EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • PPI
  • Paralogs
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSXETG00000034308 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
-
Alias
-
Full Name
-
Gene Type
protein_coding
Species
Xenopus_tropicalis
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
1293 bases
Position
chrGL172807.1:865259-866551
Accession
-
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSXETP00000058888Exo_endo_phosPF03372.233.3e-0611
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSXETT00000062894-1074-ENSXETP00000058888358 (aa)-F6VYW4
Gene Model
Click here to download ENSXETG00000034308's gene model file
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXETG00000034308's network
Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSXETG00000034308-6246.903ENSXETG00000027501-9446.903
ENSXETG00000034308-6233.333ENSXETG00000034353-9933.333
ENSXETG00000034308-8631.613ENSXETG00000031859-9131.214
ENSXETG00000034308-9234.848ENSXETG00000033331-8534.848
ENSXETG00000034308-9331.858ENSXETG00000033336-7331.593
ENSXETG00000034308-9932.603ENSXETG00000030050-9532.603
ENSXETG00000034308-9131.611ENSXETG00000034095-7331.611
ENSXETG00000034308-9733.523ENSXETG00000030588-8633.523
ENSXETG00000034308-9932.133ENSXETG00000031025-8732.133
ENSXETG00000034308-6532.618ENSXETG00000034013-9932.618
ENSXETG00000034308-6541.880ENSXETG00000017444-9841.880
ENSXETG00000034308-9831.742ENSXETG00000031921-8431.742
ENSXETG00000034308-6635.443ENSXETG00000033389-9935.443
ENSXETG00000034308-9435.398ENSXETG00000020006-8035.398
ENSXETG00000034308-9234.024ENSXETG00000034113-8634.024
ENSXETG00000034308-9738.617ENSXETG00000024962-8638.617
ENSXETG00000034308-9633.616ENSXETG00000002398-9033.616
ENSXETG00000034308-9733.051ENSXETG00000033090-8434.085
ENSXETG00000034308-9832.493ENSXETG00000032998-7932.493
ENSXETG00000034308-9131.692ENSXETG00000033886-9632.822
ENSXETG00000034308-9632.857ENSXETG00000031978-9132.857
ENSXETG00000034308-8435.216ENSXETG00000031573-7234.783
ENSXETG00000034308-9730.398ENSXETG00000026296-8330.398
ENSXETG00000034308-9231.737ENSXETG00000031405-6931.737
ENSXETG00000034308-6633.755ENSXETG00000031403-9833.755
ENSXETG00000034308-9132.219ENSXETG00000033118-7132.164
ENSXETG00000034308-9731.921ENSXETG00000031835-8731.921
ENSXETG00000034308-9332.733ENSXETG00000010370-8232.733
ENSXETG00000034308-6634.177ENSXETG00000030935-9934.177
ENSXETG00000034308-8534.539ENSXETG00000008562-8132.628
ENSXETG00000034308-9933.518ENSXETG00000032834-8733.518
ENSXETG00000034308-5835.577ENSXETG00000032507-9935.577
ENSXETG00000034308-9630.286ENSXETG00000031779-7230.286
ENSXETG00000034308-8531.803ENSXETG00000033289-8231.378
ENSXETG00000034308-9730.086ENSXETG00000032316-7730.086
ENSXETG00000034308-9830.986ENSXETG00000033205-7830.986
ENSXETG00000034308-9932.865ENSXETG00000031547-8732.865
ENSXETG00000034308-9832.768ENSXETG00000032474-8532.768
ENSXETG00000034308-9234.848ENSXETG00000023159-9634.848
ENSXETG00000034308-6634.599ENSXETG00000030794-9834.599
ENSXETG00000034308-8532.468ENSXETG00000031893-7232.468
ENSXETG00000034308-9731.519ENSXETG00000030277-9231.339
ENSXETG00000034308-6230.045ENSXETG00000032742-6930.045
