EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSXMAG00000005440 (Gene tree)
Gene ID: 102220441
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_maculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26761 bases
Position: chr8:21614863-21641623
Accession: 102220441
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXMAP00000005488	IBN_N	PF03810.19	1.8e-15	1	1
ENSXMAP00000029912	IBN_N	PF03810.19	1.8e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXMAT00000021844	-	7536	-	ENSXMAP00000029912	891 (aa)	-	UPI000293B779
ENSXMAT00000005494	-	7388	XM_005808603	ENSXMAP00000005488	891 (aa)	XP_005808660	M3ZTE5

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSG00000083312	TNPO1	100	94.819	Homo_sapiens
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	97.980	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.980	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.102	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.214	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXMAG00000005440	tnpo1	87	96.903	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.903	Amphilophus_citrinellus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	97.868	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	97.868	Amphiprion_ocellaris
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	97.868	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.868	Amphiprion_percula
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	97.531	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.531	Anabas_testudineus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	99	89.402	ENSAPLG00000009619	-	97	90.482	Anas_platyrhynchos
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.042	Anolis_carolinensis
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.593	ENSANAG00000022453	-	99	92.593	Aotus_nancymaae
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	83.165	ENSANAG00000025351	-	99	83.165	Aotus_nancymaae
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	58.287	ENSANAG00000027118	-	99	60.576	Aotus_nancymaae
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	95.286	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.286	Astatotilapia_calliptera
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	94.731	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.731	Astyanax_mexicanus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.929	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	92.929	Bos_taurus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.705	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.705	Callithrix_jacchus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	96	93.007	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.007	Canis_familiaris
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	90.572	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.572	Canis_lupus_dingo
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.817	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.817	Capra_hircus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	99	89.503	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.822	Carlito_syrichta
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.593	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.593	Cebus_capucinus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.042	Cercocebus_atys
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.817	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.817	Chinchilla_lanigera
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.042	Chlorocebus_sabaeus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	94	81.310	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.548	Choloepus_hoffmanni
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.490	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.603	Chrysemys_picta_bellii
ENSXMAG00000005440	tnpo1	99	76.233	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.345	Ciona_savignyi
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.042	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.929	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.929	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXMAG00000005440	tnpo1	96	93.107	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.107	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.184	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.184	Cynoglossus_semilaevis
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.204	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.204	Cyprinodon_variegatus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	94.388	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.388	Danio_rerio
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	87.248	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.472	Dasypus_novemcinctus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	93	93.012	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.012	Dipodomys_ordii
ENSXMAG00000005440	tnpo1	99	58.333	FBgn0035693	CG8219	99	58.108	Drosophila_melanogaster
ENSXMAG00000005440	tnpo1	86	95.131	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.131	Echinops_telfairi
ENSXMAG00000005440	tnpo1	94	85.375	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.375	Eptatretus_burgeri
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.042	Equus_asinus_asinus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.042	Equus_caballus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	88.998	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.453	Esox_lucius
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.042	Felis_catus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.490	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.490	Ficedula_albicollis
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.705	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.705	Fukomys_damarensis
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.204	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.204	Fundulus_heteroclitus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.833	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.833	Gadus_morhua
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.593	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.929	Gallus_gallus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.655	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.655	Gambusia_affinis
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.521	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.521	Gasterosteus_aculeatus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.715	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.715	Gopherus_agassizii
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.042	Gorilla_gorilla
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	78.475	ENSGGOG00000022535	-	98	78.475	Gorilla_gorilla
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	97.082	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	97.082	Haplochromis_burtoni
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.593	ENSHGLG00000000970	-	99	92.593	Heterocephalus_glaber_female
ENSXMAG00000005440	tnpo1	96	92.649	ENSHGLG00100017090	-	99	92.649	Heterocephalus_glaber_male
ENSXMAG00000005440	tnpo1	97	73.055	ENSHGLG00100000963	-	99	72.706	Heterocephalus_glaber_male
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.154	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.154	Jaculus_jaculus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.970	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.970	Kryptolebias_marmoratus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	91	93.958	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.958	Labrus_bergylta
ENSXMAG00000005440	tnpo1	96	86.992	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.992	Latimeria_chalumnae
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	94.613	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.613	Lepisosteus_oculatus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	97	92.388	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.388	Loxodonta_africana
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.042	Macaca_fascicularis
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.929	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.010	Macaca_mulatta
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.042	Macaca_nemestrina
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.042	Mandrillus_leucophaeus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	97.755	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.755	Mastacembelus_armatus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.633	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.633	Maylandia_zebra
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.929	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	92.697	Mesocricetus_auratus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	89.450	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.450	Microcebus_murinus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.929	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.929	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000005440	tnpo1	87	96.263	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.263	Mola_mola
ENSXMAG00000005440	tnpo1	99	94.468	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	Monodelphis_domestica
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.184	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.184	Monopterus_albus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.705	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	92.822	Mus_caroli
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.929	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.069	Mus_musculus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.817	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.946	Mus_pahari
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.705	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	92.822	Mus_spretus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.042	Mustela_putorius_furo
ENSXMAG00000005440	tnpo1	96	92.791	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.791	Myotis_lucifugus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.042	Nannospalax_galili
ENSXMAG00000005440	tnpo1	87	96.774	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.774	Neolamprologus_brichardi
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.042	Nomascus_leucogenys
ENSXMAG00000005440	tnpo1	90	88.344	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.320	Ochotona_princeps
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.593	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.593	Octodon_degus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.321	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.321	Oreochromis_niloticus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	92	93.910	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.910	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	96	87.048	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.048	Oryctolagus_cuniculus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	87	96.632	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.632	Oryzias_latipes
ENSXMAG00000005440	tnpo1	99	97.072	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	97.072	Oryzias_latipes_hni
ENSXMAG00000005440	tnpo1	99	97.410	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.410	Oryzias_latipes_hsok
ENSXMAG00000005440	tnpo1	99	97.297	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	97.297	Oryzias_melastigma
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.042	Otolemur_garnettii
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.817	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.929	Ovis_aries
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.042	Pan_paniscus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.042	Panthera_pardus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.042	Panthera_tigris_altaica
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.042	Pan_troglodytes
ENSXMAG00000005440	tnpo1	94	82.182	ENSPTRG00000047731	-	100	82.182	Pan_troglodytes
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.042	Papio_anubis
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	90.909	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.909	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.603	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.603	Pelodiscus_sinensis
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.834	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.834	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	96	93.107	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.107	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.715	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.715	Phascolarctos_cinereus
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.768	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	98.768	Poecilia_formosa
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.768	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	98.768	Poecilia_latipinna
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.990	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.990	Poecilia_mexicana
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.655	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	98.655	Poecilia_reticulata
ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.929	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.929	Pongo_abelii
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ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	93.042	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.042	Pteropus_vampyrus
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ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	92.144	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	92.144	Xenopus_tropicalis