EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000022797 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis SYF2 pre-mRNA splicing factor (syf2)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7514 bases
Position: chrGL172688.1:2544729-2552242
Accession: NM_001037263
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000049327	SYF2	PF08231.12	5.6e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000049327	-	1068	-	ENSXETP00000049327	249 (aa)	-	F7DJ57

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000022797's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000022797's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000022797	syf2	94	83.262	ENSG00000117614	SYF2	96	83.262	Homo_sapiens
ENSXETG00000022797	syf2	89	81.982	ENSAPOG00000001174	syf2	99	78.481	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000022797	syf2	92	84.279	ENSAMEG00000010115	-	95	83.190	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000022797	syf2	78	85.641	ENSAMEG00000010134	-	100	85.641	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000022797	syf2	89	80.180	ENSACIG00000023688	syf2	89	80.180	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000022797	syf2	99	75.000	ENSAOCG00000022046	syf2	98	78.632	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000022797	syf2	87	77.315	ENSAOCG00000010912	syf2	66	77.315	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000022797	syf2	99	75.000	ENSAPEG00000018858	syf2	97	75.000	Amphiprion_percula
ENSXETG00000022797	syf2	87	80.184	ENSATEG00000007745	syf2	99	76.371	Anabas_testudineus
ENSXETG00000022797	syf2	80	86.935	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	86.935	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000022797	syf2	82	81.863	ENSACAG00000013653	-	100	81.863	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000022797	syf2	67	72.455	ENSACAG00000026777	-	94	72.611	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000022797	syf2	94	83.691	ENSANAG00000032473	SYF2	96	83.691	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000022797	syf2	89	80.180	ENSACLG00000019916	syf2	97	78.017	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000022797	syf2	89	78.378	ENSAMXG00000004051	syf2	93	78.378	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000022797	syf2	92	84.211	ENSBTAG00000001651	SYF2	97	84.211	Bos_taurus
ENSXETG00000022797	syf2	84	50.000	WBGene00019402	syf-2	100	46.383	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000022797	syf2	87	86.574	ENSCJAG00000046570	SYF2	96	83.262	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000022797	syf2	87	86.111	ENSCAFG00000012895	-	94	83.621	Canis_familiaris
ENSXETG00000022797	syf2	90	76.444	ENSCAFG00000030331	-	96	76.444	Canis_familiaris
ENSXETG00000022797	syf2	87	86.111	ENSCAFG00020021091	-	94	83.621	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000022797	syf2	75	76.471	ENSCAFG00020021094	-	83	84.615	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000022797	syf2	96	81.250	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	81.250	Capra_hircus
ENSXETG00000022797	syf2	94	81.702	ENSTSYG00000005114	SYF2	97	81.702	Carlito_syrichta
ENSXETG00000022797	syf2	80	86.869	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	86.869	Cavia_aperea
ENSXETG00000022797	syf2	95	82.278	ENSCPOG00000005326	SYF2	97	82.278	Cavia_porcellus
ENSXETG00000022797	syf2	94	83.691	ENSCCAG00000022459	SYF2	96	83.691	Cebus_capucinus
ENSXETG00000022797	syf2	94	81.116	ENSCATG00000026917	SYF2	96	81.116	Cercocebus_atys
ENSXETG00000022797	syf2	95	82.700	ENSCLAG00000008474	SYF2	97	82.700	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000022797	syf2	94	81.545	ENSCSAG00000000948	SYF2	96	81.545	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000022797	syf2	71	66.667	ENSCHOG00000005273	-	98	66.667	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000022797	syf2	90	85.333	ENSCPBG00000025073	SYF2	95	83.051	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000022797	syf2	85	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000022797	syf2	85	50.704	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSXETG00000022797	syf2	94	72.103	ENSCANG00000037322	SYF2	95	72.103	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000022797	syf2	93	82.759	ENSCGRG00001020733	Syf2	95	83.843	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000022797	syf2	79	85.714	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.427	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000022797	syf2	88	76.606	ENSCSEG00000000117	syf2	93	76.126	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000022797	syf2	89	78.829	ENSCVAG00000019543	syf2	97	76.395	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000022797	syf2	89	81.081	ENSDARG00000004706	syf2	93	81.081	Danio_rerio
