EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXETG00000025124 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srrt
Alias: ars2|serrate|srrt-a|srrt-b
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10912 bases
Position: chrGL174244.1:7950-18861
Accession: 549806
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000033727	ARS2	PF04959.13	5e-84	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000033727	-	2603	-	ENSXETP00000033727	860 (aa)	-	F6RQL2
ENSXETT00000033723	-	795	-	ENSXETP00000033723	219 (aa)	-	Q28FS2

Gene Model

Click here to download ENSXETG00000025124's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000025124's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.180	ENSG00000087087	SRRT	98	89.130	Homo_sapiens
ENSXETG00000025124	srrt	72	75.796	ENSAPOG00000002304	srrt	75	75.843	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000025124	srrt	96	58.797	ENSAMEG00000014506	SRRT	69	78.916	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000025124	srrt	71	77.070	ENSACIG00000015795	srrt	78	76.966	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000025124	srrt	95	56.663	ENSAOCG00000009693	srrt	77	73.596	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000025124	srrt	95	52.941	ENSAOCG00000009189	-	70	61.702	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000025124	srrt	95	56.988	ENSAPEG00000003646	srrt	78	73.596	Amphiprion_percula
ENSXETG00000025124	srrt	95	52.941	ENSAPEG00000020016	-	70	61.702	Amphiprion_percula
ENSXETG00000025124	srrt	72	76.433	ENSATEG00000014425	srrt	76	76.404	Anabas_testudineus
ENSXETG00000025124	srrt	60	55.682	ENSATEG00000003652	-	85	60.000	Anabas_testudineus
ENSXETG00000025124	srrt	72	80.128	ENSACAG00000001014	SRRT	72	81.356	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSANAG00000031718	SRRT	71	81.366	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000025124	srrt	71	75.796	ENSACLG00000013156	srrt	69	75.843	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000025124	srrt	75	59.205	ENSACLG00000009423	-	78	60.000	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000025124	srrt	71	79.503	ENSAMXG00000016671	srrt	80	75.410	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSBTAG00000001134	SRRT	71	79.503	Bos_taurus
ENSXETG00000025124	srrt	51	51.786	WBGene00017085	E01A2.2	85	38.843	Caenorhabditis_elegans
ENSXETG00000025124	srrt	72	81.366	ENSCJAG00000014917	SRRT	71	81.366	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000025124	srrt	96	61.988	ENSCAFG00000023538	SRRT	71	81.366	Canis_familiaris
ENSXETG00000025124	srrt	98	61.187	ENSCAFG00020013358	SRRT	71	81.366	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000025124	srrt	86	76.293	ENSCHIG00000010495	SRRT	71	79.503	Capra_hircus
ENSXETG00000025124	srrt	96	59.441	ENSTSYG00000036426	SRRT	73	81.646	Carlito_syrichta
ENSXETG00000025124	srrt	83	75.862	ENSCAPG00000013586	SRRT	89	70.886	Cavia_aperea
ENSXETG00000025124	srrt	84	75.751	ENSCPOG00000001739	SRRT	72	81.366	Cavia_porcellus
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSCCAG00000015877	SRRT	71	81.366	Cebus_capucinus
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.395	ENSCATG00000036306	SRRT	73	81.646	Cercocebus_atys
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSCLAG00000007568	SRRT	89	71.186	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSCSAG00000017996	SRRT	71	81.366	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000025124	srrt	63	80.255	ENSCPBG00000011553	SRRT	71	82.022	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000025124	srrt	78	48.996	ENSCING00000003506	-	62	52.239	Ciona_intestinalis
ENSXETG00000025124	srrt	83	45.420	ENSCSAVG00000008394	-	76	54.734	Ciona_savignyi
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.180	ENSCANG00000034556	SRRT	71	81.366	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000025124	srrt	96	61.871	ENSCGRG00001001594	Srrt	71	81.366	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000025124	srrt	71	81.046	ENSCGRG00000007292	Srrt	89	71.888	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000025124	srrt	74	78.571	ENSCSEG00000017878	srrt	71	78.571	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000025124	srrt	75	57.895	ENSCSEG00000005233	-	81	57.923	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000025124	srrt	70	59.955	ENSCVAG00000017344	-	71	59.954	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000025124	srrt	95	55.556	ENSCVAG00000019848	srrt	76	75.843	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000025124	srrt	72	78.882	ENSDARG00000017762	srrt	71	74.317	Danio_rerio
