EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSXMAG00000021899 (Gene tree)
Gene ID: 102230823
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Xiphophorus_maculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19998 bases
Position: chr3:4264879-4284876
Accession: 102230823
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSXMAP00000037990	PAZ	PF02170.22	8e-29	1	1
ENSXMAP00000037990	Piwi	PF02171.17	1.7e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSXMAT00000026420	-	5174	XM_005806479	ENSXMAP00000037990	858 (aa)	XP_005806536	UPI0003B4A598

Gene Model

Click here to download ENSXMAG00000021899's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSXMAG00000021899's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSG00000092847	AGO1	100	97.187	Homo_sapiens
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.767	ENSAPOG00000024299	ago1	100	99.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	96.270	Ailuropoda_melanoleuca
ENSXMAG00000021899	ago1	82	93.162	ENSACIG00000005298	ago1	98	93.162	Amphilophus_citrinellus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.767	ENSAOCG00000017727	ago1	100	99.767	Amphiprion_ocellaris
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.767	ENSAPEG00000004458	ago1	100	99.767	Amphiprion_percula
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.767	ENSATEG00000008523	ago1	100	99.767	Anabas_testudineus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	89.675	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	89.675	Anas_platyrhynchos
ENSXMAG00000021899	ago1	91	97.059	ENSACAG00000029174	AGO1	100	97.059	Anolis_carolinensis
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.145	ENSANAG00000037711	AGO1	100	96.270	Aotus_nancymaae
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.534	ENSACLG00000000890	ago1	100	99.534	Astatotilapia_calliptera
ENSXMAG00000021899	ago1	80	99.854	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.854	Astyanax_mexicanus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.686	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	96.270	Bos_taurus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.694	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	96.270	Callithrix_jacchus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	96.270	Canis_familiaris
ENSXMAG00000021899	ago1	99	95.887	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.340	ENSCHIG00000011848	-	100	95.481	Capra_hircus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.694	ENSTSYG00000009767	-	100	96.270	Carlito_syrichta
ENSXMAG00000021899	ago1	100	75.758	ENSTSYG00000032426	-	99	78.143	Carlito_syrichta
ENSXMAG00000021899	ago1	89	92.531	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	91.858	Cavia_aperea
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.694	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	96.270	Cavia_porcellus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	96.270	Cebus_capucinus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	95.921	ENSCATG00000031521	AGO1	100	97.187	Cercocebus_atys
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.694	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	96.270	Chinchilla_lanigera
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	96.270	Chlorocebus_sabaeus
ENSXMAG00000021899	ago1	85	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSXMAG00000021899	ago1	100	96.037	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	96.037	Chrysemys_picta_bellii
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSCANG00000039798	AGO1	100	96.270	Colobus_angolensis_palliatus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.353	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	96.270	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.694	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	96.694	Cricetulus_griseus_crigri
ENSXMAG00000021899	ago1	99	97.683	ENSCSEG00000001051	ago1	100	97.683	Cynoglossus_semilaevis
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.650	ENSCVAG00000018173	ago1	100	99.650	Cyprinodon_variegatus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	98.951	ENSDARG00000092644	ago1	100	98.951	Danio_rerio
ENSXMAG00000021899	ago1	91	97.187	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	97.187	Dasypus_novemcinctus
ENSXMAG00000021899	ago1	91	97.087	ENSDORG00000008494	Ago1	100	97.087	Dipodomys_ordii
ENSXMAG00000021899	ago1	82	89.958	ENSETEG00000007626	AGO1	100	89.335	Echinops_telfairi
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.694	ENSEASG00005012086	AGO1	100	96.270	Equus_asinus_asinus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSECAG00000024353	AGO1	100	96.270	Equus_caballus
ENSXMAG00000021899	ago1	92	88.818	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	88.818	Erinaceus_europaeus
ENSXMAG00000021899	ago1	91	99.744	ENSELUG00000016803	ago1	100	99.744	Esox_lucius
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	96.270	Felis_catus
ENSXMAG00000021899	ago1	91	90.816	ENSFALG00000000790	AGO1	100	90.816	Ficedula_albicollis
