EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000021176 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ptrhd1
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1 (ptrhd1)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3418 bases
Position: chrGL173106.1:844424-847841
Accession: NM_001103060
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000045785	PTH2	PF01981.16	3.6e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000045785	-	1123	-	ENSXETP00000045785	139 (aa)	-	F7BUR1

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000021176's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000021176's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	63.504	ENSG00000184924	PTRHD1	90	63.492	Homo_sapiens
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	62.810	ENSAPOG00000024433	ptrhd1	88	63.964	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	94	62.879	ENSAMEG00000002651	PTRHD1	87	63.115	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	62.810	ENSACIG00000002596	ptrhd1	88	63.964	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	62.810	ENSAOCG00000007632	ptrhd1	88	63.964	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	62.810	ENSAPEG00000011491	ptrhd1	88	63.964	Amphiprion_percula
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	ENSATEG00000019199	ptrhd1	88	63.964	Anabas_testudineus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	99	62.676	ENSANAG00000019089	PTRHD1	92	62.595	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	ENSACLG00000000814	ptrhd1	88	64.865	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000021176	ptrhd1	89	62.903	ENSAMXG00000034266	ptrhd1	79	63.158	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	64.964	ENSBTAG00000015012	PTRHD1	89	65.600	Bos_taurus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	48.696	WBGene00050885	Y94H6A.12	84	50.485	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000021176	ptrhd1	99	61.871	ENSCJAG00000008012	PTRHD1	91	61.719	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	64.234	ENSCAFG00000024865	PTRHD1	90	65.079	Canis_familiaris
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	63.504	ENSCHIG00000014757	PTRHD1	89	64.000	Capra_hircus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	67.442	ENSTSYG00000009995	PTRHD1	84	68.644	Carlito_syrichta
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	61.314	ENSCPOG00000005561	PTRHD1	90	62.698	Cavia_porcellus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	99	62.590	ENSCCAG00000033856	PTRHD1	91	62.500	Cebus_capucinus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	63.971	ENSCATG00000033690	PTRHD1	90	64.000	Cercocebus_atys
ENSXETG00000021176	ptrhd1	100	62.857	ENSCLAG00000006505	PTRHD1	83	65.289	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	63.504	ENSCSAG00000008490	PTRHD1	90	63.492	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	94	53.846	ENSCHOG00000001920	PTRHD1	87	52.500	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000021176	ptrhd1	90	66.142	ENSCPBG00000022276	PTRHD1	83	64.957	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000021176	ptrhd1	85	51.695	ENSCING00000019647	-	92	52.778	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000021176	ptrhd1	97	63.971	ENSCANG00000034444	PTRHD1	89	64.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	97	62.500	ENSCGRG00001003289	Ptrhd1	59	62.400	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000021176	ptrhd1	97	62.500	ENSCGRG00000011834	Ptrhd1	89	62.400	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	62.295	ENSCSEG00000006943	ptrhd1	88	62.500	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000021176	ptrhd1	88	63.415	ENSCVAG00000016345	ptrhd1	90	63.717	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	ENSDARG00000016122	ptrhd1	88	62.162	Danio_rerio
ENSXETG00000021176	ptrhd1	94	64.394	ENSDNOG00000043646	PTRHD1	81	63.934	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	63.571	ENSDORG00000026776	Ptrhd1	88	64.341	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000021176	ptrhd1	85	59.322	FBgn0038446	CG14903	91	58.333	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000021176	ptrhd1	88	54.098	ENSETEG00000009379	-	81	54.054	Echinops_telfairi
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	62.609	ENSEBUG00000002249	ptrhd1	87	61.905	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	50.000	ENSEASG00005001302	-	85	47.500	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	50.862	ENSECAG00000005314	-	71	51.429	Equus_caballus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	63.504	ENSECAG00000017730	PTRHD1	91	62.992	Equus_caballus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	94	59.848	ENSEEUG00000004263	PTRHD1	90	57.143	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	61.789	ENSELUG00000003837	ptrhd1	90	61.947	Esox_lucius