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSDNOG00000003851	SRRT	71	81.366	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000025124	srrt	84	75.966	ENSDORG00000005584	Srrt	89	72.591	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000025124	srrt	82	45.826	FBgn0033062	Ars2	61	49.045	Drosophila_melanogaster
ENSXETG00000025124	srrt	76	74.841	ENSETEG00000016175	SRRT	71	76.129	Echinops_telfairi
ENSXETG00000025124	srrt	61	54.749	ENSEBUG00000008517	-	65	60.475	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.295	ENSEASG00005016956	SRRT	71	81.366	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.295	ENSECAG00000012292	SRRT	71	81.366	Equus_caballus
ENSXETG00000025124	srrt	58	82.292	ENSEEUG00000009117	SRRT	57	85.135	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000025124	srrt	73	59.592	ENSELUG00000021216	-	71	61.310	Esox_lucius
ENSXETG00000025124	srrt	72	78.261	ENSELUG00000006651	srrt	71	71.856	Esox_lucius
ENSXETG00000025124	srrt	96	61.593	ENSFCAG00000006855	SRRT	71	81.366	Felis_catus
ENSXETG00000025124	srrt	84	71.336	ENSFDAG00000021347	SRRT	88	67.241	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000025124	srrt	66	75.796	ENSFHEG00000002756	srrt	78	75.843	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000025124	srrt	55	53.975	ENSFHEG00000004105	-	94	54.176	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000025124	srrt	95	51.142	ENSGMOG00000018619	srrt	71	69.780	Gadus_morhua
ENSXETG00000025124	srrt	60	70.588	ENSGMOG00000018694	-	59	70.588	Gadus_morhua
ENSXETG00000025124	srrt	72	75.796	ENSGAFG00000005423	srrt	72	76.404	Gambusia_affinis
ENSXETG00000025124	srrt	72	57.479	ENSGAFG00000020383	-	96	47.418	Gambusia_affinis
ENSXETG00000025124	srrt	78	57.778	ENSGACG00000001100	-	69	58.788	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000025124	srrt	74	74.843	ENSGACG00000020387	srrt	72	73.481	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.180	ENSGGOG00000001508	SRRT	71	81.529	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000025124	srrt	71	75.796	ENSHBUG00000002942	srrt	69	75.843	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000025124	srrt	96	61.440	ENSHGLG00000008344	Srrt	89	71.459	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000025124	srrt	72	81.366	ENSHGLG00100018857	Srrt	89	72.318	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000025124	srrt	76	75.843	ENSHCOG00000005403	srrt	77	74.157	Hippocampus_comes
ENSXETG00000025124	srrt	81	52.601	ENSHCOG00000008904	-	77	57.019	Hippocampus_comes
ENSXETG00000025124	srrt	69	77.444	ENSIPUG00000021150	srrt	80	76.966	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.180	ENSSTOG00000013776	SRRT	71	81.366	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000025124	srrt	96	61.894	ENSJJAG00000010446	Srrt	89	72.103	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000025124	srrt	73	58.571	ENSKMAG00000008468	-	71	58.958	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000025124	srrt	73	75.796	ENSKMAG00000013599	srrt	76	75.843	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000025124	srrt	74	82.584	ENSLBEG00000016308	srrt	75	78.090	Labrus_bergylta
ENSXETG00000025124	srrt	68	83.333	ENSLACG00000001089	SRRT	73	84.181	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000025124	srrt	66	76.316	ENSLOCG00000013658	srrt	66	72.174	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.559	ENSLAFG00000007725	SRRT	71	81.366	Loxodonta_africana
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.180	ENSMFAG00000033745	SRRT	74	81.529	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSMMUG00000021255	SRRT	71	81.366	Macaca_mulatta
