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Description

Ensembl ID: ENSXMAG00000018474 (Gene tree)
Gene ID: 102229270
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_maculatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10437 bases
Position: chr10:4134776-4145212
Accession: 102229270
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXMAP00000018520	eRF1_2	PF03464.15	3.1e-34	1	1
ENSXMAP00000018520	eRF1_3	PF03465.15	1.7e-25	1	1
ENSXMAP00000018520	eRF1_1	PF03463.15	1.1e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXMAT00000018548	-	3841	XM_005810603	ENSXMAP00000018520	385 (aa)	XP_005810660	M4AVM5

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
xma03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.558	ENSG00000152684	PELO	100	81.558	Homo_sapiens
ENSXMAG00000018474	pelo	100	92.987	ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.987	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000018474	pelo	64	93.522	ENSAPOG00000000616	pelo	90	93.522	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000018474	pelo	64	93.522	ENSAPOG00000023700	-	90	93.522	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXMAG00000018474	pelo	97	89.276	ENSACIG00000014386	pelo	97	94.083	Amphilophus_citrinellus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	93.247	ENSAOCG00000023717	pelo	100	93.247	Amphiprion_ocellaris
ENSXMAG00000018474	pelo	100	93.247	ENSAPEG00000011235	pelo	100	93.247	Amphiprion_percula
ENSXMAG00000018474	pelo	100	94.026	ENSATEG00000019550	pelo	100	94.026	Anabas_testudineus
ENSXMAG00000018474	pelo	77	72.819	ENSAPLG00000013265	PELO	100	72.819	Anas_platyrhynchos
ENSXMAG00000018474	pelo	97	81.333	ENSACAG00000004352	PELO	100	80.779	Anolis_carolinensis
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSANAG00000014096	PELO	100	81.818	Aotus_nancymaae
ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.688	ENSACLG00000010305	pelo	100	91.688	Astatotilapia_calliptera
ENSXMAG00000018474	pelo	97	93.029	ENSAMXG00000020299	pelo	99	91.688	Astyanax_mexicanus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.558	ENSBTAG00000003268	PELO	99	81.558	Bos_taurus
ENSXMAG00000018474	pelo	99	61.417	WBGene00011280	pelo-1	100	61.417	Caenorhabditis_elegans
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.558	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.558	Callithrix_jacchus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.078	ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.078	Canis_lupus_dingo
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.299	ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.299	Capra_hircus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.338	ENSTSYG00000005203	PELO	100	82.338	Carlito_syrichta
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.338	ENSCPOG00000027406	PELO	100	82.338	Cavia_porcellus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.558	ENSCCAG00000035600	PELO	100	81.558	Cebus_capucinus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSCATG00000011829	PELO	100	81.818	Cercocebus_atys
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSCLAG00000005043	PELO	100	81.818	Chinchilla_lanigera
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSCSAG00000016692	PELO	100	81.818	Chlorocebus_sabaeus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.338	ENSCHOG00000000523	PELO	100	82.338	Choloepus_hoffmanni
ENSXMAG00000018474	pelo	97	81.600	ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.039	Chrysemys_picta_bellii
ENSXMAG00000018474	pelo	97	64.611	ENSCING00000001979	-	100	64.935	Ciona_intestinalis
ENSXMAG00000018474	pelo	100	66.234	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.234	Ciona_savignyi
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSCANG00000023382	PELO	100	81.818	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXMAG00000018474	pelo	97	82.306	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.338	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXMAG00000018474	pelo	97	83.110	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	83.117	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.948	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.948	Cynoglossus_semilaevis
ENSXMAG00000018474	pelo	100	98.442	ENSCVAG00000016082	pelo	100	98.442	Cyprinodon_variegatus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	89.091	ENSDARG00000055477	pelo	100	89.091	Danio_rerio
ENSXMAG00000018474	pelo	100	78.756	ENSDNOG00000036721	PELO	100	78.756	Dasypus_novemcinctus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	83.117	ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.117	Dipodomys_ordii
ENSXMAG00000018474	pelo	96	68.649	FBgn0011207	pelo	96	68.074	Drosophila_melanogaster
ENSXMAG00000018474	pelo	71	79.532	ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	Eptatretus_burgeri
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.078	ENSEASG00005013348	PELO	100	82.078	Equus_asinus_asinus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	90.909	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.909	Esox_lucius
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.078	ENSFCAG00000032341	PELO	100	82.078	Felis_catus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.078	ENSFALG00000004559	PELO	100	82.078	Ficedula_albicollis
ENSXMAG00000018474	pelo	74	83.451	ENSFDAG00000002076	PELO	88	83.451	Fukomys_damarensis
ENSXMAG00000018474	pelo	100	96.883	ENSFHEG00000009769	pelo	100	96.883	Fundulus_heteroclitus
ENSXMAG00000018474	pelo	98	89.125	ENSGMOG00000005849	pelo	100	88.831	Gadus_morhua
ENSXMAG00000018474	pelo	100	98.182	ENSGAFG00000019350	pelo	100	98.182	Gambusia_affinis
ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.688	ENSGACG00000007245	pelo	100	91.688	Gasterosteus_aculeatus
ENSXMAG00000018474	pelo	97	81.600	ENSGAGG00000004018	PELO	100	81.039	Gopherus_agassizii
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSGGOG00000012635	PELO	100	81.818	Gorilla_gorilla
ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.688	ENSHBUG00000005866	pelo	100	91.688	Haplochromis_burtoni
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.597	ENSHGLG00000005932	PELO	100	82.597	Heterocephalus_glaber_female
ENSXMAG00000018474	pelo	100	80.519	ENSHGLG00100017627	PELO	100	80.519	Heterocephalus_glaber_male
ENSXMAG00000018474	pelo	100	89.870	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.870	Hippocampus_comes
