EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXMAG00000004236 (Gene tree)
Gene ID: 102216827
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_maculatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 49748 bases
Position: chr8:17244487-17294234
Accession: 102216827
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXMAP00000037572	MIF4G	PF02854.19	1.2e-26	1	1
ENSXMAP00000032052	MIF4G	PF02854.19	1.3e-26	1	1
ENSXMAP00000004240	MIF4G	PF02854.19	1.4e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXMAT00000025657	-	6505	XM_023338569	ENSXMAP00000032052	675 (aa)	XP_023194337	UPI0003B73CFE
ENSXMAT00000038329	-	1827	-	ENSXMAP00000037572	608 (aa)	-	-
ENSXMAT00000004245	-	6586	XM_014468641	ENSXMAP00000004240	702 (aa)	XP_014324127	M3ZPU7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.085	ENSG00000134030	CTIF	100	64.029	Homo_sapiens
ENSXMAG00000004236	ctif	100	71.774	ENSAPOG00000020192	ctif	100	72.419	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000004236	ctif	89	56.530	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	55.216	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXMAG00000004236	ctif	100	78.895	ENSACIG00000017099	ctif	100	77.589	Amphilophus_citrinellus
ENSXMAG00000004236	ctif	100	67.847	ENSAOCG00000014275	ctif	89	89.474	Amphiprion_ocellaris
ENSXMAG00000004236	ctif	100	81.534	ENSAPEG00000016975	ctif	100	80.889	Amphiprion_percula
ENSXMAG00000004236	ctif	100	81.241	ENSATEG00000016752	ctif	100	79.734	Anabas_testudineus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.824	ENSACAG00000018006	CTIF	99	55.045	Anolis_carolinensis
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.085	ENSANAG00000024925	CTIF	99	56.940	Aotus_nancymaae
ENSXMAG00000004236	ctif	100	80.769	ENSACLG00000005956	ctif	100	79.259	Astatotilapia_calliptera
ENSXMAG00000004236	ctif	90	72.963	ENSAMXG00000015964	ctif	100	62.151	Astyanax_mexicanus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.278	ENSBTAG00000018901	CTIF	99	56.439	Bos_taurus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.680	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	56.535	Callithrix_jacchus
ENSXMAG00000004236	ctif	97	57.212	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	56.672	Canis_familiaris
ENSXMAG00000004236	ctif	97	57.212	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	56.672	Canis_lupus_dingo
ENSXMAG00000004236	ctif	99	56.693	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	55.608	Capra_hircus
ENSXMAG00000004236	ctif	92	54.325	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	53.043	Carlito_syrichta
ENSXMAG00000004236	ctif	99	52.950	ENSCAPG00000011865	CTIF	95	57.831	Cavia_aperea
ENSXMAG00000004236	ctif	99	56.836	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	55.710	Cavia_porcellus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.746	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	56.604	Cebus_capucinus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.085	ENSCATG00000038134	CTIF	99	56.940	Cercocebus_atys
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.746	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	56.447	Chinchilla_lanigera
ENSXMAG00000004236	ctif	99	56.662	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	55.538	Chlorocebus_sabaeus
ENSXMAG00000004236	ctif	89	89.583	ENSCPBG00000025654	CTIF	73	89.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.746	ENSCANG00000030916	CTIF	99	56.918	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	59.750	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	58.399	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXMAG00000004236	ctif	99	55.204	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	54.091	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXMAG00000004236	ctif	100	74.438	ENSCSEG00000019857	ctif	100	75.281	Cynoglossus_semilaevis
ENSXMAG00000004236	ctif	100	86.895	ENSCVAG00000017158	ctif	100	86.325	Cyprinodon_variegatus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	64.356	ENSDARG00000090617	ctif	100	65.537	Danio_rerio
ENSXMAG00000004236	ctif	75	57.296	ENSDNOG00000037310	CTIF	88	60.614	Dasypus_novemcinctus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.228	ENSDORG00000003221	Ctif	99	57.075	Dipodomys_ordii
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.788	ENSEASG00005016094	CTIF	100	56.563	Equus_asinus_asinus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.100	ENSECAG00000020473	CTIF	100	56.875	Equus_caballus
ENSXMAG00000004236	ctif	92	54.261	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	53.054	Erinaceus_europaeus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	63.467	ENSELUG00000008733	ctif	100	64.420	Esox_lucius
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.085	ENSFCAG00000000664	CTIF	99	56.940	Felis_catus
ENSXMAG00000004236	ctif	97	56.607	ENSFALG00000008943	CTIF	98	56.281	Ficedula_albicollis