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSMNEG00000041864	SRRT	72	81.529	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.180	ENSMLEG00000029479	SRRT	73	81.529	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000025124	srrt	75	59.414	ENSMAMG00000010681	-	79	58.902	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000025124	srrt	72	77.070	ENSMAMG00000014311	srrt	72	76.966	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000025124	srrt	75	59.205	ENSMZEG00005028002	-	78	60.000	Maylandia_zebra
ENSXETG00000025124	srrt	71	75.796	ENSMZEG00005016135	srrt	69	75.843	Maylandia_zebra
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.251	ENSMAUG00000011386	Srrt	89	72.258	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.344	ENSMICG00000009471	SRRT	73	80.124	Microcebus_murinus
ENSXETG00000025124	srrt	96	60.990	ENSMOCG00000001971	Srrt	89	72.473	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000025124	srrt	85	46.728	ENSMMOG00000011137	-	91	47.215	Mola_mola
ENSXETG00000025124	srrt	95	54.673	ENSMMOG00000016399	srrt	75	75.843	Mola_mola
ENSXETG00000025124	srrt	53	71.822	ENSMODG00000004862	SRRT	89	71.670	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000025124	srrt	75	76.786	ENSMALG00000018604	srrt	76	66.443	Monopterus_albus
ENSXETG00000025124	srrt	58	46.094	ENSMALG00000005567	-	84	48.827	Monopterus_albus
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.441	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	100	73.723	Mus_caroli
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.441	ENSMUSG00000037364	Srrt	99	73.723	Mus_musculus
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.559	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	100	74.088	Mus_pahari
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.441	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	100	73.723	Mus_spretus
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.178	ENSMPUG00000015839	SRRT	71	81.988	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSMLUG00000009975	SRRT	71	80.745	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.251	ENSNGAG00000023715	Srrt	71	89.796	Nannospalax_galili
ENSXETG00000025124	srrt	74	75.000	ENSNBRG00000019100	srrt	73	73.333	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000025124	srrt	95	55.112	ENSNLEG00000011987	SRRT	73	79.861	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000025124	srrt	72	62.366	ENSMEUG00000011941	SRRT	71	63.011	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000025124	srrt	63	80.916	ENSOPRG00000002502	-	67	80.916	Ochotona_princeps
ENSXETG00000025124	srrt	96	61.268	ENSODEG00000016856	SRRT	89	71.888	Octodon_degus
ENSXETG00000025124	srrt	75	57.197	ENSONIG00000016080	-	95	47.856	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000025124	srrt	71	78.981	ENSONIG00000004242	srrt	72	80.337	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000025124	srrt	75	76.966	ENSORLG00000008120	srrt	72	75.281	Oryzias_latipes
ENSXETG00000025124	srrt	81	76.966	ENSORLG00020003058	srrt	72	75.281	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000025124	srrt	81	76.966	ENSORLG00015008062	srrt	72	75.281	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000025124	srrt	92	48.481	ENSOMEG00000006963	-	96	49.529	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000025124	srrt	98	55.290	ENSOMEG00000003155	srrt	78	75.843	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSOGAG00000017242	SRRT	71	81.366	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.293	ENSOARG00000015645	SRRT	71	79.503	Ovis_aries
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.180	ENSPPAG00000041090	SRRT	72	81.529	Pan_paniscus
ENSXETG00000025124	srrt	96	61.358	ENSPPRG00000009557	SRRT	71	81.366	Panthera_pardus
ENSXETG00000025124	srrt	96	61.593	ENSPTIG00000014355	SRRT	71	81.366	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.180	ENSPTRG00000019511	SRRT	73	79.861	Pan_troglodytes
ENSXETG00000025124	srrt	83	74.841	ENSPANG00000020763	SRRT	72	81.529	Papio_anubis