ENSXETG00000022797	syf2	93	83.190	ENSDNOG00000047605	SYF2	95	83.190	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000022797	syf2	92	85.526	ENSDORG00000001274	Syf2	93	85.526	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000022797	syf2	88	57.727	FBgn0033556	CG12343	97	57.727	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000022797	syf2	84	71.429	ENSETEG00000015729	SYF2	98	70.089	Echinops_telfairi
ENSXETG00000022797	syf2	79	57.868	ENSEBUG00000015402	syf2	95	57.868	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000022797	syf2	95	83.193	ENSEASG00005004224	-	97	83.193	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000022797	syf2	94	75.966	ENSEASG00005004232	-	96	75.966	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000022797	syf2	92	85.526	ENSECAG00000012023	-	93	85.526	Equus_caballus
ENSXETG00000022797	syf2	96	82.353	ENSECAG00000010440	-	98	82.353	Equus_caballus
ENSXETG00000022797	syf2	71	69.886	ENSEEUG00000015084	SYF2	96	69.886	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000022797	syf2	90	80.804	ENSELUG00000003465	syf2	94	80.804	Esox_lucius
ENSXETG00000022797	syf2	92	84.716	ENSFCAG00000043095	-	94	83.621	Felis_catus
ENSXETG00000022797	syf2	97	81.743	ENSFCAG00000010324	-	83	81.743	Felis_catus
ENSXETG00000022797	syf2	82	82.353	ENSFALG00000000460	SYF2	98	75.000	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000022797	syf2	94	81.702	ENSFDAG00000008310	SYF2	97	81.702	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000022797	syf2	90	66.071	ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.071	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000022797	syf2	88	79.817	ENSGMOG00000019138	syf2	96	80.930	Gadus_morhua
ENSXETG00000022797	syf2	90	85.333	ENSGALG00000013639	SYF2	96	80.408	Gallus_gallus
ENSXETG00000022797	syf2	94	74.678	ENSGAFG00000019435	syf2	97	74.678	Gambusia_affinis
ENSXETG00000022797	syf2	89	79.279	ENSGACG00000007305	syf2	97	76.724	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000022797	syf2	90	85.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	95	83.475	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000022797	syf2	94	82.833	ENSGGOG00000012796	SYF2	96	82.833	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000022797	syf2	93	78.017	ENSHBUG00000020477	syf2	99	78.017	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000022797	syf2	89	74.775	ENSHGLG00000004304	-	93	74.775	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000022797	syf2	95	82.278	ENSHGLG00000014393	SYF2	97	82.278	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000022797	syf2	95	82.278	ENSHGLG00100014722	SYF2	97	82.278	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000022797	syf2	100	72.908	ENSHCOG00000012904	syf2	79	75.104	Hippocampus_comes
ENSXETG00000022797	syf2	99	73.984	ENSIPUG00000019859	syf2	99	75.527	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000022797	syf2	59	81.507	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	81.507	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000022797	syf2	80	86.500	ENSJJAG00000013301	Syf2	95	86.500	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000022797	syf2	94	77.253	ENSKMAG00000013856	syf2	97	77.253	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000022797	syf2	88	80.365	ENSLBEG00000014425	syf2	100	74.793	Labrus_bergylta
ENSXETG00000022797	syf2	88	82.569	ENSLACG00000012064	SYF2	92	82.569	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000022797	syf2	98	74.699	ENSLOCG00000002728	syf2	99	74.699	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000022797	syf2	73	60.870	ENSLAFG00000030814	-	100	60.870	Loxodonta_africana
