EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSXMAG00000000490 (Gene tree)
Gene ID: 102227278
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_maculatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4911 bases
Position: chr11:4136538-4141448
Accession: 102227278
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXMAP00000000485	RRM_1	PF00076.22	2e-15	1	2
ENSXMAP00000000485	RRM_1	PF00076.22	2e-15	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXMAT00000000487	-	1305	XM_005805984	ENSXMAP00000000485	434 (aa)	XP_005806041	M3ZE43

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.761	ENSG00000102241	HTATSF1	100	60.593	Homo_sapiens
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	81.696	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	81.696	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	79.075	ENSACIG00000020459	htatsf1	99	81.556	Amphilophus_citrinellus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	79.085	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	79.521	Amphiprion_ocellaris
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	79.605	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	80.482	Amphiprion_percula
ENSXMAG00000000490	htatsf1	94	81.340	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	81.340	Anabas_testudineus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	91	63.923	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	65.534	Anas_platyrhynchos
ENSXMAG00000000490	htatsf1	80	63.158	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	61.069	Anolis_carolinensis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	79.515	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	80.396	Astatotilapia_calliptera
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	69.444	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	70.933	Astyanax_mexicanus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	98	58.391	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	51	63.802	Bos_taurus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	78	40.173	WBGene00022025	Y65B4A.1	77	39.155	Caenorhabditis_elegans
ENSXMAG00000000490	htatsf1	81	66.201	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	50	66.667	Callithrix_jacchus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	66.406	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	66.406	Canis_familiaris
ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	66.406	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	50	66.927	Capra_hircus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	66.053	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	50	66.230	Carlito_syrichta
ENSXMAG00000000490	htatsf1	81	64.722	ENSCCAG00000025329	-	55	64.921	Cebus_capucinus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	81	65.642	ENSCCAG00000022701	-	50	66.138	Cebus_capucinus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.489	ENSCATG00000029963	HTATSF1	50	66.150	Cercocebus_atys
ENSXMAG00000000490	htatsf1	92	62.136	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	62.136	Chinchilla_lanigera
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.489	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	50	66.150	Chlorocebus_sabaeus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	63.311	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	63.229	Chrysemys_picta_bellii
ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	44.947	ENSCING00000005914	-	90	44.681	Ciona_intestinalis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	89	45.777	ENSCSAVG00000000371	-	93	44.959	Ciona_savignyi
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.489	ENSCANG00000028495	HTATSF1	50	66.150	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	87.387	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	87.387	Cyprinodon_variegatus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	69.536	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	69.316	Danio_rerio
ENSXMAG00000000490	htatsf1	87	45.220	FBgn0037081	barc	69	45.269	Drosophila_melanogaster
ENSXMAG00000000490	htatsf1	89	54.768	ENSEBUG00000001534	htatsf1	81	55.501	Eptatretus_burgeri
ENSXMAG00000000490	htatsf1	90	64.322	ENSEASG00005003440	HTATSF1	50	64.339	Equus_asinus_asinus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	90	64.322	ENSECAG00000009156	HTATSF1	50	64.339	Equus_caballus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	64.847	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	67.102	Esox_lucius
ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	65.104	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	50	65.195	Felis_catus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	62.281	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	62.281	Ficedula_albicollis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	97	62.238	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	56	62.238	Fukomys_damarensis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	88.565	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	88.565	Fundulus_heteroclitus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	77.247	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	77.247	Gadus_morhua
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	63.111	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	64.000	Gallus_gallus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	93.468	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	93.468	Gambusia_affinis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	77.778	ENSGACG00000020459	htatsf1	99	77.778	Gasterosteus_aculeatus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.761	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	50	66.237	Gorilla_gorilla
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	79.956	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	80.837	Haplochromis_burtoni
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	71.982	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	71.847	Hippocampus_comes
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	67.527	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	67.100	Ictalurus_punctatus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.479	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	65.974	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	84.633	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	84.633	Kryptolebias_marmoratus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	78.049	ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	78.761	Labrus_bergylta
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	62.585	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	62.585	Latimeria_chalumnae
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	46.421	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.591	Lepisosteus_oculatus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	66.146	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.802	Loxodonta_africana
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.489	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	50	66.150	Macaca_fascicularis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.489	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	50	66.150	Macaca_mulatta
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.489	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	65.979	Macaca_nemestrina
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.489	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	50	66.150	Mandrillus_leucophaeus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	78.555	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	78.555	Mastacembelus_armatus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	79.736	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	80.617	Maylandia_zebra