ENSXETG00000025124	srrt	98	59.932	ENSPKIG00000005434	srrt	75	80.899	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000025124	srrt	70	75.497	ENSPKIG00000022212	-	73	75.410	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000025124	srrt	71	81.013	ENSPSIG00000016311	SRRT	81	81.461	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000025124	srrt	98	57.209	ENSPMGG00000002841	srrt	78	75.843	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000025124	srrt	96	62.089	ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.888	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000025124	srrt	79	60.248	ENSPMAG00000009614	-	73	60.084	Petromyzon_marinus
ENSXETG00000025124	srrt	73	80.124	ENSPCIG00000000816	SRRT	71	80.124	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000025124	srrt	96	50.610	ENSPFOG00000016554	-	96	48.118	Poecilia_formosa
ENSXETG00000025124	srrt	93	67.872	ENSPFOG00000005704	srrt	72	76.404	Poecilia_formosa
ENSXETG00000025124	srrt	72	76.433	ENSPLAG00000021992	srrt	71	76.404	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000025124	srrt	92	47.439	ENSPLAG00000004526	-	96	48.109	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000025124	srrt	93	67.660	ENSPMEG00000001182	srrt	79	76.404	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000025124	srrt	93	50.610	ENSPMEG00000001520	-	95	47.273	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000025124	srrt	95	54.027	ENSPREG00000022308	srrt	72	76.404	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000025124	srrt	84	59.570	ENSPPYG00000017432	SRRT	95	53.405	Pongo_abelii
ENSXETG00000025124	srrt	72	81.366	ENSPCAG00000001621	SRRT	72	81.366	Procavia_capensis
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.180	ENSPCOG00000025751	SRRT	71	81.366	Propithecus_coquereli
ENSXETG00000025124	srrt	53	67.957	ENSPVAG00000000834	SRRT	68	67.957	Pteropus_vampyrus
ENSXETG00000025124	srrt	71	75.796	ENSPNYG00000018710	srrt	72	75.843	Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000025124	srrt	65	77.987	ENSPNAG00000010629	srrt	71	74.444	Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000025124	srrt	53	65.659	ENSRNOG00000048277	AABR07035787.1	92	65.659	Rattus_norvegicus
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSRBIG00000035718	SRRT	72	81.529	Rhinopithecus_bieti
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSRROG00000030622	SRRT	73	81.529	Rhinopithecus_roxellana
ENSXETG00000025124	srrt	84	76.129	ENSSBOG00000033570	SRRT	72	80.892	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXETG00000025124	srrt	55	72.449	ENSSHAG00000007349	-	74	73.830	Sarcophilus_harrisii
ENSXETG00000025124	srrt	70	74.324	ENSSFOG00015017293	srrt	71	73.118	Scleropages_formosus
ENSXETG00000025124	srrt	95	55.217	ENSSMAG00000015342	srrt	76	76.966	Scophthalmus_maximus
ENSXETG00000025124	srrt	54	50.417	ENSSDUG00000002051	-	93	50.531	Seriola_dumerili
ENSXETG00000025124	srrt	72	76.433	ENSSDUG00000012049	srrt	74	76.404	Seriola_dumerili
ENSXETG00000025124	srrt	72	75.796	ENSSLDG00000017477	srrt	75	75.843	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXETG00000025124	srrt	64	59.804	ENSSPAG00000018943	-	93	52.891	Stegastes_partitus
ENSXETG00000025124	srrt	71	75.796	ENSSPAG00000005665	srrt	71	75.843	Stegastes_partitus
ENSXETG00000025124	srrt	80	74.720	ENSSSCG00000024789	SRRT	71	79.861	Sus_scrofa
ENSXETG00000025124	srrt	90	45.173	ENSTRUG00000000023	-	69	56.916	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000025124	srrt	74	76.404	ENSTRUG00000016075	srrt	73	74.719	Takifugu_rubripes
ENSXETG00000025124	srrt	92	42.024	ENSTNIG00000003111	-	71	56.871	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000025124	srrt	53	65.953	ENSTNIG00000011779	srrt	73	64.938	Tetraodon_nigroviridis
ENSXETG00000025124	srrt	58	84.783	ENSTBEG00000005212	SRRT	57	84.783	Tupaia_belangeri
ENSXETG00000025124	srrt	88	76.344	ENSTTRG00000011104	SRRT	71	80.745	Tursiops_truncatus
ENSXETG00000025124	srrt	95	61.810	ENSUAMG00000027997	SRRT	73	81.646	Ursus_americanus
ENSXETG00000025124	srrt	96	61.827	ENSUMAG00000011295	SRRT	71	81.366	Ursus_maritimus
ENSXETG00000025124	srrt	96	61.988	ENSVVUG00000023572	SRRT	71	81.366	Vulpes_vulpes
ENSXETG00000025124	srrt	55	47.401	ENSXCOG00000013105	-	91	47.872	Xiphophorus_couchianus
ENSXETG00000025124	srrt	72	57.940	ENSXMAG00000002090	-	96	47.462	Xiphophorus_maculatus
ENSXETG00000025124	srrt	74	78.652	ENSXMAG00000007627	srrt	79	76.966	Xiphophorus_maculatus