EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXMAG00000008494 (Gene tree)
Gene ID: 102219975
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_maculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17886 bases
Position: chr16:6256221-6274106
Accession: 102219975
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXMAP00000008530	GTP_EFTU	PF00009.27	7.4e-45	1	1
ENSXMAP00000008530	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	4.3e-12	1	1
ENSXMAP00000008530	EFG_IV	PF03764.18	1.1e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXMAT00000008543	-	6267	XM_005796673	ENSXMAP00000008530	971 (aa)	XP_005796730	M4A236

Gene Model

Click here to download ENSXMAG00000008494's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
xma03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXMAG00000008494's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.734	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	97.734	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	92.181	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	93.924	ENSACIG00000009096	eftud2	100	93.924	Amphilophus_citrinellus
ENSXMAG00000008494	eftud2	88	91.882	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	91.882	Amphiprion_ocellaris
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.631	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	97.631	Amphiprion_percula
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.940	ENSATEG00000000457	eftud2	100	97.940	Anabas_testudineus
ENSXMAG00000008494	eftud2	99	88.671	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.877	Anas_platyrhynchos
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.461	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.770	Anolis_carolinensis
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	92.078	Aotus_nancymaae
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.734	ENSACLG00000001296	eftud2	100	97.734	Astatotilapia_calliptera
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	93.961	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	Astyanax_mexicanus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	92.387	Bos_taurus
ENSXMAG00000008494	eftud2	99	70.764	WBGene00001166	eftu-2	99	70.764	Caenorhabditis_elegans
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	92.078	Callithrix_jacchus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	92.181	Canis_familiaris
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	92.181	Canis_lupus_dingo
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	92.387	Capra_hircus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	92.078	Carlito_syrichta
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	92.284	Cavia_aperea
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	92.284	Cavia_porcellus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	92.078	Cebus_capucinus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	92.078	Cercocebus_atys
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	92.078	Chinchilla_lanigera
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	92.078	Chlorocebus_sabaeus
ENSXMAG00000008494	eftud2	91	81.306	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	81.306	Choloepus_hoffmanni
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.284	Chrysemys_picta_bellii
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	78.953	ENSCING00000009372	-	100	78.850	Ciona_intestinalis
ENSXMAG00000008494	eftud2	99	78.447	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.953	Ciona_savignyi
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	92.078	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.975	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.975	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.116	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.116	Cynoglossus_semilaevis
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	99.073	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	99.073	Cyprinodon_variegatus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	93.731	ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.731	Danio_rerio
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.564	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.667	Dasypus_novemcinctus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	92.284	Dipodomys_ordii
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	75.333	FBgn0039566	CG4849	100	75.179	Drosophila_melanogaster
ENSXMAG00000008494	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSXMAG00000008494	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.483	Eptatretus_burgeri
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	92.181	Equus_asinus_asinus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	92.078	Equus_caballus
ENSXMAG00000008494	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	94.130	ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.821	Esox_lucius
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	92.078	Felis_catus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.181	Ficedula_albicollis
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.387	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	92.490	Fukomys_damarensis
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	98.764	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	98.764	Fundulus_heteroclitus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	94.748	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	94.748	Gadus_morhua
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	94.130	Gallus_gallus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	100.000	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	100.000	Gambusia_affinis
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.013	ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.013	Gasterosteus_aculeatus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	92.078	Gorilla_gorilla
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.631	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	97.631	Haplochromis_burtoni
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.284	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	92.387	Heterocephalus_glaber_female
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.284	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	92.387	Heterocephalus_glaber_male
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	96.605	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	96.605	Hippocampus_comes
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	94.027	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.027	Ictalurus_punctatus
ENSXMAG00000008494	eftud2	91	93.356	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.148	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXMAG00000008494	eftud2	95	94.022	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	94.022	Jaculus_jaculus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.219	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	97.219	Kryptolebias_marmoratus
ENSXMAG00000008494	eftud2	95	97.516	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	Labrus_bergylta
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.894	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.894	Latimeria_chalumnae
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	94.336	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	94.027	Lepisosteus_oculatus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	92.078	Loxodonta_africana
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	92.078	Macaca_fascicularis
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	92.078	Macaca_nemestrina
