EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000020828 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: mrto4
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis MRT4 homolog%2C ribosome maturation factor (mrto4)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15544 bases
Position: chrGL173922.1:4581-20124
Accession: NM_001005116
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000044981	Ribosomal_L10	PF00466.20	1.3e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000044981	-	1127	-	ENSXETP00000044981	240 (aa)	-	F6TUR6

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000020828's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000020828's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSG00000053372	MRTO4	92	78.182	Homo_sapiens
ENSXETG00000020828	mrto4	93	74.439	ENSAPOG00000011387	mrto4	92	74.886	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000020828	mrto4	67	72.500	ENSAPOG00000013290	-	80	73.077	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000020828	mrto4	67	72.500	ENSAPOG00000013189	-	80	73.077	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000020828	mrto4	91	50.000	ENSAMEG00000014981	-	100	50.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000020828	mrto4	92	78.281	ENSAMEG00000003014	MRTO4	92	78.636	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000020828	mrto4	93	74.888	ENSACIG00000008213	mrto4	91	75.342	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000020828	mrto4	89	74.299	ENSAOCG00000006483	mrto4	84	74.762	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000020828	mrto4	98	72.766	ENSAPEG00000004866	mrto4	93	74.886	Amphiprion_percula
ENSXETG00000020828	mrto4	93	77.130	ENSATEG00000024976	mrto4	91	77.626	Anabas_testudineus
ENSXETG00000020828	mrto4	74	70.621	ENSAPLG00000013861	MRTO4	88	78.710	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSANAG00000029674	MRTO4	92	78.182	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000020828	mrto4	93	73.991	ENSACLG00000016523	mrto4	92	74.429	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000020828	mrto4	94	75.664	ENSAMXG00000003899	mrto4	90	77.778	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	79.638	ENSBTAG00000011951	MRTO4	92	80.000	Bos_taurus
ENSXETG00000020828	mrto4	99	74.477	ENSCJAG00000006812	MRTO4	92	78.182	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSCAFG00000015189	-	92	78.182	Canis_familiaris
ENSXETG00000020828	mrto4	92	68.778	ENSCAFG00000000532	-	91	69.091	Canis_familiaris
ENSXETG00000020828	mrto4	90	53.917	ENSCAFG00000009080	-	99	53.917	Canis_familiaris
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSCAFG00020008173	MRTO4	92	78.182	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000020828	mrto4	92	79.638	ENSCHIG00000014751	MRTO4	92	80.000	Capra_hircus
ENSXETG00000020828	mrto4	88	56.132	ENSCHIG00000010639	-	91	56.132	Capra_hircus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSTSYG00000013413	MRTO4	92	78.182	Carlito_syrichta
ENSXETG00000020828	mrto4	82	74.112	ENSCAPG00000012648	MRTO4	86	74.490	Cavia_aperea
ENSXETG00000020828	mrto4	92	78.281	ENSCPOG00000033237	MRTO4	91	78.636	Cavia_porcellus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSCCAG00000036206	MRTO4	92	78.182	Cebus_capucinus
ENSXETG00000020828	mrto4	97	65.948	ENSCATG00000030492	-	91	68.182	Cercocebus_atys
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.923	ENSCLAG00000001997	MRTO4	91	77.273	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000020828	mrto4	92	75.566	ENSCSAG00000018596	-	92	75.909	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.364	ENSCSAG00000000876	-	92	76.364	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000020828	mrto4	91	79.358	ENSCPBG00000023562	MRTO4	90	79.358	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000020828	mrto4	91	58.447	ENSCSAVG00000011770	-	78	58.447	Ciona_savignyi
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.376	ENSCANG00000002395	-	92	77.727	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	70.588	ENSCANG00000005353	-	92	70.909	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000020828	mrto4	94	77.876	ENSCGRG00001005758	-	92	79.545	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000020828	mrto4	96	69.828	ENSCGRG00001001286	-	89	74.286	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000020828	mrto4	96	69.828	ENSCGRG00000001527	-	89	74.286	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000020828	mrto4	94	75.664	ENSCGRG00000010649	-	92	77.273	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000020828	mrto4	91	77.169	ENSCSEG00000021629	mrto4	92	77.169	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000020828	mrto4	91	74.886	ENSCVAG00000012249	mrto4	93	74.886	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000020828	mrto4	95	74.236	ENSDARG00000007130	mrto4	91	75.909	Danio_rerio