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.077	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	55.590	Fukomys_damarensis
ENSXMAG00000004236	ctif	100	88.418	ENSFHEG00000004334	ctif	100	88.136	Fundulus_heteroclitus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.431	ENSGALG00000035912	-	74	89.583	Gallus_gallus
ENSXMAG00000004236	ctif	100	94.868	ENSGAFG00000011896	ctif	100	98.305	Gambusia_affinis
ENSXMAG00000004236	ctif	72	53.288	ENSGAGG00000020663	CTIF	91	57.069	Gopherus_agassizii
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.903	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	56.761	Gorilla_gorilla
ENSXMAG00000004236	ctif	100	80.917	ENSHBUG00000018092	ctif	100	79.407	Haplochromis_burtoni
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.637	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	57.484	Heterocephalus_glaber_female
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.479	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	57.325	Heterocephalus_glaber_male
ENSXMAG00000004236	ctif	99	61.943	ENSHCOG00000011784	ctif	98	68.261	Hippocampus_comes
ENSXMAG00000004236	ctif	99	62.857	ENSIPUG00000014050	ctif	99	62.291	Ictalurus_punctatus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.595	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	56.439	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.413	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	56.260	Jaculus_jaculus
ENSXMAG00000004236	ctif	100	81.037	ENSKMAG00000014651	ctif	100	79.734	Kryptolebias_marmoratus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	71.358	ENSLBEG00000018277	ctif	99	72.323	Labrus_bergylta
ENSXMAG00000004236	ctif	99	65.502	ENSLOCG00000011697	ctif	100	63.521	Lepisosteus_oculatus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	50.075	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	75.379	Loxodonta_africana
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.085	ENSMFAG00000037903	CTIF	99	56.940	Macaca_fascicularis
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.085	ENSMMUG00000020898	CTIF	99	56.940	Macaca_mulatta
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.085	ENSMNEG00000039395	CTIF	99	56.940	Macaca_nemestrina
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.903	ENSMLEG00000041132	CTIF	99	56.761	Mandrillus_leucophaeus
ENSXMAG00000004236	ctif	100	80.741	ENSMAMG00000014741	ctif	100	77.926	Mastacembelus_armatus
ENSXMAG00000004236	ctif	90	78.288	ENSMZEG00005019767	ctif	90	76.949	Maylandia_zebra
ENSXMAG00000004236	ctif	89	38.235	ENSMGAG00000001378	CTIF	61	89.583	Meleagris_gallopavo
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.814	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	57.547	Mesocricetus_auratus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.059	ENSMICG00000010167	CTIF	99	57.052	Microcebus_murinus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	59.531	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	58.216	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000004236	ctif	100	76.879	ENSMMOG00000000831	ctif	100	76.671	Mola_mola
ENSXMAG00000004236	ctif	99	54.147	ENSMODG00000003464	CTIF	100	53.532	Monodelphis_domestica
ENSXMAG00000004236	ctif	87	68.182	ENSMALG00000020553	ctif	99	82.051	Monopterus_albus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.251	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	56.146	Mus_caroli
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.229	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	55.909	Mus_musculus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	59.155	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	57.795	Mus_pahari
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.444	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	91	75.163	Mus_spretus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.812	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	56.672	Mustela_putorius_furo
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.632	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	56.406	Myotis_lucifugus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.970	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	57.837	Nannospalax_galili
ENSXMAG00000004236	ctif	100	80.917	ENSNBRG00000008679	ctif	100	79.407	Neolamprologus_brichardi
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.059	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	56.918	Nomascus_leucogenys
ENSXMAG00000004236	ctif	99	52.251	ENSMEUG00000000218	CTIF	85	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.281	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	57.457	Ochotona_princeps
ENSXMAG00000004236	ctif	99	55.740	ENSODEG00000018390	CTIF	100	54.367	Octodon_degus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	73.145	ENSONIG00000007750	ctif	94	79.894	Oreochromis_niloticus
ENSXMAG00000004236	ctif	86	46.970	ENSOANG00000001337	CTIF	99	45.868	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.544	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	57.393	Oryctolagus_cuniculus
