EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXMAG00000007383 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_maculatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19343 bases
Position: chr22:5576604-5595946
Accession: 102217227
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXMAP00000007427	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.1e-18	1	2
ENSXMAP00000007427	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5.1e-18	2	2
ENSXMAP00000027972	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6.1e-18	1	2
ENSXMAP00000027972	PAP_RNA-bind	PF04926.15	6.1e-18	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXMAT00000041744	-	2037	-	ENSXMAP00000027972	678 (aa)	-	-
ENSXMAT00000007435	-	1806	XM_005795157	ENSXMAP00000007427	601 (aa)	XP_005795214	M3ZYY3
ENSXMAT00000021408	-	684	-	ENSXMAP00000029555	227 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSXMAG00000007383's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXMAG00000007383's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXMAG00000007383	papolg	99	82.897	ENSG00000115421	PAPOLG	100	86.383	Homo_sapiens
ENSXMAG00000007383	papolg	95	94.400	ENSAPOG00000004798	papolg	78	97.368	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	74	82.600	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXMAG00000007383	papolg	89	97.222	ENSACIG00000010546	papolg	93	97.222	Amphilophus_citrinellus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	94.200	ENSAOCG00000010254	papolg	66	94.200	Amphiprion_ocellaris
ENSXMAG00000007383	papolg	95	94.400	ENSAPEG00000006944	papolg	66	94.400	Amphiprion_percula
ENSXMAG00000007383	papolg	95	94.200	ENSATEG00000009007	papolg	79	94.212	Anabas_testudineus
ENSXMAG00000007383	papolg	89	79.074	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.074	Anas_platyrhynchos
ENSXMAG00000007383	papolg	69	72.105	ENSACAG00000015048	-	69	72.105	Anolis_carolinensis
ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.099	ENSANAG00000024627	PAPOLG	82	83.099	Aotus_nancymaae
ENSXMAG00000007383	papolg	95	94.000	ENSACLG00000015592	papolg	65	94.000	Astatotilapia_calliptera
ENSXMAG00000007383	papolg	95	87.600	ENSAMXG00000004611	papolg	74	87.600	Astyanax_mexicanus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	74	82.600	Bos_taurus
ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.099	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	82	83.099	Callithrix_jacchus
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.400	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	66	82.400	Canis_familiaris
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.635	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	77	82.530	Canis_lupus_dingo
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.897	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	73	82.897	Capra_hircus
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.897	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	73	82.897	Carlito_syrichta
ENSXMAG00000007383	papolg	63	76.501	ENSCAPG00000014901	-	100	76.501	Cavia_aperea
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	74	82.600	Cavia_porcellus
ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.099	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	82	83.099	Cebus_capucinus
ENSXMAG00000007383	papolg	87	83.871	ENSCATG00000044395	PAPOLG	79	83.871	Cercocebus_atys
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	74	82.600	Chinchilla_lanigera
ENSXMAG00000007383	papolg	99	82.897	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	82	82.897	Chlorocebus_sabaeus
ENSXMAG00000007383	papolg	87	83.529	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	80	83.529	Choloepus_hoffmanni
ENSXMAG00000007383	papolg	81	62.753	ENSCING00000024664	-	91	62.753	Ciona_intestinalis
ENSXMAG00000007383	papolg	80	63.655	ENSCSAVG00000009085	-	97	63.655	Ciona_savignyi