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	92.078	Mandrillus_leucophaeus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.219	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	97.219	Mastacembelus_armatus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.734	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	97.734	Maylandia_zebra
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.684	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.889	Meleagris_gallopavo
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	92.078	Mesocricetus_auratus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	92.078	Microcebus_murinus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	ENSMOCG00000009039	-	100	92.078	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000008494	eftud2	92	75.618	ENSMOCG00000017653	-	90	75.618	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000008494	eftud2	88	98.118	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	98.118	Mola_mola
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	92.078	Monodelphis_domestica
ENSXMAG00000008494	eftud2	88	96.471	ENSMALG00000014501	eftud2	100	96.471	Monopterus_albus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.975	Mus_caroli
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	91.975	Mus_musculus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.975	Mus_pahari
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.975	Mus_spretus
ENSXMAG00000008494	eftud2	97	91.525	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.737	Mustela_putorius_furo
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	92.181	Myotis_lucifugus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	92.181	Nannospalax_galili
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.631	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	97.631	Neolamprologus_brichardi
ENSXMAG00000008494	eftud2	97	89.904	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	90.011	Nomascus_leucogenys
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	88.272	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.374	Notamacropus_eugenii
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	84.156	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	84.362	Ochotona_princeps
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.284	ENSODEG00000018041	-	100	91.770	Octodon_degus
ENSXMAG00000008494	eftud2	93	76.184	ENSODEG00000003385	-	100	76.293	Octodon_degus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.734	ENSONIG00000000912	eftud2	100	97.734	Oreochromis_niloticus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	92.181	Oryctolagus_cuniculus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	96.807	ENSORLG00000003109	eftud2	100	96.807	Oryzias_latipes
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	96.910	ENSORLG00020009865	eftud2	100	96.910	Oryzias_latipes_hni
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	96.807	ENSORLG00015002611	eftud2	100	98.039	Oryzias_latipes_hsok
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	90.329	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.432	Otolemur_garnettii
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	92.387	Ovis_aries
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	92.078	Pan_paniscus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	92.181	Panthera_pardus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	92.181	Panthera_tigris_altaica
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	92.078	Pan_troglodytes
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	92.078	Papio_anubis
ENSXMAG00000008494	eftud2	93	90.187	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.408	Pelodiscus_sinensis
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	89.392	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	89.392	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.181	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	92.181	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	92.078	Phascolarctos_cinereus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	99.794	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	99.794	Poecilia_formosa
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	99.794	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	99.794	Poecilia_latipinna
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	99.794	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	99.794	Poecilia_mexicana
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	90.741	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.844	Pongo_abelii
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	88.169	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.272	Procavia_capensis
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.078	Propithecus_coquereli
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	87.757	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.963	Pteropus_vampyrus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.631	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	97.631	Pundamilia_nyererei
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	94.542	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.542	Pygocentrus_nattereri
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.967	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.967	Rattus_norvegicus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.975	Rhinopithecus_bieti
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.975	Rhinopithecus_roxellana
ENSXMAG00000008494	eftud2	97	33.729	YKL173W	SNU114	91	34.461	Saccharomyces_cerevisiae
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	92.078	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXMAG00000008494	eftud2	95	94.022	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	94.022	Sarcophilus_harrisii
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	94.336	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	94.027	Scleropages_formosus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.219	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	97.219	Scophthalmus_maximus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.837	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	97.837	Seriola_dumerili
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.940	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	97.940	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	84.259	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	84.362	Sorex_araneus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.975	Sphenodon_punctatus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.837	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	97.837	Stegastes_partitus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	Sus_scrofa
ENSXMAG00000008494	eftud2	83	93.159	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	93.159	Taeniopygia_guttata
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	95.881	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	95.881	Takifugu_rubripes
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.179	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.179	Tetraodon_nigroviridis
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	86.626	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.728	Tupaia_belangeri
ENSXMAG00000008494	eftud2	91	90.125	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	90.125	Tursiops_truncatus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	90.844	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	91.049	Ursus_americanus
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	92.181	Ursus_maritimus
ENSXMAG00000008494	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	92.181	Vulpes_vulpes
ENSXMAG00000008494	eftud2	96	92.086	ENSXETG00000003394	eftud2	98	93.254	Xenopus_tropicalis
ENSXMAG00000008494	eftud2	81	99.872	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	99.872	Xiphophorus_couchianus