EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSXETG00000021118 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
exosc9
Alias
-
Full Name
Xenopus tropicalis exosome component 9 (exosc9)%2C mRNA.
Gene Type
protein_coding
Species
Xenopus_tropicalis
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
12270 bases
Position
chrGL173104.1:927564-939833
Accession
NM_001126754
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSXETP00000045663RNase_PHPF01138.212.6e-2211
ENSXETP00000063887RNase_PHPF01138.212.8e-2211
ENSXETP00000045663RNase_PH_CPF03725.152.7e-1111
ENSXETP00000063887RNase_PH_CPF03725.157.5e-1111
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSXETT00000045663-1369-ENSXETP00000045663439 (aa)-F6VKX6
ENSXETT00000063628-1751-ENSXETP00000063887406 (aa)-B1H0X8
Gene Model
Click here to download ENSXETG00000021118's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000021118's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSXETG00000021118exosc96530.451ENSXETG00000001819exosc89430.712
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSXETG00000021118exosc99974.939ENSG00000123737EXOSC99985.477Homo_sapiens
ENSXETG00000021118exosc99964.563ENSAPOG00000001202exosc99765.714Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000021118exosc96530.169ENSAPOG00000023524exosc79930.169Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000021118exosc99973.986ENSAMEG00000006133EXOSC99575.059Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000021118exosc98671.839ENSACIG00000013514exosc99071.839Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000021118exosc96330.038ENSAOCG00000015133exosc79530.303Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000021118exosc99965.602ENSAOCG00000023602exosc99567.322Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000021118exosc96530.169ENSAPEG00000009704exosc79930.169Amphiprion_percula
ENSXETG00000021118exosc99965.926ENSAPEG00000014416exosc99467.654Amphiprion_percula
ENSXETG00000021118exosc99967.980ENSATEG00000023032exosc99965.509Anabas_testudineus
ENSXETG00000021118exosc98572.034ENSAPLG00000004920EXOSC99471.585Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000021118exosc99873.529ENSACAG00000012689EXOSC99572.488Anolis_carolinensis
ENSXETG00000021118exosc99975.728ENSANAG00000024817EXOSC99574.822Aotus_nancymaae
ENSXETG00000021118exosc97031.973ENSACLG00000007428exosc79932.203Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000021118exosc99968.227ENSACLG00000011471exosc99568.889Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000021118exosc99966.584ENSAMXG00000031976exosc99867.413Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000021118exosc95930.522ENSAMXG00000035439exosc78430.800Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000021118exosc99975.728ENSBTAG00000004942EXOSC99575.297Bos_taurus
ENSXETG00000021118exosc99432.905WBGene00018154exos-96837.000Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000021118exosc95430.081ENSCJAG00000001928EXOSC78430.081Callithrix_jacchus
ENSXETG00000021118exosc99975.485ENSCJAG00000003038EXOSC99574.584Callithrix_jacchus
ENSXETG00000021118exosc99975.362ENSCAFG00000004139EXOSC99575.772Canis_familiaris
ENSXETG00000021118exosc99974.224ENSCAFG00020017711EXOSC99575.656Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000021118exosc99975.728ENSCHIG00000018091EXOSC99575.534Capra_hircus
ENSXETG00000021118exosc99976.456ENSTSYG00000002664EXOSC99476.456Carlito_syrichta
ENSXETG00000021118exosc97672.168ENSCAPG00000007596EXOSC97373.401Cavia_aperea
ENSXETG00000021118exosc95730.000ENSCAPG00000016467EXOSC77530.290Cavia_aperea
ENSXETG00000021118exosc99975.728ENSCPOG00000034344EXOSC99574.524Cavia_porcellus
ENSXETG00000021118exosc99969.608ENSCCAG00000030677EXOSC99468.646Cebus_capucinus
ENSXETG00000021118exosc99975.243ENSCATG00000044273EXOSC99574.286Cercocebus_atys
