EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000024897 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ovol2
Alias: -
Full Name: Xenopus tropicalis ovo like zinc finger 2 (ovol2)%2C mRNA.
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33061 bases
Position: chrGL173250.1:569156-602216
Accession: NM_001004998
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000053523	zf-C2H2	PF00096.26	2e-15	1	2
ENSXETP00000053523	zf-C2H2	PF00096.26	2e-15	2	2
ENSXETP00000053523	zf-met	PF12874.7	0.00025	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000053523	-	2705	-	ENSXETP00000053523	287 (aa)	-	Q6DIE9

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000024897's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000024897's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000024897	ovol2	51	36.522	ENSXETG00000016062	znf184	89	37.288
ENSXETG00000024897	ovol2	77	35.897	ENSXETG00000030249	-	75	35.897
ENSXETG00000024897	ovol2	52	40.367	ENSXETG00000008801	znf628	94	40.367
ENSXETG00000024897	ovol2	59	37.662	ENSXETG00000015125	-	77	37.662
ENSXETG00000024897	ovol2	96	48.921	ENSXETG00000020587	ovol1	98	48.921
ENSXETG00000024897	ovol2	55	39.048	ENSXETG00000027149	-	99	39.048
ENSXETG00000024897	ovol2	57	36.190	ENSXETG00000034213	-	99	36.190
ENSXETG00000024897	ovol2	51	37.179	ENSXETG00000023643	znf484	99	35.484
ENSXETG00000024897	ovol2	57	38.750	ENSXETG00000030967	-	88	38.750
ENSXETG00000024897	ovol2	59	35.593	ENSXETG00000017175	-	95	35.593
ENSXETG00000024897	ovol2	70	37.179	ENSXETG00000018641	znf652	52	37.179
ENSXETG00000024897	ovol2	54	40.000	ENSXETG00000006575	znf420	79	40.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000024897	ovol2	57	81.212	ENSAPLG00000016199	OVOL2	92	81.212	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000024897	ovol2	98	60.563	ENSACAG00000014216	OVOL2	99	60.563	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000024897	ovol2	75	59.722	ENSANAG00000026429	OVOL2	99	59.535	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000024897	ovol2	99	64.085	ENSCAFG00000005453	OVOL2	99	64.085	Canis_familiaris
ENSXETG00000024897	ovol2	99	64.085	ENSCAFG00020027506	OVOL2	99	64.085	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000024897	ovol2	57	79.518	ENSTSYG00000012790	OVOL2	83	79.518	Carlito_syrichta
ENSXETG00000024897	ovol2	53	82.353	ENSCAPG00000005775	OVOL2	91	82.353	Cavia_aperea
ENSXETG00000024897	ovol2	99	65.035	ENSCPBG00000023454	OVOL2	100	65.035	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000024897	ovol2	99	57.986	ENSCANG00000033179	OVOL2	99	57.986	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000024897	ovol2	92	44.528	ENSCVAG00000001397	zgc:171929	91	44.528	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000024897	ovol2	99	64.931	ENSDORG00000016697	Ovol2	99	65.398	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000024897	ovol2	99	64.014	ENSEASG00005001990	OVOL2	99	64.014	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000024897	ovol2	99	63.889	ENSECAG00000007899	OVOL2	99	63.889	Equus_caballus
ENSXETG00000024897	ovol2	56	57.764	ENSELUG00000020356	zgc:171929	53	57.764	Esox_lucius
ENSXETG00000024897	ovol2	99	64.336	ENSFCAG00000027530	OVOL2	99	64.605	Felis_catus
ENSXETG00000024897	ovol2	97	65.233	ENSFALG00000007594	OVOL2	97	65.233	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000024897	ovol2	57	78.049	ENSFDAG00000008730	OVOL2	98	78.049	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000024897	ovol2	99	63.668	ENSGALG00000008702	OVOL2	100	63.668	Gallus_gallus
ENSXETG00000024897	ovol2	99	66.899	ENSGAGG00000020202	OVOL2	100	66.899	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000024897	ovol2	99	61.324	ENSHGLG00000016810	OVOL2	99	61.324	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000024897	ovol2	99	62.199	ENSSTOG00000024979	OVOL2	99	62.199	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000024897	ovol2	96	65.248	ENSJJAG00000014942	Ovol2	99	64.726	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000024897	ovol2	92	44.569	ENSLBEG00000006082	zgc:171929	91	44.569	Labrus_bergylta
ENSXETG00000024897	ovol2	95	63.736	ENSLACG00000011247	OVOL2	95	63.736	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000024897	ovol2	55	81.875	ENSMGAG00000006770	OVOL2	96	81.875	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000024897	ovol2	100	61.592	ENSMICG00000032455	OVOL2	100	62.543	Microcebus_murinus
ENSXETG00000024897	ovol2	99	67.832	ENSMODG00000005504	OVOL2	99	67.832	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000024897	ovol2	99	63.668	MGP_CAROLIEiJ_G0024381	Ovol2	96	67.965	Mus_caroli
ENSXETG00000024897	ovol2	99	64.014	ENSMUSG00000037279	Ovol2	96	68.398	Mus_musculus
ENSXETG00000024897	ovol2	99	63.066	MGP_PahariEiJ_G0025825	Ovol2	95	67.249	Mus_pahari
ENSXETG00000024897	ovol2	99	64.014	MGP_SPRETEiJ_G0025300	Ovol2	96	68.398	Mus_spretus
ENSXETG00000024897	ovol2	99	62.937	ENSNGAG00000007174	Ovol2	96	67.672	Nannospalax_galili
ENSXETG00000024897	ovol2	100	67.708	ENSMEUG00000011922	OVOL2	99	67.230	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000024897	ovol2	58	86.826	ENSOANG00000001250	OVOL2	98	86.826	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000024897	ovol2	60	80.460	ENSOCUG00000012116	OVOL2	69	80.460	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000024897	ovol2	96	62.676	ENSOGAG00000030325	OVOL2	100	61.486	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000024897	ovol2	56	81.366	ENSPPAG00000032300	OVOL2	99	59.091	Pan_paniscus
ENSXETG00000024897	ovol2	99	65.035	ENSPPRG00000006276	OVOL2	99	65.385	Panthera_pardus
ENSXETG00000024897	ovol2	88	64.314	ENSPSIG00000006768	OVOL2	100	64.314	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000024897	ovol2	100	61.246	ENSPCOG00000013518	OVOL2	100	62.199	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000024897	ovol2	61	82.955	ENSPVAG00000001140	OVOL2	97	68.670	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000024897	ovol2	99	67.606	ENSSHAG00000018466	OVOL2	99	68.601	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000024897	ovol2	54	84.615	ENSSARG00000006563	OVOL2	99	80.952	Sorex_araneus
ENSXETG00000024897	ovol2	57	82.317	ENSSPUG00000001720	OVOL2	88	79.070	Sphenodon_punctatus
ENSXETG00000024897	ovol2	97	66.308	ENSTGUG00000005909	OVOL2	97	66.308	Taeniopygia_guttata
ENSXETG00000024897	ovol2	57	82.927	ENSVVUG00000013094	OVOL2	60	79.651	Vulpes_vulpes