ENSXMAG00000021899	ago1	100	96.154	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	Fukomys_damarensis
ENSXMAG00000021899	ago1	99	95.755	ENSFHEG00000017927	ago1	100	95.755	Fundulus_heteroclitus
ENSXMAG00000021899	ago1	87	86.649	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.649	Gadus_morhua
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.797	ENSGALG00000002249	AGO1	100	96.154	Gallus_gallus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	100.000	ENSGAFG00000009775	ago1	100	100.000	Gambusia_affinis
ENSXMAG00000021899	ago1	87	99.334	ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	Gasterosteus_aculeatus
ENSXMAG00000021899	ago1	91	97.059	ENSGAGG00000012893	-	100	97.059	Gopherus_agassizii
ENSXMAG00000021899	ago1	100	95.804	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	96.270	Gorilla_gorilla
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.534	ENSHBUG00000010459	ago1	100	99.534	Haplochromis_burtoni
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.694	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	96.270	Heterocephalus_glaber_female
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.694	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	96.270	Heterocephalus_glaber_male
ENSXMAG00000021899	ago1	99	99.764	ENSHCOG00000005708	ago1	100	99.764	Hippocampus_comes
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.301	ENSIPUG00000023216	ago1	100	99.301	Ictalurus_punctatus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.019	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	96.270	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	96.154	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	96.154	Jaculus_jaculus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.883	ENSKMAG00000019464	ago1	100	99.883	Kryptolebias_marmoratus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.883	ENSLBEG00000007694	ago1	100	99.883	Labrus_bergylta
ENSXMAG00000021899	ago1	99	90.824	ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	Latimeria_chalumnae
ENSXMAG00000021899	ago1	100	94.755	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	Lepisosteus_oculatus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.353	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.353	Loxodonta_africana
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	96.270	Macaca_fascicularis
ENSXMAG00000021899	ago1	99	92.090	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	92.171	Macaca_mulatta
ENSXMAG00000021899	ago1	100	92.424	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	97.187	Macaca_nemestrina
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	96.270	Mandrillus_leucophaeus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.767	ENSMAMG00000008381	ago1	100	99.767	Mastacembelus_armatus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.534	ENSMZEG00005007996	ago1	100	99.534	Maylandia_zebra
ENSXMAG00000021899	ago1	99	90.719	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	90.719	Meleagris_gallopavo
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	96.270	Mesocricetus_auratus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.145	ENSMICG00000016147	AGO1	100	96.270	Microcebus_murinus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	95.804	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	96.154	Microtus_ochrogaster
ENSXMAG00000021899	ago1	78	99.701	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.701	Mola_mola
ENSXMAG00000021899	ago1	100	95.921	ENSMODG00000023335	AGO1	100	95.921	Monodelphis_domestica
ENSXMAG00000021899	ago1	99	99.646	ENSMALG00000011057	ago1	100	99.646	Monopterus_albus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	98.011	Mus_caroli
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	98.011	Mus_musculus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	98.011	Mus_pahari
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	98.011	Mus_spretus
ENSXMAG00000021899	ago1	84	97.772	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.772	Mustela_putorius_furo
ENSXMAG00000021899	ago1	61	94.837	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	94.837	Myotis_lucifugus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	96.037	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	96.037	Nannospalax_galili
ENSXMAG00000021899	ago1	91	99.872	ENSNBRG00000010867	ago1	100	99.872	Neolamprologus_brichardi
ENSXMAG00000021899	ago1	100	96.270	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	96.270	Nomascus_leucogenys
ENSXMAG00000021899	ago1	84	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSXMAG00000021899	ago1	93	98.480	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	98.480	Ochotona_princeps
ENSXMAG00000021899	ago1	100	95.035	ENSODEG00000005321	AGO1	100	96.270	Octodon_degus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	99.529	ENSONIG00000016345	ago1	100	99.529	Oreochromis_niloticus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	88.269	ENSOANG00000002080	AGO1	100	88.269	Ornithorhynchus_anatinus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.797	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	96.154	Oryctolagus_cuniculus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.883	ENSORLG00000014965	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.883	ENSORLG00020018253	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes_hni
