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Description

Ensembl ID: ENSXETG00000031930 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xenopus_tropicalis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30271 bases
Position: chrGL172771.1:2049695-2079965
Accession: 22973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXETP00000046657	ResIII	PF04851.15	2.9e-07	1	1
ENSXETP00000060567	ResIII	PF04851.15	4.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXETT00000046657	SBNO1-201	4185	-	ENSXETP00000046657	1394 (aa)	-	F6YBA0
ENSXETT00000063499	SBNO1-202	2352	-	ENSXETP00000060567	784 (aa)	-	F6YE67

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSXETG00000031930	SBNO1	81	53.133	ENSXETG00000021579	sbno2	96	52.797

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.214	ENSG00000139697	SBNO1	99	82.181	Homo_sapiens
ENSXETG00000031930	SBNO1	83	81.466	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	81.983	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.018	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	82.303	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.265	ENSACIG00000008088	sbno1	99	72.477	Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000031930	SBNO1	91	80.826	ENSAOCG00000014859	sbno1	98	73.343	Amphiprion_ocellaris
ENSXETG00000031930	SBNO1	91	80.826	ENSAPEG00000006069	sbno1	98	73.343	Amphiprion_percula
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	73.628	ENSATEG00000006667	sbno1	99	73.752	Anabas_testudineus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.618	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	83.131	Anas_platyrhynchos
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	79.674	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	79.759	Anolis_carolinensis
ENSXETG00000031930	SBNO1	94	92.727	ENSANAG00000029958	-	99	91.950	Aotus_nancymaae
ENSXETG00000031930	SBNO1	83	80.858	ENSACLG00000024913	sbno1	90	81.631	Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	74.859	ENSAMXG00000019473	sbno1	99	75.634	Astyanax_mexicanus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.143	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	82.441	Bos_taurus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.084	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	82.051	Callithrix_jacchus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.077	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	93.849	Canis_familiaris
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	90.018	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	90.018	Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	91.281	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	91.281	Capra_hircus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.345	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	84.848	Carlito_syrichta
ENSXETG00000031930	SBNO1	89	91.622	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	91.622	Cavia_aperea
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	91.622	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	91.622	Cavia_porcellus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	77.746	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	80.392	Cebus_capucinus
ENSXETG00000031930	SBNO1	92	92.780	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	92.780	Cercocebus_atys
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	91.800	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	91.800	Chinchilla_lanigera
ENSXETG00000031930	SBNO1	83	90.300	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	90.240	Chlorocebus_sabaeus
ENSXETG00000031930	SBNO1	96	79.452	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	79.452	Choloepus_hoffmanni
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	81.987	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	82.487	Chrysemys_picta_bellii
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	77.746	ENSCANG00000042688	-	99	77.295	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	90.909	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	90.909	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	90.909	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	90.909	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	71.288	ENSCSEG00000011919	sbno1	91	81.507	Cynoglossus_semilaevis
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.082	ENSCVAG00000007038	sbno1	99	72.440	Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	75.427	ENSDARG00000099080	sbno1	99	76.106	Danio_rerio
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	86.389	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	87.023	Dasypus_novemcinctus
ENSXETG00000031930	SBNO1	96	87.852	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	88.095	Dipodomys_ordii
ENSXETG00000031930	SBNO1	93	83.912	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	83.912	Echinops_telfairi
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	59.873	ENSEBUG00000013823	sbno1	81	69.643	Eptatretus_burgeri
ENSXETG00000031930	SBNO1	71	90.892	ENSEASG00005012595	-	92	75.424	Equus_asinus_asinus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.416	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	83.112	Equus_caballus
ENSXETG00000031930	SBNO1	83	88.398	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	88.398	Erinaceus_europaeus
ENSXETG00000031930	SBNO1	92	82.348	ENSELUG00000002886	sbno1	99	74.789	Esox_lucius
ENSXETG00000031930	SBNO1	100	82.077	ENSFCAG00000015331	SBNO1	100	82.361	Felis_catus
ENSXETG00000031930	SBNO1	98	82.811	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	83.131	Ficedula_albicollis
ENSXETG00000031930	SBNO1	94	88.727	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	87.857	Fukomys_damarensis
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	71.860	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	72.810	Fundulus_heteroclitus
ENSXETG00000031930	SBNO1	87	80.049	ENSGMOG00000018229	sbno1	93	79.806	Gadus_morhua
ENSXETG00000031930	SBNO1	86	89.482	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	81.921	Gallus_gallus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	73.286	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	73.590	Gambusia_affinis
ENSXETG00000031930	SBNO1	87	80.640	ENSGACG00000015633	sbno1	92	79.967	Gasterosteus_aculeatus
ENSXETG00000031930	SBNO1	97	92.473	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	92.473	Gopherus_agassizii
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	92.599	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	92.599	Gorilla_gorilla
ENSXETG00000031930	SBNO1	83	74.229	ENSHBUG00000011910	sbno1	89	75.000	Haplochromis_burtoni
ENSXETG00000031930	SBNO1	94	92.909	ENSHGLG00000014165	-	99	91.771	Heterocephalus_glaber_female
