56.836	ENSKMAG00000003231	mtrf1	83	56.836	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000018904	mtrf1	61	66.809	ENSLBEG00000023151	mtrf1	94	66.809	Labrus_bergylta
ENSXETG00000018904	mtrf1	61	66.809	ENSLBEG00000027169	-	94	66.809	Labrus_bergylta
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	66.129	ENSLACG00000010582	MTRF1	83	66.129	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	56.883	ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	56.883	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	64.737	ENSLAFG00000022177	-	85	64.737	Loxodonta_africana
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	50.526	ENSLAFG00000030499	-	84	50.526	Loxodonta_africana
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.539	ENSMFAG00000037972	MTRF1	86	67.539	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.277	ENSMNEG00000035487	MTRF1	86	67.277	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.277	ENSMLEG00000033582	MTRF1	86	67.277	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	55.584	ENSMAMG00000022048	mtrf1	86	55.584	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	57.143	ENSMZEG00005017922	mtrf1	86	57.143	Maylandia_zebra
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	65.691	ENSMGAG00000014971	MTRF1	90	65.691	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.105	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	85	67.105	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.895	ENSMICG00000033131	MTRF1	85	67.895	Microcebus_murinus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	65.526	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	85	65.526	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000018904	mtrf1	61	60.426	ENSMMOG00000013394	mtrf1	96	60.426	Mola_mola
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	63.874	ENSMODG00000014772	MTRF1	86	63.874	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	57.403	ENSMALG00000013274	mtrf1	88	57.403	Monopterus_albus
ENSXETG00000018904	mtrf1	94	66.209	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	81	66.209	Mus_caroli
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	65.333	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	84	65.333	Mus_musculus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	64.533	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	84	64.533	Mus_pahari
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	65.676	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	83	65.676	Mus_spretus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.018	ENSMPUG00000001874	MTRF1	85	67.018	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	66.316	ENSMLUG00000017237	MTRF1	85	66.316	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	66.841	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	86	66.841	Nannospalax_galili
ENSXETG00000018904	mtrf1	61	68.936	ENSNBRG00000004634	mtrf1	99	68.936	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.016	ENSNLEG00000001236	MTRF1	86	67.016	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	61.780	ENSMEUG00000001846	MTRF1	86	61.780	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000018904	mtrf1	70	39.483	ENSOPRG00000006450	-	82	39.483	Ochotona_princeps
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	67.647	ENSODEG00000005782	MTRF1	84	67.647	Octodon_degus
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	56.883	ENSONIG00000012476	mtrf1	99	56.883	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000018904	mtrf1	77	66.225	ENSOANG00000003383	-	96	66.225	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	66.579	ENSOCUG00000025207	MTRF1	85	66.579	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	55.172	ENSORLG00000003225	mtrf1	85	55.172	Oryzias_latipes
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	55.789	ENSORLG00020021048	mtrf1	85	55.789	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	55.263	ENSORLG00015020957	mtrf1	85	55.263	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	56.728	ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	56.728	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000018904	mtrf1	83	59.752	ENSOGAG00000026411	-	99	59.752	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	63.684	ENSOGAG00000009719	-	85	63.684	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	68.158	ENSOARG00000006994	MTRF1	85	68.158	Ovis_aries
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.277	ENSPPAG00000000050	MTRF1	86	67.277	Pan_paniscus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.632	ENSPPRG00000009511	MTRF1	85	67.632	Panthera_pardus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	68.267	ENSPTIG00000006673	MTRF1	84	68.267	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.277	ENSPTRG00000005815	MTRF1	86	67.277	Pan_troglodytes
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	67.277	ENSPANG00000010809	MTRF1	86	67.277	Papio_anubis
ENSXETG00000018904	mtrf1	94	54.521	ENSPKIG00000015711	mtrf1	85	54.521	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	63.731	ENSPSIG00000004773	MTRF1	86	63.731	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000018904	mtrf1	60	68.103	ENSPMGG00000006724	mtrf1	94	68.103	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	66.133	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	84	66.133	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000018904	mtrf1	86	53.982	ENSPMAG00000009849	mtrf1	97	54.277	Petromyzon_marinus
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	65.183	ENSPCIG00000012940	MTRF1	86	65.183	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	56.452	ENSPFOG00000000254	mtrf1	85	56.452	Poecilia_formosa
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	56.452	ENSPLAG00000014280	mtrf1	85	56.452	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	56.720	ENSPMEG00000023245	mtrf1	85	56.720	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000018904	mtrf1	60	62.128	ENSPREG00000018619	mtrf1	97	62.128	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	65.969	ENSPPYG00000005313	MTRF1	86	65.969	Pongo_abelii
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.895	ENSPCOG00000018133	MTRF1	85	67.895	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	66.316	ENSPVAG00000008573	MTRF1	85	66.316	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000018904	mtrf1	61	69.787	ENSPNYG00000004357	mtrf1	95	69.787	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000018904	mtrf1	95	56.911	ENSPNAG00000010682	mtrf1	84	56.911	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	64.644	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	93	75.221	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	66.492	ENSRBIG00000007069	MTRF1	86	66.492	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	66.492	ENSRROG00000035345	MTRF1	86	66.492	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	67.027	ENSSBOG00000004572	MTRF1	98	67.027	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000018904	mtrf1	89	66.282	ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	66.282	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000018904	mtrf1	94	57.221	ENSSFOG00015006191	mtrf1	83	57.221	Scleropages_formosus
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	57.333	ENSSMAG00000015740	mtrf1	84	57.333	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	55.733	ENSSDUG00000022608	mtrf1	73	55.733	Seriola_dumerili
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	55.733	ENSSLDG00000013584	mtrf1	73	55.733	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000018904	mtrf1	95	65.854	ENSSARG00000002306	MTRF1	83	65.854	Sorex_araneus
ENSXETG00000018904	mtrf1	60	74.678	ENSSPUG00000007354	MTRF1	96	74.678	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000018904	mtrf1	96	54.155	ENSSPAG00000000881	mtrf1	84	54.155	Stegastes_partitus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	68.421	ENSSSCG00000009436	MTRF1	85	68.421	Sus_scrofa
ENSXETG00000018904	mtrf1	99	63.874	ENSTGUG00000012422	MTRF1	92	63.874	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000018904	mtrf1	95	57.453	ENSTRUG00000000396	mtrf1	82	57.453	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000018904	mtrf1	94	56.044	ENSTNIG00000017149	-	99	55.469	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000018904	mtrf1	62	66.109	ENSTBEG00000004696	-	100	66.109	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	68.158	ENSTTRG00000010370	MTRF1	85	68.158	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.282	ENSUMAG00000014772	MTRF1	85	67.282	Ursus_maritimus
ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.192	ENSVPAG00000002565	MTRF1	85	67.192	Vicugna_pacos
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	66.933	ENSVVUG00000028755	MTRF1	84	66.933	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000018904	mtrf1	62	61.088	ENSXCOG00000020386	mtrf1	98	61.088	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000018904	mtrf1	97	54.907	ENSXMAG00000009853	mtrf1	85	54.907	Xiphophorus_maculatus