ENSXMAG00000007383	papolg	99	82.696	ENSCANG00000038120	PAPOLG	82	82.696	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.200	ENSCGRG00001014951	Papolg	75	82.200	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.200	ENSCGRG00000005552	-	75	82.200	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXMAG00000007383	papolg	97	93.600	ENSCSEG00000000771	papolg	79	93.600	Cynoglossus_semilaevis
ENSXMAG00000007383	papolg	96	95.400	ENSCVAG00000016602	papolg	90	94.664	Cyprinodon_variegatus
ENSXMAG00000007383	papolg	94	87.952	ENSDARG00000012141	papolg	73	87.952	Danio_rerio
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.591	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	73	82.591	Dasypus_novemcinctus
ENSXMAG00000007383	papolg	70	82.506	ENSDORG00000016228	Papolg	98	82.506	Dipodomys_ordii
ENSXMAG00000007383	papolg	89	68.421	ENSETEG00000011815	PAPOLG	72	68.421	Echinops_telfairi
ENSXMAG00000007383	papolg	93	50.261	ENSEBUG00000005042	-	98	50.788	Eptatretus_burgeri
ENSXMAG00000007383	papolg	67	71.802	ENSEBUG00000004020	papolg	83	71.221	Eptatretus_burgeri
ENSXMAG00000007383	papolg	99	82.600	ENSEASG00005002038	PAPOLG	81	82.600	Equus_asinus_asinus
ENSXMAG00000007383	papolg	100	82.600	ENSECAG00000009859	PAPOLG	80	82.600	Equus_caballus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	71.743	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	67	71.743	Erinaceus_europaeus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	90.200	ENSELUG00000014497	papolg	66	90.200	Esox_lucius
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	74	82.600	Felis_catus
ENSXMAG00000007383	papolg	82	72.672	ENSFALG00000011079	PAPOLG	65	71.743	Ficedula_albicollis
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.800	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	72	82.800	Fukomys_damarensis
ENSXMAG00000007383	papolg	56	92.248	ENSFHEG00000019080	papolg	57	92.248	Fundulus_heteroclitus
ENSXMAG00000007383	papolg	97	89.941	ENSGMOG00000018772	papolg	84	89.941	Gadus_morhua
ENSXMAG00000007383	papolg	82	77.126	ENSGALG00000007853	PAPOLG	68	77.126	Gallus_gallus
ENSXMAG00000007383	papolg	96	96.200	ENSGAFG00000003263	papolg	65	96.200	Gambusia_affinis
ENSXMAG00000007383	papolg	97	92.927	ENSGACG00000002718	papolg	75	92.927	Gasterosteus_aculeatus
ENSXMAG00000007383	papolg	99	82.897	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	82	82.897	Gorilla_gorilla
ENSXMAG00000007383	papolg	95	94.000	ENSHBUG00000004882	papolg	65	94.000	Haplochromis_burtoni
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.800	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	73	82.800	Heterocephalus_glaber_female
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.800	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	73	82.800	Heterocephalus_glaber_male
ENSXMAG00000007383	papolg	96	94.200	ENSHCOG00000006782	papolg	67	94.200	Hippocampus_comes
ENSXMAG00000007383	papolg	95	88.000	ENSIPUG00000021642	papolg	77	88.000	Ictalurus_punctatus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	74	82.600	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXMAG00000007383	papolg	70	82.506	ENSJJAG00000015601	Papolg	98	82.506	Jaculus_jaculus
ENSXMAG00000007383	papolg	96	95.200	ENSKMAG00000016439	papolg	74	95.200	Kryptolebias_marmoratus
ENSXMAG00000007383	papolg	96	94.012	ENSLBEG00000023218	papolg	64	94.012	Labrus_bergylta
ENSXMAG00000007383	papolg	91	75.000	ENSLACG00000009543	PAPOLG	73	75.000	Latimeria_chalumnae
ENSXMAG00000007383	papolg	95	90.161	ENSLOCG00000016130	papolg	72	90.161	Lepisosteus_oculatus
ENSXMAG00000007383	papolg	93	82.897	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	82.857	Loxodonta_africana
ENSXMAG00000007383	papolg	99	82.600	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	82	82.600	Macaca_fascicularis
ENSXMAG00000007383	papolg	99	82.600	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	82	82.600	Macaca_mulatta
ENSXMAG00000007383	papolg	99	75.960	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	81	75.551	Macaca_nemestrina
ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.367	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	81	83.065	Mandrillus_leucophaeus