ENSXETG00000031930	SBNO1	78	85.658	ENSHCOG00000003246	sbno1	85	85.658	Hippocampus_comes
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	75.088	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	75.442	Ictalurus_punctatus
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	91.800	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	91.800	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	87.344	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	87.344	Jaculus_jaculus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.772	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	73.258	Kryptolebias_marmoratus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	73.282	ENSLBEG00000007623	sbno1	99	73.529	Labrus_bergylta
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	75.960	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	78.722	Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	77.321	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	77.605	Lepisosteus_oculatus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	81.987	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	82.357	Loxodonta_africana
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	88.889	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	88.889	Macaca_fascicularis
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	88.889	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	88.889	Macaca_mulatta
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	91.979	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	91.979	Mandrillus_leucophaeus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	73.167	ENSMAMG00000005473	sbno1	99	73.258	Mastacembelus_armatus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.690	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	83.131	Meleagris_gallopavo
ENSXETG00000031930	SBNO1	70	91.667	ENSMAUG00000004834	-	99	75.753	Mesocricetus_auratus
ENSXETG00000031930	SBNO1	94	89.818	ENSMICG00000006573	-	99	89.088	Microcebus_murinus
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	91.444	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	91.444	Microtus_ochrogaster
ENSXETG00000031930	SBNO1	87	77.896	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	70.836	Mola_mola
ENSXETG00000031930	SBNO1	100	82.432	ENSMODG00000012470	SBNO1	99	82.788	Monodelphis_domestica
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.414	ENSMALG00000001056	sbno1	99	72.261	Monopterus_albus
ENSXETG00000031930	SBNO1	100	82.168	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	95.175	Mus_caroli
ENSXETG00000031930	SBNO1	100	82.286	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	95.175	Mus_musculus
ENSXETG00000031930	SBNO1	100	82.500	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	95.175	Mus_pahari
ENSXETG00000031930	SBNO1	100	82.286	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	95.175	Mus_spretus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.336	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	82.621	Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	81.701	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	81.571	Myotis_lucifugus
ENSXETG00000031930	SBNO1	92	92.843	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	92.843	Nannospalax_galili
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	71.868	ENSNBRG00000019189	sbno1	99	72.727	Neolamprologus_brichardi
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	83.422	ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	87.452	Nomascus_leucogenys
ENSXETG00000031930	SBNO1	89	69.448	ENSMEUG00000008768	-	93	79.290	Notamacropus_eugenii
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	80.385	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	80.542	Ochotona_princeps
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	91.444	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	91.444	Octodon_degus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.101	ENSONIG00000015348	sbno1	99	72.721	Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000031930	SBNO1	98	81.858	ENSOCUG00000002441	SBNO1	94	81.627	Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000031930	SBNO1	87	80.000	ENSORLG00000001593	sbno1	99	72.753	Oryzias_latipes
ENSXETG00000031930	SBNO1	87	80.329	ENSORLG00020015216	sbno1	99	72.963	Oryzias_latipes_hni
ENSXETG00000031930	SBNO1	94	80.066	ENSORLG00015002726	sbno1	99	72.874	Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000031930	SBNO1	87	80.741	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	73.282	Oryzias_melastigma
ENSXETG00000031930	SBNO1	69	89.961	ENSOGAG00000010781	-	99	73.601	Otolemur_garnettii
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.013	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	82.311	Ovis_aries
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	92.780	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	92.780	Pan_paniscus
ENSXETG00000031930	SBNO1	100	82.077	ENSPPRG00000022092	SBNO1	100	82.361	Panthera_pardus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	81.838	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	82.265	Panthera_tigris_altaica
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	92.599	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	92.599	Pan_troglodytes
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	91.979	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	91.979	Papio_anubis
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	77.033	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	77.104	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	81.540	ENSPSIG00000009572	-	99	82.194	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000031930	SBNO1	98	72.066	ENSPSIG00000009256	-	100	78.516	Pelodiscus_sinensis
ENSXETG00000031930	SBNO1	60	81.950	ENSPMGG00000017196	sbno1	92	83.475	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXETG00000031930	SBNO1	95	90.909	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	90.909	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXETG00000031930	SBNO1	100	82.303	ENSPCIG00000010985	SBNO1	100	82.504	Phascolarctos_cinereus
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.766	ENSPFOG00000005069	sbno1	99	73.193	Poecilia_formosa
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.625	ENSPLAG00000015015	sbno1	99	72.886	Poecilia_latipinna
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.753	ENSPMEG00000021212	sbno1	99	73.179	Poecilia_mexicana
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.484	ENSPREG00000017746	sbno1	99	72.982	Poecilia_reticulata
ENSXETG00000031930	SBNO1	99	82.071	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	82.038	Pongo_abelii
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