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	62.774	ENSFCAG00000003648	PTRHD1	90	63.492	Felis_catus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	94	62.879	ENSFDAG00000004017	PTRHD1	86	64.463	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	62.810	ENSFHEG00000009135	ptrhd1	88	63.063	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	62.609	ENSGALG00000016610	PTRHD1	79	60.360	Gallus_gallus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	65.289	ENSGAFG00000005717	ptrhd1	88	65.766	Gambusia_affinis
ENSXETG00000021176	ptrhd1	88	62.602	ENSGACG00000006743	ptrhd1	89	62.832	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	90	67.717	ENSGAGG00000023951	PTRHD1	92	66.667	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	70.690	ENSGGOG00000043870	PTRHD1	83	71.429	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	ENSHBUG00000014289	ptrhd1	88	64.865	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	68.103	ENSHGLG00000008203	PTRHD1	75	70.476	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	66.379	ENSHGLG00100004341	-	77	68.571	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	68.966	ENSHGLG00100012553	PTRHD1	75	71.429	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000021176	ptrhd1	86	62.500	ENSHCOG00000013504	ptrhd1	87	62.727	Hippocampus_comes
ENSXETG00000021176	ptrhd1	84	64.957	ENSIPUG00000004885	ptrhd1	89	65.094	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	94	65.649	ENSSTOG00000006030	PTRHD1	86	65.289	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	92	66.667	ENSJJAG00000024180	Ptrhd1	86	66.949	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	81	62.500	ENSKMAG00000016961	ptrhd1	90	63.725	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	88	62.602	ENSLBEG00000024406	ptrhd1	90	62.832	Labrus_bergylta
ENSXETG00000021176	ptrhd1	81	65.487	ENSLACG00000018052	PTRHD1	90	65.789	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000021176	ptrhd1	86	65.833	ENSLOCG00000015890	ptrhd1	86	66.364	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	96	62.963	ENSLAFG00000014453	PTRHD1	89	62.400	Loxodonta_africana
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	62.774	ENSMFAG00000040267	PTRHD1	90	62.698	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	62.774	ENSMMUG00000009598	PTRHD1	90	62.698	Macaca_mulatta
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	62.774	ENSMNEG00000035044	PTRHD1	90	62.698	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	61.029	ENSMLEG00000030314	PTRHD1	90	60.800	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	ENSMAMG00000021201	ptrhd1	88	63.964	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	ENSMZEG00005021808	ptrhd1	88	64.865	Maylandia_zebra
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	71.200	ENSMAUG00000019251	Ptrhd1	89	64.800	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	96	62.687	ENSMICG00000001578	PTRHD1	89	62.097	Microcebus_murinus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	64.234	ENSMOCG00000001204	Ptrhd1	90	65.079	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	62.810	ENSMMOG00000015284	ptrhd1	88	63.063	Mola_mola
ENSXETG00000021176	ptrhd1	88	64.286	ENSMODG00000015895	PTRHD1	85	63.793	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	61.983	ENSMALG00000003471	ptrhd1	88	62.162	Monopterus_albus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	64.234	MGP_CAROLIEiJ_G0017582	Ptrhd1	90	64.286	Mus_caroli
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	64.234	ENSMUSG00000096199	Ptrhd1	90	64.286	Mus_musculus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	64.234	MGP_SPRETEiJ_G0018426	Ptrhd1	90	64.286	Mus_spretus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	96	62.687	ENSMPUG00000014016	PTRHD1	89	62.903	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000021176	ptrhd1	94	64.394	ENSMLUG00000014127	PTRHD1	87	63.934	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	69.828	ENSNGAG00000016335	Ptrhd1	75	70.476	Nannospalax_galili
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	ENSNBRG00000009690	ptrhd1	88	64.865	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	63.504	ENSNLEG00000000990	PTRHD1	90	63.492	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000021176	ptrhd1	96	64.179	ENSOPRG00000008600	PTRHD1	88	64.228	Ochotona_princeps
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	69.828	ENSODEG00000007805	PTRHD1	73	69.811	Octodon_degus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	92	60.938	ENSONIG00000015722	ptrhd1	87	61.864	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	97	61.029	ENSOCUG00000015432	PTRHD1	89	62.400	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	62.931	ENSORLG00000028768	ptrhd1	87	66.019	Oryzias_latipes