ENSXMAG00000000490	htatsf1	94	63.700	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	99	64.637	Meleagris_gallopavo
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	66.116	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	66.580	Mesocricetus_auratus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	91	62.592	ENSMICG00000009348	HTATSF1	53	62.592	Microcebus_murinus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.840	ENSMOCG00000023007	-	50	66.146	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	64.835	ENSMOCG00000022370	-	50	65.365	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	78.475	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	78.475	Mola_mola
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	63.901	ENSMODG00000014087	-	98	63.901	Monodelphis_domestica
ENSXMAG00000000490	htatsf1	56	64.032	ENSMODG00000000199	-	91	62.069	Monodelphis_domestica
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	77.506	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	77.506	Monopterus_albus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.385	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	65.885	Mus_caroli
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	64.835	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	50	65.195	Mus_musculus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	94	59.427	ENSMLUG00000009234	-	57	59.189	Myotis_lucifugus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.014	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	65.707	Nannospalax_galili
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	79.425	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	80.310	Neolamprologus_brichardi
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.489	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	50	65.979	Nomascus_leucogenys
ENSXMAG00000000490	htatsf1	89	66.158	ENSMEUG00000004133	-	93	66.158	Notamacropus_eugenii
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	80.617	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	81.278	Oreochromis_niloticus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	91	61.707	ENSOANG00000011674	-	99	61.707	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	77.093	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	77.093	Oryzias_latipes
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	76.974	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	76.974	Oryzias_latipes_hni
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	77.434	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	77.434	Oryzias_latipes_hsok
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	78.808	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	78.808	Oryzias_melastigma
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.761	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	50	66.237	Pan_paniscus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	65.714	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	50	65.714	Panthera_pardus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.761	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	50	66.237	Pan_troglodytes
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	68.527	ENSPKIG00000024852	htatsf1	100	68.527	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXMAG00000000490	htatsf1	79	67.507	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	98	67.697	Pelodiscus_sinensis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	73.171	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	73.171	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	66.116	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	65.722	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXMAG00000000490	htatsf1	96	62.118	ENSPCIG00000030173	-	89	65.903	Phascolarctos_cinereus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	58.239	ENSPCIG00000018896	-	99	58.691	Phascolarctos_cinereus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	94.820	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	94.820	Poecilia_formosa
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	94.369	ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	94.369	Poecilia_latipinna
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	94.820	ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	94.820	Poecilia_mexicana
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	95.270	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	95.270	Poecilia_reticulata
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.489	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	50	65.979	Pongo_abelii
ENSXMAG00000000490	htatsf1	88	59.079	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	53	59.079	Procavia_capensis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.205	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	50	66.057	Propithecus_coquereli
ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	64.491	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	64.491	Pteropus_vampyrus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	79.515	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	80.396	Pundamilia_nyererei
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	70.474	ENSPNAG00000006166	htatsf1	99	71.336	Pygocentrus_nattereri
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	65.489	ENSRROG00000021939	HTATSF1	50	65.979	Rhinopithecus_roxellana
ENSXMAG00000000490	htatsf1	81	65.922	ENSSBOG00000027186	-	50	66.402	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	88	66.581	ENSSHAG00000006440	-	94	69.022	Sarcophilus_harrisii
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	61.384	ENSSHAG00000018908	-	98	61.384	Sarcophilus_harrisii
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	62.232	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.232	Scleropages_formosus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	75.991	ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	75.551	Scophthalmus_maximus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	77.181	ENSSDUG00000020002	htatsf1	99	76.957	Seriola_dumerili
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	81.069	ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	81.069	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	91	61.179	ENSSARG00000005193	HTATSF1	55	60.934	Sorex_araneus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	60.526	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	60.659	Sphenodon_punctatus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	81.099	ENSSPAG00000000732	htatsf1	99	81.978	Stegastes_partitus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	66.301	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	66.234	Sus_scrofa
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	62.168	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	99	62.168	Taeniopygia_guttata
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	75.506	ENSTRUG00000013383	htatsf1	100	75.281	Takifugu_rubripes
ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	75.676	ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	75.676	Tetraodon_nigroviridis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	78	65.230	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	65.230	Tursiops_truncatus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	65.104	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	65.104	Ursus_americanus
ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	59.775	ENSXETG00000019749	htatsf1	85	59.775	Xenopus_tropicalis
ENSXMAG00000000490	htatsf1	97	95.227	ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	95.227	Xiphophorus_couchianus