ENSXETG00000021118exosc99975.604ENSCLAG00000004644EXOSC99476.214Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000021118exosc99975.000ENSCSAG00000003705EXOSC99574.048Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000021118exosc99063.661ENSCHOG00000000779EXOSC99164.571Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000021118exosc99974.576ENSCPBG00000024725EXOSC99573.508Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000021118exosc96530.034ENSCPBG00000023202EXOSC79930.034Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000021118exosc99040.470ENSCSAVG00000002868-9141.620Ciona_savignyi
ENSXETG00000021118exosc99974.515ENSCANG00000037429EXOSC99573.571Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000021118exosc99974.390ENSCGRG00001023030Exosc99573.923Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000021118exosc99974.390ENSCGRG00000003785Exosc99573.923Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000021118exosc99869.154ENSCSEG00000014567exosc99969.154Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000021118exosc99963.470ENSCVAG00000001098exosc99467.160Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000021118exosc97030.272ENSCVAG00000000739exosc79930.508Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000021118exosc99868.514ENSDARG00000006392exosc910070.671Danio_rerio
ENSXETG00000021118exosc96930.034ENSDARG00000100060exosc79930.272Danio_rerio
ENSXETG00000021118exosc99975.121ENSDNOG00000010614EXOSC99475.243Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000021118exosc96185.425ENSDORG00000007684Exosc99685.425Dipodomys_ordii
ENSXETG00000021118exosc96736.996FBgn0030789Rrp456736.957Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000021118exosc99973.399ENSETEG00000015190EXOSC99272.906Echinops_telfairi
ENSXETG00000021118exosc99975.728ENSEASG00005018326EXOSC99575.120Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000021118exosc99975.971ENSECAG00000024732EXOSC99575.359Equus_caballus
ENSXETG00000021118exosc99967.718ENSEEUG00000013683EXOSC99567.464Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000021118exosc97031.650ENSELUG00000007128exosc710031.879Esox_lucius
ENSXETG00000021118exosc99962.929ENSELUG00000011222exosc99366.912Esox_lucius
ENSXETG00000021118exosc99970.096ENSFCAG00000025246EXOSC99569.412Felis_catus
ENSXETG00000021118exosc99871.324ENSFALG00000008302EXOSC99570.167Ficedula_albicollis
ENSXETG00000021118exosc99975.485ENSFDAG00000014446EXOSC99475.182Fukomys_damarensis
ENSXETG00000021118exosc96830.742ENSGMOG00000007935exosc79630.986Gadus_morhua
ENSXETG00000021118exosc99865.915ENSGMOG00000014066exosc99865.915Gadus_morhua
ENSXETG00000021118exosc99873.219ENSGALG00000011884EXOSC99373.464Gallus_gallus
ENSXETG00000021118exosc97030.169ENSGAFG00000003112exosc79930.405Gambusia_affinis
ENSXETG00000021118exosc98672.989ENSGAFG00000015284exosc99567.397Gambusia_affinis
ENSXETG00000021118exosc96530.169ENSGACG00000003085exosc79930.169Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000021118exosc99867.920ENSGACG00000018481exosc99967.883Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000021118exosc99874.755ENSGAGG00000016512EXOSC99374.755Gopherus_agassizii
ENSXETG00000021118exosc99975.243ENSGGOG00000028227EXOSC99574.286Gorilla_gorilla
ENSXETG00000021118exosc97032.313ENSHBUG00000009582exosc79932.542Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000021118exosc99968.227ENSHBUG00000001818exosc99568.889Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000021118exosc99968.204ENSHGLG00000000611-9567.883Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000021118exosc99959.259ENSHGLG00000016703-8164.140Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000021118exosc99975.728ENSHGLG00000002467-9475.182Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000021118exosc99975.971ENSHGLG00100015581EXOSC99475.426Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000021118exosc99959.259ENSHGLG00100005612-8364.140Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000021118exosc99968.204ENSHGLG00100007278-9167.883Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000021118exosc99868.500ENSHCOG00000013001exosc99864.912Hippocampus_comes
