EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXMAG00000006041 (Gene tree)
Gene ID: 102227862
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_maculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18152 bases
Position: chr21:16212050-16230201
Accession: 102227862
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXMAP00000006095	IBN_N	PF03810.19	5.2e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXMAT00000039776	-	6053	-	ENSXMAP00000040310	1002 (aa)	-	-
ENSXMAT00000042244	-	6372	-	ENSXMAP00000023679	1002 (aa)	-	-
ENSXMAT00000006101	-	6190	XM_005803645	ENSXMAP00000006095	1090 (aa)	XP_005803702	M3ZV52

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.022	ENSG00000196497	IPO4	99	43.945	Homo_sapiens
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	78.349	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	78.899	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.831	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	43.434	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	78.532	ENSACIG00000004246	ipo4	100	78.532	Amphilophus_citrinellus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	81.560	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	81.560	Amphiprion_ocellaris
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	81.651	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	81.651	Amphiprion_percula
ENSXMAG00000006041	ipo4	92	84.263	ENSATEG00000017082	ipo4	99	84.263	Anabas_testudineus
ENSXMAG00000006041	ipo4	84	45.523	ENSACAG00000003973	-	97	46.170	Anolis_carolinensis
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.744	ENSANAG00000037973	IPO4	99	43.853	Aotus_nancymaae
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	77.339	ENSACLG00000019742	ipo4	100	77.339	Astatotilapia_calliptera
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	70.183	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	69.918	Astyanax_mexicanus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.738	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.554	Bos_taurus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.930	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	44.037	Callithrix_jacchus
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	45.074	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	45.312	Canis_familiaris
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	44.671	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	43.848	Canis_lupus_dingo
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	43.866	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	43.738	Capra_hircus
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	43.937	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	43.871	Carlito_syrichta
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.444	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	44.118	Cavia_porcellus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.022	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	44.128	Cebus_capucinus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.300	ENSCATG00000040395	IPO4	99	44.220	Cercocebus_atys
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.526	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.485	Chinchilla_lanigera
ENSXMAG00000006041	ipo4	91	44.545	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	42.018	Chrysemys_picta_bellii
ENSXMAG00000006041	ipo4	92	36.940	ENSCING00000008639	-	99	36.745	Ciona_intestinalis
ENSXMAG00000006041	ipo4	93	36.381	ENSCSAVG00000011482	-	99	36.381	Ciona_savignyi
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.115	ENSCANG00000029513	IPO4	99	44.037	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	42.673	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	42.230	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	42.673	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	42.230	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	75.527	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	75.527	Cynoglossus_semilaevis
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	82.087	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	82.224	Cyprinodon_variegatus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	74.312	ENSDARG00000041493	ipo4	100	74.312	Danio_rerio
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.465	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	44.342	Dasypus_novemcinctus
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	44.052	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	43.974	Dipodomys_ordii
ENSXMAG00000006041	ipo4	97	30.166	FBgn0042177	CG32164	96	30.204	Drosophila_melanogaster
ENSXMAG00000006041	ipo4	97	30.455	FBgn0042178	CG32165	96	30.504	Drosophila_melanogaster
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	42.988	ENSETEG00000018381	IPO4	99	42.687	Echinops_telfairi
ENSXMAG00000006041	ipo4	90	45.905	ENSEASG00005011954	IPO4	96	45.190	Equus_asinus_asinus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.659	ENSECAG00000009909	IPO4	99	43.927	Equus_caballus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	74.128	ENSELUG00000020628	ipo4	100	74.128	Esox_lucius
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.936	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	45.037	Felis_catus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	40.826	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	40.531	Fukomys_damarensis
ENSXMAG00000006041	ipo4	89	87.719	ENSFHEG00000009351	ipo4	97	88.451	Fundulus_heteroclitus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	74.519	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	74.361	Gadus_morhua
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	96.700	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	96.700	Gambusia_affinis
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	79.817	ENSGACG00000002276	ipo4	99	79.358	Gasterosteus_aculeatus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.930	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	43.853	Gorilla_gorilla
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	77.982	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	77.982	Haplochromis_burtoni
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.606	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	43.670	Heterocephalus_glaber_female
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.330	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	43.394	Heterocephalus_glaber_male
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	75.272	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.725	Hippocampus_comes
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	71.835	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	71.743	Ictalurus_punctatus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.659	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	44.618	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	44.651	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	44.393	Jaculus_jaculus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	80.550	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	80.459	Kryptolebias_marmoratus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	79.541	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	79.266	Labrus_bergylta
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	48.974	ENSLACG00000001428	IPO4	100	49.060	Latimeria_chalumnae
