EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSXETG00000027042 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago3
Alias: -
Full Name: argonaute 3%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23883 bases
Position: chrGL172830.1:78038-101920
Accession: XB-GENE-6462752
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000009533	PAZ	PF02170.22	1e-28	1	1
ENSXETP00000009533	Piwi	PF02171.17	1.8e-113	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000009533	-	2577	-	ENSXETP00000009533	858 (aa)	-	F7D3A7

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000027042	ago3	99	84.742	ENSXETG00000004364	ago1	98	84.742
ENSXETG00000027042	ago3	99	70.930	ENSXETG00000009664	ago4	99	70.930
ENSXETG00000027042	ago3	99	78.953	ENSXETG00000023755	ago2	97	78.953

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.830	ENSG00000126070	AGO3	100	99.361	Homo_sapiens
ENSXETG00000027042	ago3	99	94.322	ENSAPOG00000014494	-	99	94.322	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000027042	ago3	99	97.196	ENSAPOG00000024260	ago3a	99	97.196	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.947	ENSAMEG00000000497	AGO3	99	98.947	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000027042	ago3	92	95.828	ENSACIG00000019272	AGO3	100	95.828	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000027042	ago3	92	97.724	ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.724	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000027042	ago3	99	97.196	ENSAOCG00000017642	ago3a	99	97.196	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000027042	ago3	53	89.873	ENSAOCG00000022538	-	90	89.873	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000027042	ago3	93	88.206	ENSAOCG00000017051	-	100	88.206	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000027042	ago3	99	96.408	ENSAPEG00000004375	ago3a	99	96.408	Amphiprion_percula
ENSXETG00000027042	ago3	99	94.090	ENSAPEG00000020249	-	99	94.090	Amphiprion_percula
ENSXETG00000027042	ago3	99	96.408	ENSATEG00000008458	ago3a	99	96.408	Anabas_testudineus
ENSXETG00000027042	ago3	99	94.090	ENSATEG00000005160	-	99	94.090	Anabas_testudineus
ENSXETG00000027042	ago3	100	98.952	ENSAPLG00000009642	AGO3	99	98.952	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000027042	ago3	99	99.181	ENSACAG00000003385	AGO3	99	99.181	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.830	ENSANAG00000037735	AGO3	99	98.830	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000027042	ago3	99	94.206	ENSACLG00000001965	-	99	94.206	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000027042	ago3	99	97.196	ENSACLG00000000963	ago3a	100	96.478	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000027042	ago3	92	95.575	ENSAMXG00000002198	ago3a	100	95.575	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000027042	ago3	92	94.311	ENSAMXG00000009571	ago3b	100	94.311	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.947	ENSBTAG00000018324	AGO3	99	98.947	Bos_taurus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.830	ENSCJAG00000031580	AGO3	99	98.830	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.830	ENSCAFG00000024682	AGO3	99	98.830	Canis_familiaris
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.947	ENSCAFG00020009051	AGO3	99	99.682	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.947	ENSCHIG00000011536	AGO3	99	98.947	Capra_hircus
ENSXETG00000027042	ago3	84	98.748	ENSTSYG00000011897	AGO3	99	98.748	Carlito_syrichta
ENSXETG00000027042	ago3	90	88.781	ENSCAPG00000011589	AGO3	99	88.781	Cavia_aperea
ENSXETG00000027042	ago3	99	95.322	ENSCPOG00000030524	AGO3	99	95.322	Cavia_porcellus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.830	ENSCCAG00000034189	AGO3	100	99.361	Cebus_capucinus
ENSXETG00000027042	ago3	100	98.485	ENSCATG00000029748	AGO3	100	99.361	Cercocebus_atys