ENSXETG00000021118exosc99965.517ENSIPUG00000004443EXOSC910065.111Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000021118exosc99974.696ENSSTOG00000007984EXOSC99474.696Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000021118exosc95930.204ENSJJAG00000010398Exosc78430.488Jaculus_jaculus
ENSXETG00000021118exosc96186.235ENSJJAG00000008858Exosc99886.235Jaculus_jaculus
ENSXETG00000021118exosc99867.669ENSKMAG00000020177exosc99467.669Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000021118exosc96431.227ENSKMAG00000012799exosc79131.481Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000021118exosc96530.169ENSLBEG00000027540exosc79930.169Labrus_bergylta
ENSXETG00000021118exosc99967.561ENSLBEG00000019599exosc99766.667Labrus_bergylta
ENSXETG00000021118exosc96630.147ENSLBEG00000020568exosc88630.112Labrus_bergylta
ENSXETG00000021118exosc97030.137ENSLACG00000012065EXOSC79930.375Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000021118exosc99861.707ENSLACG00000015203EXOSC99862.927Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000021118exosc96881.227ENSLOCG00000002999exosc99881.295Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000021118exosc99975.545ENSLAFG00000009514EXOSC99475.545Loxodonta_africana
ENSXETG00000021118exosc99975.243ENSMFAG00000038292EXOSC99574.286Macaca_fascicularis
ENSXETG00000021118exosc99975.243ENSMMUG00000009816EXOSC99786.383Macaca_mulatta
ENSXETG00000021118exosc99975.243ENSMNEG00000029445EXOSC99574.286Macaca_nemestrina
ENSXETG00000021118exosc99975.485ENSMLEG00000042316EXOSC99574.524Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000021118exosc97030.952ENSMAMG00000002527exosc79931.186Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000021118exosc99966.748ENSMAMG00000006465exosc99567.233Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000021118exosc97031.973ENSMZEG00005026454exosc79932.203Maylandia_zebra
ENSXETG00000021118exosc99968.227ENSMZEG00005011461exosc99568.889Maylandia_zebra
ENSXETG00000021118exosc98971.925ENSMGAG00000010649EXOSC99471.279Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000021118exosc96186.640ENSMAUG00000008629Exosc99886.555Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000021118exosc99974.702ENSMICG00000006994EXOSC99574.822Microcebus_murinus
ENSXETG00000021118exosc99974.453ENSMOCG00000007209Exosc99574.402Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000021118exosc97030.272ENSMMOG00000014984exosc79930.508Mola_mola
ENSXETG00000021118exosc98670.487ENSMMOG00000006666exosc98970.487Mola_mola
ENSXETG00000021118exosc99974.634ENSMODG00000018934EXOSC99474.101Monodelphis_domestica
ENSXETG00000021118exosc99965.000ENSMALG00000021891exosc99566.587Monopterus_albus
ENSXETG00000021118exosc97030.976ENSMALG00000009471exosc710031.208Monopterus_albus
ENSXETG00000021118exosc99973.966MGP_CAROLIEiJ_G0024939Exosc910089.796Mus_caroli
ENSXETG00000021118exosc99973.301ENSMUSG00000027714Exosc910089.796Mus_musculus
ENSXETG00000021118exosc95930.204ENSMUSG00000025785Exosc78430.488Mus_musculus
ENSXETG00000021118exosc95930.204MGP_PahariEiJ_G0015720Exosc78430.488Mus_pahari
ENSXETG00000021118exosc99973.479MGP_PahariEiJ_G0026379Exosc910088.435Mus_pahari
ENSXETG00000021118exosc99973.544MGP_SPRETEiJ_G0025873Exosc910089.796Mus_spretus
ENSXETG00000021118exosc95930.204MGP_SPRETEiJ_G0034002Exosc78430.488Mus_spretus
ENSXETG00000021118exosc99975.000ENSMPUG00000017410EXOSC99574.702Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000021118exosc99974.328ENSMLUG00000005167EXOSC99573.095Myotis_lucifugus
ENSXETG00000021118exosc96681.784ENSNGAG00000022671Exosc99881.784Nannospalax_galili