ENSXMAG00000007383	papolg	96	94.200	ENSMAMG00000010667	papolg	77	100.000	Mastacembelus_armatus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	94.000	ENSMZEG00005018140	papolg	79	94.000	Maylandia_zebra
ENSXMAG00000007383	papolg	82	76.566	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	67	76.566	Meleagris_gallopavo
ENSXMAG00000007383	papolg	95	83.000	ENSMAUG00000009088	Papolg	74	83.000	Mesocricetus_auratus
ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.065	ENSMICG00000010042	PAPOLG	82	83.065	Microcebus_murinus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.800	ENSMOCG00000006857	Papolg	74	82.800	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000007383	papolg	96	94.200	ENSMMOG00000008020	papolg	88	88.202	Mola_mola
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.222	ENSMODG00000002160	PAPOLG	72	82.222	Monodelphis_domestica
ENSXMAG00000007383	papolg	98	93.988	ENSMALG00000007012	papolg	69	93.988	Monopterus_albus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	83.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	97	83.095	Mus_caroli
ENSXMAG00000007383	papolg	95	83.000	ENSMUSG00000020273	Papolg	97	83.095	Mus_musculus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	75	82.600	Mus_pahari
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.800	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	97	83.095	Mus_spretus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.400	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	67	82.400	Mustela_putorius_furo
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	75	82.600	Myotis_lucifugus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.800	ENSNGAG00000001120	Papolg	74	82.800	Nannospalax_galili
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.389	ENSNBRG00000011943	papolg	71	82.389	Neolamprologus_brichardi
ENSXMAG00000007383	papolg	69	82.619	ENSNLEG00000009507	-	97	82.619	Nomascus_leucogenys
ENSXMAG00000007383	papolg	58	91.304	ENSMEUG00000013605	-	51	91.304	Notamacropus_eugenii
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.400	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	74	82.400	Ochotona_princeps
ENSXMAG00000007383	papolg	70	79.433	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	79.433	Octodon_degus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	83.633	ENSONIG00000002985	papolg	75	83.633	Oreochromis_niloticus
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.460	ENSOANG00000012403	PAPOLG	72	82.460	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	74	82.600	Oryctolagus_cuniculus
ENSXMAG00000007383	papolg	96	92.629	ENSORLG00000001577	papolg	67	92.629	Oryzias_latipes
ENSXMAG00000007383	papolg	96	92.829	ENSORLG00020002482	papolg	67	92.829	Oryzias_latipes_hni
ENSXMAG00000007383	papolg	96	92.829	ENSORLG00015008836	papolg	67	92.829	Oryzias_latipes_hsok
ENSXMAG00000007383	papolg	96	92.814	ENSOMEG00000001406	papolg	66	92.814	Oryzias_melastigma
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.897	ENSOARG00000001563	PAPOLG	66	82.897	Ovis_aries
ENSXMAG00000007383	papolg	99	82.897	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	82	82.897	Pan_paniscus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	74	82.600	Panthera_pardus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.400	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	74	82.400	Panthera_tigris_altaica
ENSXMAG00000007383	papolg	99	82.897	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	82	82.897	Pan_troglodytes
ENSXMAG00000007383	papolg	99	78.384	ENSPANG00000014543	PAPOLG	81	77.956	Papio_anubis
ENSXMAG00000007383	papolg	96	86.733	ENSPKIG00000003313	papolg	77	86.733	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXMAG00000007383	papolg	83	87.400	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	93	74.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXMAG00000007383	papolg	99	81.414	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	66	81.414	Pelodiscus_sinensis