ENSXMAG00000018474	pelo	100	89.091	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.091	Ictalurus_punctatus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.078	ENSSTOG00000027378	PELO	100	82.078	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	80.260	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	80.260	Jaculus_jaculus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	94.545	ENSKMAG00000021305	pelo	100	94.545	Kryptolebias_marmoratus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.688	ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.688	Labrus_bergylta
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.338	ENSLAFG00000020551	PELO	100	82.338	Loxodonta_africana
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSMFAG00000000651	PELO	100	81.818	Macaca_fascicularis
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSMMUG00000039101	PELO	100	81.818	Macaca_mulatta
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSMNEG00000035538	PELO	100	81.818	Macaca_nemestrina
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSMLEG00000039113	PELO	100	81.818	Mandrillus_leucophaeus
ENSXMAG00000018474	pelo	97	95.710	ENSMAMG00000013260	pelo	100	95.065	Mastacembelus_armatus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.688	ENSMZEG00005014258	pelo	100	91.688	Maylandia_zebra
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.597	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	82.597	Mesocricetus_auratus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.078	ENSMICG00000044040	PELO	100	82.078	Microcebus_murinus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.857	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	82.857	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.948	ENSMMOG00000001324	pelo	100	91.948	Mola_mola
ENSXMAG00000018474	pelo	100	92.208	ENSMALG00000008194	pelo	100	92.208	Monopterus_albus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.597	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	82.597	Mus_caroli
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.597	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	82.597	Mus_musculus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.857	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	82.857	Mus_pahari
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.597	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	82.597	Mus_spretus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.299	ENSMLUG00000024132	PELO	100	81.299	Myotis_lucifugus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.857	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	82.857	Nannospalax_galili
ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.688	ENSNBRG00000011799	pelo	100	91.688	Neolamprologus_brichardi
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSNLEG00000035970	PELO	100	81.818	Nomascus_leucogenys
ENSXMAG00000018474	pelo	100	80.519	ENSMEUG00000005468	PELO	100	80.519	Notamacropus_eugenii
ENSXMAG00000018474	pelo	98	81.530	ENSOPRG00000018793	PELO	100	81.530	Ochotona_princeps
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.597	ENSODEG00000017579	PELO	100	82.597	Octodon_degus
ENSXMAG00000018474	pelo	96	92.453	ENSONIG00000011511	pelo	100	92.468	Oreochromis_niloticus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.078	ENSOCUG00000023902	PELO	100	82.078	Oryctolagus_cuniculus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.948	ENSORLG00000005827	pelo	100	91.948	Oryzias_latipes
ENSXMAG00000018474	pelo	100	92.208	ENSORLG00020016456	pelo	100	92.208	Oryzias_latipes_hni
ENSXMAG00000018474	pelo	100	92.208	ENSORLG00015014447	pelo	100	92.208	Oryzias_latipes_hsok
ENSXMAG00000018474	pelo	100	94.026	ENSOMEG00000021567	pelo	100	94.026	Oryzias_melastigma
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.338	ENSOGAG00000027940	PELO	100	82.338	Otolemur_garnettii
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.558	ENSOARG00000008324	PELO	99	81.558	Ovis_aries
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSPPAG00000038951	PELO	100	81.818	Pan_paniscus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.078	ENSPPRG00000018800	PELO	100	82.078	Panthera_pardus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.078	ENSPTIG00000019988	PELO	100	82.078	Panthera_tigris_altaica
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.558	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.558	Pan_troglodytes
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSPANG00000010902	PELO	100	81.818	Papio_anubis
ENSXMAG00000018474	pelo	100	89.351	ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.351	Paramormyrops_kingsleyae
ENSXMAG00000018474	pelo	97	81.333	ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.779	Pelodiscus_sinensis
ENSXMAG00000018474	pelo	67	90.310	ENSPMGG00000014561	pelo	95	90.310	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.857	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	82.857	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.558	ENSPCIG00000004880	PELO	100	81.558	Phascolarctos_cinereus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	98.961	ENSPFOG00000007277	pelo	100	98.961	Poecilia_formosa
ENSXMAG00000018474	pelo	100	99.221	ENSPLAG00000020787	pelo	100	99.221	Poecilia_latipinna
ENSXMAG00000018474	pelo	100	98.961	ENSPMEG00000016964	pelo	100	98.961	Poecilia_mexicana
ENSXMAG00000018474	pelo	100	99.221	ENSPREG00000023071	pelo	100	99.221	Poecilia_reticulata
ENSXMAG00000018474	pelo	97	81.769	ENSPPYG00000015451	PELO	96	81.818	Pongo_abelii
ENSXMAG00000018474	pelo	100	82.078	ENSPCOG00000021178	PELO	100	82.078	Propithecus_coquereli
ENSXMAG00000018474	pelo	100	91.688	ENSPNYG00000017325	pelo	100	91.688	Pundamilia_nyererei
ENSXMAG00000018474	pelo	97	92.761	ENSPNAG00000012458	pelo	99	91.429	Pygocentrus_nattereri
ENSXMAG00000018474	pelo	100	83.117	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	83.117	Rattus_norvegicus
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSRBIG00000007299	PELO	100	81.818	Rhinopithecus_bieti
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.818	ENSRROG00000035507	PELO	100	81.818	Rhinopithecus_roxellana
ENSXMAG00000018474	pelo	98	32.987	YNL001W	-	98	32.987	Saccharomyces_cerevisiae
ENSXMAG00000018474	pelo	100	81.299	ENSSBOG00000036140	PELO	100	81.299	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXMAG00000018474	pelo	63	77.869	ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.869	Sarcophilus_harrisii
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