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.883	ENSORLG00015003287	ago1	100	99.883	Oryzias_latipes_hsok
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.883	ENSOMEG00000020528	ago1	100	99.883	Oryzias_melastigma
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.136	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	96.136	Otolemur_garnettii
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.686	ENSOARG00000019591	AGO1	100	96.270	Ovis_aries
ENSXMAG00000021899	ago1	100	95.804	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	96.270	Pan_paniscus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	96.270	Panthera_pardus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.679	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	96.037	Panthera_tigris_altaica
ENSXMAG00000021899	ago1	100	95.804	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	96.270	Pan_troglodytes
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSPANG00000009060	AGO1	100	96.270	Papio_anubis
ENSXMAG00000021899	ago1	98	95.962	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	95.962	Pelodiscus_sinensis
ENSXMAG00000021899	ago1	80	98.547	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.547	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.023	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.270	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSXMAG00000021899	ago1	100	95.921	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	Phascolarctos_cinereus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	100.000	ENSPFOG00000005867	ago1	100	100.000	Poecilia_formosa
ENSXMAG00000021899	ago1	100	100.000	ENSPLAG00000002824	ago1	100	100.000	Poecilia_latipinna
ENSXMAG00000021899	ago1	100	100.000	ENSPMEG00000001787	ago1	100	100.000	Poecilia_mexicana
ENSXMAG00000021899	ago1	100	100.000	ENSPREG00000006534	ago1	100	100.000	Poecilia_reticulata
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	96.270	Pongo_abelii
ENSXMAG00000021899	ago1	58	98.868	ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	Procavia_capensis
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.028	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	97.187	Propithecus_coquereli
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSPVAG00000005082	AGO1	100	96.270	Pteropus_vampyrus
ENSXMAG00000021899	ago1	91	94.643	ENSPNYG00000012586	ago1	100	94.643	Pundamilia_nyererei
ENSXMAG00000021899	ago1	93	94.862	ENSPNAG00000000597	ago1	99	94.862	Pygocentrus_nattereri
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.797	ENSRNOG00000055915	Ago1	100	96.154	Rattus_norvegicus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSRBIG00000032611	AGO1	100	96.270	Rhinopithecus_bieti
ENSXMAG00000021899	ago1	100	95.804	ENSRROG00000044469	AGO1	100	96.270	Rhinopithecus_roxellana
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSSBOG00000020867	AGO1	100	96.270	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSXMAG00000021899	ago1	99	94.854	ENSSHAG00000017468	AGO1	100	94.854	Sarcophilus_harrisii
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.184	ENSSFOG00015020982	ago1	100	99.184	Scleropages_formosus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.883	ENSSMAG00000002841	ago1	100	99.883	Scophthalmus_maximus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.767	ENSSDUG00000010864	ago1	100	99.767	Seriola_dumerili
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.767	ENSSLDG00000000386	ago1	100	99.767	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSXMAG00000021899	ago1	74	100.000	ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	Sorex_araneus
ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.340	ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	Sphenodon_punctatus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.767	ENSSPAG00000019154	ago1	100	99.767	Stegastes_partitus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	98.614	ENSTRUG00000024431	ago1	100	99.238	Takifugu_rubripes
ENSXMAG00000021899	ago1	100	99.302	ENSTNIG00000012102	ago1	100	99.302	Tetraodon_nigroviridis
ENSXMAG00000021899	ago1	84	96.671	ENSTBEG00000016514	AGO1	100	96.671	Tupaia_belangeri
ENSXMAG00000021899	ago1	100	94.522	ENSTTRG00000015088	AGO1	100	94.522	Tursiops_truncatus
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSUAMG00000027154	AGO1	100	96.270	Ursus_americanus
ENSXMAG00000021899	ago1	100	92.308	ENSUMAG00000002480	AGO1	100	92.308	Ursus_maritimus
ENSXMAG00000021899	ago1	95	89.951	ENSVPAG00000006663	AGO1	99	89.951	Vicugna_pacos
ENSXMAG00000021899	ago1	98	96.916	ENSVVUG00000000405	AGO1	100	98.690	Vulpes_vulpes
ENSXMAG00000021899	ago1	100	95.698	ENSXETG00000004364	ago1	100	95.698	Xenopus_tropicalis
ENSXMAG00000021899	ago1	91	98.977	ENSXCOG00000007669	ago1	100	98.977	Xiphophorus_couchianus