ENSXETG00000034308-9730.086ENSXETG00000032920-7730.086
ENSXETG00000034308-6635.865ENSXETG00000032028-9935.865
ENSXETG00000034308-9433.138ENSXETG00000003659-8333.138
ENSXETG00000034308-9534.561ENSXETG00000030078-8434.384
ENSXETG00000034308-7230.502ENSXETG00000031067-7030.502
ENSXETG00000034308-9732.295ENSXETG00000032180-9332.295
ENSXETG00000034308-9132.219ENSXETG00000031237-7132.164
ENSXETG00000034308-9735.429ENSXETG00000023937-8535.429
ENSXETG00000034308-9830.986ENSXETG00000031387-7830.986
ENSXETG00000034308-9831.268ENSXETG00000031651-8031.268
ENSXETG00000034308-8634.076ENSXETG00000019951-8034.076
ENSXETG00000034308-6636.441ENSXETG00000025636-9936.441
ENSXETG00000034308-9834.091ENSXETG00000031844-8634.091
ENSXETG00000034308-8533.981ENSXETG00000030293-7333.981
ENSXETG00000034308-9131.212ENSXETG00000033765-7331.212
ENSXETG00000034308-8534.426ENSXETG00000033763-7434.426
ENSXETG00000034308-6634.874ENSXETG00000031013-9934.874
ENSXETG00000034308-9732.676ENSXETG00000034064-7832.676
ENSXETG00000034308-8932.087ENSXETG00000030767-7232.087
ENSXETG00000034308-6637.238ENSXETG00000026017-9937.238
ENSXETG00000034308-9235.152ENSXETG00000026477-7935.152
ENSXETG00000034308-9132.219ENSXETG00000031161-7132.164
ENSXETG00000034308-9933.051ENSXETG00000033292-8633.051
ENSXETG00000034308-9431.845ENSXETG00000033299-8031.845
ENSXETG00000034308-9531.897ENSXETG00000030408-8531.897
ENSXETG00000034308-6230.045ENSXETG00000033487-6930.045
ENSXETG00000034308-9435.693ENSXETG00000033739-7935.693
ENSXETG00000034308-9432.440ENSXETG00000030615-8232.440
ENSXETG00000034308-9732.578ENSXETG00000032168-8432.578
ENSXETG00000034308-9732.958ENSXETG00000031535-7832.958
ENSXETG00000034308-9435.398ENSXETG00000025558-8035.398
ENSXETG00000034308-9831.335ENSXETG00000032876-9031.335
ENSXETG00000034308-9732.571ENSXETG00000032871-8832.571
ENSXETG00000034308-9933.051ENSXETG00000033835-8633.051
ENSXETG00000034308-8632.581ENSXETG00000032090-6332.581
ENSXETG00000034308-9632.295ENSXETG00000031821-9132.295
ENSXETG00000034308-6635.593ENSXETG00000032255-9935.593
ENSXETG00000034308-9835.143ENSXETG00000032017-7835.143
ENSXETG00000034308-9733.429ENSXETG00000027781-8933.429
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSXETG00000034308-9730.114ENSAPOG00000016904-8530.114Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000034308-7230.038ENSAPOG00000021898-5630.038Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000034308-9830.704ENSAPOG00000010713-8830.704Acanthochromis_polyacanthus
ENSXETG00000034308-8930.745ENSACIG00000012844-7730.745Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000034308-9430.769ENSACIG00000008906-7430.769Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000034308-9631.487ENSACIG00000019184-8231.487Amphilophus_citrinellus
ENSXETG00000034308-8830.408ENSACAG00000022781-6730.408Anolis_carolinensis
ENSXETG00000034308-9231.105ENSACAG00000026942-6831.105Anolis_carolinensis
ENSXETG00000034308-9030.650ENSACAG00000024977-6330.650Anolis_carolinensis
ENSXETG00000034308-9232.024ENSACAG00000010540-7932.024Anolis_carolinensis
ENSXETG00000034308-9330.233ENSACAG00000025708-8930.233Anolis_carolinensis
ENSXETG00000034308-9130.183ENSACAG00000023809-6830.183Anolis_carolinensis