ENSXETG00000022797	syf2	92	85.088	ENSLAFG00000023150	-	93	85.088	Loxodonta_africana
ENSXETG00000022797	syf2	94	81.545	ENSMFAG00000041831	SYF2	96	81.545	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000022797	syf2	94	81.545	ENSMMUG00000002968	SYF2	96	81.545	Macaca_mulatta
ENSXETG00000022797	syf2	94	81.545	ENSMNEG00000030180	SYF2	96	81.545	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000022797	syf2	94	81.116	ENSMLEG00000030248	SYF2	96	81.116	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000022797	syf2	87	78.802	ENSMAMG00000010403	syf2	96	75.862	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000022797	syf2	94	77.778	ENSMZEG00005006429	syf2	97	77.778	Maylandia_zebra
ENSXETG00000022797	syf2	80	86.935	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	86.935	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000022797	syf2	96	81.513	ENSMAUG00000018974	Syf2	98	81.513	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000022797	syf2	80	86.432	ENSMICG00000016191	SYF2	100	86.432	Microcebus_murinus
ENSXETG00000022797	syf2	92	84.279	ENSMOCG00000022938	Syf2	95	84.279	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000022797	syf2	89	78.378	ENSMMOG00000002396	syf2	93	78.378	Mola_mola
ENSXETG00000022797	syf2	91	80.702	ENSMODG00000013951	-	99	80.702	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000022797	syf2	95	75.630	ENSMALG00000010706	syf2	98	76.050	Monopterus_albus
ENSXETG00000022797	syf2	96	81.092	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	98	81.092	Mus_caroli
ENSXETG00000022797	syf2	96	81.092	ENSMUSG00000028821	Syf2	98	81.092	Mus_musculus
ENSXETG00000022797	syf2	96	81.092	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	98	81.092	Mus_pahari
ENSXETG00000022797	syf2	96	81.092	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	98	81.092	Mus_spretus
ENSXETG00000022797	syf2	94	82.128	ENSMPUG00000015801	-	96	82.128	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000022797	syf2	92	84.211	ENSMPUG00000015802	-	93	84.211	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000022797	syf2	96	82.353	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	82.353	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000022797	syf2	92	84.279	ENSNGAG00000007912	Syf2	93	84.279	Nannospalax_galili
ENSXETG00000022797	syf2	94	70.513	ENSNBRG00000010720	syf2	97	70.513	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000022797	syf2	94	82.833	ENSNLEG00000035185	SYF2	96	82.833	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000022797	syf2	93	83.117	ENSOPRG00000012870	SYF2	95	83.117	Ochotona_princeps
ENSXETG00000022797	syf2	95	81.356	ENSODEG00000017664	-	99	81.356	Octodon_degus
ENSXETG00000022797	syf2	95	73.840	ENSODEG00000014338	-	99	73.305	Octodon_degus
ENSXETG00000022797	syf2	89	80.180	ENSONIG00000008213	syf2	97	78.017	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000022797	syf2	81	85.149	ENSOANG00000009552	SYF2	100	85.149	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000022797	syf2	94	83.691	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	83.691	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000022797	syf2	89	80.180	ENSORLG00000028820	syf2	95	80.180	Oryzias_latipes
ENSXETG00000022797	syf2	94	77.253	ENSORLG00020018333	syf2	98	77.253	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000022797	syf2	94	76.824	ENSORLG00015014665	syf2	98	76.824	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000022797	syf2	89	81.081	ENSOMEG00000013911	syf2	93	81.081	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000022797	syf2	95	81.857	ENSOGAG00000009962	SYF2	97	81.857	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000022797	syf2	92	83.913	ENSOARG00000006348	-	93	83.913	Ovis_aries
ENSXETG00000022797	syf2	78	60.000	ENSOARG00000006269	-	100	60.000	Ovis_aries
ENSXETG00000022797	syf2	94	82.833	ENSPPAG00000036579	SYF2	96	82.833	Pan_paniscus
ENSXETG00000022797	syf2	96	82.353	ENSPPRG00000001638	-	97	82.353	Panthera_pardus
ENSXETG00000022797	syf2	92	84.716	ENSPPRG00000001651	-	94	83.621	Panthera_pardus
ENSXETG00000022797	syf2	87	87.037	ENSPTIG00000005711	-	80	87.156	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000022797	syf2	92	84.716	ENSPTIG00000007036	-	94	83.621	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000022797	syf2	94	82.833	ENSPTRG00000000352	SYF2	96	82.833	Pan_troglodytes