ENSXETG00000021118exosc97031.973ENSNBRG00000018223exosc79932.203Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000021118exosc95530.702ENSNBRG00000000047EXOSC79931.004Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000021118exosc99966.423ENSNBRG00000019108exosc99467.153Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000021118exosc99975.243ENSNLEG00000009300EXOSC99574.286Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000021118exosc99965.679ENSMEUG00000000117EXOSC99465.926Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000021118exosc99670.120ENSOPRG00000001158EXOSC99569.074Ochotona_princeps
ENSXETG00000021118exosc99975.303ENSODEG00000000589EXOSC99475.000Octodon_degus
ENSXETG00000021118exosc96530.034ENSODEG00000011518EXOSC79930.034Octodon_degus
ENSXETG00000021118exosc99967.980ENSONIG00000003399exosc99568.395Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000021118exosc97031.973ENSONIG00000019664exosc79932.203Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000021118exosc99874.693ENSOANG00000015114EXOSC99374.939Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000021118exosc96530.909ENSOANG00000006807EXOSC79831.159Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000021118exosc99975.854ENSOCUG00000003046EXOSC99375.854Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000021118exosc95731.250ENSOCUG00000000939EXOSC78231.535Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000021118exosc99967.317ENSORLG00000001989exosc99467.822Oryzias_latipes
ENSXETG00000021118exosc97030.952ENSORLG00000002251exosc79931.186Oryzias_latipes
ENSXETG00000021118exosc99967.317ENSORLG00020014069exosc99467.822Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000021118exosc97030.612ENSORLG00020008788exosc79930.847Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000021118exosc95930.453ENSORLG00015019052exosc89630.453Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000021118exosc99967.073ENSORLG00015013630exosc99467.574Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000021118exosc97030.612ENSORLG00015015968exosc79930.847Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000021118exosc99968.382ENSOMEG00000021965exosc99468.657Oryzias_melastigma
ENSXETG00000021118exosc97030.612ENSOMEG00000007979exosc79930.847Oryzias_melastigma
ENSXETG00000021118exosc99877.273ENSOGAG00000016104EXOSC99375.980Otolemur_garnettii
ENSXETG00000021118exosc99975.728ENSOARG00000014520EXOSC99575.895Ovis_aries
ENSXETG00000021118exosc99974.939ENSPPAG00000043865EXOSC99574.048Pan_paniscus
ENSXETG00000021118exosc95249.561ENSPPRG00000002152-5962.264Panthera_pardus
ENSXETG00000021118exosc99976.585ENSPPRG00000014689-9476.098Panthera_pardus
ENSXETG00000021118exosc99976.341ENSPTIG00000010017EXOSC99475.854Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000021118exosc99975.182ENSPTRG00000044568EXOSC99574.286Pan_troglodytes
ENSXETG00000021118exosc99975.243ENSPANG00000000792EXOSC99574.286Papio_anubis
ENSXETG00000021118exosc99869.825ENSPKIG00000005890exosc99269.576Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000021118exosc98673.521ENSPSIG00000016020EXOSC99273.803Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000021118exosc97030.034ENSPMGG00000023830exosc79930.272Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000021118exosc98773.521ENSPMGG00000019387exosc99779.638Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000021118exosc99973.913ENSPEMG00000000544Exosc99574.641Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000021118exosc98559.452ENSPMAG00000004877exosc99060.955Petromyzon_marinus
ENSXETG00000021118exosc96430.566ENSPMAG00000004395exosc89330.566Petromyzon_marinus
ENSXETG00000021118exosc99875.248ENSPCIG00000011193EXOSC99474.038Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000021118exosc98672.414ENSPFOG00000016008exosc99466.585Poecilia_formosa