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSDNOG00000010119	-	92	78.182	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000020828	mrto4	87	76.442	ENSDNOG00000030871	-	87	76.442	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000020828	mrto4	97	55.319	ENSDNOG00000045395	-	89	58.333	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.376	ENSDORG00000025382	Mrto4	92	77.727	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000020828	mrto4	99	74.059	ENSETEG00000001675	MRTO4	91	78.182	Echinops_telfairi
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSEASG00005014967	MRTO4	92	77.727	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSECAG00000012598	MRTO4	92	77.727	Equus_caballus
ENSXETG00000020828	mrto4	87	61.722	ENSEEUG00000013520	MRTO4	91	61.722	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000020828	mrto4	98	72.766	ENSELUG00000011152	mrto4	91	75.688	Esox_lucius
ENSXETG00000020828	mrto4	99	74.370	ENSFCAG00000008771	MRTO4	92	78.636	Felis_catus
ENSXETG00000020828	mrto4	91	77.523	ENSFALG00000010619	MRTO4	91	77.523	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000020828	mrto4	92	78.733	ENSFDAG00000013300	MRTO4	91	79.091	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000020828	mrto4	90	75.926	ENSFHEG00000022920	mrto4	93	74.886	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000020828	mrto4	89	76.995	ENSGMOG00000001422	mrto4	96	75.455	Gadus_morhua
ENSXETG00000020828	mrto4	91	77.523	ENSGALG00000003991	MRTO4	94	77.376	Gallus_gallus
ENSXETG00000020828	mrto4	91	74.886	ENSGAFG00000012570	mrto4	93	74.886	Gambusia_affinis
ENSXETG00000020828	mrto4	90	75.000	ENSGACG00000001672	mrto4	91	75.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000020828	mrto4	88	77.830	ENSGAGG00000012997	MRTO4	88	78.469	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000020828	mrto4	93	61.607	ENSGGOG00000042625	-	91	62.273	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000020828	mrto4	90	53.241	ENSGGOG00000036991	-	83	54.286	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000020828	mrto4	99	73.640	ENSGGOG00000000533	MRTO4	92	78.182	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000020828	mrto4	93	73.094	ENSHBUG00000009670	mrto4	92	73.516	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000020828	mrto4	92	78.281	ENSHGLG00000012157	MRTO4	92	78.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000020828	mrto4	92	78.281	ENSHGLG00100014484	MRTO4	92	78.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000020828	mrto4	98	68.085	ENSHCOG00000019894	mrto4	91	72.222	Hippocampus_comes
ENSXETG00000020828	mrto4	93	76.339	ENSIPUG00000002957	mrto4	90	78.241	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	78.281	ENSSTOG00000028112	MRTO4	92	78.636	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	74.775	ENSJJAG00000017998	Mrto4	92	75.113	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000020828	mrto4	93	74.439	ENSKMAG00000010148	mrto4	93	75.342	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.364	ENSLBEG00000025010	mrto4	91	77.209	Labrus_bergylta
ENSXETG00000020828	mrto4	93	81.081	ENSLACG00000019155	MRTO4	92	82.569	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000020828	mrto4	91	73.973	ENSLOCG00000004468	mrto4	89	73.636	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	79.091	ENSLAFG00000010416	MRTO4	92	79.091	Loxodonta_africana
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.471	ENSMFAG00000033225	-	92	76.818	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.471	ENSMMUG00000038335	MRTO4	92	76.818	Macaca_mulatta
ENSXETG00000020828	mrto4	93	58.036	ENSMMUG00000044851	-	91	58.636	Macaca_mulatta
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.471	ENSMNEG00000032783	-	92	76.818	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.923	ENSMLEG00000023273	-	92	77.273	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.471	ENSMAMG00000014839	mrto4	92	76.712	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000020828	mrto4	93	73.991	ENSMZEG00005013929	mrto4	92	74.429	Maylandia_zebra