ENSXMAG00000007383	papolg	95	83.000	ENSPEMG00000008960	-	75	83.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXMAG00000007383	papolg	83	62.257	ENSPMAG00000002961	papolg	69	62.257	Petromyzon_marinus
ENSXMAG00000007383	papolg	82	63.126	ENSPMAG00000004864	-	98	63.126	Petromyzon_marinus
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.626	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	72	82.626	Phascolarctos_cinereus
ENSXMAG00000007383	papolg	96	96.000	ENSPFOG00000012909	papolg	73	96.000	Poecilia_formosa
ENSXMAG00000007383	papolg	96	96.000	ENSPLAG00000018445	papolg	66	96.000	Poecilia_latipinna
ENSXMAG00000007383	papolg	96	96.000	ENSPMEG00000003961	papolg	65	96.000	Poecilia_mexicana
ENSXMAG00000007383	papolg	96	95.800	ENSPREG00000010358	papolg	65	95.800	Poecilia_reticulata
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.897	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	74	82.897	Pongo_abelii
ENSXMAG00000007383	papolg	84	80.127	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	69	80.127	Procavia_capensis
ENSXMAG00000007383	papolg	88	76.721	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	75	76.721	Propithecus_coquereli
ENSXMAG00000007383	papolg	94	80.684	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	74	80.684	Pteropus_vampyrus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	94.000	ENSPNYG00000006729	papolg	93	82.753	Pundamilia_nyererei
ENSXMAG00000007383	papolg	94	87.400	ENSPNAG00000015521	papolg	73	87.400	Pygocentrus_nattereri
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.800	ENSRNOG00000006261	Papolg	74	82.800	Rattus_norvegicus
ENSXMAG00000007383	papolg	99	76.471	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	81	76.056	Rhinopithecus_bieti
ENSXMAG00000007383	papolg	99	82.897	ENSRROG00000035954	PAPOLG	82	82.897	Rhinopithecus_roxellana
ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.099	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	82	83.099	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXMAG00000007383	papolg	89	83.190	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	72	83.190	Sarcophilus_harrisii
ENSXMAG00000007383	papolg	95	87.149	ENSSFOG00015002383	papolg	76	87.149	Scleropages_formosus
ENSXMAG00000007383	papolg	82	79.000	ENSSFOG00015011874	papolg	70	79.000	Scleropages_formosus
ENSXMAG00000007383	papolg	94	93.902	ENSSMAG00000015598	papolg	68	93.254	Scophthalmus_maximus
ENSXMAG00000007383	papolg	99	94.400	ENSSDUG00000000912	papolg	79	97.297	Seriola_dumerili
ENSXMAG00000007383	papolg	99	94.400	ENSSLDG00000001217	papolg	74	100.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.222	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	75	82.222	Sphenodon_punctatus
ENSXMAG00000007383	papolg	96	94.400	ENSSPAG00000009004	papolg	79	94.595	Stegastes_partitus
ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.099	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	81	83.099	Sus_scrofa
ENSXMAG00000007383	papolg	82	72.764	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	91	72.764	Taeniopygia_guttata
ENSXMAG00000007383	papolg	95	92.800	ENSTRUG00000006410	papolg	77	92.800	Takifugu_rubripes
ENSXMAG00000007383	papolg	95	84.221	ENSTNIG00000017106	papolg	75	84.221	Tetraodon_nigroviridis
ENSXMAG00000007383	papolg	88	75.200	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	68	75.200	Tupaia_belangeri
ENSXMAG00000007383	papolg	94	76.660	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	73	76.660	Tursiops_truncatus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	76	82.600	Ursus_americanus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	68	82.600	Ursus_maritimus
ENSXMAG00000007383	papolg	95	78.000	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	74	78.000	Vicugna_pacos
ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.600	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	73	82.600	Vulpes_vulpes
ENSXMAG00000007383	papolg	88	80.606	ENSXETG00000002208	papolg	70	80.606	Xenopus_tropicalis
ENSXMAG00000007383	papolg	99	96.313	ENSXCOG00000006611	papolg	100	96.313	Xiphophorus_couchianus