ENSXMAG00000006041	ipo4	79	65.473	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	65.306	Lepisosteus_oculatus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.301	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	44.444	Loxodonta_africana
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.300	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	44.220	Macaca_fascicularis
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.300	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	44.220	Macaca_mulatta
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.208	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	44.128	Macaca_nemestrina
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.300	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	44.220	Mandrillus_leucophaeus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	78.807	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	78.807	Mastacembelus_armatus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	78.073	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	78.073	Maylandia_zebra
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.606	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	43.446	Mesocricetus_auratus
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	43.866	ENSMICG00000001719	IPO4	99	44.066	Microcebus_murinus
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	44.093	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	43.562	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	78.022	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	78.022	Mola_mola
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.041	ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.318	Monodelphis_domestica
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	78.624	ENSMALG00000001587	ipo4	100	78.552	Monopterus_albus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.394	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	44.242	Mus_caroli
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	42.857	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	43.636	Mus_musculus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	42.989	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	44.078	Mus_pahari
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.134	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	43.879	Mus_spretus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.936	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	45.396	Mustela_putorius_furo
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.911	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	43.974	Myotis_lucifugus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.250	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	44.301	Nannospalax_galili
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	81.284	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	81.284	Neolamprologus_brichardi
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.936	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	44.812	Ochotona_princeps
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.618	ENSODEG00000002609	IPO4	99	44.393	Octodon_degus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	81.743	ENSONIG00000014574	ipo4	100	81.743	Oreochromis_niloticus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.502	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	43.606	Oryctolagus_cuniculus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	78.133	ENSORLG00000006457	ipo4	99	81.107	Oryzias_latipes
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	80.293	ENSORLG00020004286	ipo4	100	80.110	Oryzias_latipes_hni
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	80.385	ENSORLG00015021856	ipo4	100	80.202	Oryzias_latipes_hsok
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	78.684	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	77.516	Oryzias_melastigma
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	43.454	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	43.067	Otolemur_garnettii
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	43.097	ENSOARG00000019188	IPO4	98	42.910	Ovis_aries
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.837	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	43.802	Pan_paniscus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	45.120	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	45.221	Panthera_pardus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	45.028	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	45.129	Panthera_tigris_altaica
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.837	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	43.670	Pan_troglodytes
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.393	ENSPANG00000026278	IPO4	99	44.312	Papio_anubis
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	66.912	ENSPKIG00000007683	-	99	66.544	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	65.539	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	65.631	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	71.009	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	70.734	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.199	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	42.974	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXMAG00000006041	ipo4	93	45.890	ENSPCIG00000010718	IPO4	96	45.996	Phascolarctos_cinereus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	96.697	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	96.697	Poecilia_formosa
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	96.789	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	96.789	Poecilia_latipinna
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	96.881	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	96.881	Poecilia_mexicana
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	96.330	ENSPREG00000017605	ipo4	100	96.330	Poecilia_reticulata
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.837	ENSPPYG00000005688	IPO4	99	43.945	Pongo_abelii
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	45.167	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.312	Procavia_capensis
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	43.377	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	43.306	Propithecus_coquereli
ENSXMAG00000006041	ipo4	98	43.843	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	44.055	Pteropus_vampyrus
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	79.725	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	79.725	Pundamilia_nyererei
ENSXMAG00000006041	ipo4	100	73.028	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	73.303	Pygocentrus_nattereri
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.422	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	43.132	Rattus_norvegicus
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.115	ENSRBIG00000027704	IPO4	99	44.037	Rhinopithecus_bieti
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.115	ENSRROG00000011492	IPO4	99	44.037	Rhinopithecus_roxellana
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	43.003	ENSSBOG00000020162	IPO4	99	43.211	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	44.546	ENSSHAG00000002619	IPO4	96	44.648	Sarcophilus_harrisii
ENSXMAG00000006041	ipo4	99	64.522	ENSSFOG00015014437	IPO4	99	64.711	Scleropages_formosus
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