ENSXETG00000020828	mrto4	91	77.626	ENSMGAG00000005361	MRTO4	92	77.273	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000020828	mrto4	94	77.434	ENSMAUG00000019627	-	92	79.091	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000020828	mrto4	85	69.268	ENSMICG00000033640	-	100	69.268	Microcebus_murinus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSMICG00000004019	MRTO4	92	78.182	Microcebus_murinus
ENSXETG00000020828	mrto4	73	77.011	ENSMOCG00000018413	Mrto4	89	77.778	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000020828	mrto4	94	71.239	ENSMMOG00000010735	mrto4	89	74.286	Mola_mola
ENSXETG00000020828	mrto4	93	77.928	ENSMODG00000015874	MRTO4	91	78.636	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.364	ENSMALG00000007769	mrto4	99	76.364	Monopterus_albus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	79.186	MGP_CAROLIEiJ_G0026711	Mrto4	92	79.545	Mus_caroli
ENSXETG00000020828	mrto4	92	79.186	ENSMUSG00000028741	Mrto4	100	83.607	Mus_musculus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	78.733	MGP_PahariEiJ_G0029042	Mrto4	92	79.091	Mus_pahari
ENSXETG00000020828	mrto4	92	79.186	MGP_SPRETEiJ_G0027691	Mrto4	92	79.545	Mus_spretus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSMPUG00000016181	MRTO4	92	78.182	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.376	ENSMLUG00000025001	-	92	77.727	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	79.186	ENSMLUG00000001566	-	92	79.545	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000020828	mrto4	99	73.950	ENSNGAG00000011660	Mrto4	92	78.636	Nannospalax_galili
ENSXETG00000020828	mrto4	93	73.991	ENSNBRG00000021435	mrto4	92	74.429	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000020828	mrto4	66	72.956	ENSNLEG00000034965	-	85	73.885	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000020828	mrto4	99	68.354	ENSNLEG00000018006	-	92	72.273	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000020828	mrto4	92	67.873	ENSNLEG00000027896	-	91	68.182	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000020828	mrto4	68	81.707	ENSMEUG00000000027	MRTO4	100	81.707	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000020828	mrto4	92	78.281	ENSOPRG00000012746	MRTO4	92	78.636	Ochotona_princeps
ENSXETG00000020828	mrto4	92	71.493	ENSODEG00000014387	-	91	71.818	Octodon_degus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	64.253	ENSODEG00000014016	-	80	64.545	Octodon_degus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.376	ENSODEG00000015379	-	91	77.727	Octodon_degus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	72.851	ENSODEG00000011537	-	91	73.182	Octodon_degus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.471	ENSODEG00000019157	-	91	76.818	Octodon_degus
ENSXETG00000020828	mrto4	93	74.439	ENSONIG00000014318	mrto4	92	74.886	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	74.208	ENSOANG00000015345	MRTO4	88	76.190	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000020828	mrto4	99	74.477	ENSOCUG00000000274	MRTO4	92	78.182	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000020828	mrto4	98	74.468	ENSORLG00000027922	mrto4	99	74.167	Oryzias_latipes
ENSXETG00000020828	mrto4	90	77.778	ENSORLG00020019412	mrto4	90	77.778	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000020828	mrto4	98	74.468	ENSORLG00015015309	mrto4	99	74.167	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000020828	mrto4	90	76.852	ENSOMEG00000021110	mrto4	92	76.852	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000020828	mrto4	99	50.420	ENSOGAG00000027996	-	90	53.211	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000020828	mrto4	92	78.281	ENSOGAG00000010713	-	92	78.636	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.376	ENSPPAG00000043731	MRTO4	92	77.727	Pan_paniscus
ENSXETG00000020828	mrto4	93	53.571	ENSPPAG00000039572	-	91	54.091	Pan_paniscus
ENSXETG00000020828	mrto4	99	73.109	ENSPPRG00000024765	MRTO4	92	77.273	Panthera_pardus
ENSXETG00000020828	mrto4	99	74.370	ENSPTIG00000016208	MRTO4	92	78.636	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000020828	mrto4	94	53.540	ENSPTRG00000046027	-	91	54.545	Pan_troglodytes
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSPTRG00000000262	MRTO4	92	78.182	Pan_troglodytes
ENSXETG00000020828	mrto4	95	69.432	ENSPANG00000011596	-	96	70.909	Papio_anubis
