EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000019749 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: htatsf1
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis HIV-1 Tat specific factor 1 (htatsf1)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22479 bases
Position: chrGL172667.1:1651959-1674437
Accession: NM_001291692
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000042760	RRM_1	PF00076.22	2.4e-16	1	2
ENSXETP00000042760	RRM_1	PF00076.22	2.4e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000042760	-	2101	-	ENSXETP00000042760	524 (aa)	-	Q5EAL1

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000019749's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000019749's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000019749	htatsf1	67	65.181	ENSG00000102241	HTATSF1	97	61.134	Homo_sapiens
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.515	ENSAPOG00000009823	htatsf1	99	58.515	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	57.582	ENSACIG00000020459	htatsf1	99	57.987	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	57.484	ENSAOCG00000020994	htatsf1	99	57.484	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.043	ENSAPEG00000016432	htatsf1	99	58.478	Amphiprion_percula
ENSXETG00000019749	htatsf1	78	62.053	ENSATEG00000008903	htatsf1	93	62.053	Anabas_testudineus
ENSXETG00000019749	htatsf1	78	65.542	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	65.865	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000019749	htatsf1	62	73.556	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	65.672	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.389	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	59.348	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.386	ENSAMXG00000008387	htatsf1	100	58.936	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000019749	htatsf1	71	64.660	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	50	64.660	Bos_taurus
ENSXETG00000019749	htatsf1	65	37.536	WBGene00022025	Y65B4A.1	84	36.735	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000019749	htatsf1	67	64.820	ENSCCAG00000025329	-	54	65.354	Cebus_capucinus
ENSXETG00000019749	htatsf1	84	64.430	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	64.509	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000019749	htatsf1	68	47.727	ENSCING00000005914	-	84	46.537	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000019749	htatsf1	69	44.865	ENSCSAVG00000000371	-	77	44.324	Ciona_savignyi
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.590	ENSCVAG00000014070	htatsf1	98	59.251	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.425	ENSDARG00000056649	htatsf1	99	58.568	Danio_rerio
ENSXETG00000019749	htatsf1	70	43.236	FBgn0037081	barc	67	43.979	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000019749	htatsf1	71	43.316	ENSETEG00000006377	-	50	42.246	Echinops_telfairi
ENSXETG00000019749	htatsf1	79	52.370	ENSEBUG00000001534	htatsf1	89	53.034	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.134	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	59.653	Esox_lucius
ENSXETG00000019749	htatsf1	84	63.478	ENSFALG00000003728	HTATSF1	98	64.667	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000019749	htatsf1	83	59.778	ENSFHEG00000020286	htatsf1	98	59.778	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000019749	htatsf1	69	64.641	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	64.641	Gadus_morhua
ENSXETG00000019749	htatsf1	84	64.574	ENSGALG00000006410	HTATSF1	98	64.574	Gallus_gallus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.341	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	59.341	Gambusia_affinis
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.278	ENSGACG00000020459	htatsf1	99	58.278	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.607	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	59.565	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000019749	htatsf1	84	57.207	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	57.658	Hippocampus_comes
ENSXETG00000019749	htatsf1	77	64.461	ENSIPUG00000017828	htatsf1	80	66.839	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000019749	htatsf1	67	65.833	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	50	66.842	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.590	ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	58.991	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000019749	htatsf1	83	60.179	ENSLBEG00000001154	htatsf1	97	60.179	Labrus_bergylta
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	62.389	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	62.389	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000019749	htatsf1	76	45.700	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	43.070	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000019749	htatsf1	71	66.842	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	54	67.368	Loxodonta_africana
ENSXETG00000019749	htatsf1	67	65.278	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	54	66.053	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000019749	htatsf1	77	62.019	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	58.862	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.389	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	59.348	Maylandia_zebra
ENSXETG00000019749	htatsf1	80	65.187	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	99	65.187	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000019749	htatsf1	83	60.089	ENSMMOG00000011013	htatsf1	98	60.089	Mola_mola
ENSXETG00000019749	htatsf1	83	66.219	ENSMODG00000014087	-	95	66.219	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.720	ENSMALG00000019977	htatsf1	99	58.720	Monopterus_albus
ENSXETG00000019749	htatsf1	70	65.160	ENSMLUG00000009234	-	50	65.160	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000019749	htatsf1	67	65.738	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	50	66.402	Nannospalax_galili
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.913	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	59.870	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000019749	htatsf1	75	69.849	ENSMEUG00000004133	-	93	69.849	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.300	ENSONIG00000008638	htatsf1	99	59.436	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000019749	htatsf1	78	65.871	ENSOANG00000011674	-	99	65.871	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.065	ENSORLG00000002356	htatsf1	99	58.478	Oryzias_latipes
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	57.906	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	58.531	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.388	ENSORLG00015002268	htatsf1	99	58.388	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000019749	htatsf1	89	56.198	ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	58.462	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000019749	htatsf1	74	64.615	ENSPKIG00000024852	htatsf1	85	64.615	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000019749	htatsf1	66	66.761	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	99	67.606	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.991	ENSPMGG00000006172	htatsf1	100	58.991	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000019749	htatsf1	83	62.387	ENSPCIG00000018896	-	97	62.613	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000019749	htatsf1	75	70.250	ENSPCIG00000030173	-	90	70.250	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.553	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	58.553	Poecilia_formosa
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.278	ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	58.278	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.462	ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	58.462	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.251	ENSPREG00000007811	htatsf1	99	59.251	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000019749	htatsf1	72	59.269	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	52	59.635	Procavia_capensis
ENSXETG00000019749	htatsf1	73	65.803	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	65.803	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.389	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	59.348	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	57.589	ENSPNAG00000006166	htatsf1	100	58.244	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000019749	htatsf1	84	64.889	ENSSHAG00000018908	-	98	64.889	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000019749	htatsf1	70	72.358	ENSSHAG00000006440	-	94	72.358	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	58.422	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	58.475	Scleropages_formosus
ENSXETG00000019749	htatsf1	83	59.778	ENSSMAG00000002970	htatsf1	98	60.619	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000019749	htatsf1	75	62.189	ENSSDUG00000020002	htatsf1	87	65.041	Seriola_dumerili
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	60.088	ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	59.912	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000019749	htatsf1	73	60.814	ENSSARG00000005193	HTATSF1	51	62.834	Sorex_araneus
ENSXETG00000019749	htatsf1	84	65.778	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	65.778	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000019749	htatsf1	83	59.333	ENSSPAG00000000732	htatsf1	98	58.850	Stegastes_partitus
ENSXETG00000019749	htatsf1	67	67.131	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	54	67.018	Sus_scrofa
ENSXETG00000019749	htatsf1	84	64.286	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	98	64.286	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000019749	htatsf1	83	60.268	ENSTRUG00000013383	htatsf1	98	60.268	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.002	ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	59.002	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000019749	htatsf1	66	65.352	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	65.352	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000019749	htatsf1	76	63.235	ENSXCOG00000006912	htatsf1	94	63.235	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.775	ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	59.775	Xiphophorus_maculatus