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.947	ENSCLAG00000013184	AGO3	99	98.947	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.830	ENSCSAG00000001092	AGO3	99	98.830	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000027042	ago3	92	100.000	ENSCHOG00000011621	AGO3	91	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000027042	ago3	99	99.298	ENSCPBG00000018583	AGO3	99	99.298	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000027042	ago3	100	98.485	ENSCANG00000033258	AGO3	100	99.361	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.596	ENSCGRG00001024614	Ago3	99	98.596	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.596	ENSCGRG00000010670	Ago3	99	98.596	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000027042	ago3	92	97.092	ENSCSEG00000001040	ago3a	100	97.092	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000027042	ago3	92	89.888	ENSCSEG00000009788	-	100	89.888	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000027042	ago3	99	96.846	ENSCVAG00000018224	ago3a	99	96.846	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000027042	ago3	52	86.404	ENSCVAG00000011229	-	98	86.404	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000027042	ago3	99	95.444	ENSDARG00000063079	ago3b	99	95.444	Danio_rerio
ENSXETG00000027042	ago3	99	96.292	ENSDARG00000059888	ago3a	99	96.292	Danio_rerio
ENSXETG00000027042	ago3	88	98.805	ENSDNOG00000008106	AGO3	99	98.805	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.596	ENSDORG00000009414	Ago3	99	98.596	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000027042	ago3	85	98.310	ENSETEG00000007639	AGO3	89	98.310	Echinops_telfairi
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.947	ENSEASG00005012089	AGO3	99	98.947	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.947	ENSECAG00000023972	AGO3	99	98.947	Equus_caballus
ENSXETG00000027042	ago3	99	81.871	ENSEEUG00000007058	AGO3	99	81.871	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000027042	ago3	92	94.817	ENSELUG00000016755	ago3a	100	94.817	Esox_lucius
ENSXETG00000027042	ago3	99	93.478	ENSELUG00000001774	-	99	93.478	Esox_lucius
ENSXETG00000027042	ago3	73	99.361	ENSFCAG00000000747	-	100	99.361	Felis_catus
ENSXETG00000027042	ago3	100	98.836	ENSFALG00000000802	AGO3	99	98.836	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.946	ENSFDAG00000012874	AGO3	100	98.946	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000027042	ago3	99	92.923	ENSFHEG00000016205	-	99	92.923	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000027042	ago3	97	96.531	ENSGMOG00000013069	-	100	96.531	Gadus_morhua
ENSXETG00000027042	ago3	83	78.049	ENSGMOG00000019418	-	89	78.049	Gadus_morhua
ENSXETG00000027042	ago3	100	99.068	ENSGALG00000043711	AGO3	100	99.527	Gallus_gallus
ENSXETG00000027042	ago3	99	92.807	ENSGAFG00000015911	-	99	92.807	Gambusia_affinis
ENSXETG00000027042	ago3	99	97.079	ENSGAFG00000009808	ago3a	99	97.079	Gambusia_affinis
ENSXETG00000027042	ago3	97	95.096	ENSGACG00000002455	AGO3	100	95.096	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000027042	ago3	93	97.114	ENSGACG00000012453	ago3a	100	97.114	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000027042	ago3	99	99.181	ENSGAGG00000012887	AGO3	99	99.181	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.830	ENSGGOG00000036711	AGO3	99	98.830	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000027042	ago3	99	94.206	ENSHBUG00000017794	-	99	94.206	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000027042	ago3	89	95.584	ENSHBUG00000010542	ago3a	96	95.584	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.947	ENSHGLG00000012538	AGO3	99	98.947	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.472	ENSHGLG00100006043	AGO3	100	98.472	Heterocephalus_glaber_male
ENSXETG00000027042	ago3	87	95.979	ENSHCOG00000005674	ago3a	97	95.979	Hippocampus_comes
ENSXETG00000027042	ago3	99	93.279	ENSHCOG00000011851	AGO3	99	93.279	Hippocampus_comes
ENSXETG00000027042	ago3	99	94.786	ENSIPUG00000008548	ago3b	99	94.786	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000027042	ago3	99	91.930	ENSIPUG00000023241	ago3a	99	91.930	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000027042	ago3	99	94.269	ENSSTOG00000025904	AGO3	99	94.269	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.830	ENSJJAG00000017436	Ago3	99	98.830	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000027042	ago3	99	96.408	ENSKMAG00000019534	ago3a	99	96.408	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000027042	ago3	92	97.724	ENSLBEG00000007592	ago3a	100	97.724	Labrus_bergylta