ENSXETG00000021118exosc98672.414ENSPLAG00000016052exosc99467.568Poecilia_latipinna
ENSXETG00000021118exosc99866.748ENSPMEG00000023212exosc99860.349Poecilia_mexicana
ENSXETG00000021118exosc99867.482ENSPREG00000002069exosc98967.482Poecilia_reticulata
ENSXETG00000021118exosc99975.243ENSPPYG00000015037EXOSC99574.286Pongo_abelii
ENSXETG00000021118exosc98477.477ENSPCAG00000011287EXOSC98077.679Procavia_capensis
ENSXETG00000021118exosc95132.609ENSPCAG00000001772EXOSC77832.609Procavia_capensis
ENSXETG00000021118exosc99974.940ENSPCOG00000003962EXOSC99575.059Propithecus_coquereli
ENSXETG00000021118exosc98190.566ENSPVAG00000001284EXOSC97790.566Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000021118exosc97031.973ENSPNYG00000016020exosc79932.203Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000021118exosc99868.250ENSPNAG00000000578exosc98268.750Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000021118exosc910074.576ENSRNOG00000014674Exosc99774.879Rattus_norvegicus
ENSXETG00000021118exosc99974.757ENSRBIG00000030341EXOSC99573.810Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000021118exosc99974.757ENSRROG00000040804EXOSC99573.810Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000021118exosc96836.897YDR280W-9537.241Saccharomyces_cerevisiae
ENSXETG00000021118exosc99975.728ENSSBOG00000020744EXOSC99574.822Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000021118exosc99974.029ENSSHAG00000002000EXOSC99573.113Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000021118exosc910071.149ENSSFOG00015012903exosc99569.762Scleropages_formosus
ENSXETG00000021118exosc99967.237ENSSMAG00000012071exosc99567.482Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000021118exosc97030.272ENSSDUG00000019570exosc79930.508Seriola_dumerili
ENSXETG00000021118exosc99968.796ENSSDUG00000002313exosc99568.059Seriola_dumerili
ENSXETG00000021118exosc96530.169ENSSLDG00000024102exosc79930.169Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000021118exosc99968.642ENSSLDG00000020591exosc99568.148Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000021118exosc99877.057ENSSPUG00000010200EXOSC99377.057Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000021118exosc96530.034ENSSPUG00000011166EXOSC79930.034Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000021118exosc99866.917ENSSPAG00000003892exosc99467.500Stegastes_partitus
ENSXETG00000021118exosc97030.508ENSSPAG00000004284exosc79930.508Stegastes_partitus
ENSXETG00000021118exosc99975.485ENSSSCG00000009096EXOSC99575.120Sus_scrofa
ENSXETG00000021118exosc99369.430ENSTGUG00000001938-9568.593Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000021118exosc96768.214ENSTGUG00000015146-10067.708Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000021118exosc99866.585ENSTRUG00000004119exosc910067.076Takifugu_rubripes
ENSXETG00000021118exosc97030.375ENSTRUG00000008320exosc79930.612Takifugu_rubripes
ENSXETG00000021118exosc96530.169ENSTNIG00000003617exosc79930.169Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000021118exosc99866.583ENSTNIG00000004601exosc910066.583Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000021118exosc98660.556ENSTBEG00000012684EXOSC99360.833Tupaia_belangeri
ENSXETG00000021118exosc98086.585ENSTTRG00000001584EXOSC97786.585Tursiops_truncatus
ENSXETG00000021118exosc97772.086ENSUAMG00000011140EXOSC99173.700Ursus_americanus
ENSXETG00000021118exosc99973.986ENSUMAG00000003848EXOSC99575.059Ursus_maritimus
ENSXETG00000021118exosc95030.882ENSVPAG00000007287EXOSC87330.882Vicugna_pacos
ENSXETG00000021118exosc99963.170ENSVPAG00000012110EXOSC99561.416Vicugna_pacos
ENSXETG00000021118exosc99974.463ENSVVUG00000013324EXOSC99575.895Vulpes_vulpes
ENSXETG00000021118exosc99861.845ENSXCOG00000011971exosc99677.682Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000021118exosc98672.701ENSXMAG00000017823exosc99966.339Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us