ENSXETG00000034308-8231.544ENSACAG00000022260-6531.544Anolis_carolinensis
ENSXETG00000034308-9731.624ENSACAG00000022659-9231.624Anolis_carolinensis
ENSXETG00000034308-9330.422ENSACLG00000001415-7430.422Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000034308-9731.232ENSACLG00000004195-8231.232Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000034308-9731.805ENSACLG00000003105-7531.805Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000034308-7832.014ENSACLG00000027777-9632.014Astatotilapia_calliptera
ENSXETG00000034308-9930.508ENSCAFG00020005033-5330.508Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000034308-9931.356ENSCAFG00020005832-5331.356Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000034308-9930.791ENSCAFG00020025733-5230.791Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000034308-9931.356ENSCAFG00020025686-5331.356Canis_lupus_dingo
ENSXETG00000034308-9530.372ENSCVAG00000008582-7630.372Cyprinodon_variegatus
ENSXETG00000034308-7330.798ENSECAG00000034796-8730.798Equus_caballus
ENSXETG00000034308-9831.742ENSECAG00000001832-5131.742Equus_caballus
ENSXETG00000034308-9830.878ENSECAG00000003040-5130.878Equus_caballus
ENSXETG00000034308-9331.454ENSLACG00000001984-8531.454Latimeria_chalumnae
ENSXETG00000034308-6831.405ENSMMUG00000040023-9031.405Macaca_mulatta
ENSXETG00000034308-9831.445ENSMMUG00000029743-9331.445Macaca_mulatta
ENSXETG00000034308-8431.023ENSMMUG00000039873-9831.023Macaca_mulatta
ENSXETG00000034308-8132.759ENSMZEG00005026934-9932.759Maylandia_zebra
ENSXETG00000034308-8231.507ENSMZEG00005021840-6831.507Maylandia_zebra
ENSXETG00000034308-9431.343ENSMZEG00005017035-8631.343Maylandia_zebra
ENSXETG00000034308-7233.205ENSMZEG00005015499-9233.205Maylandia_zebra
ENSXETG00000034308-9730.372ENSMZEG00005016749-8030.372Maylandia_zebra
ENSXETG00000034308-8330.000ENSMODG00000027902-9830.000Monodelphis_domestica
ENSXETG00000034308-9630.259ENSMUSG00000094030Gm218336830.259Mus_musculus
ENSXETG00000034308-9930.337ENSMPUG00000018497-8530.337Mustela_putorius_furo
ENSXETG00000034308-8031.597ENSONIG00000021276-9931.597Oreochromis_niloticus
ENSXETG00000034308-6531.197ENSOCUG00000029503-9731.197Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000034308-9831.250ENSOCUG00000029537-5331.250Oryctolagus_cuniculus
ENSXETG00000034308-6835.246ENSORLG00015009902-8235.246Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000034308-5330.688ENSORLG00015005588-6430.688Oryzias_latipes_hsok
ENSXETG00000034308-6730.544ENSPANG00000033689-9630.544Papio_anubis
ENSXETG00000034308-9132.024ENSPNYG00000002207-9732.024Pundamilia_nyererei
ENSXETG00000034308-9530.294ENSPNAG00000016867-8030.294Pygocentrus_nattereri
ENSXETG00000034308-9731.609ENSSDUG00000018238-9531.609Seriola_dumerili
ENSXETG00000034308-9732.764ENSSPAG00000002492-9132.764Stegastes_partitus
ENSXETG00000034308-9931.921ENSVVUG00000014466-5131.921Vulpes_vulpes
ENSXETG00000034308-9931.638ENSVVUG00000006739-5031.638Vulpes_vulpes
ENSXETG00000034308-9931.356ENSVVUG00000018154-5231.356Vulpes_vulpes
ENSXETG00000034308-9730.000ENSXCOG00000009068-7830.000Xiphophorus_couchianus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us