ENSXETG00000022797	syf2	94	81.545	ENSPANG00000008139	SYF2	96	81.545	Papio_anubis
ENSXETG00000022797	syf2	97	74.793	ENSPKIG00000008130	syf2	100	74.793	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000022797	syf2	98	79.592	ENSPSIG00000011816	SYF2	93	79.592	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000022797	syf2	93	76.724	ENSPMGG00000008755	syf2	91	76.724	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000022797	syf2	92	83.843	ENSPEMG00000008283	Syf2	95	83.843	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000022797	syf2	90	84.375	ENSPCIG00000014235	SYF2	91	83.772	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000022797	syf2	94	75.966	ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.966	Poecilia_formosa
ENSXETG00000022797	syf2	94	75.966	ENSPLAG00000006691	syf2	99	75.966	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000022797	syf2	94	72.961	ENSPMEG00000011684	syf2	100	72.532	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000022797	syf2	87	79.167	ENSPREG00000003009	syf2	94	78.027	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000022797	syf2	94	82.403	ENSPPYG00000001713	SYF2	96	82.403	Pongo_abelii
ENSXETG00000022797	syf2	94	58.369	ENSPCOG00000027011	SYF2	94	58.369	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000022797	syf2	92	74.123	ENSPVAG00000005841	SYF2	93	74.123	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000022797	syf2	89	80.180	ENSPNYG00000004979	syf2	97	78.017	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000022797	syf2	98	74.694	ENSPNAG00000015570	syf2	97	74.694	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000022797	syf2	96	81.092	ENSRNOG00000060597	Syf2	98	81.092	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000022797	syf2	94	78.970	ENSRBIG00000042970	SYF2	96	78.970	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000022797	syf2	94	81.545	ENSRROG00000001347	SYF2	96	81.545	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000022797	syf2	94	82.833	ENSSBOG00000020184	SYF2	96	82.833	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000022797	syf2	81	85.572	ENSSHAG00000007152	-	98	85.572	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000022797	syf2	91	83.628	ENSSHAG00000015630	-	92	83.333	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000022797	syf2	95	76.695	ENSSFOG00015023647	syf2	99	76.695	Scleropages_formosus
ENSXETG00000022797	syf2	94	75.949	ENSSMAG00000009867	syf2	99	75.949	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000022797	syf2	88	80.734	ENSSDUG00000013072	syf2	98	76.068	Seriola_dumerili
ENSXETG00000022797	syf2	88	80.734	ENSSLDG00000012677	syf2	94	79.372	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000022797	syf2	93	65.517	ENSSARG00000012889	SYF2	95	65.517	Sorex_araneus
ENSXETG00000022797	syf2	93	82.328	ENSSPUG00000005251	SYF2	92	82.328	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000022797	syf2	94	75.949	ENSSPAG00000009626	syf2	99	75.949	Stegastes_partitus
ENSXETG00000022797	syf2	95	81.780	ENSSSCG00000037481	SYF2	96	81.780	Sus_scrofa
ENSXETG00000022797	syf2	99	72.874	ENSTRUG00000001499	syf2	95	74.790	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000022797	syf2	90	77.578	ENSTNIG00000016912	syf2	100	77.578	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000022797	syf2	94	63.090	ENSTBEG00000017370	SYF2	95	62.661	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000022797	syf2	87	86.111	ENSTTRG00000003550	SYF2	93	84.649	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000022797	syf2	92	83.406	ENSUAMG00000002897	SYF2	94	82.328	Ursus_americanus
ENSXETG00000022797	syf2	87	85.648	ENSUMAG00000013108	SYF2	94	82.759	Ursus_maritimus
ENSXETG00000022797	syf2	91	83.186	ENSVPAG00000005705	SYF2	93	83.186	Vicugna_pacos
ENSXETG00000022797	syf2	82	84.878	ENSVVUG00000027181	-	95	81.277	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000022797	syf2	87	86.111	ENSVVUG00000027175	-	94	83.621	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000022797	syf2	86	78.605	ENSXMAG00000022698	syf2	97	74.678	Xiphophorus_maculatus