ENSXETG00000027042	ago3	99	93.478	ENSLBEG00000016073	-	99	93.478	Labrus_bergylta
ENSXETG00000027042	ago3	100	98.488	ENSLAFG00000002744	AGO3	99	98.947	Loxodonta_africana
ENSXETG00000027042	ago3	100	98.485	ENSMFAG00000035610	AGO3	100	99.361	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.830	ENSMMUG00000006252	AGO3	99	99.678	Macaca_mulatta
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.830	ENSMNEG00000039518	AGO3	100	99.361	Macaca_nemestrina
ENSXETG00000027042	ago3	100	98.485	ENSMLEG00000027912	AGO3	100	99.361	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000027042	ago3	99	91.520	ENSMAMG00000008440	ago3a	100	96.839	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000027042	ago3	99	93.743	ENSMAMG00000005697	-	99	93.743	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000027042	ago3	99	94.322	ENSMZEG00005026243	-	99	94.322	Maylandia_zebra
ENSXETG00000027042	ago3	99	97.196	ENSMZEG00005007949	ago3a	100	96.478	Maylandia_zebra
ENSXETG00000027042	ago3	100	99.069	ENSMGAG00000003773	AGO3	99	99.069	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000027042	ago3	93	86.307	ENSMAUG00000010128	Ago3	96	86.432	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.947	ENSMICG00000016158	AGO3	99	98.947	Microcebus_murinus
ENSXETG00000027042	ago3	99	95.785	ENSMOCG00000020568	Ago3	99	95.785	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000027042	ago3	92	92.556	ENSMMOG00000018446	ago3a	100	92.556	Mola_mola
ENSXETG00000027042	ago3	92	93.552	ENSMMOG00000014065	-	100	93.552	Mola_mola
ENSXETG00000027042	ago3	99	99.064	ENSMODG00000017869	AGO3	99	99.064	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000027042	ago3	99	94.340	ENSMALG00000010895	ago3a	99	94.340	Monopterus_albus
ENSXETG00000027042	ago3	99	92.689	ENSMALG00000014658	-	99	92.689	Monopterus_albus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.363	MGP_CAROLIEiJ_G0026477	Ago3	99	98.363	Mus_caroli
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.129	ENSMUSG00000028842	Ago3	99	98.129	Mus_musculus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.363	MGP_PahariEiJ_G0028808	Ago3	99	98.363	Mus_pahari
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.480	MGP_SPRETEiJ_G0027456	Ago3	99	98.480	Mus_spretus
ENSXETG00000027042	ago3	73	99.201	ENSMLUG00000009668	AGO3	100	99.201	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.596	ENSNGAG00000012607	Ago3	99	98.596	Nannospalax_galili
ENSXETG00000027042	ago3	92	95.702	ENSNBRG00000015687	AGO3	100	95.702	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000027042	ago3	92	88.679	ENSNBRG00000010936	ago3a	100	88.679	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000027042	ago3	100	94.172	ENSNLEG00000027092	AGO3	99	94.172	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000027042	ago3	87	86.615	ENSMEUG00000009200	AGO3	91	86.615	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000027042	ago3	81	100.000	ENSOPRG00000012344	AGO3	81	100.000	Ochotona_princeps
ENSXETG00000027042	ago3	100	98.834	ENSODEG00000005161	AGO3	100	98.946	Octodon_degus
ENSXETG00000027042	ago3	99	95.205	ENSONIG00000013760	AGO3	99	95.205	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000027042	ago3	99	97.079	ENSONIG00000016349	ago3a	99	97.079	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000027042	ago3	99	99.410	ENSOANG00000002078	AGO3	100	99.410	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXETG00000027042	ago3	99	98.947	ENSOCUG00000006255	AGO3	99	98.947	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000027042	ago3	92	97.851	ENSORLG00000015016	ago3a	100	97.851	Oryzias_latipes
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ENSXETG00000027042	ago3	92	97.851	ENSORLG00015000087	ago3a	100	97.851	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000027042	ago3	99	92.757	ENSORLG00015006205	-	99	92.757	Oryzias_latipes_hsok
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ENSXETG00000027042	ago3	99	94.902	ENSSLDG00000006859	-	100	96.207	Seriola_lalandi_dorsalis
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