ENSXMAG00000004236	ctif	100	76.554	ENSORLG00000005786	ctif	100	75.000	Oryzias_latipes
ENSXMAG00000004236	ctif	100	76.671	ENSORLG00020005385	ctif	100	74.964	Oryzias_latipes_hni
ENSXMAG00000004236	ctif	100	76.847	ENSORLG00015011872	ctif	100	75.710	Oryzias_latipes_hsok
ENSXMAG00000004236	ctif	100	76.662	ENSOMEG00000007917	ctif	100	74.540	Oryzias_melastigma
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.837	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	56.604	Otolemur_garnettii
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.413	ENSOARG00000003754	CTIF	100	56.329	Ovis_aries
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.903	ENSPPAG00000023554	CTIF	99	56.761	Pan_paniscus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.500	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	56.358	Panthera_pardus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.878	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	56.740	Panthera_tigris_altaica
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.903	ENSPTRG00000010009	CTIF	99	56.761	Pan_troglodytes
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.903	ENSPANG00000017087	CTIF	99	56.761	Papio_anubis
ENSXMAG00000004236	ctif	86	57.707	ENSPKIG00000011234	ctif	98	64.211	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXMAG00000004236	ctif	89	87.500	ENSPSIG00000006508	CTIF	73	87.500	Pelodiscus_sinensis
ENSXMAG00000004236	ctif	100	70.339	ENSPMGG00000022958	ctif	100	68.750	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.805	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	57.662	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXMAG00000004236	ctif	77	55.102	ENSPCIG00000026247	CTIF	99	58.261	Phascolarctos_cinereus
ENSXMAG00000004236	ctif	100	95.904	ENSPFOG00000009243	ctif	100	95.904	Poecilia_formosa
ENSXMAG00000004236	ctif	100	96.182	ENSPLAG00000019171	ctif	100	96.182	Poecilia_latipinna
ENSXMAG00000004236	ctif	100	96.035	ENSPMEG00000020089	ctif	100	96.035	Poecilia_mexicana
ENSXMAG00000004236	ctif	100	93.191	ENSPREG00000017326	ctif	100	91.489	Poecilia_reticulata
ENSXMAG00000004236	ctif	86	58.165	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	56.827	Pongo_abelii
ENSXMAG00000004236	ctif	99	55.850	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	54.460	Propithecus_coquereli
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.771	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	56.625	Pteropus_vampyrus
ENSXMAG00000004236	ctif	100	80.917	ENSPNYG00000007879	ctif	100	79.407	Pundamilia_nyererei
ENSXMAG00000004236	ctif	99	65.401	ENSPNAG00000029174	ctif	100	65.819	Pygocentrus_nattereri
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.998	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	57.638	Rattus_norvegicus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.188	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	56.201	Rhinopithecus_bieti
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.031	ENSRROG00000006039	CTIF	99	56.044	Rhinopithecus_roxellana
ENSXMAG00000004236	ctif	99	58.173	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	57.005	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXMAG00000004236	ctif	99	54.259	ENSSHAG00000016321	CTIF	94	60.000	Sarcophilus_harrisii
ENSXMAG00000004236	ctif	99	66.667	ENSSFOG00015022594	ctif	100	66.568	Scleropages_formosus
ENSXMAG00000004236	ctif	100	79.321	ENSSMAG00000005707	ctif	100	81.684	Scophthalmus_maximus
ENSXMAG00000004236	ctif	100	80.488	ENSSDUG00000016033	ctif	100	79.079	Seriola_dumerili
ENSXMAG00000004236	ctif	100	78.434	ENSSLDG00000007282	ctif	100	81.241	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXMAG00000004236	ctif	99	57.920	ENSSPUG00000014734	CTIF	72	89.583	Sphenodon_punctatus
ENSXMAG00000004236	ctif	100	75.283	ENSSPAG00000003721	ctif	96	81.108	Stegastes_partitus
ENSXMAG00000004236	ctif	99	56.672	ENSSSCG00000004506	CTIF	99	55.521	Sus_scrofa
ENSXMAG00000004236	ctif	99	52.766	ENSTGUG00000000030	CTIF	99	54.046	Taeniopygia_guttata
ENSXMAG00000004236	ctif	56	69.540	ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.540	Takifugu_rubripes
ENSXMAG00000004236	ctif	87	71.508	ENSTNIG00000018763	ctif	100	66.560	Tetraodon_nigroviridis
ENSXMAG00000004236	ctif	88	66.250	ENSTBEG00000002613	CTIF	77	67.500	Tupaia_belangeri
ENSXMAG00000004236	ctif	99	55.312	ENSTTRG00000004347	CTIF	100	54.232	Tursiops_truncatus
ENSXMAG00000004236	ctif	85	54.083	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	52.737	Ursus_americanus
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ENSXMAG00000004236	ctif	51	61.905	ENSVPAG00000001497	-	60	63.095	Vicugna_pacos
ENSXMAG00000004236	ctif	97	57.212	ENSVVUG00000014347	CTIF	99	56.672	Vulpes_vulpes
ENSXMAG00000004236	ctif	78	63.251	ENSXETG00000026836	ctif	74	63.251	Xenopus_tropicalis
ENSXMAG00000004236	ctif	73	95.701	ENSXCOG00000002477	ctif	98	97.273	Xiphophorus_couchianus