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	62.069	ENSORLG00020002857	ptrhd1	87	65.049	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	62.931	ENSORLG00015018271	ptrhd1	88	66.019	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	61.739	ENSOMEG00000017594	ptrhd1	80	64.706	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	62.044	ENSOGAG00000000756	PTRHD1	90	63.492	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	64.234	ENSOARG00000018052	PTRHD1	89	64.800	Ovis_aries
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	63.504	ENSPPAG00000035395	PTRHD1	90	63.492	Pan_paniscus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	62.774	ENSPPRG00000022961	PTRHD1	90	63.492	Panthera_pardus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	62.774	ENSPTIG00000012136	PTRHD1	90	63.492	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	63.504	ENSPTRG00000011716	PTRHD1	90	63.492	Pan_troglodytes
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	62.774	ENSPANG00000006781	PTRHD1	90	63.492	Papio_anubis
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	61.983	ENSPKIG00000015207	ptrhd1	76	62.162	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	66.087	ENSPMGG00000020297	ptrhd1	88	64.865	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	82	65.217	ENSPMAG00000007352	ptrhd1	91	65.217	Petromyzon_marinus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	88	61.789	ENSPCIG00000025242	PTRHD1	92	59.483	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	65.289	ENSPFOG00000004468	ptrhd1	79	65.766	Poecilia_formosa
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	65.289	ENSPLAG00000018019	ptrhd1	88	65.766	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	65.289	ENSPMEG00000001321	ptrhd1	88	65.766	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	65.289	ENSPREG00000017624	ptrhd1	88	65.766	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	61.314	ENSPPYG00000012597	PTRHD1	90	61.111	Pongo_abelii
ENSXETG00000021176	ptrhd1	97	61.029	ENSPCAG00000007535	PTRHD1	90	60.317	Procavia_capensis
ENSXETG00000021176	ptrhd1	98	61.314	ENSPCOG00000003110	PTRHD1	90	61.111	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000021176	ptrhd1	94	65.909	ENSPVAG00000017514	PTRHD1	86	66.116	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	ENSPNYG00000016755	ptrhd1	88	64.865	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000021176	ptrhd1	90	61.600	ENSPNAG00000028214	ptrhd1	91	61.739	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	72.414	ENSRNOG00000004059	Ptrhd1	75	73.333	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	97	63.971	ENSRBIG00000032190	PTRHD1	89	64.000	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000021176	ptrhd1	97	63.971	ENSRROG00000029627	PTRHD1	89	64.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000021176	ptrhd1	99	62.590	ENSSBOG00000031751	PTRHD1	91	62.500	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000021176	ptrhd1	88	63.846	ENSSHAG00000005774	PTRHD1	78	62.500	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	ENSSFOG00015000526	ptrhd1	91	63.964	Scleropages_formosus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	64.348	ENSSMAG00000004450	ptrhd1	90	62.281	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	96	59.701	ENSSDUG00000004610	ptrhd1	83	59.677	Seriola_dumerili
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	64.463	ENSSLDG00000006231	ptrhd1	88	64.865	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	73.276	ENSSPUG00000002905	PTRHD1	83	70.270	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	63.636	ENSSPAG00000000997	ptrhd1	88	64.865	Stegastes_partitus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	71	58.586	ENSSSCG00000040441	-	74	56.989	Sus_scrofa
ENSXETG00000021176	ptrhd1	88	58.400	ENSTGUG00000015169	-	84	58.261	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	59.504	ENSTRUG00000007201	ptrhd1	88	59.459	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	62.810	ENSTNIG00000019143	ptrhd1	88	63.063	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000021176	ptrhd1	86	62.500	ENSTTRG00000015128	PTRHD1	85	61.345	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	92	65.152	ENSUAMG00000007305	PTRHD1	86	66.116	Ursus_americanus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	83	68.966	ENSVPAG00000005556	PTRHD1	76	68.868	Vicugna_pacos
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	65.289	ENSXCOG00000019083	ptrhd1	88	65.766	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000021176	ptrhd1	87	65.289	ENSXMAG00000024458	ptrhd1	88	65.766	Xiphophorus_maculatus