ENSXETG00000020828	mrto4	92	67.873	ENSPANG00000017838	-	91	68.182	Papio_anubis
ENSXETG00000020828	mrto4	99	72.385	ENSPKIG00000017917	mrto4	90	76.498	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000020828	mrto4	73	78.286	ENSPSIG00000015125	MRTO4	89	79.532	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000020828	mrto4	91	70.776	ENSPMGG00000013461	mrto4	90	70.776	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	78.733	ENSPEMG00000010459	-	92	79.091	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000020828	mrto4	94	72.052	ENSPEMG00000023720	-	92	73.543	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000020828	mrto4	91	78.082	ENSPCIG00000003652	MRTO4	91	77.727	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000020828	mrto4	91	74.886	ENSPFOG00000013266	mrto4	92	74.886	Poecilia_formosa
ENSXETG00000020828	mrto4	91	74.886	ENSPLAG00000016285	mrto4	92	74.886	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000020828	mrto4	91	74.429	ENSPMEG00000003539	mrto4	92	74.429	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000020828	mrto4	90	75.349	ENSPREG00000006249	mrto4	91	75.349	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSPPYG00000001795	MRTO4	92	78.182	Pongo_abelii
ENSXETG00000020828	mrto4	92	70.000	ENSPCAG00000001458	MRTO4	92	70.000	Procavia_capensis
ENSXETG00000020828	mrto4	99	73.640	ENSPCOG00000014182	MRTO4	92	78.182	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000020828	mrto4	94	76.549	ENSPVAG00000005775	MRTO4	91	78.182	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000020828	mrto4	93	73.543	ENSPNYG00000018672	mrto4	92	73.973	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000020828	mrto4	95	74.449	ENSPNAG00000027733	mrto4	90	77.674	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000020828	mrto4	73	76.437	ENSRNOG00000017979	Mrto4	90	76.879	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000020828	mrto4	80	69.430	ENSRBIG00000036159	-	90	69.792	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000020828	mrto4	93	63.393	ENSRBIG00000013434	-	91	64.091	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.471	ENSRBIG00000036806	-	92	76.818	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.471	ENSRROG00000042838	-	92	76.818	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000020828	mrto4	92	76.018	ENSRROG00000011593	-	88	76.364	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000020828	mrto4	92	72.851	ENSRROG00000037374	-	92	73.182	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000020828	mrto4	99	73.640	ENSSBOG00000022924	MRTO4	92	77.727	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000020828	mrto4	88	77.725	ENSSHAG00000008423	MRTO4	91	77.725	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000020828	mrto4	94	75.221	ENSSFOG00015006887	mrto4	92	77.523	Scleropages_formosus
ENSXETG00000020828	mrto4	93	74.439	ENSSMAG00000014393	mrto4	92	75.342	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000020828	mrto4	93	74.888	ENSSDUG00000015362	mrto4	92	75.342	Seriola_dumerili
ENSXETG00000020828	mrto4	93	74.439	ENSSLDG00000015813	mrto4	92	74.886	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000020828	mrto4	100	74.274	ENSSARG00000012700	MRTO4	91	77.727	Sorex_araneus
ENSXETG00000020828	mrto4	99	78.903	ENSSPUG00000001110	MRTO4	93	81.364	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000020828	mrto4	98	72.034	ENSSPAG00000007811	mrto4	92	74.886	Stegastes_partitus
ENSXETG00000020828	mrto4	94	76.106	ENSSSCG00000034814	MRTO4	91	77.727	Sus_scrofa
ENSXETG00000020828	mrto4	76	77.174	ENSTGUG00000016935	MRTO4	100	77.174	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000020828	mrto4	93	72.646	ENSTRUG00000019838	mrto4	92	73.394	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000020828	mrto4	93	73.991	ENSTNIG00000014802	mrto4	92	74.429	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000020828	mrto4	92	79.638	ENSTTRG00000014203	MRTO4	92	80.000	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000020828	mrto4	88	77.358	ENSUAMG00000026191	MRTO4	84	77.725	Ursus_americanus
ENSXETG00000020828	mrto4	99	74.370	ENSUMAG00000018964	MRTO4	92	78.636	Ursus_maritimus
ENSXETG00000020828	mrto4	92	77.828	ENSVVUG00000029432	MRTO4	92	78.182	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000020828	mrto4	98	73.504	ENSXCOG00000013521	mrto4	94	74.886	Xiphophorus_couchianus